MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	GCAG	2	8	1306	1313	25 %	0 %	50 %	25 %	339501436
2	NC_015729	GGGC	2	8	1379	1386	0 %	0 %	75 %	25 %	339501436
3	NC_015729	CCTG	2	8	1589	1596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015729	ACAT	2	8	2187	2194	50 %	25 %	0 %	25 %	339501437
5	NC_015729	CAGA	2	8	2345	2352	50 %	0 %	25 %	25 %	339501437
6	NC_015729	ATTT	2	8	2752	2759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015729	AGGC	2	8	2949	2956	25 %	0 %	50 %	25 %	339501438
8	NC_015729	TCGG	2	8	3016	3023	0 %	25 %	50 %	25 %	339501438
9	NC_015729	GAAA	2	8	3923	3930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015729	TCTG	2	8	7826	7833	0 %	50 %	25 %	25 %	339501441
11	NC_015729	CTGG	2	8	7857	7864	0 %	25 %	50 %	25 %	339501441
12	NC_015729	CGGA	2	8	9156	9163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015729	GCTC	2	8	9335	9342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015729	CTTA	2	8	9547	9554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015729	GCAC	2	8	10097	10104	25 %	0 %	25 %	50 %	339501442
16	NC_015729	TCCA	2	8	10111	10118	25 %	25 %	0 %	50 %	339501442
17	NC_015729	AGGT	2	8	10426	10433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015729	GTGA	2	8	11740	11747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015729	AGGA	2	8	12281	12288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015729	AAAG	2	8	12301	12308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015729	TTTC	2	8	12541	12548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015729	ACCT	2	8	12822	12829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015729	TCCA	2	8	13125	13132	25 %	25 %	0 %	50 %	339501444
24	NC_015729	GCAC	2	8	13708	13715	25 %	0 %	25 %	50 %	339501444
25	NC_015729	CAAT	2	8	14140	14147	50 %	25 %	0 %	25 %	339501444
26	NC_015729	GTTC	2	8	14581	14588	0 %	50 %	25 %	25 %	339501445
27	NC_015729	TAGC	2	8	16055	16062	25 %	25 %	25 %	25 %	339501446
28	NC_015729	ATTC	2	8	17170	17177	25 %	50 %	0 %	25 %	339501448
29	NC_015729	CATC	2	8	19412	19419	25 %	25 %	0 %	50 %	339501450
30	NC_015729	TCAG	2	8	20341	20348	25 %	25 %	25 %	25 %	339501450
31	NC_015729	ACCG	2	8	21070	21077	25 %	0 %	25 %	50 %	339501452
32	NC_015729	ATCT	2	8	21175	21182	25 %	50 %	0 %	25 %	339501452
33	NC_015729	ATCC	2	8	21382	21389	25 %	25 %	0 %	50 %	339501452
34	NC_015729	GGCC	2	8	21516	21523	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
35	NC_015729	GGGC	2	8	21990	21997	0 %	0 %	75 %	25 %	339501452
36	NC_015729	TCGA	2	8	22234	22241	25 %	25 %	25 %	25 %	339501452
37	NC_015729	GCCA	2	8	23562	23569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015729	CAGG	2	8	23714	23721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015729	TGGT	2	8	23746	23753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015729	CATG	2	8	23900	23907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015729	CCTT	2	8	24742	24749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015729	CACC	2	8	24861	24868	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_015729	CAGG	2	8	25343	25350	25 %	0 %	50 %	25 %	339501454
44	NC_015729	CTGA	2	8	26231	26238	25 %	25 %	25 %	25 %	339501454
45	NC_015729	CGGC	2	8	26250	26257	0 %	0 %	50 %	50 %	339501454
46	NC_015729	TGAT	2	8	26769	26776	25 %	50 %	25 %	0 %	339501455
47	NC_015729	GATC	2	8	27081	27088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015729	CTGC	2	8	27106	27113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015729	TGTT	2	8	27476	27483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015729	GGCA	2	8	27816	27823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015729	GACC	2	8	28060	28067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015729	CCGC	2	8	28453	28460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_015729	GACC	2	8	29266	29273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015729	TCAA	2	8	30165	30172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015729	TGCT	2	8	30315	30322	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015729	CACC	2	8	31009	31016	25 %	0 %	0 %	75 %	339501456
