MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_83

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015728	TC	3	6	248	253	0 %	50 %	0 %	50 %	339501484
2	NC_015728	GC	3	6	385	390	0 %	0 %	50 %	50 %	339501484
3	NC_015728	CG	3	6	1238	1243	0 %	0 %	50 %	50 %	339501484
4	NC_015728	CT	3	6	1249	1254	0 %	50 %	0 %	50 %	339501484
5	NC_015728	CG	5	10	1745	1754	0 %	0 %	50 %	50 %	339501485
6	NC_015728	CG	3	6	2256	2261	0 %	0 %	50 %	50 %	339501485
7	NC_015728	TC	3	6	2318	2323	0 %	50 %	0 %	50 %	339501485
8	NC_015728	GC	4	8	3010	3017	0 %	0 %	50 %	50 %	339501486
9	NC_015728	CG	3	6	4550	4555	0 %	0 %	50 %	50 %	339501487
10	NC_015728	GC	4	8	5030	5037	0 %	0 %	50 %	50 %	339501487
11	NC_015728	CG	4	8	6066	6073	0 %	0 %	50 %	50 %	339501488
12	NC_015728	AT	3	6	6127	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	339501488
13	NC_015728	GC	3	6	7931	7936	0 %	0 %	50 %	50 %	339501491
14	NC_015728	TC	3	6	8635	8640	0 %	50 %	0 %	50 %	339501492
15	NC_015728	TC	3	6	9602	9607	0 %	50 %	0 %	50 %	339501494
16	NC_015728	CG	3	6	9659	9664	0 %	0 %	50 %	50 %	339501494
17	NC_015728	TC	3	6	9841	9846	0 %	50 %	0 %	50 %	339501495
18	NC_015728	CG	3	6	10034	10039	0 %	0 %	50 %	50 %	339501495
19	NC_015728	AG	3	6	10146	10151	50 %	0 %	50 %	0 %	339501495
20	NC_015728	CG	4	8	10437	10444	0 %	0 %	50 %	50 %	339501495
21	NC_015728	CG	3	6	10448	10453	0 %	0 %	50 %	50 %	339501495
22	NC_015728	CG	3	6	10709	10714	0 %	0 %	50 %	50 %	339501495
23	NC_015728	AG	3	6	11183	11188	50 %	0 %	50 %	0 %	339501496
24	NC_015728	GC	3	6	11591	11596	0 %	0 %	50 %	50 %	339501498
25	NC_015728	GT	3	6	12023	12028	0 %	50 %	50 %	0 %	339501498
26	NC_015728	AC	3	6	12295	12300	50 %	0 %	0 %	50 %	339501499
27	NC_015728	AC	3	6	12562	12567	50 %	0 %	0 %	50 %	339501500
28	NC_015728	TG	3	6	12685	12690	0 %	50 %	50 %	0 %	339501500
29	NC_015728	CG	3	6	12852	12857	0 %	0 %	50 %	50 %	339501500
30	NC_015728	CG	3	6	12888	12893	0 %	0 %	50 %	50 %	339501500
31	NC_015728	TC	3	6	13516	13521	0 %	50 %	0 %	50 %	339501501
32	NC_015728	CT	3	6	13548	13553	0 %	50 %	0 %	50 %	339501501
33	NC_015728	TC	3	6	14046	14051	0 %	50 %	0 %	50 %	339501502
34	NC_015728	TC	3	6	14570	14575	0 %	50 %	0 %	50 %	339501503
35	NC_015728	GC	3	6	14589	14594	0 %	0 %	50 %	50 %	339501503
36	NC_015728	GC	3	6	14993	14998	0 %	0 %	50 %	50 %	339501504
37	NC_015728	GT	3	6	15492	15497	0 %	50 %	50 %	0 %	339501505
38	NC_015728	GA	3	6	16195	16200	50 %	0 %	50 %	0 %	339501506
39	NC_015728	CT	3	6	16436	16441	0 %	50 %	0 %	50 %	339501506
40	NC_015728	GC	3	6	17013	17018	0 %	0 %	50 %	50 %	339501507
41	NC_015728	CG	3	6	17261	17266	0 %	0 %	50 %	50 %	339501507
42	NC_015728	GT	3	6	17489	17494	0 %	50 %	50 %	0 %	339501508
43	NC_015728	CG	3	6	17495	17500	0 %	0 %	50 %	50 %	339501508
44	NC_015728	CG	3	6	17539	17544	0 %	0 %	50 %	50 %	339501508
45	NC_015728	GC	3	6	17710	17715	0 %	0 %	50 %	50 %	339501508
46	NC_015728	CG	3	6	18495	18500	0 %	0 %	50 %	50 %	339501509
47	NC_015728	AG	3	6	19513	19518	50 %	0 %	50 %	0 %	339501510
48	NC_015728	GC	3	6	19656	19661	0 %	0 %	50 %	50 %	339501511
