MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	TGATC	2	10	826	835	20 %	40 %	20 %	20 %	339501436
2	NC_015729	GTTGA	2	10	4392	4401	20 %	40 %	40 %	0 %	339501439
3	NC_015729	CGTGC	2	10	5092	5101	0 %	20 %	40 %	40 %	339501440
4	NC_015729	TCCGG	2	10	5473	5482	0 %	20 %	40 %	40 %	339501440
5	NC_015729	CCGCC	2	10	14081	14090	0 %	0 %	20 %	80 %	339501444
6	NC_015729	TGCAG	2	10	16134	16143	20 %	20 %	40 %	20 %	339501447
7	NC_015729	GCTTG	2	10	17519	17528	0 %	40 %	40 %	20 %	339501448
8	NC_015729	CCCAG	2	10	18036	18045	20 %	0 %	20 %	60 %	339501449
9	NC_015729	GCCAT	2	10	18569	18578	20 %	20 %	20 %	40 %	339501449
10	NC_015729	GAAGA	2	10	18593	18602	60 %	0 %	40 %	0 %	339501449
11	NC_015729	CGCAT	2	10	18626	18635	20 %	20 %	20 %	40 %	339501449
12	NC_015729	CTCAG	2	10	22039	22048	20 %	20 %	20 %	40 %	339501452
13	NC_015729	GTGCG	2	10	22175	22184	0 %	20 %	60 %	20 %	339501452
14	NC_015729	GATTT	2	10	25574	25583	20 %	60 %	20 %	0 %	339501454
15	NC_015729	CATGC	2	10	31840	31849	20 %	20 %	20 %	40 %	339501457
16	NC_015729	GGATA	2	10	32450	32459	40 %	20 %	40 %	0 %	339501457
17	NC_015729	GTGCC	2	10	37844	37853	0 %	20 %	40 %	40 %	339501461
18	NC_015729	CTGCG	2	10	39618	39627	0 %	20 %	40 %	40 %	339501462
19	NC_015729	CATGA	2	10	39742	39751	40 %	20 %	20 %	20 %	339501462
20	NC_015729	CCCCG	2	10	39757	39766	0 %	0 %	20 %	80 %	339501463
21	NC_015729	AATGT	2	10	41866	41875	40 %	40 %	20 %	0 %	339501465
22	NC_015729	TGGCT	2	10	46273	46282	0 %	40 %	40 %	20 %	339501469
23	NC_015729	AAGGT	2	10	47811	47820	40 %	20 %	40 %	0 %	339501470
24	NC_015729	GCTGG	2	10	48074	48083	0 %	20 %	60 %	20 %	339501470
25	NC_015729	TCTGG	2	10	49162	49171	0 %	40 %	40 %	20 %	339501471
26	NC_015729	CTTTT	2	10	50130	50139	0 %	80 %	0 %	20 %	339501471
27	NC_015729	GTACG	2	10	51251	51260	20 %	20 %	40 %	20 %	339501473
28	NC_015729	AATGT	2	10	51905	51914	40 %	40 %	20 %	0 %	339501473
29	NC_015729	GATCT	2	10	52915	52924	20 %	40 %	20 %	20 %	339501474
30	NC_015729	CCCTG	2	10	53061	53070	0 %	20 %	20 %	60 %	339501474
31	NC_015729	TTTTG	2	10	54569	54578	0 %	80 %	20 %	0 %	339501475
32	NC_015729	CCCTG	2	10	58151	58160	0 %	20 %	20 %	60 %	339501478
33	NC_015729	CCCTG	2	10	58904	58913	0 %	20 %	20 %	60 %	339501478
34	NC_015729	CGGCG	2	10	58941	58950	0 %	0 %	60 %	40 %	339501478
35	NC_015729	GCCCT	2	10	58962	58971	0 %	20 %	20 %	60 %	339501478
36	NC_015729	GCGCA	2	10	58981	58990	20 %	0 %	40 %	40 %	339501478
37	NC_015729	TTGGC	2	10	61993	62002	0 %	40 %	40 %	20 %	339501481
38	NC_015729	CCCAG	2	10	62165	62174	20 %	0 %	20 %	60 %	339501482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.