MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	TTTATT	2	12	7718	7729	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015732	GTTTTG	2	12	17347	17358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015732	ATTGCA	2	12	121445	121456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015732	GCATCG	2	12	121844	121855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015732	TTTATA	2	12	129167	129178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015732	AAAATG	2	12	149000	149011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015732	GGGCTA	2	12	160368	160379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015732	ATCCGG	2	12	383656	383667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015732	GAAAAA	2	12	413859	413870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015732	GGCGAA	2	12	485162	485173	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015732	GCCGGA	2	12	487050	487061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015732	GGCGAA	2	12	490709	490720	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015732	GCCGGA	2	12	492843	492854	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015732	TATCGA	2	12	579989	580000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015732	ATAATC	2	12	607722	607733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015732	ACCTAT	2	12	660775	660786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015732	AGGAGC	2	12	706300	706311	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015732	TTTAAC	2	12	762919	762930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015732	TTATAC	2	12	768581	768592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015732	AAAAAG	2	12	897189	897200	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015732	AGTTAA	2	12	973732	973743	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015732	ATTTAT	2	12	973916	973927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015732	AAAAAT	2	12	989362	989373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015732	ATGAAA	2	12	997636	997647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015732	ATATTA	2	12	997702	997713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015732	AAATAT	2	12	1019627	1019638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015732	ATTTTT	2	12	1057790	1057801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015732	GTATTG	2	12	1121903	1121914	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015732	AATATA	2	12	1160450	1160461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015732	GAACAG	2	12	1172957	1172968	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015732	ATATAA	2	12	1240365	1240376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015732	GAATAG	2	12	1319145	1319156	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015732	GCAACA	2	12	1341697	1341708	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015732	ACAGGA	2	12	1372411	1372422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015732	CCTATC	2	12	1551401	1551412	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015732	TTTCAA	2	12	1602338	1602349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015732	TAAAAA	2	12	1713971	1713982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015732	CAGAAC	2	12	1751930	1751941	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015732	TATTTA	2	12	1770996	1771007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015732	AGAAAT	2	12	1933439	1933450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015732	ATCAAG	2	12	1936952	1936963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015732	TAAATC	2	12	1942104	1942115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015732	TTTTTA	2	12	1978300	1978311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015732	CTCCGG	2	12	1989479	1989490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015732	TTCGCC	2	12	1991588	1991599	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015732	CAAAAA	2	12	2010845	2010856	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015732	CGCCGG	2	12	2044021	2044032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015732	CTTTTA	2	12	2046413	2046424	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015732	AAATAT	2	12	2062851	2062862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015732	AAAAGA	2	12	2076103	2076114	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015732	ATGGGG	2	12	2142890	2142901	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015732	AATCGA	2	12	2187205	2187216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015732	TTTTAT	2	12	2304818	2304829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015732	GCCCAA	2	12	2341762	2341773	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015732	GACATT	2	12	2342253	2342264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015732	GCTTGA	2	12	2345425	2345436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015732	TCGGAC	2	12	2355168	2355179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015732	TAAACT	2	12	2365557	2365568	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015732	ATCATA	2	12	2408810	2408821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015732	GAAAAA	2	12	2462911	2462922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015732	GGAAGA	2	12	2478021	2478032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015732	TGATAT	2	12	2505790	2505801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015732	AGAGCC	2	12	2575916	2575927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015732	TCAGGT	2	12	2579144	2579155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015732	ATCTAC	2	12	2733340	2733351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015732	GAACCT	2	12	2747243	2747254	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015732	ATAAAA	2	12	2768193	2768204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015732	ATTAGT	2	12	2776916	2776927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015732	TAAGTT	2	12	2904216	2904227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015732	TAAAAG	2	12	2908656	2908667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015732	AAATTC	2	12	2984662	2984673	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015732	GAAAAA	2	12	3104805	3104816	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015732	TTATAT	2	12	3155052	3155063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015732	TTCCTT	2	12	3234238	3234249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.