MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 4287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015733	TGGCC	2	10	2896	2905	0 %	20 %	40 %	40 %	339484945
2	NC_015733	GGGAA	2	10	4363	4372	40 %	0 %	60 %	0 %	339484945
3	NC_015733	CTGGC	2	10	5115	5124	0 %	20 %	40 %	40 %	339484946
4	NC_015733	GCGCA	2	10	5819	5828	20 %	0 %	40 %	40 %	339484946
5	NC_015733	ACCAG	2	10	6502	6511	40 %	0 %	20 %	40 %	339484947
6	NC_015733	GCCGG	2	10	7165	7174	0 %	0 %	60 %	40 %	339484947
7	NC_015733	GGTCA	2	10	7503	7512	20 %	20 %	40 %	20 %	339484947
8	NC_015733	GGCAG	2	10	7993	8002	20 %	0 %	60 %	20 %	339484947
9	NC_015733	CACTG	2	10	14702	14711	20 %	20 %	20 %	40 %	339484953
10	NC_015733	TACCG	2	10	15348	15357	20 %	20 %	20 %	40 %	339484953
11	NC_015733	CCCTG	2	10	16894	16903	0 %	20 %	20 %	60 %	339484955
12	NC_015733	CCCTG	2	10	20093	20102	0 %	20 %	20 %	60 %	339484958
13	NC_015733	CGGTG	2	10	20331	20340	0 %	20 %	60 %	20 %	339484958
14	NC_015733	GGCCG	2	10	20379	20388	0 %	0 %	60 %	40 %	339484958
15	NC_015733	CGCTG	2	10	21291	21300	0 %	20 %	40 %	40 %	339484959
16	NC_015733	CAGCG	2	10	22134	22143	20 %	0 %	40 %	40 %	339484960
17	NC_015733	CGGCG	3	15	28384	28398	0 %	0 %	60 %	40 %	339484964
18	NC_015733	CCCAG	2	10	29080	29089	20 %	0 %	20 %	60 %	339484965
19	NC_015733	TCGCC	2	10	29540	29549	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015733	ACCAC	2	10	30077	30086	40 %	0 %	0 %	60 %	339484966
21	NC_015733	GCCGC	2	10	31717	31726	0 %	0 %	40 %	60 %	339484969
22	NC_015733	GCCTT	2	10	32392	32401	0 %	40 %	20 %	40 %	339484969
23	NC_015733	GCACT	2	10	38452	38461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015733	ATCAC	2	10	39040	39049	40 %	20 %	0 %	40 %	339484976
25	NC_015733	TCTGC	2	10	39660	39669	0 %	40 %	20 %	40 %	339484977
26	NC_015733	GCGTG	2	10	40934	40943	0 %	20 %	60 %	20 %	339484978
27	NC_015733	GCGCC	2	10	41733	41742	0 %	0 %	40 %	60 %	339484979
28	NC_015733	GCCAG	2	10	42411	42420	20 %	0 %	40 %	40 %	339484979
29	NC_015733	GCGGT	2	10	45334	45343	0 %	20 %	60 %	20 %	339484981
30	NC_015733	GCGCG	2	10	47135	47144	0 %	0 %	60 %	40 %	339484983
31	NC_015733	GGTGC	2	10	50929	50938	0 %	20 %	60 %	20 %	339484988
32	NC_015733	GCCGG	2	10	52857	52866	0 %	0 %	60 %	40 %	339484991
33	NC_015733	ACCGC	2	10	59590	59599	20 %	0 %	20 %	60 %	339485000
34	NC_015733	GTGTT	2	10	62636	62645	0 %	60 %	40 %	0 %	339485002
35	NC_015733	GAGCA	2	10	63025	63034	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015733	CATCA	2	10	63775	63784	40 %	20 %	0 %	40 %	339485003
37	NC_015733	GCATG	2	10	64593	64602	20 %	20 %	40 %	20 %	339485004
38	NC_015733	TGGGC	2	10	65451	65460	0 %	20 %	60 %	20 %	339485004
39	NC_015733	GGCTT	2	10	66622	66631	0 %	40 %	40 %	20 %	339485005
40	NC_015733	ACCAC	2	10	67875	67884	40 %	0 %	0 %	60 %	339485007
41	NC_015733	CGGCC	2	10	68249	68258	0 %	0 %	40 %	60 %	339485008
42	NC_015733	GCCTG	2	10	68387	68396	0 %	20 %	40 %	40 %	339485008
43	NC_015733	CGGTG	2	10	68459	68468	0 %	20 %	60 %	20 %	339485008
44	NC_015733	GGTTC	2	10	70575	70584	0 %	40 %	40 %	20 %	339485010
45	NC_015733	GGCCG	2	10	70723	70732	0 %	0 %	60 %	40 %	339485010
46	NC_015733	TGTGG	2	10	71230	71239	0 %	40 %	60 %	0 %	339485010
47	NC_015733	CCCGG	2	10	72194	72203	0 %	0 %	40 %	60 %	339485012
48	NC_015733	CCACT	2	10	72355	72364	20 %	20 %	0 %	60 %	339485012
49	NC_015733	CTGGC	2	10	73750	73759	0 %	20 %	40 %	40 %	339485014
50	NC_015733	GCTGG	2	10	74470	74479	0 %	20 %	60 %	20 %	339485015
51	NC_015733	GCAGC	2	10	75707	75716	20 %	0 %	40 %	40 %	339485017
52	NC_015733	GGCCG	2	10	76455	76464	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015733	TGCGT	2	10	78508	78517	0 %	40 %	40 %	20 %	339485020
54	NC_015733	CAGCG	2	10	79760	79769	20 %	0 %	40 %	40 %	339485020
55	NC_015733	CAGCG	2	10	81814	81823	20 %	0 %	40 %	40 %	339485022
56	NC_015733	CCAGG	2	10	81859	81868	20 %	0 %	40 %	40 %	339485022
57	NC_015733	AGCGT	2	10	84214	84223	20 %	20 %	40 %	20 %	339485025
58	NC_015733	AGCTG	2	10	84756	84765	20 %	20 %	40 %	20 %	339485026
