MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_83

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015728	GAAA	2	8	59	66	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015728	CCGA	2	8	180	187	25 %	0 %	25 %	50 %	339501484
3	NC_015728	GCCC	2	8	870	877	0 %	0 %	25 %	75 %	339501484
4	NC_015728	CCGA	2	8	1431	1438	25 %	0 %	25 %	50 %	339501485
5	NC_015728	TCGA	2	8	1503	1510	25 %	25 %	25 %	25 %	339501485
6	NC_015728	GATC	2	8	1562	1569	25 %	25 %	25 %	25 %	339501485
7	NC_015728	GTCG	2	8	1958	1965	0 %	25 %	50 %	25 %	339501485
8	NC_015728	TGCC	2	8	3152	3159	0 %	25 %	25 %	50 %	339501486
9	NC_015728	CAGC	2	8	3416	3423	25 %	0 %	25 %	50 %	339501486
10	NC_015728	TCGG	2	8	3789	3796	0 %	25 %	50 %	25 %	339501486
11	NC_015728	TGAG	2	8	3798	3805	25 %	25 %	50 %	0 %	339501486
12	NC_015728	ATCT	2	8	4008	4015	25 %	50 %	0 %	25 %	339501487
13	NC_015728	GGGC	2	8	4490	4497	0 %	0 %	75 %	25 %	339501487
14	NC_015728	CGTC	2	8	5260	5267	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015728	AGAC	2	8	6224	6231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015728	AGCC	2	8	6650	6657	25 %	0 %	25 %	50 %	339501489
17	NC_015728	CCAA	2	8	6662	6669	50 %	0 %	0 %	50 %	339501489
18	NC_015728	ATCA	2	8	7217	7224	50 %	25 %	0 %	25 %	339501489
19	NC_015728	GTAA	2	8	7229	7236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015728	CATC	2	8	7401	7408	25 %	25 %	0 %	50 %	339501490
21	NC_015728	CAGC	2	8	7594	7601	25 %	0 %	25 %	50 %	339501490
22	NC_015728	GGGC	2	8	8022	8029	0 %	0 %	75 %	25 %	339501491
23	NC_015728	TCAA	2	8	8363	8370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015728	TGGT	2	8	9665	9672	0 %	50 %	50 %	0 %	339501494
25	NC_015728	GTCG	2	8	10585	10592	0 %	25 %	50 %	25 %	339501495
26	NC_015728	AGAA	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	339501496
27	NC_015728	GGGC	2	8	11164	11171	0 %	0 %	75 %	25 %	339501496
28	NC_015728	AGGT	2	8	11456	11463	25 %	25 %	50 %	0 %	339501497
29	NC_015728	AGCC	2	8	11900	11907	25 %	0 %	25 %	50 %	339501498
30	NC_015728	TCCG	2	8	12089	12096	0 %	25 %	25 %	50 %	339501498
31	NC_015728	TTCG	2	8	12997	13004	0 %	50 %	25 %	25 %	339501500
32	NC_015728	CCGA	2	8	15426	15433	25 %	0 %	25 %	50 %	339501505
33	NC_015728	CCTT	2	8	15593	15600	0 %	50 %	0 %	50 %	339501505
34	NC_015728	CGGG	2	8	16466	16473	0 %	0 %	75 %	25 %	339501506
35	NC_015728	TCGC	2	8	16595	16602	0 %	25 %	25 %	50 %	339501507
36	NC_015728	ATCA	2	8	17131	17138	50 %	25 %	0 %	25 %	339501507
37	NC_015728	TGCG	2	8	17271	17278	0 %	25 %	50 %	25 %	339501507
38	NC_015728	CGAA	2	8	18081	18088	50 %	0 %	25 %	25 %	339501508
39	NC_015728	GGTC	2	8	18205	18212	0 %	25 %	50 %	25 %	339501508
40	NC_015728	CCGC	2	8	18401	18408	0 %	0 %	25 %	75 %	339501509
41	NC_015728	CGAG	2	8	18568	18575	25 %	0 %	50 %	25 %	339501509
42	NC_015728	GTCG	2	8	18610	18617	0 %	25 %	50 %	25 %	339501509
43	NC_015728	CAAC	2	8	19851	19858	50 %	0 %	0 %	50 %	339501511
44	NC_015728	CAGG	2	8	21834	21841	25 %	0 %	50 %	25 %	339501515
45	NC_015728	CCCG	2	8	22341	22348	0 %	0 %	25 %	75 %	339501515
46	NC_015728	TGGG	2	8	22375	22382	0 %	25 %	75 %	0 %	339501515
47	NC_015728	GCCC	2	8	23560	23567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_015728	ATCG	2	8	24676	24683	25 %	25 %	25 %	25 %	339501518
