MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 3360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CTTG	2	8	898	905	0 %	50 %	25 %	25 %	339327782
2	NC_015727	CGTG	2	8	1090	1097	0 %	25 %	50 %	25 %	339327782
3	NC_015727	TCGA	2	8	1133	1140	25 %	25 %	25 %	25 %	339327782
4	NC_015727	CTGT	2	8	1786	1793	0 %	50 %	25 %	25 %	339327783
5	NC_015727	AAGT	2	8	2275	2282	50 %	25 %	25 %	0 %	339327783
6	NC_015727	CGCA	2	8	2460	2467	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
7	NC_015727	CGCA	2	8	2617	2624	25 %	0 %	25 %	50 %	339327784
8	NC_015727	CGGC	2	8	4825	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
9	NC_015727	CCAG	2	8	5325	5332	25 %	0 %	25 %	50 %	339327785
10	NC_015727	GCGG	2	8	5450	5457	0 %	0 %	75 %	25 %	339327785
11	NC_015727	GGCC	2	8	5513	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	339327785
12	NC_015727	ACTG	2	8	5565	5572	25 %	25 %	25 %	25 %	339327785
13	NC_015727	GCCC	2	8	5649	5656	0 %	0 %	25 %	75 %	339327785
14	NC_015727	TCCG	2	8	5877	5884	0 %	25 %	25 %	50 %	339327786
15	NC_015727	GAAG	2	8	5922	5929	50 %	0 %	50 %	0 %	339327786
16	NC_015727	GGCG	2	8	6428	6435	0 %	0 %	75 %	25 %	339327787
17	NC_015727	GGCG	2	8	7309	7316	0 %	0 %	75 %	25 %	339327789
18	NC_015727	CGAG	2	8	7903	7910	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
19	NC_015727	GCAG	2	8	8163	8170	25 %	0 %	50 %	25 %	339327791
20	NC_015727	GGCC	2	8	8203	8210	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
21	NC_015727	CCGG	2	8	8317	8324	0 %	0 %	50 %	50 %	339327791
22	NC_015727	GCGG	2	8	9381	9388	0 %	0 %	75 %	25 %	339327792
23	NC_015727	CAGC	2	8	9687	9694	25 %	0 %	25 %	50 %	339327792
24	NC_015727	TGGC	2	8	10396	10403	0 %	25 %	50 %	25 %	339327793
25	NC_015727	CGTG	2	8	10472	10479	0 %	25 %	50 %	25 %	339327793
26	NC_015727	GGAA	2	8	11259	11266	50 %	0 %	50 %	0 %	339327794
27	NC_015727	GGGC	2	8	11302	11309	0 %	0 %	75 %	25 %	339327794
28	NC_015727	GGCA	2	8	12022	12029	25 %	0 %	50 %	25 %	339327794
29	NC_015727	GGCG	2	8	12635	12642	0 %	0 %	75 %	25 %	339327795
30	NC_015727	TGGC	2	8	12820	12827	0 %	25 %	50 %	25 %	339327795
31	NC_015727	CGAC	2	8	12922	12929	25 %	0 %	25 %	50 %	339327795
32	NC_015727	TCGA	2	8	13082	13089	25 %	25 %	25 %	25 %	339327796
33	NC_015727	TGGA	2	8	13220	13227	25 %	25 %	50 %	0 %	339327796
34	NC_015727	GGCG	2	8	13400	13407	0 %	0 %	75 %	25 %	339327796
35	NC_015727	GGAA	2	8	13864	13871	50 %	0 %	50 %	0 %	339327797
36	NC_015727	CGCC	2	8	14632	14639	0 %	0 %	25 %	75 %	339327797
37	NC_015727	CCTG	2	8	14659	14666	0 %	25 %	25 %	50 %	339327797
38	NC_015727	CTGC	2	8	14817	14824	0 %	25 %	25 %	50 %	339327798
39	NC_015727	GGGC	2	8	15183	15190	0 %	0 %	75 %	25 %	339327798
40	NC_015727	GTCC	2	8	15332	15339	0 %	25 %	25 %	50 %	339327798
41	NC_015727	GGCC	2	8	15367	15374	0 %	0 %	50 %	50 %	339327798
42	NC_015727	GGCT	3	12	15501	15512	0 %	25 %	50 %	25 %	339327798
43	NC_015727	CCTG	2	8	15606	15613	0 %	25 %	25 %	50 %	339327798
44	NC_015727	GCTT	2	8	15635	15642	0 %	50 %	25 %	25 %	339327798
45	NC_015727	CCGG	2	8	16064	16071	0 %	0 %	50 %	50 %	339327798