49	NC_015728	AC	3	6	19940	19945	50 %	0 %	0 %	50 %	339501511
50	NC_015728	GC	3	6	20292	20297	0 %	0 %	50 %	50 %	339501512
51	NC_015728	CG	3	6	20426	20431	0 %	0 %	50 %	50 %	339501512
52	NC_015728	CG	4	8	21522	21529	0 %	0 %	50 %	50 %	339501514
53	NC_015728	GC	3	6	21692	21697	0 %	0 %	50 %	50 %	339501514
54	NC_015728	CG	3	6	22012	22017	0 %	0 %	50 %	50 %	339501515
55	NC_015728	GC	3	6	22608	22613	0 %	0 %	50 %	50 %	339501515
56	NC_015728	GC	5	10	23031	23040	0 %	0 %	50 %	50 %	339501515
57	NC_015728	CG	3	6	23680	23685	0 %	0 %	50 %	50 %	339501517
58	NC_015728	GC	3	6	24101	24106	0 %	0 %	50 %	50 %	339501517
59	NC_015728	GC	3	6	24812	24817	0 %	0 %	50 %	50 %	339501518
60	NC_015728	TC	3	6	24998	25003	0 %	50 %	0 %	50 %	339501519
61	NC_015728	GC	3	6	25010	25015	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
62	NC_015728	AG	3	6	25076	25081	50 %	0 %	50 %	0 %	339501519
63	NC_015728	CG	3	6	25193	25198	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
64	NC_015728	CG	3	6	25607	25612	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
65	NC_015728	GC	3	6	26132	26137	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
66	NC_015728	GA	3	6	26206	26211	50 %	0 %	50 %	0 %	339501519
67	NC_015728	CG	3	6	26267	26272	0 %	0 %	50 %	50 %	339501519
68	NC_015728	GC	4	8	27475	27482	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
69	NC_015728	CG	3	6	27817	27822	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
70	NC_015728	GC	4	8	27829	27836	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
71	NC_015728	GC	3	6	28244	28249	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
72	NC_015728	GC	3	6	28318	28323	0 %	0 %	50 %	50 %	339501521
73	NC_015728	CT	3	6	28396	28401	0 %	50 %	0 %	50 %	339501521
74	NC_015728	GA	3	6	29294	29299	50 %	0 %	50 %	0 %	339501521
75	NC_015728	TC	3	6	29338	29343	0 %	50 %	0 %	50 %	339501522
76	NC_015728	TG	3	6	29493	29498	0 %	50 %	50 %	0 %	339501522
77	NC_015728	GC	3	6	29745	29750	0 %	0 %	50 %	50 %	339501522
78	NC_015728	GC	3	6	30196	30201	0 %	0 %	50 %	50 %	339501523
79	NC_015728	GC	3	6	33013	33018	0 %	0 %	50 %	50 %	339501526
80	NC_015728	CG	3	6	33089	33094	0 %	0 %	50 %	50 %	339501526
81	NC_015728	TC	3	6	34178	34183	0 %	50 %	0 %	50 %	339501526
82	NC_015728	AC	3	6	34304	34309	50 %	0 %	0 %	50 %	339501526
83	NC_015728	GT	3	6	34374	34379	0 %	50 %	50 %	0 %	339501526
84	NC_015728	GC	3	6	35111	35116	0 %	0 %	50 %	50 %	339501527
85	NC_015728	CG	3	6	35762	35767	0 %	0 %	50 %	50 %	339501527
86	NC_015728	GC	3	6	36704	36709	0 %	0 %	50 %	50 %	339501527
87	NC_015728	GC	3	6	36744	36749	0 %	0 %	50 %	50 %	339501527
88	NC_015728	TC	3	6	37614	37619	0 %	50 %	0 %	50 %	339501528
89	NC_015728	AC	3	6	37663	37668	50 %	0 %	0 %	50 %	339501528
90	NC_015728	CT	3	6	38113	38118	0 %	50 %	0 %	50 %	339501529
91	NC_015728	TC	3	6	38396	38401	0 %	50 %	0 %	50 %	339501529
92	NC_015728	CG	4	8	38459	38466	0 %	0 %	50 %	50 %	339501529
93	NC_015728	TG	3	6	38619	38624	0 %	50 %	50 %	0 %	339501529
