MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 18449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015727	CAG	2	6	123	128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327782
2	NC_015727	GCC	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
3	NC_015727	GCC	2	6	341	346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
4	NC_015727	GGA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
5	NC_015727	CGC	2	6	423	428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327782
6	NC_015727	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327782
7	NC_015727	TCA	2	6	951	956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
8	NC_015727	TCA	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327782
9	NC_015727	GTT	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327782
10	NC_015727	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327782
11	NC_015727	TGA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327782
12	NC_015727	GGT	2	6	1266	1271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327782
13	NC_015727	GGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327782
14	NC_015727	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
15	NC_015727	CGG	2	6	1343	1348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327783
16	NC_015727	CGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327783
17	NC_015727	CGT	3	9	1695	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
18	NC_015727	GAC	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327783
19	NC_015727	TGC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327783
20	NC_015727	CAC	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327783
21	NC_015727	TCG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327784
22	NC_015727	CCG	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
23	NC_015727	GCC	2	6	4730	4735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327785
24	NC_015727	TCC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327785
25	NC_015727	CGG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
26	NC_015727	GGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
27	NC_015727	CCA	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327785
28	NC_015727	CAG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327785
29	NC_015727	AAG	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327785
30	NC_015727	CGG	2	6	5601	5606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327785
31	NC_015727	ATT	2	6	5849	5854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339327786
32	NC_015727	TCG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327786
33	NC_015727	ACC	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327786
34	NC_015727	CGC	2	6	6033	6038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327786
35	NC_015727	AGC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327787
36	NC_015727	CAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327788
37	NC_015727	CCT	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327788
38	NC_015727	GTT	3	9	7126	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327789
39	NC_015727	CAG	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
40	NC_015727	TCA	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327789
41	NC_015727	CAG	2	6	7249	7254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327789
42	NC_015727	TGG	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327789
43	NC_015727	GCC	2	6	7375	7380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327790
44	NC_015727	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
45	NC_015727	CAA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327790
46	NC_015727	GCC	2	6	7676	7681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
47	NC_015727	CGA	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
48	NC_015727	GGC	2	6	7771	7776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
49	NC_015727	GCG	2	6	7787	7792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327791
50	NC_015727	GCC	2	6	7928	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
51	NC_015727	CGA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
52	NC_015727	CCA	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327791
53	NC_015727	GCA	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
54	NC_015727	GCC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
55	NC_015727	CGC	3	9	8267	8275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
56	NC_015727	TCC	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327791
57	NC_015727	CGC	2	6	8371	8376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327791
58	NC_015727	ACG	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
59	NC_015727	GCA	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327791
60	NC_015727	GTC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327791
61	NC_015727	ATG	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327792
62	NC_015727	GCG	2	6	8776	8781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
63	NC_015727	GCA	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
64	NC_015727	GGC	2	6	8968	8973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
65	NC_015727	CAG	2	6	8986	8991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
66	NC_015727	CAG	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
67	NC_015727	TGG	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327792
68	NC_015727	AGC	2	6	9236	9241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
69	NC_015727	ATG	2	6	9440	9445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327792
70	NC_015727	CGT	2	6	9453	9458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
71	NC_015727	TTG	2	6	9464	9469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327792
72	NC_015727	AAG	2	6	9470	9475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327792
73	NC_015727	GGT	2	6	9604	9609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327792
74	NC_015727	ATC	2	6	9629	9634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327792
75	NC_015727	CGG	2	6	9655	9660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327792
76	NC_015727	GCA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
77	NC_015727	AGC	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
78	NC_015727	AGC	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327792
79	NC_015727	CGT	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
80	NC_015727	TCG	2	6	9779	9784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327792
81	NC_015727	GCA	2	6	10156	10161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327793
82	NC_015727	ACA	2	6	10172	10177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327793
83	NC_015727	GTG	2	6	10324	10329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327793
84	NC_015727	ACC	2	6	10497	10502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327793
85	NC_015727	CGC	3	9	10533	10541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327793
86	NC_015727	GAG	2	6	10751	10756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327793
87	NC_015727	CGG	2	6	10830	10835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327793
88	NC_015727	AAG	2	6	10928	10933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327793
89	NC_015727	GGA	2	6	10948	10953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327793
90	NC_015727	CCT	2	6	10998	11003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327793
91	NC_015727	CAA	2	6	11029	11034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327793
92	NC_015727	CTG	2	6	11133	11138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327793
93	NC_015727	AAG	2	6	11150	11155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327793
94	NC_015727	GCG	2	6	11164	11169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327793
95	NC_015727	GCG	2	6	11338	11343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
96	NC_015727	GTC	2	6	11350	11355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327794
97	NC_015727	CGG	2	6	11397	11402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
98	NC_015727	CAA	2	6	11508	11513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327794
99	NC_015727	GGC	2	6	11579	11584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
100	NC_015727	GGC	2	6	11589	11594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
101	NC_015727	TCG	2	6	11627	11632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327794
102	NC_015727	GTG	2	6	11659	11664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327794
103	NC_015727	GCG	2	6	11735	11740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
104	NC_015727	GCG	2	6	11774	11779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
105	NC_015727	GGC	2	6	11808	11813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
106	NC_015727	GAT	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327794
107	NC_015727	CGA	2	6	11922	11927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327794
108	NC_015727	CGG	3	9	11990	11998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
109	NC_015727	GCG	2	6	12056	12061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327794
110	NC_015727	CGG	2	6	12317	12322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327795
111	NC_015727	GTG	2	6	12375	12380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327795
112	NC_015727	GGC	2	6	12402	12407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327795
113	NC_015727	CAA	2	6	12422	12427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327795
114	NC_015727	CGA	2	6	12455	12460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327795
115	NC_015727	GGC	2	6	12478	12483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327795
116	NC_015727	CTT	2	6	12512	12517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327795
117	NC_015727	TGA	2	6	12541	12546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327795
118	NC_015727	GGC	2	6	12548	12553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327795
119	NC_015727	CGG	3	9	12554	12562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327795
120	NC_015727	GGT	2	6	12584	12589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327795
121	NC_015727	GCC	2	6	12627	12632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327795
122	NC_015727	GTG	2	6	12702	12707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327795
123	NC_015727	GTC	2	6	12717	12722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327795
124	NC_015727	GTC	2	6	12882	12887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327795
125	NC_015727	TGG	2	6	12890	12895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327795
126	NC_015727	GCG	2	6	12953	12958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327795
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128	NC_015727	GCG	2	6	13213	13218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327796
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499	NC_015727	CGC	2	6	41366	41371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327821
500	NC_015727	GAT	2	6	41382	41387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327821

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