MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	AAC	2	6	19	24	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015729	CCG	2	6	325	330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501436
3	NC_015729	TGC	2	6	333	338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
4	NC_015729	GCG	2	6	381	386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501436
5	NC_015729	CGA	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501436
6	NC_015729	TGC	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
7	NC_015729	AAG	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501436
8	NC_015729	TCG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
9	NC_015729	GCG	2	6	566	571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501436
10	NC_015729	TGG	2	6	591	596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501436
11	NC_015729	GTC	2	6	622	627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
12	NC_015729	GAC	2	6	647	652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501436
13	NC_015729	GCT	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
14	NC_015729	TGA	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501436
15	NC_015729	ATC	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501436
16	NC_015729	GGA	2	6	952	957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501436
17	NC_015729	CTG	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
18	NC_015729	TGC	2	6	1095	1100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
19	NC_015729	GAG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501436
20	NC_015729	GCC	2	6	1139	1144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501436
21	NC_015729	TGA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501436
22	NC_015729	TGC	2	6	1405	1410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
23	NC_015729	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501436
24	NC_015729	CGC	2	6	1645	1650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
25	NC_015729	CCG	2	6	1664	1669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
26	NC_015729	GCC	2	6	1679	1684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
27	NC_015729	GAC	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501437
28	NC_015729	GCC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
29	NC_015729	GAG	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501437
30	NC_015729	GGC	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501437
31	NC_015729	CAC	2	6	2064	2069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501437
32	NC_015729	TGG	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501437
33	NC_015729	CCG	2	6	2217	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
34	NC_015729	TGG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501437
35	NC_015729	GCA	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501437
36	NC_015729	CAG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015729	TGA	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015729	TGG	3	9	2694	2702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015729	GAT	2	6	2803	2808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015729	ACC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501438
41	NC_015729	CAG	2	6	2935	2940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501438
42	NC_015729	TGT	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501438
43	NC_015729	GGT	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501438
44	NC_015729	CGA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501438
45	NC_015729	ACG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501438
46	NC_015729	TGC	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501438
47	NC_015729	CAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501438
48	NC_015729	GCT	2	6	3319	3324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501438
49	NC_015729	TGG	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501438
50	NC_015729	TTG	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501438
51	NC_015729	TCG	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501438
52	NC_015729	CGC	2	6	3612	3617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015729	GCG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015729	ACC	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015729	CCA	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015729	CCG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501439
57	NC_015729	AAG	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501439
58	NC_015729	CGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501439
59	NC_015729	GTC	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501439
60	NC_015729	CGC	2	6	4453	4458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501439
61	NC_015729	TCG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501439
62	NC_015729	CTC	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015729	GTT	2	6	4748	4753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015729	AAG	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015729	TGG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015729	GAT	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501440
67	NC_015729	GTC	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501440
68	NC_015729	CCA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
69	NC_015729	GGT	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501440
70	NC_015729	GCG	2	6	5155	5160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
71	NC_015729	CCA	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
72	NC_015729	ACG	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
73	NC_015729	GCA	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
74	NC_015729	GCA	2	6	5411	5416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
75	NC_015729	GCC	2	6	5505	5510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501440
76	NC_015729	CTG	2	6	5525	5530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501440
77	NC_015729	ACG	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
78	NC_015729	GGC	2	6	5703	5708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
79	NC_015729	GCG	2	6	5819	5824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
80	NC_015729	CCA	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
81	NC_015729	GCG	2	6	6025	6030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
82	NC_015729	GGC	3	9	6039	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
83	NC_015729	CGG	2	6	6053	6058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
84	NC_015729	ACC	2	6	6160	6165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
85	NC_015729	CGG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
86	NC_015729	CAG	2	6	6231	6236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
87	NC_015729	GCC	2	6	6294	6299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501440
88	NC_015729	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015729	CAT	2	6	6469	6474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015729	AGT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015729	TGC	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
92	NC_015729	GCT	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
93	NC_015729	CTG	2	6	6700	6705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
94	NC_015729	TGC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
95	NC_015729	AAC	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501441
96	NC_015729	CAT	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501441
97	NC_015729	GTC	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
98	NC_015729	CTG	3	9	7252	7260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
99	NC_015729	TTC	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501441
100	NC_015729	CCG	2	6	7481	7486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501441
101	NC_015729	CAG	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501441
102	NC_015729	GAT	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501441
103	NC_015729	ATC	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501441
104	NC_015729	CAT	2	6	7923	7928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501441
105	NC_015729	ATG	2	6	7948	7953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501441
106	NC_015729	TAT	2	6	7957	7962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501441
107	NC_015729	CAG	3	9	7969	7977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501441