46	NC_015727	GACC	2	8	18671	18678	25 %	0 %	25 %	50 %	339327799
47	NC_015727	ATCG	2	8	18768	18775	25 %	25 %	25 %	25 %	339327799
48	NC_015727	GCAC	2	8	19702	19709	25 %	0 %	25 %	50 %	339327799
49	NC_015727	CGGT	2	8	20038	20045	0 %	25 %	50 %	25 %	339327799
50	NC_015727	GCCG	2	8	21065	21072	0 %	0 %	50 %	50 %	339327800
51	NC_015727	CCGG	2	8	21325	21332	0 %	0 %	50 %	50 %	339327800
52	NC_015727	TGGC	2	8	21347	21354	0 %	25 %	50 %	25 %	339327800
53	NC_015727	CAGT	2	8	21889	21896	25 %	25 %	25 %	25 %	339327801
54	NC_015727	GGAT	2	8	22044	22051	25 %	25 %	50 %	0 %	339327801
55	NC_015727	GGTC	2	8	22201	22208	0 %	25 %	50 %	25 %	339327801
56	NC_015727	CGGG	2	8	22716	22723	0 %	0 %	75 %	25 %	339327801
57	NC_015727	CGAC	2	8	23081	23088	25 %	0 %	25 %	50 %	339327802
58	NC_015727	GGCG	2	8	23529	23536	0 %	0 %	75 %	25 %	339327802
59	NC_015727	CGGC	2	8	23849	23856	0 %	0 %	50 %	50 %	339327803
60	NC_015727	AGGC	2	8	23916	23923	25 %	0 %	50 %	25 %	339327803
61	NC_015727	TAGT	2	8	24043	24050	25 %	50 %	25 %	0 %	339327803
62	NC_015727	TCGC	2	8	24358	24365	0 %	25 %	25 %	50 %	339327803
63	NC_015727	TGGT	2	8	24602	24609	0 %	50 %	50 %	0 %	339327804
64	NC_015727	GAAC	2	8	24871	24878	50 %	0 %	25 %	25 %	339327804
65	NC_015727	ACCC	2	8	25011	25018	25 %	0 %	0 %	75 %	339327804
66	NC_015727	GCTC	2	8	25323	25330	0 %	25 %	25 %	50 %	339327804
67	NC_015727	CTTT	2	8	26164	26171	0 %	75 %	0 %	25 %	339327805
68	NC_015727	CGAT	2	8	27106	27113	25 %	25 %	25 %	25 %	339327807
69	NC_015727	TGCG	2	8	27261	27268	0 %	25 %	50 %	25 %	339327807
70	NC_015727	CCTG	2	8	27889	27896	0 %	25 %	25 %	50 %	339327808
71	NC_015727	CGGC	2	8	28203	28210	0 %	0 %	50 %	50 %	339327808
72	NC_015727	CGCA	2	8	28571	28578	25 %	0 %	25 %	50 %	339327808
73	NC_015727	GCCC	2	8	28765	28772	0 %	0 %	25 %	75 %	339327808
74	NC_015727	GCAG	2	8	28831	28838	25 %	0 %	50 %	25 %	339327808
75	NC_015727	GGCG	2	8	28974	28981	0 %	0 %	75 %	25 %	339327809
76	NC_015727	GCCG	2	8	29185	29192	0 %	0 %	50 %	50 %	339327809
77	NC_015727	AGGA	2	8	29753	29760	50 %	0 %	50 %	0 %	339327809
78	NC_015727	ATTG	2	8	33302	33309	25 %	50 %	25 %	0 %	339327812
79	NC_015727	CATG	2	8	33439	33446	25 %	25 %	25 %	25 %	339327812
80	NC_015727	TTGA	2	8	34204	34211	25 %	50 %	25 %	0 %	339327813
81	NC_015727	CAGG	2	8	34450	34457	25 %	0 %	50 %	25 %	339327813
82	NC_015727	GAAA	2	8	35069	35076	75 %	0 %	25 %	0 %	339327814
83	NC_015727	GGAT	2	8	35517	35524	25 %	25 %	50 %	0 %	339327815
84	NC_015727	CGTA	2	8	35738	35745	25 %	25 %	25 %	25 %	339327816
85	NC_015727	CCAG	2	8	35853	35860	25 %	0 %	25 %	50 %	339327816
86	NC_015727	GGGA	2	8	36969	36976	25 %	0 %	75 %	0 %	339327818
87	NC_015727	TGCT	2	8	36986	36993	0 %	50 %	25 %	25 %	339327818
88	NC_015727	TTCA	2	8	37129	37136	25 %	50 %	0 %	25 %	339327818
89	NC_015727	AGCG	2	8	37186	37193	25 %	0 %	50 %	25 %	339327818
90	NC_015727	GCAC	2	8	37246	37253	25 %	0 %	25 %	50 %	339327818
91	NC_015727	CGAC	2	8	37274	37281	25 %	0 %	25 %	50 %	339327818
92	NC_015727	CGAC	2	8	38074	38081	25 %	0 %	25 %	50 %	339327819
