MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 2992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015726	ACCCC	2	10	501	510	20 %	0 %	0 %	80 %	339324159
2	NC_015726	ACCAC	2	10	1737	1746	40 %	0 %	0 %	60 %	339324159
3	NC_015726	AGCGC	2	10	3852	3861	20 %	0 %	40 %	40 %	339324161
4	NC_015726	GCTCA	2	10	9176	9185	20 %	20 %	20 %	40 %	339324164
5	NC_015726	GCCAC	2	10	10254	10263	20 %	0 %	20 %	60 %	339324165
6	NC_015726	TGCGC	2	10	14909	14918	0 %	20 %	40 %	40 %	339324169
7	NC_015726	CCCAG	2	10	15685	15694	20 %	0 %	20 %	60 %	339324170
8	NC_015726	GCCGC	2	10	15965	15974	0 %	0 %	40 %	60 %	339324170
9	NC_015726	GGGCA	2	10	16256	16265	20 %	0 %	60 %	20 %	339324170
10	NC_015726	GCCGC	3	15	17618	17632	0 %	0 %	40 %	60 %	339324172
11	NC_015726	CGCGC	2	10	18625	18634	0 %	0 %	40 %	60 %	339324173
12	NC_015726	GCCGC	2	10	18673	18682	0 %	0 %	40 %	60 %	339324173
13	NC_015726	GCGCA	2	10	26555	26564	20 %	0 %	40 %	40 %	339324180
14	NC_015726	GTCAT	2	10	27735	27744	20 %	40 %	20 %	20 %	339324180
15	NC_015726	CCGAT	2	10	29530	29539	20 %	20 %	20 %	40 %	339324181
16	NC_015726	GGCGA	2	10	30307	30316	20 %	0 %	60 %	20 %	339324182
17	NC_015726	GCGCG	2	10	31136	31145	0 %	0 %	60 %	40 %	339324183
18	NC_015726	GCCTG	2	10	33403	33412	0 %	20 %	40 %	40 %	339324184
19	NC_015726	CACGC	2	10	33662	33671	20 %	0 %	20 %	60 %	339324184
20	NC_015726	CGATG	2	10	35093	35102	20 %	20 %	40 %	20 %	339324185
21	NC_015726	GCTCG	2	10	35454	35463	0 %	20 %	40 %	40 %	339324186
22	NC_015726	GACCA	2	10	35500	35509	40 %	0 %	20 %	40 %	339324186
23	NC_015726	CAGGG	2	10	36726	36735	20 %	0 %	60 %	20 %	339324187
24	NC_015726	CCCGA	2	10	37352	37361	20 %	0 %	20 %	60 %	339324187
25	NC_015726	GCGGT	2	10	38019	38028	0 %	20 %	60 %	20 %	339324188
26	NC_015726	CGCGG	2	10	39160	39169	0 %	0 %	60 %	40 %	339324189
27	NC_015726	CGCGG	2	10	39424	39433	0 %	0 %	60 %	40 %	339324189
28	NC_015726	CTCCG	2	10	40165	40174	0 %	20 %	20 %	60 %	339324190
29	NC_015726	GCAGG	2	10	40529	40538	20 %	0 %	60 %	20 %	339324191
30	NC_015726	CGTCA	2	10	41713	41722	20 %	20 %	20 %	40 %	339324194
31	NC_015726	CCCGG	2	10	42351	42360	0 %	0 %	40 %	60 %	339324194
32	NC_015726	GCCAT	2	10	44563	44572	20 %	20 %	20 %	40 %	339324195
33	NC_015726	CGCCA	2	10	45290	45299	20 %	0 %	20 %	60 %	339324196
34	NC_015726	CAGCC	2	10	47482	47491	20 %	0 %	20 %	60 %	339324200
35	NC_015726	TGGCC	2	10	47700	47709	0 %	20 %	40 %	40 %	339324200
