MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	AT	3	6	126	131	50 %	50 %	0 %	0 %	339501436
2	NC_015729	GC	3	6	546	551	0 %	0 %	50 %	50 %	339501436
3	NC_015729	GC	3	6	1909	1914	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
4	NC_015729	CG	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
5	NC_015729	CG	4	8	2221	2228	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
6	NC_015729	GC	3	6	2386	2391	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
7	NC_015729	CG	3	6	2584	2589	0 %	0 %	50 %	50 %	339501437
8	NC_015729	CG	4	8	4913	4920	0 %	0 %	50 %	50 %	339501440
9	NC_015729	GC	3	6	5309	5314	0 %	0 %	50 %	50 %	339501440
10	NC_015729	AC	4	8	7754	7761	50 %	0 %	0 %	50 %	339501441
11	NC_015729	CG	3	6	14163	14168	0 %	0 %	50 %	50 %	339501444
12	NC_015729	TC	3	6	15058	15063	0 %	50 %	0 %	50 %	339501445
13	NC_015729	GC	3	6	15300	15305	0 %	0 %	50 %	50 %	339501446
14	NC_015729	CG	4	8	15434	15441	0 %	0 %	50 %	50 %	339501446
15	NC_015729	CG	3	6	16836	16841	0 %	0 %	50 %	50 %	339501447
16	NC_015729	CG	3	6	18101	18106	0 %	0 %	50 %	50 %	339501449
17	NC_015729	GT	3	6	18259	18264	0 %	50 %	50 %	0 %	339501449
18	NC_015729	GC	4	8	19514	19521	0 %	0 %	50 %	50 %	339501450
19	NC_015729	AC	3	6	19659	19664	50 %	0 %	0 %	50 %	339501450
20	NC_015729	TA	3	6	20451	20456	50 %	50 %	0 %	0 %	339501451
21	NC_015729	GC	3	6	20948	20953	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
22	NC_015729	GC	3	6	21258	21263	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
23	NC_015729	CG	3	6	21325	21330	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
24	NC_015729	CG	3	6	21664	21669	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
25	NC_015729	GC	3	6	22282	22287	0 %	0 %	50 %	50 %	339501452
26	NC_015729	TG	3	6	24936	24941	0 %	50 %	50 %	0 %	339501453
27	NC_015729	GC	3	6	25952	25957	0 %	0 %	50 %	50 %	339501454
28	NC_015729	GT	3	6	26133	26138	0 %	50 %	50 %	0 %	339501454
29	NC_015729	GT	3	6	26244	26249	0 %	50 %	50 %	0 %	339501454
30	NC_015729	TC	3	6	26589	26594	0 %	50 %	0 %	50 %	339501455
31	NC_015729	CA	3	6	32341	32346	50 %	0 %	0 %	50 %	339501457
32	NC_015729	GC	3	6	32401	32406	0 %	0 %	50 %	50 %	339501457
33	NC_015729	AG	3	6	33269	33274	50 %	0 %	50 %	0 %	339501458
34	NC_015729	TG	3	6	33479	33484	0 %	50 %	50 %	0 %	339501458
35	NC_015729	TA	3	6	33489	33494	50 %	50 %	0 %	0 %	339501458
36	NC_015729	CG	3	6	34361	34366	0 %	0 %	50 %	50 %	339501459
37	NC_015729	CG	3	6	35497	35502	0 %	0 %	50 %	50 %	339501459
38	NC_015729	GC	3	6	36155	36160	0 %	0 %	50 %	50 %	339501460
39	NC_015729	GC	3	6	36318	36323	0 %	0 %	50 %	50 %	339501460
40	NC_015729	CG	4	8	36884	36891	0 %	0 %	50 %	50 %	339501460
41	NC_015729	GA	3	6	38817	38822	50 %	0 %	50 %	0 %	339501462
42	NC_015729	GC	3	6	39028	39033	0 %	0 %	50 %	50 %	339501462
43	NC_015729	GC	3	6	39241	39246	0 %	0 %	50 %	50 %	339501462
44	NC_015729	CG	3	6	40940	40945	0 %	0 %	50 %	50 %	339501464
45	NC_015729	CG	3	6	41386	41391	0 %	0 %	50 %	50 %	339501464
46	NC_015729	CG	3	6	41940	41945	0 %	0 %	50 %	50 %	339501465
