MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 9692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015733	CTC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015733	TTG	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015733	GCG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015733	GAA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015733	GGA	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015733	CCG	2	6	8148	8153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015733	CGA	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015733	GAA	2	6	8258	8263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015733	CGA	2	6	8903	8908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015733	ACA	2	6	9064	9069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015733	GAA	2	6	9104	9109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015733	TGC	2	6	9205	9210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015733	TTC	2	6	9218	9223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015733	CAG	2	6	9261	9266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015733	GCG	2	6	9340	9345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015733	GTC	2	6	17321	17326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015733	CCT	2	6	17398	17403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015733	TCC	2	6	21496	21501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015733	AAT	3	9	21535	21543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015733	CCG	2	6	21610	21615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015733	CCG	2	6	21640	21645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015733	AAC	2	6	23260	23265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015733	AAT	2	6	23269	23274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015733	GCT	2	6	29576	29581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015733	CGA	2	6	29592	29597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015733	TAA	2	6	35722	35727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015733	CAA	2	6	35822	35827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015733	CAA	2	6	37045	37050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015733	CCT	2	6	37607	37612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015733	GAA	2	6	37633	37638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015733	GGC	2	6	37897	37902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015733	AGG	2	6	37910	37915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015733	CTG	2	6	37924	37929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015733	ACC	2	6	37954	37959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015733	GTG	2	6	37999	38004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015733	GCG	2	6	39539	39544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015733	GGT	2	6	39556	39561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015733	TTC	2	6	39577	39582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015733	AGC	2	6	41485	41490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015733	GGC	2	6	44089	44094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015733	CAG	2	6	46645	46650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015733	GGT	2	6	47297	47302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015733	TCC	2	6	47714	47719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015733	TGT	2	6	47737	47742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015733	GCT	2	6	51245	51250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015733	CAT	2	6	51265	51270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015733	GAG	2	6	51273	51278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015733	ATG	2	6	51529	51534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015733	GAA	2	6	51915	51920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015733	GGC	2	6	53029	53034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015733	AGG	2	6	53070	53075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015733	GCA	2	6	53549	53554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015733	AGC	2	6	53835	53840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015733	AGC	2	6	55995	56000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015733	TAC	2	6	57258	57263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015733	CGA	2	6	57275	57280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015733	CTG	2	6	57369	57374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015733	TCT	2	6	57412	57417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015733	CGT	2	6	59768	59773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015733	GCC	2	6	59774	59779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015733	GGT	2	6	59809	59814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015733	TAT	2	6	63237	63242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015733	GGC	2	6	64270	64275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015733	GTC	2	6	66943	66948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015733	ACC	2	6	66966	66971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015733	ATG	2	6	67031	67036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015733	CGA	2	6	71626	71631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015733	GCA	2	6	72379	72384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015733	ACT	2	6	78326	78331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015733	GAG	2	6	78369	78374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015733	GCT	2	6	80522	80527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015733	TTA	2	6	83524	83529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015733	GAC	2	6	83544	83549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015733	GTG	2	6	84526	84531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015733	CAG	2	6	84560	84565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015733	CCA	2	6	84598	84603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015733	CGA	2	6	84635	84640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015733	GAG	2	6	84697	84702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015733	GAA	2	6	85728	85733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015733	ATG	2	6	86694	86699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015733	CCG	2	6	86723	86728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015733	GTC	2	6	87070	87075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015733	TGT	2	6	90055	90060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015733	CCG	2	6	90228	90233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015733	GCT	2	6	91121	91126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015733	GCA	2	6	91254	91259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015733	TGA	2	6	91442	91447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015733	TGT	2	6	92073	92078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015733	ATG	2	6	92085	92090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015733	GGC	2	6	92095	92100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015733	CGT	2	6	92178	92183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015733	GCT	2	6	95690	95695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015733	GGC	2	6	100088	100093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015733	GAT	2	6	101578	101583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015733	AGG	2	6	101643	101648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015733	GCC	2	6	101674	101679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015733	ATT	2	6	102532	102537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015733	CAG	2	6	102635	102640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015733	GAG	2	6	102641	102646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015733	CCG	2	6	102943	102948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015733	ACC	2	6	102978	102983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015733	ATG	2	6	103697	103702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015733	CGC	2	6	103703	103708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015733	GAG	2	6	103712	103717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015733	TTG	2	6	103753	103758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015733	CGG	2	6	103818	103823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015733	CGG	2	6	103841	103846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015733	GAG	2	6	103880	103885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015733	TCT	2	6	103917	103922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015733	GCC	2	6	104205	104210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015733	AGC	2	6	104276	104281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015733	TGC	2	6	104282	104287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015733	GAG	2	6	105696	105701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015733	TTG	2	6	105734	105739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015733	ACA	2	6	111904	111909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015733	GGT	2	6	111920	111925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015733	CCG	2	6	112033	112038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015733	AGA	2	6	115175	115180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015733	GTT	2	6	115225	115230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015733	CAC	2	6	115341	115346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015733	TTG	2	6	115400	115405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015733	GCG	2	6	117594	117599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015733	TTG	4	12	117703	117714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015733	CGA	2	6	117825	117830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015733	TGC	2	6	118249	118254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015733	ACA	2	6	120977	120982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015733	GGC	2	6	121042	121047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015733	CTG	2	6	121409	121414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015733	TCG	2	6	121442	121447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015733	TCC	2	6	121964	121969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015733	TCG	2	6	121971	121976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015733	TTG	2	6	122078	122083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015733	CTG	2	6	122196	122201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015733	CAG	2	6	122271	122276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015733	CGG	2	6	123980	123985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015733	GGC	2	6	126956	126961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015733	CCG	2	6	126976	126981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015733	CAG	2	6	127212	127217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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