MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015736	TG	3	6	3098	3103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015736	GC	4	8	3376	3383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015736	AG	3	6	3740	3745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015736	CT	4	8	3757	3764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015736	GC	3	6	3908	3913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015736	GC	3	6	3921	3926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015736	GC	3	6	4199	4204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015736	CT	3	6	4227	4232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015736	GC	3	6	4615	4620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015736	TG	3	6	6458	6463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015736	AC	3	6	7756	7761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015736	GC	3	6	8438	8443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015736	AC	3	6	8532	8537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015736	GC	3	6	10004	10009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015736	GC	4	8	10072	10079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015736	GC	3	6	10600	10605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015736	AC	3	6	10872	10877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015736	GC	3	6	11799	11804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015736	CG	3	6	12212	12217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015736	AC	3	6	17650	17655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015736	CT	3	6	17872	17877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015736	GC	3	6	17986	17991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015736	GC	3	6	18102	18107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015736	CT	3	6	20982	20987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015736	AC	3	6	21383	21388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015736	CT	3	6	21566	21571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015736	TA	3	6	21856	21861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015736	CG	3	6	22094	22099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015736	GC	3	6	23381	23386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015736	GC	3	6	25359	25364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015736	GC	3	6	25555	25560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015736	GC	3	6	25627	25632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015736	GC	3	6	28751	28756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015736	GC	3	6	28819	28824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015736	CA	4	8	32485	32492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015736	GC	3	6	35806	35811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015736	CG	3	6	35947	35952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015736	CA	3	6	36084	36089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015736	GC	4	8	36229	36236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015736	GC	3	6	36835	36840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015736	GC	3	6	36910	36915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015736	GA	3	6	48521	48526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015736	AC	3	6	48649	48654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015736	GC	3	6	48883	48888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015736	AT	3	6	49023	49028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015736	GC	3	6	49381	49386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015736	TC	3	6	49677	49682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015736	AC	3	6	49811	49816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015736	GT	3	6	51675	51680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015736	GC	3	6	51809	51814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015736	CG	3	6	52691	52696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015736	TG	3	6	55018	55023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015736	CA	4	8	55036	55043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015736	CA	3	6	56446	56451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015736	GA	3	6	58065	58070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015736	GA	3	6	58105	58110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015736	GT	3	6	58400	58405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015736	GC	3	6	58423	58428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015736	CG	3	6	58824	58829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015736	CG	4	8	59039	59046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015736	GC	3	6	65090	65095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015736	GA	3	6	65876	65881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015736	TG	3	6	68136	68141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015736	CT	3	6	68722	68727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015736	CT	3	6	72523	72528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015736	AC	3	6	73195	73200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015736	GC	3	6	73223	73228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015736	CG	3	6	73496	73501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015736	CG	3	6	74308	74313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015736	CG	3	6	77465	77470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015736	TG	3	6	77678	77683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015736	GC	3	6	78004	78009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015736	CG	3	6	78206	78211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015736	GC	3	6	78317	78322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015736	GA	3	6	78409	78414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015736	GC	4	8	80684	80691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015736	GC	3	6	82937	82942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015736	GC	3	6	83000	83005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015736	AC	3	6	83741	83746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015736	GC	3	6	84135	84140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015736	TG	3	6	84537	84542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015736	GC	3	6	86333	86338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015736	GC	3	6	86348	86353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015736	GC	3	6	86575	86580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015736	GC	4	8	86943	86950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015736	GC	3	6	87686	87691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015736	CA	3	6	88038	88043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015736	GC	3	6	88058	88063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015736	GC	3	6	88249	88254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015736	GC	3	6	88349	88354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015736	GC	3	6	88739	88744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015736	GC	3	6	88946	88951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015736	CG	3	6	89054	89059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015736	AC	3	6	91780	91785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015736	AG	3	6	93615	93620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015736	CG	3	6	93712	93717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015736	TG	3	6	102498	102503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015736	CG	3	6	106336	106341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015736	CG	3	6	106371	106376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015736	CG	3	6	106453	106458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015736	CG	3	6	123377	123382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015736	CG	3	6	124340	124345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015736	AC	3	6	124475	124480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015736	GT	3	6	126339	126344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015736	GA	3	6	126473	126478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015736	GC	3	6	126769	126774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015736	TA	3	6	127126	127131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015736	GC	3	6	127267	127272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015736	GT	3	6	127501	127506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015736	CT	3	6	127628	127633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015736	GC	3	6	131496	131501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015736	GC	3	6	131698	131703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015736	AG	3	6	131861	131866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015736	GC	3	6	135292	135297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015736	TG	3	6	135477	135482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015736	CT	3	6	135738	135743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015736	CA	3	6	137107	137112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015736	GC	3	6	137306	137311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015736	GC	3	6	137356	137361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015736	GC	3	6	137706	137711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015736	CG	3	6	138853	138858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015736	GC	3	6	138890	138895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.