59	NC_015733	CAGCT	2	10	85910	85919	20 %	20 %	20 %	40 %	339485027
60	NC_015733	TCCAG	2	10	86257	86266	20 %	20 %	20 %	40 %	339485027
61	NC_015733	TCCTA	2	10	87852	87861	20 %	40 %	0 %	40 %	339485029
62	NC_015733	TGGCC	2	10	89401	89410	0 %	20 %	40 %	40 %	339485029
63	NC_015733	CACGC	2	10	90561	90570	20 %	0 %	20 %	60 %	339485030
64	NC_015733	GGCCA	2	10	91534	91543	20 %	0 %	40 %	40 %	339485032
65	NC_015733	CAGCA	2	10	93233	93242	40 %	0 %	20 %	40 %	339485034
66	NC_015733	GCCCG	2	10	93292	93301	0 %	0 %	40 %	60 %	339485034
67	NC_015733	GCCCT	2	10	94613	94622	0 %	20 %	20 %	60 %	339485035
68	NC_015733	TGTGA	2	10	97788	97797	20 %	40 %	40 %	0 %	339485037
69	NC_015733	AGCCC	2	10	98421	98430	20 %	0 %	20 %	60 %	339485038
70	NC_015733	CCAGC	2	10	99229	99238	20 %	0 %	20 %	60 %	339485038
71	NC_015733	GCACC	2	10	100190	100199	20 %	0 %	20 %	60 %	339485039
72	NC_015733	GGCCA	2	10	102877	102886	20 %	0 %	40 %	40 %	339485041
73	NC_015733	GCTCG	2	10	103249	103258	0 %	20 %	40 %	40 %	339485043
74	NC_015733	GGCCT	2	10	105491	105500	0 %	20 %	40 %	40 %	339485044
75	NC_015733	TGGCT	2	10	105868	105877	0 %	40 %	40 %	20 %	339485045
76	NC_015733	CTGGG	2	10	106781	106790	0 %	20 %	60 %	20 %	339485045
77	NC_015733	CCGCC	2	10	107431	107440	0 %	0 %	20 %	80 %	339485046
78	NC_015733	GCGAT	2	10	108369	108378	20 %	20 %	40 %	20 %	339485047
79	NC_015733	GCGCG	2	10	109110	109119	0 %	0 %	60 %	40 %	339485048
80	NC_015733	TAGCG	2	10	110739	110748	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015733	GCCAC	2	10	111304	111313	20 %	0 %	20 %	60 %	339485050
82	NC_015733	GCAGC	2	10	114276	114285	20 %	0 %	40 %	40 %	339485052
83	NC_015733	CGGTG	2	10	120847	120856	0 %	20 %	60 %	20 %	339485058
84	NC_015733	TTTTA	2	10	121555	121564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015733	CAGTT	2	10	121993	122002	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015733	CAGTA	2	10	122137	122146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015733	CAGCG	2	10	122423	122432	20 %	0 %	40 %	40 %	339485061
88	NC_015733	AAAAG	2	10	123922	123931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015733	CCGCG	2	10	125343	125352	0 %	0 %	40 %	60 %	339485062
90	NC_015733	CCTCC	2	10	127460	127469	0 %	20 %	0 %	80 %	339485065
91	NC_015733	TGCCC	2	10	127681	127690	0 %	20 %	20 %	60 %	339485065
92	NC_015733	TGCTT	2	10	130839	130848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015733	TCGTG	2	10	132580	132589	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015733	ACCGA	2	10	134091	134100	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015733	AGTCG	2	10	134468	134477	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015733	ATCCC	2	10	136425	136434	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_015733	ATCCC	2	10	136649	136658	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_015733	CACGT	2	10	137953	137962	20 %	20 %	20 %	40 %	339485068
99	NC_015733	CAGGC	2	10	139558	139567	20 %	0 %	40 %	40 %	339485069
100	NC_015733	CAGGT	2	10	139702	139711	20 %	20 %	40 %	20 %	339485069
101	NC_015733	GCCGG	2	10	139887	139896	0 %	0 %	60 %	40 %	339485069
102	NC_015733	ACGGA	2	10	145905	145914	40 %	0 %	40 %	20 %	339485074
103	NC_015733	CTTCG	2	10	146500	146509	0 %	40 %	20 %	40 %	339485075
104	NC_015733	GGTGC	2	10	146629	146638	0 %	20 %	60 %	20 %	339485075
105	NC_015733	CAGTG	2	10	146794	146803	20 %	20 %	40 %	20 %	339485075
106	NC_015733	GCCTT	2	10	147320	147329	0 %	40 %	20 %	40 %	339485075
107	NC_015733	CGAGG	2	10	148850	148859	20 %	0 %	60 %	20 %	339485076
108	NC_015733	AGTGA	2	10	152949	152958	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015733	ACATT	2	10	153555	153564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015733	GCGGT	2	10	153877	153886	0 %	20 %	60 %	20 %	339485080
111	NC_015733	CGACC	2	10	154040	154049	20 %	0 %	20 %	60 %	339485080
112	NC_015733	GGGCT	2	10	154179	154188	0 %	20 %	60 %	20 %	339485080
