MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CGGC	2	8	4311	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015727	TGGC	2	8	4519	4526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015727	ACGG	2	8	6101	6108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015727	CCGC	2	8	6253	6260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015727	GCCA	2	8	6302	6309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015727	GCTC	2	8	6629	6636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015727	CCTG	2	8	7040	7047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015727	TGGT	2	8	8475	8482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015727	CCGG	2	8	8601	8608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015727	CGCC	2	8	9987	9994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015727	GATG	2	8	17046	17053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015727	CGAC	2	8	17668	17675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015727	TTCA	2	8	20493	20500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015727	TCCA	2	8	21577	21584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015727	AAGG	2	8	26880	26887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015727	GCAG	2	8	27731	27738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015727	GGAA	2	8	27753	27760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015727	GGCA	2	8	28898	28905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015727	ATGA	2	8	31653	31660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015727	ACTG	2	8	32368	32375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015727	CTCA	2	8	32939	32946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015727	GCAA	2	8	33663	33670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015727	CAGG	2	8	33827	33834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015727	GCCG	2	8	34055	34062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015727	GGGC	2	8	34872	34879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015727	GTGC	2	8	34885	34892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015727	CCAC	2	8	35453	35460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_015727	CCCT	2	8	51618	51625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_015727	GGTT	2	8	51755	51762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015727	CGGC	2	8	58242	58249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015727	GAGC	2	8	70467	70474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015727	TTAA	2	8	70529	70536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015727	TTTC	2	8	71819	71826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015727	GTAA	2	8	73086	73093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015727	ATGC	2	8	73600	73607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015727	CCAT	2	8	73637	73644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015727	CGGC	2	8	73667	73674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015727	CGGC	2	8	74844	74851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015727	CGGC	2	8	75190	75197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015727	GCCG	2	8	75259	75266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015727	CGGC	2	8	75416	75423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015727	GACC	2	8	75675	75682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015727	CTTT	2	8	76398	76405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015727	TCAA	2	8	78138	78145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015727	ACCC	2	8	78178	78185	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_015727	CCAA	2	8	78200	78207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015727	TACA	2	8	78273	78280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015727	GCTT	2	8	78388	78395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015727	TGCG	2	8	78584	78591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015727	CTGC	3	12	79287	79298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015727	GACT	2	8	80928	80935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015727	CATG	2	8	81629	81636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015727	TGGA	2	8	81880	81887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015727	GGCC	2	8	81992	81999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015727	TACT	2	8	84952	84959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015727	ACTG	2	8	88644	88651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015727	GGAC	2	8	92435	92442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015727	GTCC	2	8	96732	96739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015727	AACC	2	8	96767	96774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015727	GCCC	2	8	96897	96904	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_015727	CATC	2	8	98122	98129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015727	GGAT	2	8	98318	98325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015727	CGGC	2	8	100676	100683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015727	AAGA	2	8	102502	102509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015727	TCAT	2	8	102742	102749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015727	GTCG	2	8	102758	102765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015727	ACTA	2	8	103692	103699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015727	CGCT	2	8	105109	105116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015727	CGAC	2	8	107236	107243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015727	GGTT	2	8	109273	109280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015727	ATTC	2	8	110480	110487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015727	TGGC	2	8	113163	113170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015727	AACC	2	8	113244	113251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015727	GTCT	2	8	143039	143046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015727	AAGA	2	8	145207	145214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015727	GTTT	2	8	146731	146738	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015727	TCAA	2	8	150755	150762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015727	AAGC	2	8	152544	152551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015727	CGGC	2	8	153947	153954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015727	GGGC	2	8	155330	155337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015727	GTGG	2	8	155344	155351	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015727	TTGG	2	8	155416	155423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015727	CGTC	2	8	155535	155542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015727	AATA	2	8	155545	155552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015727	TCCC	2	8	156078	156085	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_015727	TGCC	2	8	157932	157939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015727	TCAA	2	8	158430	158437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015727	ACCC	2	8	158470	158477	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_015727	CCAA	2	8	158492	158499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015727	TACA	2	8	158565	158572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015727	TGCG	2	8	158885	158892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015727	GTCC	2	8	159016	159023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015727	GCAT	2	8	159221	159228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015727	CTGC	2	8	160632	160639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015727	GGCC	2	8	163585	163592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015727	AACG	2	8	163924	163931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015727	CAGC	2	8	164282	164289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015727	CCCT	2	8	164872	164879	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_015727	CAGA	2	8	169035	169042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015727	GACC	2	8	175643	175650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015727	CTCA	2	8	175692	175699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015727	CGCT	2	8	175987	175994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015727	GGGT	2	8	177259	177266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015727	AGGT	2	8	177546	177553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015727	GCGA	2	8	177637	177644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015727	GCCA	2	8	178367	178374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015727	GCCG	2	8	179375	179382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015727	GACG	2	8	181876	181883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015727	GCGG	2	8	183077	183084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015727	ATGA	2	8	189394	189401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015727	ACCG	2	8	189697	189704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015727	CTCG	2	8	189849	189856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015727	TCAA	2	8	190802	190809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015727	GAAT	2	8	190852	190859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015727	GGTC	2	8	194382	194389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015727	TGTC	2	8	194998	195005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015727	TCAA	2	8	197538	197545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015727	CGCA	2	8	198783	198790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015727	GCGA	2	8	201110	201117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015727	ATCC	2	8	201262	201269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015727	GGCC	2	8	205456	205463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015727	CGGC	2	8	207135	207142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015727	TAAA	2	8	207182	207189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015727	CACG	2	8	207992	207999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015727	GATC	2	8	208325	208332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015727	CAGC	2	8	211599	211606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015727	GTTC	2	8	211718	211725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015727	TTAC	2	8	211840	211847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015727	GAGG	2	8	224991	224998	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015727	ATCC	2	8	225133	225140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015727	GGCT	2	8	225988	225995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015727	CAGG	2	8	226027	226034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015727	CGGC	2	8	227388	227395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015727	GGGC	2	8	228769	228776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015727	CAGG	2	8	228915	228922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015727	CGTC	2	8	229614	229621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015727	CGAT	2	8	231195	231202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015727	AGGA	2	8	233572	233579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015727	CATT	2	8	234896	234903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015727	GCTT	2	8	234969	234976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015727	GCCC	2	8	238432	238439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_015727	GCCG	2	8	238446	238453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015727	TTGC	2	8	239751	239758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015727	CAAG	2	8	239845	239852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015727	CCGG	2	8	239856	239863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015727	CCTT	2	8	240011	240018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015727	GGCG	2	8	244392	244399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015727	ACGC	2	8	244706	244713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015727	CCTT	2	8	244736	244743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015727	CCTG	2	8	250746	250753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015727	CATC	2	8	251725	251732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015727	GACT	2	8	257754	257761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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