94	NC_015728	CG	3	6	39543	39548	0 %	0 %	50 %	50 %	339501531
95	NC_015728	GC	3	6	39768	39773	0 %	0 %	50 %	50 %	339501531
96	NC_015728	AC	3	6	39805	39810	50 %	0 %	0 %	50 %	339501531
97	NC_015728	CG	3	6	40946	40951	0 %	0 %	50 %	50 %	339501531
98	NC_015728	TC	3	6	41025	41030	0 %	50 %	0 %	50 %	339501531
99	NC_015728	AC	3	6	41815	41820	50 %	0 %	0 %	50 %	339501532
100	NC_015728	TC	3	6	42052	42057	0 %	50 %	0 %	50 %	339501532
101	NC_015728	GC	3	6	44052	44057	0 %	0 %	50 %	50 %	339501535
102	NC_015728	GC	3	6	44070	44075	0 %	0 %	50 %	50 %	339501535
103	NC_015728	GC	3	6	44917	44922	0 %	0 %	50 %	50 %	339501535
104	NC_015728	GC	4	8	45082	45089	0 %	0 %	50 %	50 %	339501535
105	NC_015728	CG	3	6	45388	45393	0 %	0 %	50 %	50 %	339501535
106	NC_015728	CG	3	6	45419	45424	0 %	0 %	50 %	50 %	339501535
107	NC_015728	GC	3	6	45450	45455	0 %	0 %	50 %	50 %	339501535
108	NC_015728	CT	3	6	46206	46211	0 %	50 %	0 %	50 %	339501535
109	NC_015728	AC	3	6	47950	47955	50 %	0 %	0 %	50 %	339501538
110	NC_015728	GC	3	6	48504	48509	0 %	0 %	50 %	50 %	339501539
111	NC_015728	GC	3	6	48737	48742	0 %	0 %	50 %	50 %	339501539
112	NC_015728	TG	3	6	49223	49228	0 %	50 %	50 %	0 %	339501541
113	NC_015728	CG	3	6	49239	49244	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
114	NC_015728	GC	3	6	49287	49292	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
115	NC_015728	CG	3	6	49332	49337	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
116	NC_015728	GC	3	6	49433	49438	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
117	NC_015728	CG	3	6	49721	49726	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
118	NC_015728	GC	3	6	50217	50222	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
119	NC_015728	CG	4	8	50557	50564	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
120	NC_015728	CG	3	6	50752	50757	0 %	0 %	50 %	50 %	339501541
121	NC_015728	GC	3	6	51454	51459	0 %	0 %	50 %	50 %	339501543
122	NC_015728	CG	3	6	51654	51659	0 %	0 %	50 %	50 %	339501543
123	NC_015728	TG	3	6	53531	53536	0 %	50 %	50 %	0 %	339501545
124	NC_015728	CA	3	6	54170	54175	50 %	0 %	0 %	50 %	339501545
125	NC_015728	AC	3	6	54701	54706	50 %	0 %	0 %	50 %	339501546
126	NC_015728	GC	3	6	56473	56478	0 %	0 %	50 %	50 %	339501548
127	NC_015728	TG	3	6	57256	57261	0 %	50 %	50 %	0 %	339501548
128	NC_015728	CG	3	6	57628	57633	0 %	0 %	50 %	50 %	339501549
129	NC_015728	GC	3	6	59859	59864	0 %	0 %	50 %	50 %	339501551
130	NC_015728	CG	3	6	60055	60060	0 %	0 %	50 %	50 %	339501551
131	NC_015728	CT	3	6	60979	60984	0 %	50 %	0 %	50 %	339501552
132	NC_015728	GC	3	6	61075	61080	0 %	0 %	50 %	50 %	339501552
133	NC_015728	CA	3	6	62164	62169	50 %	0 %	0 %	50 %	339501554
134	NC_015728	TC	3	6	62615	62620	0 %	50 %	0 %	50 %	339501555
135	NC_015728	GT	3	6	62659	62664	0 %	50 %	50 %	0 %	339501555
136	NC_015728	TC	3	6	62704	62709	0 %	50 %	0 %	50 %	339501555
137	NC_015728	GC	4	8	62733	62740	0 %	0 %	50 %	50 %	339501555
138	NC_015728	GT	3	6	62817	62822	0 %	50 %	50 %	0 %	339501555
139	NC_015728	TG	3	6	63042	63047	0 %	50 %	50 %	0 %	339501555