47	NC_015729	GC	3	6	42459	42464	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
48	NC_015729	GC	5	10	42507	42516	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
49	NC_015729	CG	3	6	42890	42895	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
50	NC_015729	GC	3	6	43285	43290	0 %	0 %	50 %	50 %	339501466
51	NC_015729	GC	3	6	44217	44222	0 %	0 %	50 %	50 %	339501467
52	NC_015729	CG	3	6	44307	44312	0 %	0 %	50 %	50 %	339501467
53	NC_015729	CT	3	6	44461	44466	0 %	50 %	0 %	50 %	339501467
54	NC_015729	CG	3	6	45295	45300	0 %	0 %	50 %	50 %	339501468
55	NC_015729	CG	3	6	45815	45820	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
56	NC_015729	CT	3	6	45867	45872	0 %	50 %	0 %	50 %	339501469
57	NC_015729	CG	3	6	46169	46174	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
58	NC_015729	GC	4	8	46239	46246	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
59	NC_015729	GC	3	6	46943	46948	0 %	0 %	50 %	50 %	339501469
60	NC_015729	GT	3	6	47094	47099	0 %	50 %	50 %	0 %	339501469
61	NC_015729	CA	3	6	47320	47325	50 %	0 %	0 %	50 %	339501469
62	NC_015729	GA	3	6	47697	47702	50 %	0 %	50 %	0 %	339501470
63	NC_015729	GC	3	6	47993	47998	0 %	0 %	50 %	50 %	339501470
64	NC_015729	CG	3	6	48452	48457	0 %	0 %	50 %	50 %	339501470
65	NC_015729	CG	3	6	48774	48779	0 %	0 %	50 %	50 %	339501470
66	NC_015729	TA	3	6	48999	49004	50 %	50 %	0 %	0 %	339501471
67	NC_015729	GC	3	6	49682	49687	0 %	0 %	50 %	50 %	339501471
68	NC_015729	AT	3	6	49720	49725	50 %	50 %	0 %	0 %	339501471
69	NC_015729	AC	3	6	51958	51963	50 %	0 %	0 %	50 %	339501473
70	NC_015729	CA	3	6	52492	52497	50 %	0 %	0 %	50 %	339501474
71	NC_015729	CG	3	6	52498	52503	0 %	0 %	50 %	50 %	339501474
72	NC_015729	CG	3	6	52988	52993	0 %	0 %	50 %	50 %	339501474
73	NC_015729	CG	3	6	53515	53520	0 %	0 %	50 %	50 %	339501475
74	NC_015729	GC	3	6	54125	54130	0 %	0 %	50 %	50 %	339501475
75	NC_015729	GA	3	6	54138	54143	50 %	0 %	50 %	0 %	339501475
76	NC_015729	TA	3	6	54753	54758	50 %	50 %	0 %	0 %	339501475
77	NC_015729	GC	3	6	55205	55210	0 %	0 %	50 %	50 %	339501476
78	NC_015729	AC	3	6	55492	55497	50 %	0 %	0 %	50 %	339501476
79	NC_015729	CG	3	6	55535	55540	0 %	0 %	50 %	50 %	339501476
80	NC_015729	CG	3	6	57127	57132	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
81	NC_015729	GC	3	6	57826	57831	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
82	NC_015729	GC	3	6	58499	58504	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
83	NC_015729	GC	3	6	58779	58784	0 %	0 %	50 %	50 %	339501478
84	NC_015729	CG	4	8	60003	60010	0 %	0 %	50 %	50 %	339501480
85	NC_015729	CG	3	6	62313	62318	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482
86	NC_015729	CG	3	6	62427	62432	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482
87	NC_015729	CA	3	6	62494	62499	50 %	0 %	0 %	50 %	339501482
88	NC_015729	GC	3	6	62520	62525	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482
89	NC_015729	GC	3	6	62720	62725	0 %	0 %	50 %	50 %	339501482

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.