93	NC_015727	CTGG	2	8	38803	38810	0 %	25 %	50 %	25 %	339327820
94	NC_015727	ATCC	2	8	40904	40911	25 %	25 %	0 %	50 %	339327821
95	NC_015727	CCCG	2	8	42546	42553	0 %	0 %	25 %	75 %	339327822
96	NC_015727	CCAC	2	8	42865	42872	25 %	0 %	0 %	75 %	339327822
97	NC_015727	TGGA	2	8	44029	44036	25 %	25 %	50 %	0 %	339327823
98	NC_015727	TGGC	2	8	44504	44511	0 %	25 %	50 %	25 %	339327823
99	NC_015727	GCCC	2	8	44556	44563	0 %	0 %	25 %	75 %	339327823
100	NC_015727	ACGC	2	8	44712	44719	25 %	0 %	25 %	50 %	339327824
101	NC_015727	AGGA	2	8	44747	44754	50 %	0 %	50 %	0 %	339327824
102	NC_015727	CCTG	2	8	45835	45842	0 %	25 %	25 %	50 %	339327826
103	NC_015727	GCGT	2	8	46393	46400	0 %	25 %	50 %	25 %	339327827
104	NC_015727	GAGC	2	8	46953	46960	25 %	0 %	50 %	25 %	339327827
105	NC_015727	GTAT	2	8	47327	47334	25 %	50 %	25 %	0 %	339327827
106	NC_015727	GGAA	2	8	47350	47357	50 %	0 %	50 %	0 %	339327827
107	NC_015727	ATCG	2	8	47879	47886	25 %	25 %	25 %	25 %	339327828
108	NC_015727	TGCA	2	8	48473	48480	25 %	25 %	25 %	25 %	339327828
109	NC_015727	TCTG	2	8	48687	48694	0 %	50 %	25 %	25 %	339327828
110	NC_015727	TGGA	2	8	49099	49106	25 %	25 %	50 %	0 %	339327829
111	NC_015727	CATT	2	8	49325	49332	25 %	50 %	0 %	25 %	339327829
112	NC_015727	CCGC	2	8	49537	49544	0 %	0 %	25 %	75 %	339327830
113	NC_015727	CGGT	2	8	49545	49552	0 %	25 %	50 %	25 %	339327830
114	NC_015727	AGGC	2	8	50487	50494	25 %	0 %	50 %	25 %	339327831
115	NC_015727	GACG	2	8	50599	50606	25 %	0 %	50 %	25 %	339327831
116	NC_015727	CTCA	2	8	50804	50811	25 %	25 %	0 %	50 %	339327831
117	NC_015727	CTGA	2	8	51275	51282	25 %	25 %	25 %	25 %	339327831
118	NC_015727	TATC	2	8	52892	52899	25 %	50 %	0 %	25 %	339327832
119	NC_015727	CGGC	2	8	53053	53060	0 %	0 %	50 %	50 %	339327832
120	NC_015727	GGCC	2	8	53146	53153	0 %	0 %	50 %	50 %	339327832
121	NC_015727	GGAT	2	8	53946	53953	25 %	25 %	50 %	0 %	339327833
122	NC_015727	GACG	2	8	55375	55382	25 %	0 %	50 %	25 %	339327834
123	NC_015727	GAAT	2	8	55760	55767	50 %	25 %	25 %	0 %	339327835
124	NC_015727	GGAA	2	8	56079	56086	50 %	0 %	50 %	0 %	339327835
125	NC_015727	GAGT	2	8	56222	56229	25 %	25 %	50 %	0 %	339327835
126	NC_015727	CGCT	2	8	56297	56304	0 %	25 %	25 %	50 %	339327835
127	NC_015727	TGCG	2	8	56363	56370	0 %	25 %	50 %	25 %	339327835
128	NC_015727	GGTT	2	8	56723	56730	0 %	50 %	50 %	0 %	339327835
129	NC_015727	TGAT	2	8	57686	57693	25 %	50 %	25 %	0 %	339327836
130	NC_015727	GCCT	2	8	57943	57950	0 %	25 %	25 %	50 %	339327836
131	NC_015727	CAGT	2	8	59055	59062	25 %	25 %	25 %	25 %	339327837
132	NC_015727	CGTC	2	8	59337	59344	0 %	25 %	25 %	50 %	339327837
133	NC_015727	TAAG	2	8	59458	59465	50 %	25 %	25 %	0 %	339327837
134	NC_015727	TGGT	2	8	60059	60066	0 %	50 %	50 %	0 %	339327838
135	NC_015727	TCCA	2	8	60352	60359	25 %	25 %	0 %	50 %	339327838
136	NC_015727	ACGA	2	8	60475	60482	50 %	0 %	25 %	25 %	339327838
137	NC_015727	CATT	2	8	60722	60729	25 %	50 %	0 %	25 %	339327839
138	NC_015727	ACTC	2	8	60888	60895	25 %	25 %	0 %	50 %	339327839
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