113	NC_015733	TGACC	2	10	156596	156605	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
114	NC_015733	TGACC	2	10	157259	157268	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
115	NC_015733	TGACC	2	10	157922	157931	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
116	NC_015733	TGACC	2	10	158585	158594	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
117	NC_015733	TGACC	2	10	159248	159257	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
118	NC_015733	TGACC	2	10	159911	159920	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
119	NC_015733	TGACC	2	10	160574	160583	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
120	NC_015733	TGACC	2	10	161237	161246	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
121	NC_015733	TGACC	2	10	161900	161909	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
122	NC_015733	TGACC	2	10	162563	162572	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
123	NC_015733	TGACC	2	10	163226	163235	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
124	NC_015733	TGACC	2	10	163892	163901	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
125	NC_015733	TGACC	2	10	164555	164564	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
126	NC_015733	TGACC	2	10	165218	165227	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
127	NC_015733	TGACC	2	10	165881	165890	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
128	NC_015733	TGACC	2	10	166544	166553	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
129	NC_015733	TGACC	2	10	167207	167216	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
130	NC_015733	TGACC	2	10	167873	167882	20 %	20 %	20 %	40 %	339485080
131	NC_015733	CTGAT	2	10	172977	172986	20 %	40 %	20 %	20 %	339485081
132	NC_015733	ACCGC	2	10	175219	175228	20 %	0 %	20 %	60 %	339485084
133	NC_015733	GGGCT	2	10	176711	176720	0 %	20 %	60 %	20 %	339485085
134	NC_015733	CACGT	2	10	177423	177432	20 %	20 %	20 %	40 %	339485086
135	NC_015733	AGGCA	2	10	178660	178669	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015733	GCGCC	2	10	178899	178908	0 %	0 %	40 %	60 %	339485088
137	NC_015733	GCCAG	2	10	179807	179816	20 %	0 %	40 %	40 %	339485089
138	NC_015733	GCCGT	2	10	180595	180604	0 %	20 %	40 %	40 %	339485089
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149	NC_015733	AGCCA	2	10	198379	198388	40 %	0 %	20 %	40 %	339485109
150	NC_015733	AGCCA	2	10	198421	198430	40 %	0 %	20 %	40 %	339485109
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152	NC_015733	GGCCG	2	10	203946	203955	0 %	0 %	60 %	40 %	339485114
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154	NC_015733	TGCCG	2	10	206196	206205	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_015733	TCCGT	2	10	206621	206630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_015733	CGCTG	2	10	222294	222303	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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175	NC_015733	TGGCC	2	10	225359	225368	0 %	20 %	40 %	40 %	339485131
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249	NC_015733	AGTGC	2	10	340808	340817	20 %	20 %	40 %	20 %	339485232
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251	NC_015733	GGTGC	2	10	342771	342780	0 %	20 %	60 %	20 %	339485234
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254	NC_015733	TCGAC	2	10	348048	348057	20 %	20 %	20 %	40 %	339485239
255	NC_015733	GAGTT	2	10	348429	348438	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015733	CCGGC	2	10	350180	350189	0 %	0 %	40 %	60 %	339485241
257	NC_015733	TCTGA	2	10	351131	351140	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_015733	TCGGT	2	10	353989	353998	0 %	40 %	40 %	20 %	339485243
264	NC_015733	ACCTT	2	10	357849	357858	20 %	40 %	0 %	40 %	339485245
265	NC_015733	TGGTC	2	10	360121	360130	0 %	40 %	40 %	20 %	339485247
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399	NC_015733	GCCAC	2	10	560376	560385	20 %	0 %	20 %	60 %	339485419
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