MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CTTGA	2	10	713	722	20 %	40 %	20 %	20 %	339327782
2	NC_015727	GCGTC	2	10	1475	1484	0 %	20 %	40 %	40 %	339327783
3	NC_015727	GCGCC	2	10	5545	5554	0 %	0 %	40 %	60 %	339327785
4	NC_015727	TGCGC	2	10	6445	6454	0 %	20 %	40 %	40 %	339327787
5	NC_015727	GGGCA	2	10	7808	7817	20 %	0 %	60 %	20 %	339327791
6	NC_015727	CGTGC	2	10	10432	10441	0 %	20 %	40 %	40 %	339327793
7	NC_015727	TGCCG	2	10	11194	11203	0 %	20 %	40 %	40 %	339327793
8	NC_015727	GCCGT	2	10	12655	12664	0 %	20 %	40 %	40 %	339327795
9	NC_015727	GGCCG	2	10	13491	13500	0 %	0 %	60 %	40 %	339327796
10	NC_015727	CGGCA	2	10	13883	13892	20 %	0 %	40 %	40 %	339327797
11	NC_015727	CTGCG	2	10	18956	18965	0 %	20 %	40 %	40 %	339327799
12	NC_015727	TGACA	2	10	21826	21835	40 %	20 %	20 %	20 %	339327801
13	NC_015727	CGAGG	2	10	23817	23826	20 %	0 %	60 %	20 %	339327803
14	NC_015727	CAGCG	2	10	24548	24557	20 %	0 %	40 %	40 %	339327804
15	NC_015727	CAAGC	2	10	24562	24571	40 %	0 %	20 %	40 %	339327804
16	NC_015727	TCGCC	2	10	25347	25356	0 %	20 %	20 %	60 %	339327804
17	NC_015727	GCAGG	2	10	27310	27319	20 %	0 %	60 %	20 %	339327807
18	NC_015727	GCAGG	2	10	27374	27383	20 %	0 %	60 %	20 %	339327807
19	NC_015727	CAGTC	2	10	29711	29720	20 %	20 %	20 %	40 %	339327809
20	NC_015727	GCCCA	2	10	29972	29981	20 %	0 %	20 %	60 %	339327809
21	NC_015727	TGCGC	2	10	29997	30006	0 %	20 %	40 %	40 %	339327809
22	NC_015727	GCCCG	2	10	30608	30617	0 %	0 %	40 %	60 %	339327809
23	NC_015727	TGCAT	2	10	33190	33199	20 %	40 %	20 %	20 %	339327812
24	NC_015727	CGGTT	2	10	35007	35016	0 %	40 %	40 %	20 %	339327814
25	NC_015727	GCCGA	2	10	35146	35155	20 %	0 %	40 %	40 %	339327814
26	NC_015727	CAGGC	2	10	37378	37387	20 %	0 %	40 %	40 %	339327818
27	NC_015727	GCCCG	2	10	39148	39157	0 %	0 %	40 %	60 %	339327820
28	NC_015727	CGTGG	2	10	39715	39724	0 %	20 %	60 %	20 %	339327820
29	NC_015727	TGCCA	2	10	40369	40378	20 %	20 %	20 %	40 %	339327821
30	NC_015727	CCGGA	2	10	43552	43561	20 %	0 %	40 %	40 %	339327823
31	NC_015727	TGCGG	2	10	45512	45521	0 %	20 %	60 %	20 %	339327825
32	NC_015727	CTGAC	2	10	46504	46513	20 %	20 %	20 %	40 %	339327827
33	NC_015727	GCCTG	2	10	47207	47216	0 %	20 %	40 %	40 %	339327827
34	NC_015727	GGCCT	2	10	48416	48425	0 %	20 %	40 %	40 %	339327828
35	NC_015727	TCGGT	2	10	50706	50715	0 %	40 %	40 %	20 %	339327831
36	NC_015727	GGCAG	2	10	54330	54339	20 %	0 %	60 %	20 %	339327833
37	NC_015727	CGGCG	2	10	54790	54799	0 %	0 %	60 %	40 %	339327834
38	NC_015727	GTTGT	2	10	55601	55610	0 %	60 %	40 %	0 %	339327835
39	NC_015727	TAGCC	2	10	56436	56445	20 %	20 %	20 %	40 %	339327835
40	NC_015727	GCCTT	2	10	57466	57475	0 %	40 %	20 %	40 %	339327836
41	NC_015727	CGAGG	2	10	57838	57847	20 %	0 %	60 %	20 %	339327836
42	NC_015727	GCACC	2	10	62401	62410	20 %	0 %	20 %	60 %	339327840
43	NC_015727	GCGGA	2	10	62883	62892	20 %	0 %	60 %	20 %	339327841
44	NC_015727	CGTCG	2	10	63017	63026	0 %	20 %	40 %	40 %	339327841
45	NC_015727	TCAGG	2	10	71346	71355	20 %	20 %	40 %	20 %	339327847
46	NC_015727	CTTGC	2	10	71587	71596	0 %	40 %	20 %	40 %	339327847
