MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 2200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	TCCTT	2	10	530	539	0 %	60 %	0 %	40 %	339498646
2	NC_015732	CAAAA	2	10	750	759	80 %	0 %	0 %	20 %	339498646
3	NC_015732	AAAAT	2	10	1924	1933	80 %	20 %	0 %	0 %	339498647
4	NC_015732	TTCCT	2	10	4054	4063	0 %	60 %	0 %	40 %	339498649
5	NC_015732	AGTAA	2	10	4384	4393	60 %	20 %	20 %	0 %	339498650
6	NC_015732	AAGGG	2	10	4565	4574	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015732	AGATT	2	10	7737	7746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015732	GACAG	2	10	9905	9914	40 %	0 %	40 %	20 %	339498656
9	NC_015732	AAACA	2	10	11242	11251	80 %	0 %	0 %	20 %	339498658
10	NC_015732	AAAAT	2	10	11415	11424	80 %	20 %	0 %	0 %	339498659
11	NC_015732	CTTTT	2	10	11712	11721	0 %	80 %	0 %	20 %	339498659
12	NC_015732	TAATT	2	10	12310	12319	40 %	60 %	0 %	0 %	339498659
13	NC_015732	TAAGA	2	10	15102	15111	60 %	20 %	20 %	0 %	339498662
14	NC_015732	CAAAG	2	10	15356	15365	60 %	0 %	20 %	20 %	339498662
15	NC_015732	GATTG	2	10	16080	16089	20 %	40 %	40 %	0 %	339498662
16	NC_015732	ATTCC	2	10	16665	16674	20 %	40 %	0 %	40 %	339498662
17	NC_015732	GGGGC	2	10	17498	17507	0 %	0 %	80 %	20 %	339498663
18	NC_015732	GTTTT	2	10	24080	24089	0 %	80 %	20 %	0 %	339498670
19	NC_015732	TGGAC	2	10	27452	27461	20 %	20 %	40 %	20 %	339498672
20	NC_015732	TTCCT	2	10	31241	31250	0 %	60 %	0 %	40 %	339498675
21	NC_015732	GCTCA	2	10	31937	31946	20 %	20 %	20 %	40 %	339498676
22	NC_015732	ATATT	2	10	32521	32530	40 %	60 %	0 %	0 %	339498677
23	NC_015732	AAATC	2	10	32919	32928	60 %	20 %	0 %	20 %	339498677
24	NC_015732	ATTGT	2	10	33602	33611	20 %	60 %	20 %	0 %	339498677
25	NC_015732	TACAT	2	10	35071	35080	40 %	40 %	0 %	20 %	339498678
26	NC_015732	TTTCA	2	10	35132	35141	20 %	60 %	0 %	20 %	339498678
27	NC_015732	AATTG	2	10	37494	37503	40 %	40 %	20 %	0 %	339498680
28	NC_015732	AAATA	3	15	39900	39914	80 %	20 %	0 %	0 %	339498682
29	NC_015732	AAATG	2	10	41489	41498	60 %	20 %	20 %	0 %	339498683
30	NC_015732	TCTTT	2	10	42650	42659	0 %	80 %	0 %	20 %	339498685
31	NC_015732	AAAAG	2	10	44827	44836	80 %	0 %	20 %	0 %	339498688
32	NC_015732	TTCTT	2	10	44928	44937	0 %	80 %	0 %	20 %	339498688
33	NC_015732	ATTGT	2	10	48330	48339	20 %	60 %	20 %	0 %	339498691
34	NC_015732	TCCCA	2	10	49458	49467	20 %	20 %	0 %	60 %	339498692
35	NC_015732	TGTTT	2	10	50069	50078	0 %	80 %	20 %	0 %	339498692
36	NC_015732	TCAAA	2	10	52752	52761	60 %	20 %	0 %	20 %	339498693
37	NC_015732	AAGTA	2	10	59220	59229	60 %	20 %	20 %	0 %	339498699
38	NC_015732	GCTAT	2	10	59867	59876	20 %	40 %	20 %	20 %	339498699
39	NC_015732	CGAAC	2	10	62882	62891	40 %	0 %	20 %	40 %	339498701
40	NC_015732	TCTCT	2	10	65247	65256	0 %	60 %	0 %	40 %	339498704
41	NC_015732	TATTT	2	10	66344	66353	20 %	80 %	0 %	0 %	339498705
42	NC_015732	CCGGC	2	10	66786	66795	0 %	0 %	40 %	60 %	339498705
43	NC_015732	TTTTC	2	10	67531	67540	0 %	80 %	0 %	20 %	339498706
44	NC_015732	AGGTT	2	10	69486	69495	20 %	40 %	40 %	0 %	339498707
45	NC_015732	TTCGG	2	10	69795	69804	0 %	40 %	40 %	20 %	339498708
46	NC_015732	TCCTT	2	10	72181	72190	0 %	60 %	0 %	40 %	339498708
47	NC_015732	GATAA	2	10	72279	72288	60 %	20 %	20 %	0 %	339498708
48	NC_015732	CGGTT	2	10	72591	72600	0 %	40 %	40 %	20 %	339498708
