MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 3423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015730	CGGAC	2	10	368	377	20 %	0 %	40 %	40 %	339501578
2	NC_015730	GTTGG	2	10	566	575	0 %	40 %	60 %	0 %	339501578
3	NC_015730	CCGTG	2	10	2417	2426	0 %	20 %	40 %	40 %	339501579
4	NC_015730	GCGCC	2	10	2945	2954	0 %	0 %	40 %	60 %	339501580
5	NC_015730	GGTTT	2	10	7004	7013	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015730	TCAGG	2	10	7088	7097	20 %	20 %	40 %	20 %	339501583
7	NC_015730	GGGGA	2	10	8418	8427	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015730	CGACG	2	10	8808	8817	20 %	0 %	40 %	40 %	339501585
9	NC_015730	AACCG	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	339501586
10	NC_015730	GCAAT	2	10	10340	10349	40 %	20 %	20 %	20 %	339501586
11	NC_015730	GGTGC	2	10	11265	11274	0 %	20 %	60 %	20 %	339501587
12	NC_015730	GCGCT	2	10	12372	12381	0 %	20 %	40 %	40 %	339501588
13	NC_015730	CATCG	2	10	12515	12524	20 %	20 %	20 %	40 %	339501588
14	NC_015730	ACGGA	2	10	14565	14574	40 %	0 %	40 %	20 %	339501590
15	NC_015730	GGCCG	2	10	16168	16177	0 %	0 %	60 %	40 %	339501591
16	NC_015730	GTCAG	2	10	16747	16756	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015730	GGCAC	2	10	17763	17772	20 %	0 %	40 %	40 %	339501592
18	NC_015730	CGACC	2	10	18776	18785	20 %	0 %	20 %	60 %	339501593
19	NC_015730	AAGGC	2	10	19001	19010	40 %	0 %	40 %	20 %	339501594
20	NC_015730	TGTGC	2	10	19176	19185	0 %	40 %	40 %	20 %	339501594
21	NC_015730	CGATG	2	10	19566	19575	20 %	20 %	40 %	20 %	339501594
22	NC_015730	ACTGG	2	10	22017	22026	20 %	20 %	40 %	20 %	339501597
23	NC_015730	GGGCC	2	10	22035	22044	0 %	0 %	60 %	40 %	339501597
24	NC_015730	CGGGT	2	10	22528	22537	0 %	20 %	60 %	20 %	339501597
25	NC_015730	CCCTT	2	10	23073	23082	0 %	40 %	0 %	60 %	339501598
26	NC_015730	GCCTT	2	10	23165	23174	0 %	40 %	20 %	40 %	339501598
27	NC_015730	GCGCT	2	10	23995	24004	0 %	20 %	40 %	40 %	339501598
28	NC_015730	TGCCA	2	10	26357	26366	20 %	20 %	20 %	40 %	339501601
29	NC_015730	AACAG	2	10	29498	29507	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015730	TGATC	2	10	30724	30733	20 %	40 %	20 %	20 %	339501604
31	NC_015730	CGGCG	2	10	30914	30923	0 %	0 %	60 %	40 %	339501604
32	NC_015730	CGGGG	2	10	33652	33661	0 %	0 %	80 %	20 %	339501607
33	NC_015730	TGCGC	2	10	34061	34070	0 %	20 %	40 %	40 %	339501607
34	NC_015730	GATCT	2	10	37065	37074	20 %	40 %	20 %	20 %	339501610
35	NC_015730	GCATC	2	10	37500	37509	20 %	20 %	20 %	40 %	339501611
36	NC_015730	CGTTG	2	10	37585	37594	0 %	40 %	40 %	20 %	339501611
37	NC_015730	AAATC	2	10	39843	39852	60 %	20 %	0 %	20 %	339501613
38	NC_015730	GCGGT	2	10	39945	39954	0 %	20 %	60 %	20 %	339501613
39	NC_015730	GGTCA	2	10	44668	44677	20 %	20 %	40 %	20 %	339501618
40	NC_015730	TCGAT	2	10	46150	46159	20 %	40 %	20 %	20 %	339501619
41	NC_015730	AGCCA	2	10	47152	47161	40 %	0 %	20 %	40 %	339501620
42	NC_015730	CGCTT	2	10	48699	48708	0 %	40 %	20 %	40 %	339501620