108	NC_015729	CCG	2	6	7980	7985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501441
109	NC_015729	TGA	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501441
110	NC_015729	CAC	2	6	8034	8039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501441
111	NC_015729	GAT	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015729	AAT	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015729	CGA	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015729	GCC	2	6	8794	8799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015729	TCG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015729	TCG	2	6	8988	8993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015729	GGC	2	6	9013	9018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015729	CAA	2	6	9140	9145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015729	GCT	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015729	ATT	2	6	9201	9206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015729	CCA	2	6	9317	9322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015729	GGC	2	6	9328	9333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015729	ATC	2	6	9671	9676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501442
124	NC_015729	TCT	2	6	9696	9701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501442
125	NC_015729	GCG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501442
126	NC_015729	CTT	2	6	9739	9744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501442
127	NC_015729	AAG	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501442
128	NC_015729	TTG	2	6	9763	9768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501442
129	NC_015729	CGG	2	6	9797	9802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501442
130	NC_015729	GTT	2	6	9921	9926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501442
131	NC_015729	AAT	2	6	10089	10094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501442
132	NC_015729	CGT	2	6	10105	10110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501442
133	NC_015729	ATG	2	6	10160	10165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501442
134	NC_015729	TGA	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015729	AGA	2	6	10359	10364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015729	TGC	2	6	10377	10382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015729	TTC	2	6	10420	10425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015729	TTG	2	6	10515	10520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015729	TCT	2	6	10638	10643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015729	GCA	2	6	10696	10701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015729	CGC	2	6	10744	10749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015729	CGA	2	6	10755	10760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015729	CGG	2	6	10762	10767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015729	GCA	2	6	10822	10827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015729	GGC	2	6	10888	10893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015729	CAT	2	6	11011	11016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501443
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149	NC_015729	TCA	2	6	11348	11353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015729	TGA	2	6	11478	11483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015729	TGA	2	6	11606	11611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015729	AAG	2	6	11644	11649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015729	AAC	2	6	11655	11660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015729	TCG	2	6	11819	11824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015729	TCA	2	6	11886	11891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015729	CAA	2	6	12141	12146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_015729	CGC	2	6	12148	12153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_015729	CTG	2	6	12154	12159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015729	CCA	2	6	12178	12183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_015729	TTC	2	6	12327	12332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_015729	CCT	2	6	12481	12486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_015729	GTT	2	6	12571	12576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015729	CTT	3	9	12596	12604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015729	TGA	2	6	12634	12639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015729	CAT	2	6	12896	12901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_015729	AAG	2	6	12990	12995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501444
167	NC_015729	GGC	2	6	13273	13278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501444
168	NC_015729	CAG	2	6	13401	13406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501444
169	NC_015729	GGA	2	6	13533	13538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501444
170	NC_015729	TAG	2	6	13629	13634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501444
171	NC_015729	ATC	2	6	13752	13757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501444
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212	NC_015729	GAT	2	6	17828	17833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
213	NC_015729	ATA	2	6	17913	17918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_015729	CAC	2	6	20106	20111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501450
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248	NC_015729	ATC	2	6	20507	20512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501451
249	NC_015729	GCA	2	6	20696	20701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_015729	CGC	2	6	20831	20836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501452
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255	NC_015729	CAA	2	6	21087	21092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501452
256	NC_015729	CGG	2	6	21140	21145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501452
257	NC_015729	GGC	2	6	21184	21189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501452
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259	NC_015729	CGT	2	6	21235	21240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501452
260	NC_015729	GCC	2	6	21352	21357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501452
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263	NC_015729	GCT	2	6	21440	21445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501452
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299	NC_015729	AGA	2	6	23759	23764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015729	CGG	2	6	23815	23820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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381	NC_015729	CAA	2	6	30968	30973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501456
382	NC_015729	ACC	2	6	31149	31154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501456
383	NC_015729	CAC	2	6	31262	31267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501456
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385	NC_015729	CTC	2	6	31723	31728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
386	NC_015729	CGT	2	6	31858	31863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
387	NC_015729	CAC	2	6	31882	31887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501457
388	NC_015729	CAA	2	6	31935	31940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501457
389	NC_015729	TGC	2	6	31999	32004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
390	NC_015729	GTC	2	6	32041	32046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
391	NC_015729	TCT	2	6	32096	32101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501457
392	NC_015729	CGT	2	6	32144	32149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
393	NC_015729	CAA	2	6	32152	32157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501457
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395	NC_015729	GCT	2	6	32408	32413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
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402	NC_015729	GAT	2	6	32937	32942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501458
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499	NC_015729	CGC	2	6	41310	41315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501464
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