MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	CGGCCA	2	12	5285	5296	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339501440
2	NC_015729	ATAGCC	2	12	5862	5873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339501440
3	NC_015729	GCTGGG	2	12	6944	6955	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339501441
4	NC_015729	GCGCCG	2	12	10142	10153	0 %	0 %	50 %	50 %	339501442
5	NC_015729	CCAGGC	2	12	17986	17997	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339501449
6	NC_015729	GCCGAT	2	12	20958	20969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501452
7	NC_015729	TGGATG	2	12	20975	20986	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	339501452
8	NC_015729	CAAGGA	2	12	21759	21770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	339501452
9	NC_015729	GCCCCG	2	12	36846	36857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501460
10	NC_015729	CTCGGC	2	12	40440	40451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339501463
11	NC_015729	GCGCTG	2	12	42526	42537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339501466
12	NC_015729	CCAGCA	2	12	43773	43784	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339501466
13	NC_015729	CTGAAC	2	12	54402	54413	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339501475
14	NC_015729	TGGATC	2	12	55219	55230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339501476
15	NC_015729	CCAGCG	2	12	58645	58656	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339501478
16	NC_015729	GGCGCA	2	12	59419	59430	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339501479
17	NC_015729	CGGCAT	2	12	60041	60052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501480
18	NC_015729	AGCCTG	2	12	61209	61220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501480
19	NC_015729	CGTCAG	2	12	62841	62852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.