MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_83

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015728	GCGGCA	2	12	489	500	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339501484
2	NC_015728	TCGATC	2	12	564	575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339501484
3	NC_015728	GACATC	2	12	2372	2383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339501485
4	NC_015728	GCTGCG	2	12	6316	6327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015728	GTCAGC	2	12	7047	7058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501489
6	NC_015728	ACCTTG	2	12	9473	9484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339501493
7	NC_015728	GGGTCG	2	12	9694	9705	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339501494
8	NC_015728	CAGGGG	2	12	10280	10291	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	339501495
9	NC_015728	GCTCCT	2	12	15806	15817	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339501505
10	NC_015728	CGTTCG	2	12	16691	16702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501507
11	NC_015728	TGTCCG	2	12	17752	17763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501508
12	NC_015728	ATCCCG	2	12	19870	19881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501511
13	NC_015728	GATCGC	2	12	20914	20925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501513
14	NC_015728	TCCGGA	2	12	22259	22270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501515
15	NC_015728	GGTCGG	2	12	23972	23983	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339501517
16	NC_015728	CATCGG	2	12	24023	24034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339501517
17	NC_015728	TCGCTC	2	12	24563	24574	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339501518
18	NC_015728	AGCGAG	2	12	28630	28641	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339501521
19	NC_015728	ACTTGA	2	12	37946	37957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339501529
20	NC_015728	GTGATA	2	12	40548	40559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501531
21	NC_015728	GCCATC	2	12	47175	47186	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501537
22	NC_015728	TGACCG	2	12	47452	47463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015728	AGAAAA	2	12	47848	47859	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	339501538
24	NC_015728	CGATGA	2	12	50568	50579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339501541
25	NC_015728	CGCCAA	2	12	52843	52854	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339501544
26	NC_015728	CATGAA	2	12	53901	53912	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339501545
27	NC_015728	GTGATA	2	12	54540	54551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501545
28	NC_015728	TTTGGT	2	12	56038	56049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501548
29	NC_015728	AACCCG	2	12	56613	56624	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339501548
30	NC_015728	GGTTTC	2	12	57841	57852	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339501549
31	NC_015728	GCCAGC	2	12	58340	58351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339501549
32	NC_015728	CCGATC	2	12	58490	58501	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501549
33	NC_015728	GAAATA	2	12	61612	61623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339501553
34	NC_015728	ACCGAT	2	12	63936	63947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339501557
35	NC_015728	CATCGA	2	12	65383	65394	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339501557
36	NC_015728	TTCTGT	2	12	73151	73162	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	339501567
37	NC_015728	CGGCAG	2	12	74183	74194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339501567
38	NC_015728	ACTCGC	2	12	76479	76490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501569
39	NC_015728	CCCCGG	2	12	79950	79961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501575

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.