49	NC_015728	GCCT	2	8	24741	24748	0 %	25 %	25 %	50 %	339501518
50	NC_015728	TTTC	2	8	24876	24883	0 %	75 %	0 %	25 %	339501519
51	NC_015728	CTTG	2	8	24950	24957	0 %	50 %	25 %	25 %	339501519
52	NC_015728	GCCT	2	8	25224	25231	0 %	25 %	25 %	50 %	339501519
53	NC_015728	CGAG	2	8	25774	25781	25 %	0 %	50 %	25 %	339501519
54	NC_015728	CCGG	2	8	26045	26052	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
55	NC_015728	CAGC	2	8	26470	26477	25 %	0 %	25 %	50 %	339501520
56	NC_015728	CAAG	2	8	26762	26769	50 %	0 %	25 %	25 %	339501520
57	NC_015728	CCAC	2	8	28226	28233	25 %	0 %	0 %	75 %	339501521
58	NC_015728	CACG	2	8	28990	28997	25 %	0 %	25 %	50 %	339501521
59	NC_015728	TGAA	2	8	30687	30694	50 %	25 %	25 %	0 %	339501524
60	NC_015728	ACCA	2	8	30997	31004	50 %	0 %	0 %	50 %	339501524
61	NC_015728	CAGC	2	8	31101	31108	25 %	0 %	25 %	50 %	339501524
62	NC_015728	CAGT	2	8	31595	31602	25 %	25 %	25 %	25 %	339501525
63	NC_015728	GGCA	2	8	31650	31657	25 %	0 %	50 %	25 %	339501526
64	NC_015728	GGAA	2	8	31743	31750	50 %	0 %	50 %	0 %	339501526
65	NC_015728	GCAA	2	8	33220	33227	50 %	0 %	25 %	25 %	339501526
66	NC_015728	TGAT	2	8	33365	33372	25 %	50 %	25 %	0 %	339501526
67	NC_015728	GACC	2	8	33506	33513	25 %	0 %	25 %	50 %	339501526
68	NC_015728	ATCC	2	8	34411	34418	25 %	25 %	0 %	50 %	339501526
69	NC_015728	TCCG	2	8	34455	34462	0 %	25 %	25 %	50 %	339501526
70	NC_015728	CCGT	2	8	35011	35018	0 %	25 %	25 %	50 %	339501527
71	NC_015728	ATCG	2	8	35264	35271	25 %	25 %	25 %	25 %	339501527
72	NC_015728	GCCA	2	8	35704	35711	25 %	0 %	25 %	50 %	339501527
73	NC_015728	CCGC	2	8	36143	36150	0 %	0 %	25 %	75 %	339501527
74	NC_015728	TCGG	2	8	36190	36197	0 %	25 %	50 %	25 %	339501527
75	NC_015728	GGCG	2	8	36670	36677	0 %	0 %	75 %	25 %	339501527
76	NC_015728	ATCC	2	8	36852	36859	25 %	25 %	0 %	50 %	339501527
77	NC_015728	ATCC	2	8	37052	37059	25 %	25 %	0 %	50 %	339501527
78	NC_015728	CGAT	2	8	37281	37288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015728	GGGC	2	8	37336	37343	0 %	0 %	75 %	25 %	339501528
80	NC_015728	CGAG	2	8	38084	38091	25 %	0 %	50 %	25 %	339501529
81	NC_015728	TGAT	2	8	38823	38830	25 %	50 %	25 %	0 %	339501530
82	NC_015728	TCTG	2	8	38935	38942	0 %	50 %	25 %	25 %	339501530
83	NC_015728	CTGT	2	8	39613	39620	0 %	50 %	25 %	25 %	339501531
84	NC_015728	TTGC	2	8	40461	40468	0 %	50 %	25 %	25 %	339501531
85	NC_015728	GATG	2	8	40648	40655	25 %	25 %	50 %	0 %	339501531
86	NC_015728	GTTC	2	8	40712	40719	0 %	50 %	25 %	25 %	339501531
87	NC_015728	GGGC	2	8	40737	40744	0 %	0 %	75 %	25 %	339501531
88	NC_015728	TCAC	2	8	40761	40768	25 %	25 %	0 %	50 %	339501531
89	NC_015728	GTGC	2	8	41049	41056	0 %	25 %	50 %	25 %	339501531
90	NC_015728	CCCG	2	8	41101	41108	0 %	0 %	25 %	75 %	339501531
91	NC_015728	GATA	2	8	41427	41434	50 %	25 %	25 %	0 %	339501532
92	NC_015728	CCTG	2	8	41738	41745	0 %	25 %	25 %	50 %	339501532
93	NC_015728	TAGA	2	8	41867	41874	50 %	25 %	25 %	0 %	339501532
94	NC_015728	GCCC	2	8	42620	42627	0 %	0 %	25 %	75 %	339501532
95	NC_015728	GCCC	2	8	42941	42948	0 %	0 %	25 %	75 %	339501533
96	NC_015728	GAAT	2	8	43129	43136	50 %	25 %	25 %	0 %	339501533