47	NC_015727	CGGAG	2	10	72973	72982	20 %	0 %	60 %	20 %	339327848
48	NC_015727	CGCGA	2	10	81270	81279	20 %	0 %	40 %	40 %	339327855
49	NC_015727	TTGCG	2	10	81430	81439	0 %	40 %	40 %	20 %	339327855
50	NC_015727	GTTCG	2	10	82384	82393	0 %	40 %	40 %	20 %	339327856
51	NC_015727	CGCCT	2	10	85339	85348	0 %	20 %	20 %	60 %	339327858
52	NC_015727	GGGGC	2	10	85349	85358	0 %	0 %	80 %	20 %	339327858
53	NC_015727	TGGTG	2	10	85413	85422	0 %	40 %	60 %	0 %	339327858
54	NC_015727	CCAGC	2	10	87489	87498	20 %	0 %	20 %	60 %	339327860
55	NC_015727	AGCGG	2	10	88892	88901	20 %	0 %	60 %	20 %	339327861
56	NC_015727	CTGGA	2	10	89851	89860	20 %	20 %	40 %	20 %	339327862
57	NC_015727	AGGGA	2	10	91385	91394	40 %	0 %	60 %	0 %	339327863
58	NC_015727	CGGGC	2	10	91645	91654	0 %	0 %	60 %	40 %	339327863
59	NC_015727	ATGGC	2	10	91929	91938	20 %	20 %	40 %	20 %	339327863
60	NC_015727	CCCGC	2	10	93331	93340	0 %	0 %	20 %	80 %	339327864
61	NC_015727	GTCCG	2	10	93978	93987	0 %	20 %	40 %	40 %	339327864
62	NC_015727	GCTGC	2	10	94111	94120	0 %	20 %	40 %	40 %	339327864
63	NC_015727	CGGCG	2	10	95252	95261	0 %	0 %	60 %	40 %	339327866
64	NC_015727	GGAGC	2	10	95388	95397	20 %	0 %	60 %	20 %	339327866
65	NC_015727	CGGCG	2	10	98870	98879	0 %	0 %	60 %	40 %	339327871
66	NC_015727	GGAGC	2	10	99006	99015	20 %	0 %	60 %	20 %	339327871
67	NC_015727	ATCGC	2	10	100870	100879	20 %	20 %	20 %	40 %	339327874
68	NC_015727	TGGCC	2	10	101534	101543	0 %	20 %	40 %	40 %	339327875
69	NC_015727	GCCAA	2	10	104301	104310	40 %	0 %	20 %	40 %	339327878
70	NC_015727	GCCGA	2	10	104559	104568	20 %	0 %	40 %	40 %	339327878
71	NC_015727	TGCCA	2	10	108116	108125	20 %	20 %	20 %	40 %	339327881
72	NC_015727	ATGCG	2	10	108191	108200	20 %	20 %	40 %	20 %	339327881
73	NC_015727	GACAC	2	10	108957	108966	40 %	0 %	20 %	40 %	339327882
74	NC_015727	GGCGC	2	10	112120	112129	0 %	0 %	60 %	40 %	339327887
75	NC_015727	AGTTC	2	10	115126	115135	20 %	40 %	20 %	20 %	339327893
76	NC_015727	GTACG	2	10	119213	119222	20 %	20 %	40 %	20 %	339327897
77	NC_015727	GTGCG	2	10	120067	120076	0 %	20 %	60 %	20 %	339327897
78	NC_015727	AAAGC	2	10	120472	120481	60 %	0 %	20 %	20 %	339327898
79	NC_015727	GACGG	2	10	127552	127561	20 %	0 %	60 %	20 %	339327905
80	NC_015727	CGGGG	2	10	128868	128877	0 %	0 %	80 %	20 %	339327907
81	NC_015727	ATTCA	2	10	129378	129387	40 %	40 %	0 %	20 %	339327907
82	NC_015727	CACGA	2	10	133304	133313	40 %	0 %	20 %	40 %	339327910
83	NC_015727	ACCGC	2	10	133945	133954	20 %	0 %	20 %	60 %	339327911
84	NC_015727	GCCGA	2	10	137175	137184	20 %	0 %	40 %	40 %	339327914
85	NC_015727	GCGCC	2	10	138181	138190	0 %	0 %	40 %	60 %	339327914
86	NC_015727	GCCAG	2	10	139753	139762	20 %	0 %	40 %	40 %	339327915
87	NC_015727	GTGGG	2	10	140147	140156	0 %	20 %	80 %	0 %	339327916
88	NC_015727	GCAGG	2	10	142893	142902	20 %	0 %	60 %	20 %	339327917
89	NC_015727	GCGCC	2	10	143099	143108	0 %	0 %	40 %	60 %	339327918
90	NC_015727	TGCGT	2	10	144993	145002	0 %	40 %	40 %	20 %	339327919
91	NC_015727	CGGCG	2	10	145108	145117	0 %	0 %	60 %	40 %	339327919