49	NC_015732	TTTTG	2	10	72884	72893	0 %	80 %	20 %	0 %	339498708
50	NC_015732	GTATG	2	10	74161	74170	20 %	40 %	40 %	0 %	339498709
51	NC_015732	CCTGG	2	10	77017	77026	0 %	20 %	40 %	40 %	339498710
52	NC_015732	CCTGC	2	10	83145	83154	0 %	20 %	20 %	60 %	339498715
53	NC_015732	TATTG	2	10	83495	83504	20 %	60 %	20 %	0 %	339498716
54	NC_015732	ATTTC	2	10	84406	84415	20 %	60 %	0 %	20 %	339498716
55	NC_015732	CGGTT	2	10	86230	86239	0 %	40 %	40 %	20 %	339498717
56	NC_015732	GGACC	2	10	86929	86938	20 %	0 %	40 %	40 %	339498717
57	NC_015732	AAATC	2	10	87598	87607	60 %	20 %	0 %	20 %	339498718
58	NC_015732	GCGAT	2	10	87688	87697	20 %	20 %	40 %	20 %	339498718
59	NC_015732	TAAAG	2	10	90805	90814	60 %	20 %	20 %	0 %	339498720
60	NC_015732	TTTGT	2	10	91105	91114	0 %	80 %	20 %	0 %	339498721
61	NC_015732	TGTAT	2	10	91759	91768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015732	AGTTA	2	10	92359	92368	40 %	40 %	20 %	0 %	339498722
63	NC_015732	GGTGT	2	10	94172	94181	0 %	40 %	60 %	0 %	339498722
64	NC_015732	TTTTG	2	10	95254	95263	0 %	80 %	20 %	0 %	339498723
65	NC_015732	AATTA	2	10	97655	97664	60 %	40 %	0 %	0 %	339498725
66	NC_015732	AATAT	2	10	98051	98060	60 %	40 %	0 %	0 %	339498725
67	NC_015732	CCGCT	2	10	101244	101253	0 %	20 %	20 %	60 %	339498729
68	NC_015732	CCCGG	2	10	101648	101657	0 %	0 %	40 %	60 %	339498729
69	NC_015732	TGCCG	2	10	102585	102594	0 %	20 %	40 %	40 %	339498729
70	NC_015732	CTGGC	2	10	105208	105217	0 %	20 %	40 %	40 %	339498729
71	NC_015732	CTGGC	2	10	105313	105322	0 %	20 %	40 %	40 %	339498729
72	NC_015732	CGGAA	2	10	113575	113584	40 %	0 %	40 %	20 %	339498735
73	NC_015732	ATGCC	2	10	114242	114251	20 %	20 %	20 %	40 %	339498735
74	NC_015732	GGTTG	2	10	117896	117905	0 %	40 %	60 %	0 %	339498740
75	NC_015732	TATCG	2	10	119136	119145	20 %	40 %	20 %	20 %	339498741
76	NC_015732	AACAA	2	10	119857	119866	80 %	0 %	0 %	20 %	339498743
77	NC_015732	GCTTT	2	10	121708	121717	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015732	GGTTA	2	10	123070	123079	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015732	TCGTT	2	10	123641	123650	0 %	60 %	20 %	20 %	339498744
80	NC_015732	CGGCG	2	10	123816	123825	0 %	0 %	60 %	40 %	339498744
81	NC_015732	TTCTT	2	10	125274	125283	0 %	80 %	0 %	20 %	339498745
82	NC_015732	AACTG	2	10	127258	127267	40 %	20 %	20 %	20 %	339498746
83	NC_015732	TCGTT	2	10	127795	127804	0 %	60 %	20 %	20 %	339498746
84	NC_015732	AACTA	2	10	129385	129394	60 %	20 %	0 %	20 %	339498747
85	NC_015732	AAAAC	2	10	129623	129632	80 %	0 %	0 %	20 %	339498748
86	NC_015732	TGTAT	2	10	131106	131115	20 %	60 %	20 %	0 %	339498749
87	NC_015732	AGCGA	2	10	131468	131477	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015732	CATAT	2	10	131636	131645	40 %	40 %	0 %	20 %	339498750
89	NC_015732	GATGA	2	10	133120	133129	40 %	20 %	40 %	0 %	339498752
90	NC_015732	TTCCT	2	10	136182	136191	0 %	60 %	0 %	40 %	339498754
91	NC_015732	TGCCT	2	10	136443	136452	0 %	40 %	20 %	40 %	339498754
92	NC_015732	GCAGG	2	10	137478	137487	20 %	0 %	60 %	20 %	339498755
93	NC_015732	ATTGA	2	10	137658	137667	40 %	40 %	20 %	0 %	339498755
94	NC_015732	ATCAG	2	10	137920	137929	40 %	20 %	20 %	20 %	339498755
95	NC_015732	AAAAG	2	10	139475	139484	80 %	0 %	20 %	0 %	339498757
96	NC_015732	TCCTC	2	10	139648	139657	0 %	40 %	0 %	60 %	339498757