43	NC_015730	TGCAT	2	10	49599	49608	20 %	40 %	20 %	20 %	339501621
44	NC_015730	GCGGT	2	10	51935	51944	0 %	20 %	60 %	20 %	339501625
45	NC_015730	GGCAA	2	10	52279	52288	40 %	0 %	40 %	20 %	339501625
46	NC_015730	AATCA	2	10	52914	52923	60 %	20 %	0 %	20 %	339501625
47	NC_015730	GCGCT	2	10	57569	57578	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015730	AAGCC	2	10	57782	57791	40 %	0 %	20 %	40 %	339501631
49	NC_015730	TCCCC	2	10	58758	58767	0 %	20 %	0 %	80 %	339501631
50	NC_015730	TGATC	2	10	65447	65456	20 %	40 %	20 %	20 %	339501634
51	NC_015730	GGTCG	2	10	66307	66316	0 %	20 %	60 %	20 %	339501635
52	NC_015730	TGGAC	2	10	67440	67449	20 %	20 %	40 %	20 %	339501637
53	NC_015730	GTTGC	2	10	69028	69037	0 %	40 %	40 %	20 %	339501639
54	NC_015730	GCGGT	2	10	70793	70802	0 %	20 %	60 %	20 %	339501641
55	NC_015730	ATATC	2	10	74692	74701	40 %	40 %	0 %	20 %	339501644
56	NC_015730	AACTG	2	10	76292	76301	40 %	20 %	20 %	20 %	339501647
57	NC_015730	GTCCA	2	10	77788	77797	20 %	20 %	20 %	40 %	339501648
58	NC_015730	TTTCC	2	10	80293	80302	0 %	60 %	0 %	40 %	339501650
59	NC_015730	GGCAT	2	10	80826	80835	20 %	20 %	40 %	20 %	339501650
60	NC_015730	TTGCC	2	10	81743	81752	0 %	40 %	20 %	40 %	339501651
61	NC_015730	TTTGT	2	10	83128	83137	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015730	CGATG	2	10	83345	83354	20 %	20 %	40 %	20 %	339501653
63	NC_015730	TCGCC	2	10	84894	84903	0 %	20 %	20 %	60 %	339501654
64	NC_015730	TTCCC	2	10	87028	87037	0 %	40 %	0 %	60 %	339501655
65	NC_015730	GCTTG	2	10	88527	88536	0 %	40 %	40 %	20 %	339501658
66	NC_015730	GAACA	2	10	89184	89193	60 %	0 %	20 %	20 %	339501659
67	NC_015730	GGGCG	2	10	91457	91466	0 %	0 %	80 %	20 %	339501662
68	NC_015730	GGACG	2	10	91931	91940	20 %	0 %	60 %	20 %	339501662
69	NC_015730	TCGGA	2	10	91973	91982	20 %	20 %	40 %	20 %	339501662
70	NC_015730	GGGCA	2	10	92758	92767	20 %	0 %	60 %	20 %	339501663
71	NC_015730	CGGCG	2	10	92987	92996	0 %	0 %	60 %	40 %	339501663
72	NC_015730	GCCAT	2	10	93352	93361	20 %	20 %	20 %	40 %	339501663
73	NC_015730	TGCCT	2	10	93753	93762	0 %	40 %	20 %	40 %	339501664
74	NC_015730	CGACG	2	10	94805	94814	20 %	0 %	40 %	40 %	339501664
75	NC_015730	AAATG	2	10	94856	94865	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015730	GGGCG	2	10	95540	95549	0 %	0 %	80 %	20 %	339501665
77	NC_015730	CTGAT	2	10	96034	96043	20 %	40 %	20 %	20 %	339501666
78	NC_015730	GATCA	2	10	96703	96712	40 %	20 %	20 %	20 %	339501667
79	NC_015730	TGATC	2	10	97531	97540	20 %	40 %	20 %	20 %	339501668
80	NC_015730	TGCGG	2	10	98191	98200	0 %	20 %	60 %	20 %	339501669
81	NC_015730	GACGG	2	10	98912	98921	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015730	TACCG	2	10	99781	99790	20 %	20 %	20 %	40 %	339501672
83	NC_015730	TTTCA	2	10	100245	100254	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015730	GCGCC	2	10	102053	102062	0 %	0 %	40 %	60 %	339501676
85	NC_015730	CAAAC	2	10	106750	106759	60 %	0 %	0 %	40 %	339501682
