MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 10958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015731	CAGA	2	8	38	45	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015731	TACC	2	8	838	845	25 %	25 %	0 %	50 %	339481523
3	NC_015731	AAAG	2	8	952	959	75 %	0 %	25 %	0 %	339481523
4	NC_015731	GCTG	2	8	1129	1136	0 %	25 %	50 %	25 %	339481523
5	NC_015731	ACAA	2	8	1524	1531	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015731	ATTC	2	8	1555	1562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015731	TTAA	2	8	1632	1639	50 %	50 %	0 %	0 %	339481524
8	NC_015731	TCTT	2	8	1808	1815	0 %	75 %	0 %	25 %	339481524
9	NC_015731	AGCG	2	8	3340	3347	25 %	0 %	50 %	25 %	339481525
10	NC_015731	ATGC	2	8	4675	4682	25 %	25 %	25 %	25 %	339481525
11	NC_015731	TACA	2	8	4945	4952	50 %	25 %	0 %	25 %	339481525
12	NC_015731	GCAA	2	8	5666	5673	50 %	0 %	25 %	25 %	339481526
13	NC_015731	ACGA	2	8	5824	5831	50 %	0 %	25 %	25 %	339481526
14	NC_015731	ACCG	2	8	6814	6821	25 %	0 %	25 %	50 %	339481526
15	NC_015731	GCTG	2	8	7566	7573	0 %	25 %	50 %	25 %	339481526
16	NC_015731	GGCT	2	8	7687	7694	0 %	25 %	50 %	25 %	339481526
17	NC_015731	ATCA	2	8	7909	7916	50 %	25 %	0 %	25 %	339481526
18	NC_015731	AAGC	2	8	8103	8110	50 %	0 %	25 %	25 %	339481526
19	NC_015731	GCGT	2	8	8587	8594	0 %	25 %	50 %	25 %	339481527
20	NC_015731	TCAG	2	8	9805	9812	25 %	25 %	25 %	25 %	339481527
21	NC_015731	TGGG	2	8	9867	9874	0 %	25 %	75 %	0 %	339481527
22	NC_015731	CAAA	2	8	10074	10081	75 %	0 %	0 %	25 %	339481528
23	NC_015731	CGCC	2	8	10853	10860	0 %	0 %	25 %	75 %	339481529
24	NC_015731	CAAA	2	8	11242	11249	75 %	0 %	0 %	25 %	339481530
25	NC_015731	CGAG	2	8	12573	12580	25 %	0 %	50 %	25 %	339481530
26	NC_015731	TTTG	2	8	12892	12899	0 %	75 %	25 %	0 %	339481530
27	NC_015731	AAAG	2	8	12933	12940	75 %	0 %	25 %	0 %	339481531
28	NC_015731	GCGG	2	8	13248	13255	0 %	0 %	75 %	25 %	339481531
29	NC_015731	GATT	2	8	13452	13459	25 %	50 %	25 %	0 %	339481531
30	NC_015731	CGCA	2	8	13842	13849	25 %	0 %	25 %	50 %	339481531
31	NC_015731	GATG	2	8	14561	14568	25 %	25 %	50 %	0 %	339481532
32	NC_015731	TTTG	2	8	14624	14631	0 %	75 %	25 %	0 %	339481532
33	NC_015731	ACGC	2	8	14980	14987	25 %	0 %	25 %	50 %	339481532
34	NC_015731	ACCG	2	8	15083	15090	25 %	0 %	25 %	50 %	339481532
35	NC_015731	GAAG	2	8	15116	15123	50 %	0 %	50 %	0 %	339481532
36	NC_015731	GATG	2	8	15524	15531	25 %	25 %	50 %	0 %	339481532
37	NC_015731	GGCG	2	8	15671	15678	0 %	0 %	75 %	25 %	339481532
38	NC_015731	GCAT	2	8	16559	16566	25 %	25 %	25 %	25 %	339481532
39	NC_015731	ATTT	2	8	17356	17363	25 %	75 %	0 %	0 %	339481533
40	NC_015731	TTGC	2	8	18279	18286	0 %	50 %	25 %	25 %	339481534
41	NC_015731	GAAT	2	8	18834	18841	50 %	25 %	25 %	0 %	339481534
42	NC_015731	CCGG	2	8	19502	19509	0 %	0 %	50 %	50 %	339481534
43	NC_015731	ATAA	2	8	19900	19907	75 %	25 %	0 %	0 %	339481534
44	NC_015731	ACTG	2	8	19957	19964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015731	CATG	2	8	20520	20527	25 %	25 %	25 %	25 %	339481535
46	NC_015731	TAGC	2	8	20912	20919	25 %	25 %	25 %	25 %	339481536
47	NC_015731	GAAG	2	8	21763	21770	50 %	0 %	50 %	0 %	339481538
48	NC_015731	CAGA	2	8	21785	21792	50 %	0 %	25 %	25 %	339481538
