MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 21961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327782
2	NC_015727	GCC	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
3	NC_015727	GCC	2	6	341	346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
4	NC_015727	GGA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
5	NC_015727	CGC	2	6	423	428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
6	NC_015727	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327782
7	NC_015727	TCA	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
8	NC_015727	TCA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
9	NC_015727	GTT	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327782
10	NC_015727	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327782
11	NC_015727	TGA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327782
12	NC_015727	GGT	2	6	1266	1271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327782
13	NC_015727	GGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
14	NC_015727	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
15	NC_015727	CGG	2	6	1343	1348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327783
16	NC_015727	CGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327783
17	NC_015727	CGT	3	9	1695	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
18	NC_015727	GAC	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327783
19	NC_015727	TGC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
20	NC_015727	CAC	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327783
21	NC_015727	TCG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327784
22	NC_015727	GCT	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015727	ACC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015727	GCT	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015727	CCG	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015727	TTC	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015727	CCG	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
28	NC_015727	GCC	2	6	4730	4735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
29	NC_015727	TCC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327785
30	NC_015727	CGG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
31	NC_015727	GGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
32	NC_015727	CCA	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327785
33	NC_015727	CAG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327785
34	NC_015727	AAG	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327785
35	NC_015727	CGG	2	6	5601	5606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
36	NC_015727	GGC	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015727	ATT	2	6	5849	5854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339327786
38	NC_015727	TCG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327786
39	NC_015727	ACC	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327786
40	NC_015727	CGC	2	6	6033	6038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327786
41	NC_015727	TGC	2	6	6048	6053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015727	GCC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015727	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015727	ATT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015727	AGC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327787
46	NC_015727	GGC	2	6	6733	6738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015727	CAT	2	6	6740	6745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015727	CAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327788
49	NC_015727	CCT	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327788
50	NC_015727	AAC	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015727	GTT	3	9	7126	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327789
52	NC_015727	CAG	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
53	NC_015727	TCA	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327789
54	NC_015727	CAG	2	6	7249	7254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
55	NC_015727	TGG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327789
56	NC_015727	GCC	2	6	7375	7380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327790
57	NC_015727	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
58	NC_015727	CAA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
59	NC_015727	CTG	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015727	AGC	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015727	GCC	2	6	7676	7681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
62	NC_015727	CGA	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
63	NC_015727	GGC	2	6	7771	7776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
64	NC_015727	GCG	2	6	7787	7792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
65	NC_015727	GCC	2	6	7928	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
66	NC_015727	CGA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
67	NC_015727	CCA	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327791
68	NC_015727	GCA	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
69	NC_015727	GCC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
70	NC_015727	CGC	3	9	8267	8275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
71	NC_015727	TCC	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327791
72	NC_015727	CGC	2	6	8371	8376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
73	NC_015727	ACG	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
74	NC_015727	GCA	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
75	NC_015727	GTC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327791
76	NC_015727	CCG	2	6	8585	8590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015727	ATG	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327792
78	NC_015727	GCG	2	6	8776	8781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
79	NC_015727	GCA	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
80	NC_015727	GGC	2	6	8968	8973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
81	NC_015727	CAG	2	6	8986	8991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
82	NC_015727	CAG	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
83	NC_015727	TGG	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327792
84	NC_015727	AGC	2	6	9236	9241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
85	NC_015727	ATG	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327792
86	NC_015727	CGT	2	6	9453	9458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
87	NC_015727	TTG	2	6	9464	9469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327792
88	NC_015727	AAG	2	6	9470	9475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327792
89	NC_015727	GGT	2	6	9604	9609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327792
90	NC_015727	ATC	2	6	9629	9634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327792
91	NC_015727	CGG	2	6	9655	9660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
92	NC_015727	GCA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
93	NC_015727	AGC	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
94	NC_015727	AGC	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
95	NC_015727	CGT	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
96	NC_015727	TCG	2	6	9779	9784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
97	NC_015727	GCC	2	6	9903	9908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015727	GTC	2	6	10007	10012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015727	GGA	2	6	10139	10144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015727	GCA	2	6	10156	10161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327793
101	NC_015727	ACA	2	6	10172	10177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327793
102	NC_015727	GTG	2	6	10324	10329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327793
103	NC_015727	ACC	2	6	10497	10502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327793
104	NC_015727	CGC	3	9	10533	10541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327793
105	NC_015727	GAG	2	6	10751	10756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327793
106	NC_015727	CGG	2	6	10830	10835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327793
107	NC_015727	AAG	2	6	10928	10933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327793
108	NC_015727	GGA	2	6	10948	10953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327793
109	NC_015727	CCT	2	6	10998	11003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327793
110	NC_015727	CAA	2	6	11029	11034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327793
111	NC_015727	CTG	2	6	11133	11138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327793
112	NC_015727	AAG	2	6	11150	11155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327793
113	NC_015727	GCG	2	6	11164	11169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327793
114	NC_015727	GCG	2	6	11338	11343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
115	NC_015727	GTC	2	6	11350	11355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327794
116	NC_015727	CGG	2	6	11397	11402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
117	NC_015727	CAA	2	6	11508	11513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327794
118	NC_015727	GGC	2	6	11579	11584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
119	NC_015727	GGC	2	6	11589	11594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
120	NC_015727	TCG	2	6	11627	11632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327794
121	NC_015727	GTG	2	6	11659	11664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327794
122	NC_015727	GCG	2	6	11735	11740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
123	NC_015727	GCG	2	6	11774	11779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
124	NC_015727	GGC	2	6	11808	11813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
125	NC_015727	GAT	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327794
126	NC_015727	CGA	2	6	11922	11927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327794
127	NC_015727	CGG	3	9	11990	11998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
128	NC_015727	GCG	2	6	12056	12061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
129	NC_015727	AGC	2	6	12144	12149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015727	CGG	2	6	12317	12322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327795
131	NC_015727	GTG	2	6	12375	12380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327795
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