86	NC_015730	GCAAG	2	10	107010	107019	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015730	CGCTT	2	10	108081	108090	0 %	40 %	20 %	40 %	339501683
88	NC_015730	CTGCC	2	10	110692	110701	0 %	20 %	20 %	60 %	339501686
89	NC_015730	TTGCT	2	10	112143	112152	0 %	60 %	20 %	20 %	339501688
90	NC_015730	CGGAT	2	10	112182	112191	20 %	20 %	40 %	20 %	339501688
91	NC_015730	CTTGT	2	10	115203	115212	0 %	60 %	20 %	20 %	339501689
92	NC_015730	GTGAG	2	10	120091	120100	20 %	20 %	60 %	0 %	339501695
93	NC_015730	TGGGC	2	10	121274	121283	0 %	20 %	60 %	20 %	339501697
94	NC_015730	GTTTT	2	10	124651	124660	0 %	80 %	20 %	0 %	339501701
95	NC_015730	TGTCC	2	10	126264	126273	0 %	40 %	20 %	40 %	339501702
96	NC_015730	CGATC	2	10	127296	127305	20 %	20 %	20 %	40 %	339501703
97	NC_015730	AGGCA	2	10	128148	128157	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015730	TGACC	2	10	131253	131262	20 %	20 %	20 %	40 %	339501706
99	NC_015730	CTTTG	2	10	131887	131896	0 %	60 %	20 %	20 %	339501707
100	NC_015730	TTTCC	2	10	133455	133464	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015730	CGATA	2	10	133992	134001	40 %	20 %	20 %	20 %	339501712
102	NC_015730	CAGCA	2	10	134818	134827	40 %	0 %	20 %	40 %	339501713
103	NC_015730	TGGTC	2	10	137117	137126	0 %	40 %	40 %	20 %	339501715
104	NC_015730	TTTCC	2	10	137330	137339	0 %	60 %	0 %	40 %	339501715
105	NC_015730	ATCTG	2	10	139690	139699	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015730	CAGCC	2	10	143207	143216	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_015730	CAGCC	2	10	144109	144118	20 %	0 %	20 %	60 %	339501723
108	NC_015730	CGGGC	2	10	145332	145341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015730	AGCGA	2	10	145996	146005	40 %	0 %	40 %	20 %	339501725
110	NC_015730	GGTGC	2	10	146545	146554	0 %	20 %	60 %	20 %	339501725
111	NC_015730	TGCGC	2	10	146793	146802	0 %	20 %	40 %	40 %	339501725
112	NC_015730	GTCGC	2	10	149345	149354	0 %	20 %	40 %	40 %	339501728
113	NC_015730	TGGGA	2	10	150657	150666	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015730	CATTG	2	10	151714	151723	20 %	40 %	20 %	20 %	339501731
115	NC_015730	CGCGC	2	10	152706	152715	0 %	0 %	40 %	60 %	339501733
116	NC_015730	GCCGG	2	10	155499	155508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015730	GGTCG	2	10	156652	156661	0 %	20 %	60 %	20 %	339501738
118	NC_015730	GACGC	2	10	158252	158261	20 %	0 %	40 %	40 %	339501740
119	NC_015730	CGGGC	2	10	159982	159991	0 %	0 %	60 %	40 %	339501742
120	NC_015730	GCATT	2	10	160047	160056	20 %	40 %	20 %	20 %	339501742
121	NC_015730	TTGGG	2	10	160393	160402	0 %	40 %	60 %	0 %	339501743
122	NC_015730	TGAAA	2	10	161683	161692	60 %	20 %	20 %	0 %	339501744
123	NC_015730	GGTAC	2	10	162861	162870	20 %	20 %	40 %	20 %	339501745
124	NC_015730	TCAGT	2	10	163064	163073	20 %	40 %	20 %	20 %	339501745
125	NC_015730	GACAA	2	10	163095	163104	60 %	0 %	20 %	20 %	339501745
126	NC_015730	TGCCA	2	10	165583	165592	20 %	20 %	20 %	40 %	339501748
