MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 40863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	ATT	2	6	18	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015732	CAG	2	6	87	92	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
3	NC_015732	GAA	2	6	99	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
4	NC_015732	AGA	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
5	NC_015732	ATT	3	9	159	167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498646
6	NC_015732	GAA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
7	NC_015732	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
8	NC_015732	ACA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
9	NC_015732	ACA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
10	NC_015732	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498646
11	NC_015732	ATA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
12	NC_015732	CTG	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498646
13	NC_015732	CTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
14	NC_015732	ATG	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498646
15	NC_015732	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
16	NC_015732	CCA	2	6	915	920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498646
17	NC_015732	AGC	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
18	NC_015732	CAA	2	6	1107	1112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
19	NC_015732	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
20	NC_015732	CGG	2	6	1319	1324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498646
21	NC_015732	GAA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
22	NC_015732	TTA	2	6	1459	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015732	ATA	2	6	1484	1489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015732	AGT	2	6	1492	1497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015732	ATA	2	6	1571	1576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015732	AAG	2	6	1590	1595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015732	CTA	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015732	TAC	3	9	1608	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015732	TAA	2	6	1617	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015732	AAG	2	6	1632	1637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015732	AGA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
32	NC_015732	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
33	NC_015732	TGA	3	9	2090	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
34	NC_015732	GAC	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498647
35	NC_015732	TTA	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
36	NC_015732	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
37	NC_015732	TTA	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
38	NC_015732	ATC	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498647
39	NC_015732	CCG	2	6	2381	2386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498647
40	NC_015732	GTA	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
41	NC_015732	AGA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
42	NC_015732	GAA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
43	NC_015732	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
44	NC_015732	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498648
45	NC_015732	ATC	2	6	2992	2997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
46	NC_015732	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
47	NC_015732	CCT	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498648
48	NC_015732	TAT	2	6	3092	3097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498648
49	NC_015732	ACG	3	9	3140	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
50	NC_015732	AAG	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
51	NC_015732	TCA	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
52	NC_015732	CGA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
53	NC_015732	GAT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
54	NC_015732	GAA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
55	NC_015732	GAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
56	NC_015732	CAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498649
57	NC_015732	TCG	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498649
58	NC_015732	GTT	2	6	4184	4189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498649
59	NC_015732	GGC	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498650
60	NC_015732	CGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498650
61	NC_015732	CGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498650
62	NC_015732	TTC	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498651
63	NC_015732	ATC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015732	TCC	2	6	4950	4955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015732	GAA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
66	NC_015732	TGT	2	6	5159	5164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
67	NC_015732	CCG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498652
68	NC_015732	AAC	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
69	NC_015732	CAA	2	6	5262	5267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
70	NC_015732	ATC	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
71	NC_015732	GAA	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
72	NC_015732	GTT	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
73	NC_015732	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
74	NC_015732	CAG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
75	NC_015732	TCA	2	6	5902	5907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
76	NC_015732	CTT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
77	NC_015732	TTC	2	6	6079	6084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
78	NC_015732	ACG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
79	NC_015732	CTG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498652
80	NC_015732	ATT	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498652
81	NC_015732	AAT	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
82	NC_015732	CAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
83	NC_015732	CAA	2	6	6406	6411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
84	NC_015732	TAA	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
85	NC_015732	CAG	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
86	NC_015732	AAT	2	6	6720	6725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
87	NC_015732	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
88	NC_015732	ATG	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498652
89	NC_015732	CAG	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
90	NC_015732	ATT	2	6	6849	6854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498652
91	NC_015732	GAG	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015732	AGA	2	6	7016	7021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498653
93	NC_015732	TAT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498653
94	NC_015732	GAA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498653
95	NC_015732	TTC	2	6	7313	7318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498653
96	NC_015732	GAA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498653
97	NC_015732	TTC	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498653
98	NC_015732	ACA	2	6	7554	7559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498653
99	NC_015732	TAA	2	6	7730	7735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015732	CAA	2	6	7840	7845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498654
101	NC_015732	TAT	2	6	7882	7887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
102	NC_015732	ATT	2	6	7902	7907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
103	NC_015732	TAT	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
104	NC_015732	CAT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498654
105	NC_015732	ATT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
106	NC_015732	TGG	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498654
107	NC_015732	AAC	2	6	8351	8356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498654
108	NC_015732	TAA	2	6	8617	8622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015732	GTT	2	6	8905	8910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498655
110	NC_015732	TCA	2	6	8931	8936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498655
111	NC_015732	TCT	2	6	9228	9233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498655
112	NC_015732	ATG	2	6	9285	9290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498655
113	NC_015732	TGG	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498655
114	NC_015732	CAT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498655
115	NC_015732	TAA	2	6	9535	9540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498655
116	NC_015732	TAC	2	6	9618	9623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015732	TAA	2	6	9771	9776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015732	GAT	2	6	9999	10004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498656
119	NC_015732	GTG	2	6	10020	10025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498656
120	NC_015732	GTG	2	6	10081	10086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498656
121	NC_015732	ATG	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498656