49	NC_015731	ATGG	2	8	22690	22697	25 %	25 %	50 %	0 %	339481538
50	NC_015731	ATTT	2	8	22817	22824	25 %	75 %	0 %	0 %	339481538
51	NC_015731	ATTG	2	8	22918	22925	25 %	50 %	25 %	0 %	339481538
52	NC_015731	AAGG	2	8	23000	23007	50 %	0 %	50 %	0 %	339481538
53	NC_015731	TGAC	2	8	23220	23227	25 %	25 %	25 %	25 %	339481538
54	NC_015731	ATTA	2	8	23821	23828	50 %	50 %	0 %	0 %	339481539
55	NC_015731	GAAA	2	8	23997	24004	75 %	0 %	25 %	0 %	339481539
56	NC_015731	ACGA	2	8	24088	24095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015731	TGAT	2	8	24372	24379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015731	TACC	2	8	24628	24635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015731	TGGG	2	8	25190	25197	0 %	25 %	75 %	0 %	339481541
60	NC_015731	TCGT	2	8	25515	25522	0 %	50 %	25 %	25 %	339481542
61	NC_015731	TGGA	2	8	25677	25684	25 %	25 %	50 %	0 %	339481542
62	NC_015731	TCAG	2	8	26133	26140	25 %	25 %	25 %	25 %	339481542
63	NC_015731	TGCC	2	8	26951	26958	0 %	25 %	25 %	50 %	339481543
64	NC_015731	ATCA	2	8	27043	27050	50 %	25 %	0 %	25 %	339481544
65	NC_015731	GCTG	2	8	27340	27347	0 %	25 %	50 %	25 %	339481544
66	NC_015731	GTTG	2	8	27743	27750	0 %	50 %	50 %	0 %	339481545
67	NC_015731	ATGA	2	8	28106	28113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015731	AATT	2	8	28180	28187	50 %	50 %	0 %	0 %	339481546
69	NC_015731	TTGC	2	8	28198	28205	0 %	50 %	25 %	25 %	339481546
70	NC_015731	TACT	2	8	28788	28795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015731	TCAT	2	8	29261	29268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015731	CAAA	2	8	29270	29277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015731	AATT	2	8	29619	29626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015731	AGTT	2	8	29660	29667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015731	TTTC	2	8	29763	29770	0 %	75 %	0 %	25 %	339481548
76	NC_015731	ACGC	2	8	29821	29828	25 %	0 %	25 %	50 %	339481548
77	NC_015731	TTCG	2	8	29846	29853	0 %	50 %	25 %	25 %	339481548
78	NC_015731	GCTC	2	8	31158	31165	0 %	25 %	25 %	50 %	339481548
79	NC_015731	AGTT	2	8	31718	31725	25 %	50 %	25 %	0 %	339481548
80	NC_015731	GCTG	2	8	32156	32163	0 %	25 %	50 %	25 %	339481548
81	NC_015731	TACG	2	8	32624	32631	25 %	25 %	25 %	25 %	339481548
82	NC_015731	CCGG	2	8	32998	33005	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
83	NC_015731	GCAT	2	8	33600	33607	25 %	25 %	25 %	25 %	339481548
84	NC_015731	GCCG	2	8	33669	33676	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
85	NC_015731	GGAA	2	8	34467	34474	50 %	0 %	50 %	0 %	339481548
86	NC_015731	CACG	2	8	34703	34710	25 %	0 %	25 %	50 %	339481548
87	NC_015731	GATC	2	8	35368	35375	25 %	25 %	25 %	25 %	339481548
88	NC_015731	GCAA	2	8	35839	35846	50 %	0 %	25 %	25 %	339481548
89	NC_015731	CCGG	2	8	36665	36672	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
90	NC_015731	CGCA	2	8	36783	36790	25 %	0 %	25 %	50 %	339481548
91	NC_015731	GCCG	2	8	36811	36818	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
92	NC_015731	TGGC	2	8	37197	37204	0 %	25 %	50 %	25 %	339481548
93	NC_015731	TGCC	2	8	37221	37228	0 %	25 %	25 %	50 %	339481548
