MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015731	GGAAT	2	10	24552	24561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015731	AACAA	2	10	28114	28123	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015731	TTTGT	2	10	28718	28727	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015731	CCACA	2	10	29429	29438	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015731	AAATT	2	10	43402	43411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015731	ACGGC	2	10	67101	67110	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015731	TATTT	2	10	68304	68313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015731	GGGAT	2	10	70364	70373	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015731	GCATC	2	10	75278	75287	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015731	TGCTT	2	10	75356	75365	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015731	CTATG	2	10	77708	77717	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015731	ATAAA	2	10	92197	92206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015731	ATGCT	2	10	96980	96989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015731	AGTTA	2	10	98563	98572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015731	TGATG	2	10	105877	105886	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015731	TCCTG	2	10	114288	114297	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015731	GAATT	2	10	124996	125005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015731	TTAAG	2	10	137081	137090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015731	CACTA	2	10	166320	166329	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015731	ATTTT	2	10	179393	179402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015731	AAATG	2	10	184073	184082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015731	AAAAT	2	10	185725	185734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015731	TTCTT	2	10	190959	190968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015731	TGCAG	2	10	192897	192906	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015731	AATGA	2	10	195974	195983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015731	AAAAT	2	10	207809	207818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015731	TTTTG	2	10	216554	216563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015731	AGTTG	2	10	226000	226009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015731	ATAGA	2	10	243213	243222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015731	GTATA	2	10	243599	243608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015731	AAAAT	2	10	250995	251004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015731	TATTT	2	10	252689	252698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015731	CAATA	2	10	262035	262044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015731	GTATG	2	10	271490	271499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015731	ATTTT	2	10	275342	275351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015731	GGATT	2	10	281968	281977	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015731	AAAAT	2	10	282253	282262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015731	GGGAT	2	10	282399	282408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015731	TGCCA	2	10	283869	283878	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015731	ACACA	2	10	291753	291762	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015731	TATCA	2	10	298810	298819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015731	GTTTT	2	10	301693	301702	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015731	AAAAT	2	10	306653	306662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015731	CTAAT	2	10	306708	306717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015731	ACTAA	2	10	308491	308500	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015731	CGCAC	2	10	311645	311654	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_015731	GTTAA	2	10	313073	313082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015731	AGCCA	2	10	313961	313970	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015731	ATCTA	2	10	317704	317713	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015731	CCATT	2	10	327799	327808	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015731	AAGCG	2	10	329213	329222	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015731	AATGG	2	10	329732	329741	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015731	CATGA	2	10	330949	330958	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015731	CGCTG	2	10	333293	333302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015731	CAATC	2	10	334964	334973	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015731	CAAAA	2	10	335728	335737	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015731	AATCT	2	10	335983	335992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015731	GATCT	2	10	336024	336033	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015731	GGATT	2	10	346764	346773	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015731	ATTAA	2	10	347617	347626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015731	TTATA	2	10	349444	349453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015731	TAATA	2	10	349470	349479	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015731	TTAAA	2	10	349939	349948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015731	AAGTT	2	10	367080	367089	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015731	ACAAA	2	10	368900	368909	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015731	CATTT	2	10	368953	368962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015731	TTTAT	2	10	375291	375300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015731	CAACG	2	10	377255	377264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015731	TTATT	2	10	377402	377411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015731	ATTCT	2	10	388474	388483	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015731	AGAAA	2	10	421958	421967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015731	AATTC	2	10	422891	422900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015731	GAAAA	2	10	424998	425007	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015731	ATTTC	2	10	427257	427266	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015731	GGGAT	2	10	427372	427381	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015731	GAATG	2	10	429390	429399	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015731	TATCT	2	10	429764	429773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015731	TTTGT	2	10	435047	435056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015731	TCTTA	2	10	436767	436776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015731	TTATT	2	10	445138	445147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015731	TCGAT	2	10	454238	454247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015731	TATCT	2	10	465201	465210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015731	GTTTT	2	10	465386	465395	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015731	AAATT	2	10	468131	