127	NC_015730	GTGCG	2	10	167966	167975	0 %	20 %	60 %	20 %	339501750
128	NC_015730	CCCGT	2	10	169747	169756	0 %	20 %	20 %	60 %	339501753
129	NC_015730	ATCCA	2	10	171573	171582	40 %	20 %	0 %	40 %	339501755
130	NC_015730	CGTTG	2	10	171759	171768	0 %	40 %	40 %	20 %	339501755
131	NC_015730	AACGC	2	10	173017	173026	40 %	0 %	20 %	40 %	339501755
132	NC_015730	GCCCA	2	10	173292	173301	20 %	0 %	20 %	60 %	339501755
133	NC_015730	GATCG	2	10	176415	176424	20 %	20 %	40 %	20 %	339501759
134	NC_015730	TTGCC	2	10	179684	179693	0 %	40 %	20 %	40 %	339501760
135	NC_015730	TCGCG	2	10	180220	180229	0 %	20 %	40 %	40 %	339501761
136	NC_015730	TCGGG	2	10	181414	181423	0 %	20 %	60 %	20 %	339501761
137	NC_015730	CGGGT	2	10	181533	181542	0 %	20 %	60 %	20 %	339501761
138	NC_015730	GCCGA	2	10	181854	181863	20 %	0 %	40 %	40 %	339501761
139	NC_015730	TTGAT	2	10	183672	183681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015730	GCCGC	2	10	188872	188881	0 %	0 %	40 %	60 %	339501767
141	NC_015730	GGCGC	2	10	191468	191477	0 %	0 %	60 %	40 %	339501769
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148	NC_015730	TGCGC	2	10	197860	197869	0 %	20 %	40 %	40 %	339501774
149	NC_015730	CATGC	2	10	198065	198074	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_015730	ACCGC	2	10	200402	200411	20 %	0 %	20 %	60 %	339501778
151	NC_015730	CGGGC	2	10	200616	200625	0 %	0 %	60 %	40 %	339501778
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154	NC_015730	GACCG	2	10	201917	201926	20 %	0 %	40 %	40 %	339501780
155	NC_015730	TGATC	2	10	202863	202872	20 %	40 %	20 %	20 %	339501781
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158	NC_015730	CTTGC	2	10	205230	205239	0 %	40 %	20 %	40 %	339501783
159	NC_015730	GTCAT	2	10	207425	207434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_015730	AAGCA	2	10	210838	210847	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_015730	ATTTT	2	10	213219	213228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015730	GATTG	2	10	213253	213262	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015730	CAGCC	2	10	219225	219234	20 %	0 %	20 %	60 %	339501798
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171	NC_015730	TGCGG	2	10	227795	227804	0 %	20 %	60 %	20 %	339501802
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175	NC_015730	ACGCG	2	10	231650	231659	20 %	0 %	40 %	40 %	339501805
176	NC_015730	GCGCG	2	10	232798	232807	0 %	0 %	60 %	40 %	339501806
177	NC_015730	GCTGT	2	10	236200	236209	0 %	40 %	40 %	20 %	339501809
178	NC_015730	AGCTT	2	10	236791	236800	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_015730	GGCTG	2	10	237351	237360	0 %	20 %	60 %	20 %	339501810
180	NC_015730	ATGAC	2	10	237438	237447	40 %	20 %	20 %	20 %	339501810
181	NC_015730	ACGCC	2	10	239254	239263	20 %	0 %	20 %	60 %	339501812