94	NC_015731	TTTC	2	8	37514	37521	0 %	75 %	0 %	25 %	339481548
95	NC_015731	CAGT	2	8	37535	37542	25 %	25 %	25 %	25 %	339481548
96	NC_015731	TTGG	2	8	37728	37735	0 %	50 %	50 %	0 %	339481548
97	NC_015731	GATT	2	8	37938	37945	25 %	50 %	25 %	0 %	339481548
98	NC_015731	CAGC	2	8	38196	38203	25 %	0 %	25 %	50 %	339481548
99	NC_015731	GCCG	2	8	38326	38333	0 %	0 %	50 %	50 %	339481548
100	NC_015731	CTGC	2	8	38439	38446	0 %	25 %	25 %	50 %	339481548
101	NC_015731	ACGG	2	8	39032	39039	25 %	0 %	50 %	25 %	339481549
102	NC_015731	TGCT	2	8	39552	39559	0 %	50 %	25 %	25 %	339481549
103	NC_015731	TAAT	2	8	40137	40144	50 %	50 %	0 %	0 %	339481550
104	NC_015731	ATGC	2	8	40284	40291	25 %	25 %	25 %	25 %	339481551
105	NC_015731	CGTG	2	8	40361	40368	0 %	25 %	50 %	25 %	339481551
106	NC_015731	TTGC	2	8	40531	40538	0 %	50 %	25 %	25 %	339481551
107	NC_015731	GTGC	2	8	40591	40598	0 %	25 %	50 %	25 %	339481551
108	NC_015731	CGAG	2	8	40665	40672	25 %	0 %	50 %	25 %	339481551
109	NC_015731	GCCT	2	8	41665	41672	0 %	25 %	25 %	50 %	339481552
110	NC_015731	GGAA	2	8	41959	41966	50 %	0 %	50 %	0 %	339481552
111	NC_015731	CTGC	2	8	41992	41999	0 %	25 %	25 %	50 %	339481552
112	NC_015731	CGGG	2	8	42061	42068	0 %	0 %	75 %	25 %	339481552
113	NC_015731	ATGC	2	8	42113	42120	25 %	25 %	25 %	25 %	339481552
114	NC_015731	TTAT	2	8	42221	42228	25 %	75 %	0 %	0 %	339481552
115	NC_015731	AGCG	2	8	42429	42436	25 %	0 %	50 %	25 %	339481552
116	NC_015731	AGAA	2	8	42459	42466	75 %	0 %	25 %	0 %	339481552
117	NC_015731	AATA	2	8	43094	43101	75 %	25 %	0 %	0 %	339481553
118	NC_015731	GTCA	2	8	43102	43109	25 %	25 %	25 %	25 %	339481553
119	NC_015731	TCAG	2	8	43648	43655	25 %	25 %	25 %	25 %	339481554
120	NC_015731	GCAG	2	8	43672	43679	25 %	0 %	50 %	25 %	339481554
121	NC_015731	CGCA	2	8	43828	43835	25 %	0 %	25 %	50 %	339481554
122	NC_015731	GGAT	2	8	43971	43978	25 %	25 %	50 %	0 %	339481554
123	NC_015731	AATC	2	8	44006	44013	50 %	25 %	0 %	25 %	339481554
124	NC_015731	TCCT	2	8	44300	44307	0 %	50 %	0 %	50 %	339481554
125	NC_015731	GATC	2	8	44330	44337	25 %	25 %	25 %	25 %	339481554
126	NC_015731	TTGC	2	8	44362	44369	0 %	50 %	25 %	25 %	339481554
127	NC_015731	GGTT	2	8	44573	44580	0 %	50 %	50 %	0 %	339481554
128	NC_015731	GCTG	2	8	44879	44886	0 %	25 %	50 %	25 %	339481554
129	NC_015731	ATGG	2	8	44965	44972	25 %	25 %	50 %	0 %	339481554
130	NC_015731	AAGG	2	8	45165	45172	50 %	0 %	50 %	0 %	339481554
131	NC_015731	CCTG	2	8	45531	45538	0 %	25 %	25 %	50 %	339481555
132	NC_015731	CTAT	2	8	45619	45626	25 %	50 %	0 %	25 %	339481555
133	NC_015731	GTCG	2	8	45891	45898	0 %	25 %	50 %	25 %	339481555
134	NC_015731	TGCT	2	8	46036	46043	0 %	50 %	25 %	25 %	339481555
135	NC_015731	TGAA	2	8	46075	46082	50 %	25 %	25 %	0 %	339481555
136	NC_015731	GCTG	2	8	46555	46562	0 %	25 %	50 %	25 %	339481555
137	NC_015731	TTGA	2	8	46647	46654	25 %	50 %	25 %	0 %	339481555
138	NC_015731	TGGT	2	8	47114	47121	0 %	50 %	50 %	0 %	339481555
139	NC_015731	CTGG	2	8	47646	47653	0 %	25 %	50 %	25 %	339481555
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141	NC_015731	AGCA	2	8	48775	48782	50 %	0 %	25 %	25 %	339481556
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