MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 3512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	GCT	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015727	ACC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015727	GCT	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015727	CCG	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015727	TTC	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015727	GGC	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015727	TGC	2	6	6048	6053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015727	GCC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015727	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015727	ATT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015727	GGC	2	6	6733	6738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015727	CAT	2	6	6740	6745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015727	AAC	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015727	CTG	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015727	AGC	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015727	CCG	2	6	8585	8590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015727	GCC	2	6	9903	9908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015727	GTC	2	6	10007	10012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015727	GGA	2	6	10139	10144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015727	AGC	2	6	12144	12149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015727	ACA	2	6	13016	13021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015727	GCG	2	6	16564	16569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015727	GGC	2	6	16616	16621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015727	ATT	2	6	16718	16723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015727	GAA	2	6	16852	16857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015727	CCT	2	6	16891	16896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015727	CGG	2	6	16931	16936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015727	CGG	2	6	16983	16988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015727	GGC	2	6	17080	17085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015727	CGG	2	6	17301	17306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015727	TCG	2	6	17328	17333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015727	GTG	2	6	17424	17429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015727	GCC	2	6	17444	17449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015727	GGC	2	6	17457	17462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015727	GGT	3	9	17487	17495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015727	CAG	2	6	17544	17549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015727	GAT	2	6	17591	17596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015727	CCG	2	6	17704	17709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015727	TCT	2	6	17734	17739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015727	CCA	2	6	17746	17751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015727	GGT	2	6	18065	18070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015727	CCG	2	6	18153	18158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015727	GCT	2	6	18182	18187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015727	GTG	2	6	18336	18341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015727	TCC	2	6	21538	21543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015727	TCG	2	6	21603	21608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015727	TGC	2	6	28918	28923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015727	GAC	2	6	31671	31676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015727	TCC	2	6	31708	31713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015727	TCC	2	6	31764	31769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015727	GCG	2	6	31770	31775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015727	CTG	2	6	31777	31782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015727	ATG	2	6	31906	31911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015727	GAG	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015727	CTG	2	6	31944	31949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015727	CGG	2	6	31963	31968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015727	TCT	2	6	32073	32078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015727	GAG	2	6	32100	32105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015727	AGC	2	6	32124	32129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015727	AAC	2	6	32149	32154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015727	CTG	2	6	32183	32188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015727	GCC	2	6	32214	32219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015727	GCC	2	6	32227	32232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015727	CTT	2	6	32393	32398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015727	TGG	2	6	32551	32556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015727	GAA	2	6	32609	32614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015727	GCC	2	6	32963	32968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015727	GAA	2	6	33626	33631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015727	TCC	2	6	33798	33803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015727	GAT	2	6	33902	33907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015727	GCC	2	6	34018	34023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015727	CAC	2	6	34027	34032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015727	GCG	2	6	34843	34848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015727	GCA	2	6	34928	34933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015727	CGT	2	6	35372	35377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015727	TGC	2	6	35382	35387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015727	ACC	2	6	35465	35470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015727	TTC	2	6	38469	38474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015727	GAA	2	6	38477	38482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015727	GCT	2	6	38655	38660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015727	GCT	2	6	38695	38700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015727	CAT	2	6	38736	38741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015727	CCT	2	6	39826	39831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015727	GTC	2	6	39909	39914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015727	AAG	2	6	39946	39951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015727	CCG	2	6	40110	40115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015727	CAT	2	6	40165	40170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015727	CGC	2	6	41768	41773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015727	CTG	2	6	41855	41860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015727	GCA	2	6	49490	49495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015727	GAA	2	6	51427	51432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015727	ATG	2	6	51533	51538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015727	ATT	2	6	51787	51792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015727	GCG	2	6	51808	51813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015727	GAT	2	6	51838	51843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015727	AGC	2	6	51920	51925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015727	GAA	2	6	51952	51957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015727	GAG	2	6	51981	51986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015727	GTT	2	6	52082	52087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015727	ATT	2	6	52302	52307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015727	TAA	2	6	52391	52396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015727	GTC	2	6	52424	52429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015727	ATG	2	6	52435	52440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015727	CGC	2	6	53567	53572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015727	GAG	2	6	53657	53662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015727	CAG	2	6	57022	57027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015727	GCC	2	6	57039	57044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015727	CAC	2	6	57077	57082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015727	CCA	2	6	57242	57247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015727	ATC	2	6	58133	58138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015727	CCT	2	6	58201	58206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015727	AAT	2	6	60687	60692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015727	TGG	2	6	61739	61744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015727	GCC	2	6	62712	62717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015727	GCT	2	6	62720	62725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015727	GCG	2	6	62729	62734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015727	GAA	2	6	62766	62771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015727	TCG	2	6	62784	62789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015727	ACC	2	6	64729	64734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015727	CGA	2	6	65969	65974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015727	CCA	2	6	69203	69208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015727	AGG	2	6	69250	69255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015727	TTG	2	6	72026	72031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015727	GCG	2	6	73127	73132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015727	GTG	2	6	73217	73222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015727	GTG	2	6	73232	73237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015727	GCA	2	6	73288	73293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015727	AAG	2	6	73388	73393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015727	TGG	2	6	73412	73417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015727	CCG	2	6	73446	73451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015727	CGA	2	6	73591	73596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015727	CGG	2	6	73619	73624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015727	GAT	2	6	73705	73710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015727	CTG	2	6	73795	73800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015727	TGG	3	9	73920	73928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015727	CTA	2	6	73951	73956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015727	CAC	2	6	73960	73965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015727	CGC	2	6	74030	74035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015727	CGG	2	6	74067	74072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015727	GCA	3	9	74124	74132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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