MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_83

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015728	GAAA	2	8	59	66	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015728	CGTC	2	8	5260	5267	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015728	AGAC	2	8	6224	6231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015728	GTAA	2	8	7229	7236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015728	TCAA	2	8	8363	8370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015728	GCCC	2	8	23560	23567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015728	CGAT	2	8	37281	37288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015728	TTTC	2	8	47544	47551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015728	TTCA	2	8	47812	47819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015728	ACCG	2	8	51300	51307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015728	ATCC	2	8	52042	52049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015728	TCGA	2	8	53128	53135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015728	CACC	2	8	53346	53353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015728	TGGG	2	8	55998	56005	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015728	GGTG	2	8	58908	58915	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015728	ATTG	2	8	61873	61880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015728	TCCA	2	8	79669	79676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015728	CCTT	2	8	81555	81562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015728	TGAT	2	8	81920	81927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015728	ACCC	2	8	82743	82750	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_015728	TGGG	2	8	82789	82796	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015728	TCTT	2	8	82941	82948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.