57	NC_015729	GCAA	2	8	31434	31441	50 %	0 %	25 %	25 %	339501456
58	NC_015729	GTCG	2	8	31572	31579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015729	TGAC	2	8	32024	32031	25 %	25 %	25 %	25 %	339501457
60	NC_015729	AGAA	2	8	32357	32364	75 %	0 %	25 %	0 %	339501457
61	NC_015729	ATAA	2	8	32739	32746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015729	GTTC	2	8	33318	33325	0 %	50 %	25 %	25 %	339501458
63	NC_015729	TGGA	2	8	35556	35563	25 %	25 %	50 %	0 %	339501459
64	NC_015729	CATG	2	8	36165	36172	25 %	25 %	25 %	25 %	339501460
65	NC_015729	TCGA	2	8	36428	36435	25 %	25 %	25 %	25 %	339501460
66	NC_015729	CAGG	2	8	36675	36682	25 %	0 %	50 %	25 %	339501460
67	NC_015729	TTGC	2	8	36741	36748	0 %	50 %	25 %	25 %	339501460
68	NC_015729	CTGT	2	8	37153	37160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015729	TGGG	2	8	38001	38008	0 %	25 %	75 %	0 %	339501461
70	NC_015729	CAGC	2	8	38146	38153	25 %	0 %	25 %	50 %	339501461
71	NC_015729	CGTG	2	8	39595	39602	0 %	25 %	50 %	25 %	339501462
72	NC_015729	CATT	2	8	39662	39669	25 %	50 %	0 %	25 %	339501462
73	NC_015729	GCTG	2	8	40394	40401	0 %	25 %	50 %	25 %	339501463
74	NC_015729	CATA	2	8	41052	41059	50 %	25 %	0 %	25 %	339501464
75	NC_015729	AGAT	2	8	41530	41537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015729	CAGA	2	8	41636	41643	50 %	0 %	25 %	25 %	339501465
77	NC_015729	CATC	2	8	42024	42031	25 %	25 %	0 %	50 %	339501465
78	NC_015729	TACG	2	8	42107	42114	25 %	25 %	25 %	25 %	339501465
79	NC_015729	CAGG	2	8	42588	42595	25 %	0 %	50 %	25 %	339501466
80	NC_015729	CCCA	2	8	43474	43481	25 %	0 %	0 %	75 %	339501466
81	NC_015729	GCAC	2	8	43757	43764	25 %	0 %	25 %	50 %	339501466
82	NC_015729	GGTC	2	8	45059	45066	0 %	25 %	50 %	25 %	339501467
83	NC_015729	GACA	2	8	47552	47559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015729	CAGC	2	8	47870	47877	25 %	0 %	25 %	50 %	339501470
85	NC_015729	TTGA	2	8	48248	48255	25 %	50 %	25 %	0 %	339501470
86	NC_015729	CGAC	2	8	48348	48355	25 %	0 %	25 %	50 %	339501470
87	NC_015729	GGGC	2	8	48387	48394	0 %	0 %	75 %	25 %	339501470
88	NC_015729	GACA	2	8	49138	49145	50 %	0 %	25 %	25 %	339501471
89	NC_015729	TTGA	2	8	49349	49356	25 %	50 %	25 %	0 %	339501471
90	NC_015729	GGGT	2	8	50051	50058	0 %	25 %	75 %	0 %	339501471
91	NC_015729	ACCA	2	8	50323	50330	50 %	0 %	0 %	50 %	339501471
92	NC_015729	GAAT	2	8	50550	50557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015729	ATCG	2	8	51498	51505	25 %	25 %	25 %	25 %	339501473
94	NC_015729	AGCG	2	8	52435	52442	25 %	0 %	50 %	25 %	339501474
95	NC_015729	GTGA	2	8	52756	52763	25 %	25 %	50 %	0 %	339501474
96	NC_015729	GGCC	2	8	52893	52900	0 %	0 %	50 %	50 %	339501474
97	NC_015729	GACC	2	8	53241	53248	25 %	0 %	25 %	50 %	339501474
98	NC_015729	GAAT	2	8	53275	53282	50 %	25 %	25 %	0 %	339501474
99	NC_015729	TTGA	2	8	53526	53533	25 %	50 %	25 %	0 %	339501475
100	NC_015729	GCAA	2	8	53606	53613	50 %	0 %	25 %	25 %	339501475
101	NC_015729	GAAT	2	8	53705	53712	50 %	25 %	25 %	0 %	339501475
102	NC_015729	GACA	2	8	53899	53906	50 %	0 %	25 %	25 %	339501475
103	NC_015729	ACCC	2	8	54102	54109	25 %	0 %	0 %	75 %	339501475
104	NC_015729	AGCA	2	8	55014	55021	50 %	0 %	25 %	25 %	339501476
105	NC_015729	CAGG	2	8	55038	55045	25 %	0 %	50 %	25 %	339501476
106	NC_015729	GGCA	2	8	55188	55195	25 %	0 %	50 %	25 %	339501476
107	NC_015729	GCCC	2	8	56224	56231	0 %	0 %	25 %	75 %	339501477
108	NC_015729	ATTG	2	8	56846	56853	25 %	50 %	25 %	0 %	339501478
109	NC_015729	GGAC	2	8	58230	58237	25 %	0 %	50 %	25 %	339501478
110	NC_015729	CGTC	2	8	58415	58422	0 %	25 %	25 %	50 %	339501478
111	NC_015729	CTTC	2	8	60376	60383	0 %	50 %	0 %	50 %	339501480
112	NC_015729	GATC	2	8	60599	60606	25 %	25 %	25 %	25 %	339501480
113	NC_015729	ATGT	2	8	61885	61892	25 %	50 %	25 %	0 %	339501481
114	NC_015729	TGCC	2	8	62753	62760	0 %	25 %	25 %	50 %	339501482
115	NC_015729	GCTG	2	8	62894	62901	0 %	25 %	50 %	25 %	339501482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.