97	NC_015732	TGGCA	2	10	139703	139712	20 %	20 %	40 %	20 %	339498757
98	NC_015732	GGGAT	2	10	141706	141715	20 %	20 %	60 %	0 %	339498759
99	NC_015732	GGCCG	2	10	142977	142986	0 %	0 %	60 %	40 %	339498760
100	NC_015732	AAGGC	2	10	143602	143611	40 %	0 %	40 %	20 %	339498761
101	NC_015732	GGCTA	2	10	144652	144661	20 %	20 %	40 %	20 %	339498763
102	NC_015732	TTTGT	2	10	145071	145080	0 %	80 %	20 %	0 %	339498763
103	NC_015732	ATTAT	2	10	145861	145870	40 %	60 %	0 %	0 %	339498763
104	NC_015732	ATTTT	2	10	146710	146719	20 %	80 %	0 %	0 %	339498765
105	NC_015732	GAATA	2	10	147947	147956	60 %	20 %	20 %	0 %	339498765
106	NC_015732	TGTCA	2	10	148364	148373	20 %	40 %	20 %	20 %	339498766
107	NC_015732	TGGAA	2	10	148574	148583	40 %	20 %	40 %	0 %	339498766
108	NC_015732	CATCC	2	10	153764	153773	20 %	20 %	0 %	60 %	339498770
109	NC_015732	AACCG	2	10	154273	154282	40 %	0 %	20 %	40 %	339498771
110	NC_015732	GTGGA	2	10	154686	154695	20 %	20 %	60 %	0 %	339498771
111	NC_015732	AAAGG	2	10	161621	161630	60 %	0 %	40 %	0 %	339498778
112	NC_015732	GATCG	2	10	164213	164222	20 %	20 %	40 %	20 %	339498780
113	NC_015732	TTTAG	2	10	166212	166221	20 %	60 %	20 %	0 %	339498784
114	NC_015732	GATGA	2	10	167361	167370	40 %	20 %	40 %	0 %	339498785
115	NC_015732	TTCGG	2	10	169082	169091	0 %	40 %	40 %	20 %	339498786
116	NC_015732	GATGG	2	10	171152	171161	20 %	20 %	60 %	0 %	339498788
117	NC_015732	AAAGG	2	10	171955	171964	60 %	0 %	40 %	0 %	339498789
118	NC_015732	GTTCC	2	10	175010	175019	0 %	40 %	20 %	40 %	339498792
119	NC_015732	GGTAA	2	10	175385	175394	40 %	20 %	40 %	0 %	339498792
120	NC_015732	CCGAT	2	10	175729	175738	20 %	20 %	20 %	40 %	339498793
121	NC_015732	ATTTC	2	10	178271	178280	20 %	60 %	0 %	20 %	339498795
122	NC_015732	CAGGG	2	10	180342	180351	20 %	0 %	60 %	20 %	339498797
123	NC_015732	GCCGG	2	10	180390	180399	0 %	0 %	60 %	40 %	339498797
124	NC_015732	AGGTC	2	10	180475	180484	20 %	20 %	40 %	20 %	339498797
125	NC_015732	TCCAT	2	10	180672	180681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015732	CCATA	2	10	184266	184275	40 %	20 %	0 %	40 %	339498801
127	NC_015732	GAAAA	2	10	185287	185296	80 %	0 %	20 %	0 %	339498803
128	NC_015732	AGAAT	2	10	185696	185705	60 %	20 %	20 %	0 %	339498803
129	NC_015732	AGTTG	2	10	185728	185737	20 %	40 %	40 %	0 %	339498803
130	NC_015732	ACAGT	2	10	188440	188449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015732	CGGAT	2	10	189602	189611	20 %	20 %	40 %	20 %	339498807
132	NC_015732	AACGA	2	10	192317	192326	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015732	CAGGG	2	10	193908	193917	20 %	0 %	60 %	20 %	339498812
134	NC_015732	ATGGA	2	10	198182	198191	40 %	20 %	40 %	0 %	339498816
135	NC_015732	GCCCC	2	10	201056	201065	0 %	0 %	20 %	80 %	339498818
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138	NC_015732	TTGTA	2	10	208664	208673	20 %	60 %	20 %	0 %	339498826
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260	NC_015732	CTGTA	2	10	392413	392422	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_015732	GGTCC	2	10	395055	395064	0 %	20 %	40 %	40 %	339498988
262	NC_015732	TGGTA	2	10	398147	398156	20 %	40 %	40 %	0 %	339498990
263	NC_015732	CATCG	2	10	402305	402314	20 %	20 %	20 %	40 %	339498993
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