92	NC_015727	GCCAC	2	10	145541	145550	20 %	0 %	20 %	60 %	339327920
93	NC_015727	TCCCT	2	10	148456	148465	0 %	40 %	0 %	60 %	339327923
94	NC_015727	CGTAC	2	10	148480	148489	20 %	20 %	20 %	40 %	339327923
95	NC_015727	CTGAT	2	10	148758	148767	20 %	40 %	20 %	20 %	339327923
96	NC_015727	ACGCC	2	10	150412	150421	20 %	0 %	20 %	60 %	339327924
97	NC_015727	CTTTG	2	10	152174	152183	0 %	60 %	20 %	20 %	339327925
98	NC_015727	CACAC	2	10	153198	153207	40 %	0 %	0 %	60 %	339327926
99	NC_015727	GCGCT	2	10	154846	154855	0 %	20 %	40 %	40 %	339327927
100	NC_015727	CCGAG	2	10	159566	159575	20 %	0 %	40 %	40 %	339327931
101	NC_015727	GATTC	2	10	159721	159730	20 %	40 %	20 %	20 %	339327931
102	NC_015727	CTGGG	2	10	160330	160339	0 %	20 %	60 %	20 %	339327931
103	NC_015727	TGCCC	2	10	162064	162073	0 %	20 %	20 %	60 %	339327933
104	NC_015727	CCGGC	2	10	163091	163100	0 %	0 %	40 %	60 %	339327934
105	NC_015727	GCGCG	2	10	163124	163133	0 %	0 %	60 %	40 %	339327934
106	NC_015727	GCCCG	2	10	163214	163223	0 %	0 %	40 %	60 %	339327934
107	NC_015727	CGGCG	2	10	163493	163502	0 %	0 %	60 %	40 %	339327934
108	NC_015727	AAATC	2	10	167988	167997	60 %	20 %	0 %	20 %	339327938
109	NC_015727	CTGCG	2	10	168375	168384	0 %	20 %	40 %	40 %	339327938
110	NC_015727	GTCGC	2	10	170233	170242	0 %	20 %	40 %	40 %	339327940
111	NC_015727	CCGAG	2	10	170980	170989	20 %	0 %	40 %	40 %	339327940
112	NC_015727	AATGG	2	10	171842	171851	40 %	20 %	40 %	0 %	339327942
113	NC_015727	CCTGC	2	10	173622	173631	0 %	20 %	20 %	60 %	339327944
114	NC_015727	GCCAT	2	10	173824	173833	20 %	20 %	20 %	40 %	339327944
115	NC_015727	TTGGA	2	10	173920	173929	20 %	40 %	40 %	0 %	339327944
116	NC_015727	CGGAC	2	10	174479	174488	20 %	0 %	40 %	40 %	339327944
117	NC_015727	TTGAG	2	10	176991	177000	20 %	40 %	40 %	0 %	339327946
118	NC_015727	CAGCG	2	10	179998	180007	20 %	0 %	40 %	40 %	339327951
119	NC_015727	GGCAT	2	10	181817	181826	20 %	20 %	40 %	20 %	339327952
120	NC_015727	GAGTT	2	10	182560	182569	20 %	40 %	40 %	0 %	339327954
121	NC_015727	GCCGC	2	10	182770	182779	0 %	0 %	40 %	60 %	339327954
122	NC_015727	GGCAG	3	15	183454	183468	20 %	0 %	60 %	20 %	339327955
123	NC_015727	TGCTG	2	10	183941	183950	0 %	40 %	40 %	20 %	339327955
124	NC_015727	CCAGG	2	10	185513	185522	20 %	0 %	40 %	40 %	339327957
125	NC_015727	GGCGC	2	10	186086	186095	0 %	0 %	60 %	40 %	339327957
126	NC_015727	CGGCA	2	10	186923	186932	20 %	0 %	40 %	40 %	339327957
127	NC_015727	GGACA	2	10	187647	187656	40 %	0 %	40 %	20 %	339327958
128	NC_015727	TGACC	2	10	188308	188317	20 %	20 %	20 %	40 %	339327959
129	NC_015727	GCACG	2	10	188407	188416	20 %	0 %	40 %	40 %	339327959
130	NC_015727	GAGCC	2	10	188441	188450	20 %	0 %	40 %	40 %	339327959
131	NC_015727	CTCGC	2	10	192081	192090	0 %	20 %	20 %	60 %	339327962
132	NC_015727	AGCGA	2	10	192938	192947	40 %	0 %	40 %	20 %	339327963
133	NC_015727	GCGGT	2	10	193640	193649	0 %	20 %	60 %	20 %	339327964
134	NC_015727	CCCGA	2	10	197854	197863	20 %	0 %	20 %	60 %	339327969
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