140	NC_015728	GC	6	12	63658	63669	0 %	0 %	50 %	50 %	339501556
141	NC_015728	CG	3	6	63710	63715	0 %	0 %	50 %	50 %	339501556
142	NC_015728	CG	3	6	64265	64270	0 %	0 %	50 %	50 %	339501557
143	NC_015728	CG	4	8	64339	64346	0 %	0 %	50 %	50 %	339501557
144	NC_015728	CG	4	8	64399	64406	0 %	0 %	50 %	50 %	339501557
145	NC_015728	CG	4	8	65422	65429	0 %	0 %	50 %	50 %	339501557
146	NC_015728	GC	3	6	65653	65658	0 %	0 %	50 %	50 %	339501557
147	NC_015728	GC	3	6	66206	66211	0 %	0 %	50 %	50 %	339501557
148	NC_015728	AC	3	6	67000	67005	50 %	0 %	0 %	50 %	339501558
149	NC_015728	GC	3	6	67834	67839	0 %	0 %	50 %	50 %	339501559
150	NC_015728	GC	3	6	67988	67993	0 %	0 %	50 %	50 %	339501559
151	NC_015728	GC	3	6	68256	68261	0 %	0 %	50 %	50 %	339501560
152	NC_015728	CG	3	6	68438	68443	0 %	0 %	50 %	50 %	339501560
153	NC_015728	CG	4	8	68454	68461	0 %	0 %	50 %	50 %	339501560
154	NC_015728	GC	3	6	68906	68911	0 %	0 %	50 %	50 %	339501561
155	NC_015728	GA	3	6	69311	69316	50 %	0 %	50 %	0 %	339501561
156	NC_015728	GC	3	6	69495	69500	0 %	0 %	50 %	50 %	339501562
157	NC_015728	CG	3	6	70070	70075	0 %	0 %	50 %	50 %	339501562
158	NC_015728	CG	3	6	70648	70653	0 %	0 %	50 %	50 %	339501562
159	NC_015728	GA	3	6	70809	70814	50 %	0 %	50 %	0 %	339501563
160	NC_015728	CT	3	6	70853	70858	0 %	50 %	0 %	50 %	339501563
161	NC_015728	CA	3	6	71460	71465	50 %	0 %	0 %	50 %	339501563
162	NC_015728	AC	3	6	71543	71548	50 %	0 %	0 %	50 %	339501563
163	NC_015728	GC	3	6	71903	71908	0 %	0 %	50 %	50 %	339501564
164	NC_015728	CG	3	6	71993	71998	0 %	0 %	50 %	50 %	339501565
165	NC_015728	GC	4	8	72573	72580	0 %	0 %	50 %	50 %	339501566
166	NC_015728	AG	3	6	72908	72913	50 %	0 %	50 %	0 %	339501566
167	NC_015728	CG	3	6	73218	73223	0 %	0 %	50 %	50 %	339501567
168	NC_015728	CG	3	6	73287	73292	0 %	0 %	50 %	50 %	339501567
169	NC_015728	TG	3	6	74300	74305	0 %	50 %	50 %	0 %	339501567
170	NC_015728	GC	3	6	74421	74426	0 %	0 %	50 %	50 %	339501567
171	NC_015728	TG	3	6	74541	74546	0 %	50 %	50 %	0 %	339501567
172	NC_015728	CG	3	6	74923	74928	0 %	0 %	50 %	50 %	339501568
173	NC_015728	GT	3	6	75693	75698	0 %	50 %	50 %	0 %	339501569
174	NC_015728	AC	3	6	76726	76731	50 %	0 %	0 %	50 %	339501570
175	NC_015728	AC	3	6	76738	76743	50 %	0 %	0 %	50 %	339501570
176	NC_015728	GC	3	6	77625	77630	0 %	0 %	50 %	50 %	339501572
177	NC_015728	CG	3	6	77771	77776	0 %	0 %	50 %	50 %	339501572
178	NC_015728	GC	3	6	77942	77947	0 %	0 %	50 %	50 %	339501572
179	NC_015728	GC	3	6	78234	78239	0 %	0 %	50 %	50 %	339501573
180	NC_015728	GC	3	6	78394	78399	0 %	0 %	50 %	50 %	339501573
181	NC_015728	CG	3	6	79480	79485	0 %	0 %	50 %	50 %	339501574
182	NC_015728	CG	3	6	80029	80034	0 %	0 %	50 %	50 %	339501575
183	NC_015728	GC	4	8	80353	80360	0 %	0 %	50 %	50 %	339501575
184	NC_015728	CG	4	8	81226	81233	0 %	0 %	50 %	50 %	339501575
185	NC_015728	CG	3	6	81339	81344	0 %	0 %	50 %	50 %	339501575
186	NC_015728	CG	4	8	81403	81410	0 %	0 %	50 %	50 %	339501575

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.