97	NC_015728	CATG	2	8	43626	43633	25 %	25 %	25 %	25 %	339501534
98	NC_015728	AAGG	2	8	43958	43965	50 %	0 %	50 %	0 %	339501535
99	NC_015728	CGCC	2	8	44200	44207	0 %	0 %	25 %	75 %	339501535
100	NC_015728	CGCC	2	8	44857	44864	0 %	0 %	25 %	75 %	339501535
101	NC_015728	GGGC	2	8	44974	44981	0 %	0 %	75 %	25 %	339501535
102	NC_015728	GAAT	2	8	45650	45657	50 %	25 %	25 %	0 %	339501535
103	NC_015728	GTCC	2	8	45865	45872	0 %	25 %	25 %	50 %	339501535
104	NC_015728	GCAT	2	8	45951	45958	25 %	25 %	25 %	25 %	339501535
105	NC_015728	ATGC	2	8	46130	46137	25 %	25 %	25 %	25 %	339501535
106	NC_015728	AAAG	2	8	46607	46614	75 %	0 %	25 %	0 %	339501536
107	NC_015728	CCGG	2	8	47044	47051	0 %	0 %	50 %	50 %	339501537
108	NC_015728	TTTC	2	8	47544	47551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015728	TTCA	2	8	47812	47819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015728	ATCT	2	8	48342	48349	25 %	50 %	0 %	25 %	339501539
111	NC_015728	CCAT	2	8	49374	49381	25 %	25 %	0 %	50 %	339501541
112	NC_015728	GCCA	2	8	50144	50151	25 %	0 %	25 %	50 %	339501541
113	NC_015728	CCCG	2	8	50206	50213	0 %	0 %	25 %	75 %	339501541
114	NC_015728	CAGC	2	8	50319	50326	25 %	0 %	25 %	50 %	339501541
115	NC_015728	AGAA	2	8	50462	50469	75 %	0 %	25 %	0 %	339501541
116	NC_015728	ACCG	2	8	51300	51307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015728	CATC	2	8	51744	51751	25 %	25 %	0 %	50 %	339501543
118	NC_015728	GTCC	2	8	51869	51876	0 %	25 %	25 %	50 %	339501543
119	NC_015728	ATCC	2	8	52042	52049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015728	ACGA	2	8	52212	52219	50 %	0 %	25 %	25 %	339501544
121	NC_015728	GCCC	2	8	52690	52697	0 %	0 %	25 %	75 %	339501544
122	NC_015728	TCGC	2	8	52715	52722	0 %	25 %	25 %	50 %	339501544
123	NC_015728	CGCA	2	8	52946	52953	25 %	0 %	25 %	50 %	339501544
124	NC_015728	TCGA	2	8	53128	53135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015728	CACC	2	8	53346	53353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_015728	TGCC	2	8	54673	54680	0 %	25 %	25 %	50 %	339501546
127	NC_015728	GGCT	2	8	55108	55115	0 %	25 %	50 %	25 %	339501546
128	NC_015728	TCGT	2	8	55730	55737	0 %	50 %	25 %	25 %	339501547
129	NC_015728	TGGG	2	8	55998	56005	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015728	AATG	2	8	56910	56917	50 %	25 %	25 %	0 %	339501548
131	NC_015728	GACG	2	8	57552	57559	25 %	0 %	50 %	25 %	339501549
132	NC_015728	TGCC	2	8	58192	58199	0 %	25 %	25 %	50 %	339501549
133	NC_015728	GGTG	2	8	58908	58915	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015728	CAGC	2	8	60886	60893	25 %	0 %	25 %	50 %	339501552
135	NC_015728	ACCA	2	8	61283	61290	50 %	0 %	0 %	50 %	339501552
136	NC_015728	ATTT	2	8	61448	61455	25 %	75 %	0 %	0 %	339501553
137	NC_015728	ATTG	2	8	61873	61880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015728	CGGC	2	8	62269	62276	0 %	0 %	50 %	50 %	339501554
139	NC_015728	TTTC	2	8	62368	62375	0 %	75 %	0 %	25 %	339501554
140	NC_015728	TTTG	2	8	62396	62403	0 %	75 %	25 %	0 %	339501555
141	NC_015728	GCCA	2	8	63003	63010	25 %	0 %	25 %	50 %	339501555
142	NC_015728	ACAG	2	8	63226	63233	50 %	0 %	25 %	25 %	339501555
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.