MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	AAC	2	6	19	24	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015729	CAG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015729	TGA	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015729	TGG	3	9	2694	2702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015729	GAT	2	6	2803	2808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015729	CGC	2	6	3612	3617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015729	GCG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015729	ACC	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015729	CCA	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015729	CTC	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015729	GTT	2	6	4748	4753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015729	AAG	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015729	TGG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015729	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015729	CAT	2	6	6469	6474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015729	AGT	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015729	GAT	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015729	AAT	2	6	8450	8455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015729	CGA	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015729	GCC	2	6	8794	8799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015729	TCG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015729	TCG	2	6	8988	8993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015729	GGC	2	6	9013	9018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015729	CAA	2	6	9140	9145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015729	GCT	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015729	ATT	2	6	9201	9206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015729	CCA	2	6	9317	9322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015729	GGC	2	6	9328	9333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015729	TGA	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015729	AGA	2	6	10359	10364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015729	TGC	2	6	10377	10382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015729	TTC	2	6	10420	10425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015729	TTG	2	6	10515	10520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015729	TCT	2	6	10638	10643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015729	GCA	2	6	10696	10701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015729	CGC	2	6	10744	10749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015729	CGA	2	6	10755	10760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015729	CGG	2	6	10762	10767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015729	GCA	2	6	10822	10827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015729	GGC	2	6	10888	10893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015729	TCA	2	6	11348	11353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015729	TGA	2	6	11478	11483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015729	TGA	2	6	11606	11611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015729	AAG	2	6	11644	11649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015729	AAC	2	6	11655	11660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015729	TCG	2	6	11819	11824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015729	TCA	2	6	11886	11891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015729	CAA	2	6	12141	12146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015729	CGC	2	6	12148	12153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015729	CTG	2	6	12154	12159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015729	CCA	2	6	12178	12183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015729	TTC	2	6	12327	12332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015729	CCT	2	6	12481	12486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015729	GTT	2	6	12571	12576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015729	CTT	3	9	12596	12604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015729	TGA	2	6	12634	12639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015729	CAT	2	6	12896	12901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015729	TTA	2	6	17783	17788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015729	GAT	2	6	17828	17833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015729	ATA	2	6	17913	17918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015729	TTG	2	6	18993	18998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015729	GCA	2	6	20696	20701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015729	ATA	2	6	22463	22468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015729	CTG	2	6	22592	22597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015729	TTG	2	6	22648	22653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015729	GCA	2	6	22698	22703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015729	GCC	2	6	22783	22788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015729	CGA	2	6	22824	22829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015729	TGG	2	6	22838	22843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015729	GAA	2	6	22881	22886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015729	TTG	2	6	22890	22895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015729	GGA	2	6	22939	22944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015729	GAT	2	6	22951	22956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015729	GCT	2	6	22978	22983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015729	TGC	2	6	23028	23033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015729	CAG	2	6	23072	23077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015729	CGG	2	6	23177	23182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015729	GCC	2	6	23226	23231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015729	GGT	2	6	23355	23360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015729	GAT	2	6	23457	23462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015729	GAC	2	6	23499	23504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015729	GCG	2	6	23616	23621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015729	AAC	2	6	23652	23657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015729	GCG	2	6	23733	23738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015729	AGA	2	6	23759	23764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015729	CGG	2	6	23815	23820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015729	GCA	2	6	23848	23853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015729	CCG	2	6	24018	24023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015729	GCG	2	6	24063	24068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015729	CCA	2	6	24080	24085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015729	TGC	2	6	24121	24126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015729	GAA	2	6	24157	24162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015729	GGC	2	6	24284	24289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015729	GCA	2	6	24334	24339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015729	CCG	2	6	24383	24388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015729	ACC	2	6	24414	24419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015729	AAC	2	6	24430	24435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015729	GCC	2	6	24438	24443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015729	CGC	2	6	24479	24484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015729	GGC	2	6	24487	24492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015729	CTT	2	6	24514	24519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015729	CAA	2	6	24520	24525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015729	CGG	2	6	24586	24591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015729	TGA	2	6	24658	24663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015729	CAC	2	6	24709	24714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015729	TGA	2	6	25204	25209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015729	AGC	2	6	26876	26881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015729	CCA	2	6	26914	26919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015729	GCT	2	6	27005	27010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015729	TGC	2	6	27357	27362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015729	TGC	2	6	27371	27376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015729	GCA	2	6	27457	27462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015729	CGT	2	6	27650	27655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015729	GAT	2	6	27771	27776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015729	AGC	2	6	27891	27896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015729	CGC	2	6	27925	27930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015729	CAC	2	6	27954	27959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015729	TGC	2	6	28051	28056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015729	ATC	2	6	28098	28103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015729	TCA	2	6	28120	28125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015729	TGG	2	6	28211	28216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015729	CAT	2	6	28241	28246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015729	GAT	2	6	28461	28466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015729	GCG	2	6	28527	28532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015729	ATG	2	6	28561	28566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015729	ACC	2	6	28642	28647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015729	TGG	2	6	28760	28765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015729	TCT	2	6	28808	28813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015729	CTT	2	6	28836	28841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015729	GCA	2	6	28971	28976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015729	CCG	2	6	29007	29012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015729	CAG	2	6	29013	29018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015729	GCC	2	6	29021	29026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015729	CGC	2	6	29045	29050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015729	GCT	2	6	29130	29135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015729	ACC	2	6	29708	29713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015729	TGC	2	6	29714	29719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015729	GCA	2	6	29904	29909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015729	GAG	2	6	29983	29988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015729	CTG	2	6	45571	45576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015729	TGC	2	6	45597	45602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_015729	TGT	2	6	50428	50433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_015729	CAG	2	6	56077	56082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_015729	TGG	2	6	56115	56120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_015729	ACA	2	6	56464	56469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_015729	CCA	2	6	56585	56590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_015729	GCC	2	6	56615	56620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_015729	ACA	2	6	63424	63429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_015729	TAA	3	9	63445	63453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015729	TCG	2	6	63516	63521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.