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184	NC_015730	AGTTG	2	10	241392	241401	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015730	TGCGA	2	10	241859	241868	20 %	20 %	40 %	20 %	339501816
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191	NC_015730	GACAG	2	10	250816	250825	40 %	0 %	40 %	20 %	339501826
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201	NC_015730	ACGGC	2	10	268168	268177	20 %	0 %	40 %	40 %	339501843
202	NC_015730	CGTCT	2	10	269145	269154	0 %	40 %	20 %	40 %	339501844
203	NC_015730	GATCA	2	10	269844	269853	40 %	20 %	20 %	20 %	339501845
204	NC_015730	AGATG	2	10	270236	270245	40 %	20 %	40 %	0 %	339501846
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206	NC_015730	GCGCA	2	10	270998	271007	20 %	0 %	40 %	40 %	339501846
207	NC_015730	GGTAC	2	10	271595	271604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
208	NC_015730	GCACC	2	10	271628	271637	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
209	NC_015730	GCGCG	2	10	271870	271879	0 %	0 %	60 %	40 %	339501847
210	NC_015730	CGGGG	2	10	272769	272778	0 %	0 %	80 %	20 %	339501849
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216	NC_015730	TCCGG	2	10	284889	284898	0 %	20 %	40 %	40 %	339501863
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219	NC_015730	CAGAT	2	10	292712	292721	40 %	20 %	20 %	20 %	339501869
220	NC_015730	AGCGC	2	10	293147	293156	20 %	0 %	40 %	40 %	339501870
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237	NC_015730	TGGTG	2	10	315454	315463	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
238	NC_015730	TTGTA	2	10	315670	315679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_015730	GACCC	2	10	317213	317222	20 %	0 %	20 %	60 %	339501889
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248	NC_015730	TCACC	2	10	326079	326088	20 %	20 %	0 %	60 %	339501889
249	NC_015730	CGATC	2	10	328472	328481	20 %	20 %	20 %	40 %	339501891
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252	NC_015730	TGCCG	2	10	330080	330089	0 %	20 %	40 %	40 %	339501891
253	NC_015730	CGGCG	2	10	330730	330739	0 %	0 %	60 %	40 %	339501892
254	NC_015730	TCAAA	2	10	334400	334409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_015730	GGGCA	2	10	335102	335111	20 %	0 %	60 %	20 %	339501896
256	NC_015730	CAATC	2	10	337825	337834	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
257	NC_015730	CTGCC	2	10	337977	337986	0 %	20 %	20 %	60 %	339501899
258	NC_015730	TTGTT	2	10	339270	339279	0 %	80 %	20 %	0 %	339501900
259	NC_015730	TGCGC	2	10	346191	346200	0 %	20 %	40 %	40 %	339501905
260	NC_015730	TGGCG	2	10	346739	346748	0 %	20 %	60 %	20 %	339501905
261	NC_015730	GGGTG	2	10	348025	348034	0 %	20 %	80 %	0 %	339501906
262	NC_015730	AAGGG	2	10	348087	348096	40 %	0 %	60 %	0 %	339501907
263	NC_015730	CAGAT	2	10	349617	349626	40 %	20 %	20 %	20 %	339501907
264	NC_015730	GCTTG	2	10	350944	350953	0 %	40 %	40 %	20 %	339501908
265	NC_015730	CAGCG	2	10	352015	352024	20 %	0 %	40 %	40 %	339501909
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