122	NC_015732	AAT	2	6	10125	10130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498656
123	NC_015732	AGT	2	6	10146	10151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498656
124	NC_015732	TTA	2	6	10203	10208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015732	ATC	2	6	10223	10228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015732	ATC	2	6	10394	10399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498657
127	NC_015732	TGT	2	6	10647	10652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498657
128	NC_015732	GAA	2	6	10720	10725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498657
129	NC_015732	GAA	2	6	10837	10842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498657
130	NC_015732	AGA	2	6	10860	10865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498657
131	NC_015732	TTA	2	6	10867	10872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498657
132	NC_015732	AAG	2	6	11075	11080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498658
133	NC_015732	ATC	2	6	11155	11160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498658
134	NC_015732	ATT	2	6	11324	11329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498659
135	NC_015732	TAT	2	6	11406	11411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498659
136	NC_015732	TGA	2	6	11479	11484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498659
137	NC_015732	TCC	2	6	11488	11493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498659
138	NC_015732	ATT	2	6	11558	11563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498659
139	NC_015732	GTC	2	6	11595	11600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498659
140	NC_015732	AGG	2	6	11616	11621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498659
141	NC_015732	GGT	2	6	11767	11772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498659
142	NC_015732	GTG	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498659
143	NC_015732	CTT	2	6	11828	11833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498659
144	NC_015732	TTC	2	6	12007	12012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498659
145	NC_015732	CTG	2	6	12042	12047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498659
146	NC_015732	ATG	2	6	12396	12401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498659
147	NC_015732	TTG	2	6	12573	12578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498660
148	NC_015732	TGA	2	6	12613	12618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498660
149	NC_015732	TGA	2	6	12621	12626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498660
150	NC_015732	ACA	2	6	12640	12645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498660
151	NC_015732	GAA	2	6	12755	12760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498660
152	NC_015732	TGG	2	6	13018	13023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498660
153	NC_015732	TTG	2	6	13068	13073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498660
154	NC_015732	GAA	2	6	13079	13084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498660
155	NC_015732	TTC	2	6	13093	13098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498660
156	NC_015732	CAG	2	6	13312	13317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498661
157	NC_015732	AAG	2	6	13328	13333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498661
158	NC_015732	TAA	2	6	13646	13651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498661
159	NC_015732	TCC	2	6	13700	13705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498661
160	NC_015732	CAT	2	6	13714	13719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498661
161	NC_015732	GTA	2	6	13812	13817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498661
162	NC_015732	TGA	2	6	14026	14031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498661
163	NC_015732	TCA	2	6	14196	14201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498661
164	NC_015732	ATC	2	6	14261	14266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498661
165	NC_015732	CTT	2	6	14284	14289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498661
166	NC_015732	TTA	2	6	14517	14522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498661
167	NC_015732	CAA	2	6	14755	14760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498661
168	NC_015732	GAA	2	6	14803	14808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015732	CAG	2	6	15002	15007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498662
170	NC_015732	TCA	2	6	15034	15039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498662
171	NC_015732	TTC	2	6	15122	15127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498662
172	NC_015732	AAC	2	6	15135	15140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498662
173	NC_015732	CCA	2	6	15490	15495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498662
174	NC_015732	GAC	3	9	15519	15527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498662
175	NC_015732	CAG	2	6	15587	15592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498662
176	NC_015732	TAA	2	6	15608	15613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498662
177	NC_015732	GTT	2	6	15863	15868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498662
178	NC_015732	GCG	2	6	15895	15900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498662
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187	NC_015732	TGA	2	6	16531	16536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498662
188	NC_015732	ATA	2	6	16644	16649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498662
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191	NC_015732	CTT	2	6	16931	16936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498662
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196	NC_015732	TTG	2	6	17324	17329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_015732	GAT	2	6	17379	17384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498663
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200	NC_015732	TCA	2	6	17606	17611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498663
201	NC_015732	TTC	2	6	17624	17629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498663
202	NC_015732	GAA	2	6	17742	17747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498663
203	NC_015732	TGA	2	6	17837	17842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498663
204	NC_015732	TGA	2	6	17915	17920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498663
205	NC_015732	TAA	2	6	17975	17980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498663
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210	NC_015732	ATC	2	6	18267	18272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498664
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239	NC_015732	CAT	2	6	20590	20595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498666
240	NC_015732	AAT	2	6	20722	20727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498666
241	NC_015732	ATC	2	6	20780	20785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498666
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243	NC_015732	GCG	2	6	20935	20940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498666
244	NC_015732	TGA	2	6	20961	20966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498666
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249	NC_015732	CAA	2	6	21346	21351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498667
250	NC_015732	TAT	2	6	21409	21414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498667
251	NC_015732	GTA	2	6	21425	21430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498667
252	NC_015732	TAT	2	6	21449	21454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498667
253	NC_015732	ATC	2	6	21503	21508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498667
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255	NC_015732	TAA	2	6	21767	21772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498668
256	NC_015732	TGT	2	6	21774	21779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498668
257	NC_015732	TGC	2	6	21873	21878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498668
258	NC_015732	TAA	2	6	21962	21967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498668
259	NC_015732	GTC	2	6	21971	21976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498668
260	NC_015732	TTG	2	6	22016	22021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015732	AAG	2	6	22034	22039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015732	AGA	2	6	22155	22160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498669
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275	NC_015732	TCA	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498669
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285	NC_015732	ATG	2	6	23877	23882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015732	GTA	2	6	23890	23895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015732	TAT	2	6	23925	23930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498670
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289	NC_015732	GTT	2	6	24016	24021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498670
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291	NC_015732	CTC	2	6	24206	24211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498670
292	NC_015732	TGG	2	6	24449	24454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498670
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