468140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015731	GCATA	2	10	488324	488333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015731	GGGTC	2	10	500040	500049	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015731	TGACT	2	10	505180	505189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015731	TGGGG	2	10	510281	510290	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015731	CGATC	2	10	518660	518669	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015731	TTTAG	2	10	521117	521126	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015731	TAGCG	2	10	521256	521265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015731	CATTT	2	10	527858	527867	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015731	CTTTA	2	10	528141	528150	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015731	CTATT	2	10	533216	533225	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015731	TAACA	2	10	533384	533393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015731	TGGTT	2	10	545078	545087	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015731	AGGTT	2	10	546925	546934	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015731	ATTGC	2	10	552820	552829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015731	ATTCG	2	10	556637	556646	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015731	ATTTA	2	10	572615	572624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015731	TAGAT	2	10	574546	574555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015731	TGGAT	2	10	583667	583676	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015731	TTGAA	2	10	602742	602751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015731	TTAAG	2	10	614509	614518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015731	GATTG	2	10	615415	615424	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015731	CATTA	2	10	618208	618217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015731	TTGAG	2	10	629372	629381	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015731	GGTAA	2	10	633075	633084	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015731	TCGTG	2	10	633892	633901	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015731	AAAGT	2	10	634757	634766	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015731	ACCGT	2	10	636539	636548	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015731	TAATC	2	10	637885	637894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015731	TAAAC	2	10	646682	646691	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015731	ATTTT	2	10	646950	646959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015731	AACAG	2	10	666620	666629	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015731	TTTGC	2	10	677023	677032	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015731	GCAGC	2	10	678695	678704	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015731	TGTTT	2	10	678717	678726	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015731	AGATT	2	10	686371	686380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015731	TCAAT	2	10	701131	701140	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015731	AATCC	2	10	726846	726855	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015731	AAAAC	2	10	770708	770717	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015731	TCTGA	2	10	773496	773505	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015731	CGGTG	2	10	783706	783715	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015731	TAAAA	2	10	786529	786538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015731	GGAAA	2	10	786539	786548	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015731	CACGC	2	10	790536	790545	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_015731	TGGTT	2	10	802563	802572	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015731	GATAA	2	10	815961	815970	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015731	CTTGA	2	10	816830	816839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015731	TAGCG	2	10	825208	825217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015731	TCCAA	2	10	828924	828933	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015731	GATAG	2	10	833497	833506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015731	ATTGT	2	10	838977	838986	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015731	ATGGA	2	10	841115	841124	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015731	ATTGA	2	10	851040	851049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015731	GTTTG	2	10	855729	855738	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015731	ACTGC	2	10	860493	860502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_015731	AATAA	2	10	860578	860587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015731	TTTTA	2	10	872710	872719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015731	ATTTT	2	10	890525	890534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015731	ATGGT	2	10	891030	891039	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015731	ATTGT	2	10	892284	892293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015731	GGACG	2	10	940631	940640	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015731	GAGTT	2	10	947237	947246	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015731	ATTTT	2	10	969248	969257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015731	AAAAT	2	10	975620	975629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015731	GTATT	2	10	1068053	1068062	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_015731	TGAAT	2	10	1891625	1891634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015731	CTTGC	2	10	1906850	1906859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_015731	AAATA	2	10	1918918	1918927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015731	TCAAA	2	10	1919131	1919140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_015731	GTTTC	4	20	1935069	1935088	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_015731	GTTTT	2	10	3132110	3132119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_015731	TATCA	2	10	3160715	3160724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
467	NC_015731	GGTCA	2	10	3188487	3188496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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475	NC_015731	GGACA	2	10	3261124	3261133	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_015731	AGATA	2	10	3282807	3282816	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_015731	TCTCA	2	10	3286059	3286068	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
482	NC_015731	TTATT	2	10	3290171	3290180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_015731	CATGC	2	10	3290981	3290990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
484	NC_015731	TAAAA	2	10	3301543	3301552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_015731	CGATT	2	10	3310884	3310893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_015731	ATCCT	2	10	3349967	3349976	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_015731	GATCA	2	10	3462140	3462149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

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