MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015730	CCGGGA	2	12	46388	46399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015730	TTCAGA	2	12	241020	241031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015730	GAATTG	2	12	274756	274767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015730	GATCAG	2	12	417614	417625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015730	CGCAAC	2	12	512424	512435	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015730	CGGCGC	2	12	713124	713135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015730	CATTAC	2	12	752111	752122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015730	AGTCTG	2	12	788349	788360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015730	CGGCGT	2	12	796513	796524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015730	GGTGGC	2	12	917500	917511	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015730	CGGCAT	2	12	917625	917636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015730	CTGCAT	2	12	925186	925197	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015730	CACAGT	2	12	943554	943565	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015730	CTGCAC	2	12	960657	960668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015730	TTTTGC	2	12	962410	962421	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015730	ATCCGC	2	12	963125	963136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015730	CGGCGC	2	12	974157	974168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015730	CTCACG	2	12	989446	989457	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015730	AAATGT	2	12	1043546	1043557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015730	TCCGCC	2	12	1050626	1050637	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015730	TATTGT	2	12	1074147	1074158	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015730	CTGCAC	2	12	1106071	1106082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015730	AAAGAC	2	12	1588126	1588137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015730	ATGCAG	2	12	1603857	1603868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015730	AACCGC	2	12	1679406	1679417	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015730	TAAAAA	2	12	1755266	1755277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015730	GGGGCA	2	12	1778287	1778298	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015730	GGCACA	2	12	1784038	1784049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015730	CTATCT	2	12	1799660	1799671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015730	CTAGAG	2	12	1924848	1924859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015730	GGGATG	2	12	1962676	1962687	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015730	TTTCCT	2	12	2085789	2085800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015730	GTTCCT	2	12	2104058	2104069	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015730	GCGCAA	2	12	2116315	2116326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015730	CCGGTG	2	12	2249518	2249529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015730	TTGGAT	2	12	2268504	2268515	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015730	AAACGC	2	12	2272370	2272381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015730	TGGCGA	2	12	2272883	2272894	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015730	GCAAAA	2	12	2291216	2291227	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015730	TTCCTT	2	12	2294350	2294361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015730	AAAGGT	2	12	2315641	2315652	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015730	AGGTGG	3	18	2330097	2330114	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015730	CTGATT	2	12	2366759	2366770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015730	TCAGGT	2	12	2389359	2389370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015730	GCCCTT	2	12	2440587	2440598	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015730	GATCTT	2	12	2475987	2475998	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015730	ACGCCG	2	12	2662115	2662126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015730	CCAAGC	2	12	2675182	2675193	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015730	CGGATG	2	12	2748710	2748721	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015730	AACTGT	2	12	2766539	2766550	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015730	GAAAAA	2	12	2770520	2770531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015730	CGTTTG	2	12	2798553	2798564	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015730	GTTTTT	2	12	2814491	2814502	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015730	GCGCGA	2	12	2857741	2857752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015730	CACCGC	2	12	2858470	2858481	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015730	CCCTGC	2	12	2859890	2859901	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015730	AAGAGG	2	12	2869178	2869189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015730	GGCGCA	2	12	2869398	2869409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015730	CGGGTC	2	12	2913026	2913037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015730	ACCCAA	2	12	2939209	2939220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015730	CCTGGC	2	12	2971491	2971502	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015730	TCGGCC	2	12	3061303	3061314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015730	CACAAA	2	12	3097379	3097390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015730	ATTGCG	2	12	3116911	3116922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015730	GCTTTA	2	12	3125852	3125863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015730	ATCAGA	2	12	3200142	3200153	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015730	CATATT	2	12	3278186	3278197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015730	CAGTTC	2	12	3318361	3318372	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015730	CAAAAT	2	12	3427804	3427815	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015730	TGCGCG	2	12	3445251	3445262	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015730	GCTTGC	2	12	3509080	3509091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015730	GATACA	2	12	3600853	3600864	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015730	AGTGCA	2	12	3655094	3655105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015730	AAACGG	2	12	3662598	3662609	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015730	CAACCA	2	12	3662671	3662682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015730	AAAAGA	2	12	3684005	3684016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015730	ATTACA	2	12	3690819	3690830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015730	ATTTGT	2	12	3698385	3698396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015730	AAGGCG	2	12	3711773	3711784	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015730	GTCGCC	2	12	3716428	3716439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015730	AAACGC	2	12	3728566	3728577	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015730	GCCGAG	2	12	3745929	3745940	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015730	GCCGGA	2	12	3746359	3746370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015730	TGCATC	2	12	3746901	3746912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015730	CGTCGC	2	12	3747242	3747253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015730	TTATTT	2	12	3843251	3843262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015730	CCGGAT	2	12	3863059	3863070	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015730	GGTTCA	2	12	4023736	4023747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015730	CGGCGC	2	12	4050323	4050334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015730	CCCGCT	2	12	4052225	4052236	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015730	CCGGAT	2	12	4073077	4073088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015730	CTGCTC	2	12	4246925	4246936	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015730	CGGCGA	2	12	4367652	4367663	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.