MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 7163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015731	AAC	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015731	CTT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015731	TTG	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015731	TAT	2	6	1608	1613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015731	AAT	2	6	16772	16777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015731	TGA	2	6	16820	16825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015731	ACG	2	6	16845	16850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015731	GTT	2	6	19929	19934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015731	ATT	2	6	19984	19989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015731	TGG	2	6	20153	20158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015731	TGT	2	6	20199	20204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015731	GTT	2	6	20670	20675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015731	GTA	2	6	20711	20716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015731	ATA	2	6	21436	21441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015731	AAG	2	6	24052	24057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015731	GTG	2	6	24115	24120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015731	AAT	2	6	24178	24183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015731	TCA	2	6	24193	24198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015731	GAA	2	6	24210	24215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015731	CAA	2	6	24249	24254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015731	CTG	2	6	24275	24280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015731	TGC	2	6	24390	24395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015731	TCA	2	6	24415	24420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015731	TCG	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015731	TAC	2	6	24605	24610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015731	GAA	2	6	26418	26423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015731	ATT	2	6	26541	26546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015731	AAT	2	6	28621	28626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015731	CCT	2	6	28636	28641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015731	TCA	2	6	28662	28667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015731	TAA	2	6	28696	28701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015731	TTG	2	6	29193	29198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015731	ATT	2	6	29241	29246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015731	AAG	2	6	29318	29323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015731	AGC	2	6	29356	29361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015731	TGA	2	6	29526	29531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015731	CAA	2	6	29586	29591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015731	ATC	2	6	29597	29602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015731	ATA	2	6	39853	39858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015731	TGT	2	6	39862	39867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015731	TGC	2	6	40246	40251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015731	AAG	2	6	40274	40279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015731	ATT	2	6	42773	42778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015731	AGG	2	6	42786	42791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015731	TAA	2	6	43120	43125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015731	CAC	2	6	43173	43178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015731	TTG	2	6	43311	43316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015731	GGC	2	6	43361	43366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015731	AAG	2	6	45206	45211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015731	AGA	2	6	47800	47805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015731	CAG	2	6	47833	47838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015731	GTT	2	6	63538	63543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015731	TTC	2	6	63594	63599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015731	ATA	2	6	64450	64455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015731	TGA	2	6	64520	64525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015731	CCA	2	6	64560	64565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015731	TTA	2	6	66155	66160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015731	CCT	2	6	66833	66838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015731	ACC	2	6	66926	66931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015731	AGT	2	6	67072	67077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015731	ACT	2	6	67247	67252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015731	CTT	2	6	67274	67279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015731	CTA	2	6	68137	68142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015731	AGG	2	6	68486	68491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015731	AGC	2	6	68555	68560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015731	CTG	2	6	68685	68690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015731	GAC	2	6	68713	68718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015731	AGC	2	6	68726	68731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015731	TTA	2	6	68742	68747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015731	TTG	2	6	68922	68927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015731	TTA	2	6	69070	69075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015731	TTA	2	6	71608	71613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015731	ATC	2	6	71621	71626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015731	CAA	2	6	71672	71677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015731	ATT	3	9	71855	71863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015731	AAT	2	6	71864	71869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015731	TCT	2	6	71882	71887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015731	AGT	2	6	72136	72141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015731	GAT	2	6	74465	74470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015731	CAT	2	6	74521	74526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015731	TGC	2	6	74537	74542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015731	TAA	2	6	74745	74750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015731	TAT	2	6	74949	74954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015731	GTT	2	6	74971	74976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015731	CTG	2	6	75044	75049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015731	TTA	2	6	75123	75128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015731	TAA	3	9	75200	75208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015731	CAG	2	6	75343	75348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015731	CAG	2	6	75476	75481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015731	GCC	2	6	76398	76403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015731	ATT	2	6	76443	76448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015731	TAT	2	6	76462	76467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015731	TCA	2	6	76482	76487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015731	TGA	2	6	77589	77594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015731	AAC	2	6	77698	77703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015731	ATC	2	6	79064	79069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015731	TTG	2	6	79198	79203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015731	GGT	3	9	79454	79462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015731	ATA	2	6	80250	80255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015731	AAT	2	6	80270	80275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015731	ACA	2	6	80341	80346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015731	TAA	2	6	80397	80402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015731	GAG	2	6	81196	81201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015731	CTA	2	6	81205	81210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015731	AAT	2	6	81517	81522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015731	AAT	2	6	82026	82031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015731	AAT	2	6	82048	82053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015731	AAC	2	6	82113	82118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015731	TAA	2	6	82163	82168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015731	CGA	2	6	82213	82218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015731	ATA	2	6	82541	82546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015731	CTA	2	6	82913	82918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015731	TCA	2	6	82981	82986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015731	GCT	2	6	83011	83016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015731	GTA	2	6	84433	84438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015731	TGC	2	6	85817	85822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015731	GGT	2	6	85910	85915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015731	AAC	2	6	85960	85965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015731	TTG	2	6	86004	86009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015731	GAT	2	6	86018	86023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015731	AAC	2	6	86158	86163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015731	CTC	2	6	92008	92013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015731	GAT	2	6	92229	92234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015731	ATG	2	6	92823	92828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015731	TCA	2	6	92870	92875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015731	ATC	2	6	92894	92899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015731	CCA	2	6	93059	93064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015731	ATA	2	6	93136	93141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015731	TAA	2	6	93201	93206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015731	GTG	2	6	93222	93227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015731	TAA	2	6	93379	93384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015731	CCG	2	6	93915	93920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015731	TTA	2	6	93966	93971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015731	AGA	2	6	94126	94131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015731	ATT	2	6	94679	94684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015731	CGG	2	6	94768	94773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015731	ACT	2	6	94824	94829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015731	TCT	2	6	94870	94875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015731	AAT	2	6	95068	95073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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