36	NC_015726	CAACC	2	10	52137	52146	40 %	0 %	0 %	60 %	339324206
37	NC_015726	GATGG	2	10	52438	52447	20 %	20 %	60 %	0 %	339324206
38	NC_015726	GGACC	2	10	53844	53853	20 %	0 %	40 %	40 %	339324208
39	NC_015726	CGGCG	2	10	54352	54361	0 %	0 %	60 %	40 %	339324209
40	NC_015726	GCGCT	2	10	54435	54444	0 %	20 %	40 %	40 %	339324209
41	NC_015726	GGGCA	2	10	55117	55126	20 %	0 %	60 %	20 %	339324210
42	NC_015726	GTGAA	2	10	55616	55625	40 %	20 %	40 %	0 %	339324210
43	NC_015726	GAGCA	2	10	55735	55744	40 %	0 %	40 %	20 %	339324210
44	NC_015726	AACCG	2	10	56028	56037	40 %	0 %	20 %	40 %	339324210
45	NC_015726	CTGGA	2	10	57235	57244	20 %	20 %	40 %	20 %	339324211
46	NC_015726	TGCGG	2	10	60311	60320	0 %	20 %	60 %	20 %	339324214
47	NC_015726	GCCGC	2	10	62115	62124	0 %	0 %	40 %	60 %	339324216
48	NC_015726	GCGCC	2	10	63360	63369	0 %	0 %	40 %	60 %	339324217
49	NC_015726	TGCCC	2	10	63471	63480	0 %	20 %	20 %	60 %	339324217
50	NC_015726	CGATC	2	10	65460	65469	20 %	20 %	20 %	40 %	339324219
51	NC_015726	CCCTG	2	10	67983	67992	0 %	20 %	20 %	60 %	339324222
52	NC_015726	CGGCG	2	10	68409	68418	0 %	0 %	60 %	40 %	339324222
53	NC_015726	GCGCG	2	10	68911	68920	0 %	0 %	60 %	40 %	339324223
54	NC_015726	CGGCG	2	10	70692	70701	0 %	0 %	60 %	40 %	339324224
55	NC_015726	CTGCG	2	10	70707	70716	0 %	20 %	40 %	40 %	339324224
56	NC_015726	CGAGC	2	10	71648	71657	20 %	0 %	40 %	40 %	339324225
57	NC_015726	CGGCG	2	10	73207	73216	0 %	0 %	60 %	40 %	339324227
58	NC_015726	AGGGC	2	10	73957	73966	20 %	0 %	60 %	20 %	339324227
59	NC_015726	CTGCG	2	10	74491	74500	0 %	20 %	40 %	40 %	339324228
60	NC_015726	TGCGA	2	10	74776	74785	20 %	20 %	40 %	20 %	339324228
61	NC_015726	GCCCG	2	10	77964	77973	0 %	0 %	40 %	60 %	339324231
62	NC_015726	TGGCT	2	10	79040	79049	0 %	40 %	40 %	20 %	339324232
63	NC_015726	GGCCA	2	10	80192	80201	20 %	0 %	40 %	40 %	339324234
64	NC_015726	GGCGC	2	10	81091	81100	0 %	0 %	60 %	40 %	339324235
65	NC_015726	GGGTC	2	10	81417	81426	0 %	20 %	60 %	20 %	339324235
66	NC_015726	AAGGA	2	10	83553	83562	60 %	0 %	40 %	0 %	339324238
67	NC_015726	CGCAG	2	10	85191	85200	20 %	0 %	40 %	40 %	339324240
68	NC_015726	CCGCA	2	10	86725	86734	20 %	0 %	20 %	60 %	339324242
69	NC_015726	GCCTG	2	10	89082	89091	0 %	20 %	40 %	40 %	339324244
70	NC_015726	CACCG	2	10	90485	90494	20 %	0 %	20 %	60 %	339324246
71	NC_015726	GCCGC	2	10	92547	92556	0 %	0 %	40 %	60 %	339324249
72	NC_015726	AGGCC	2	10	94165	94174	20 %	0 %	40 %	40 %	339324250
73	NC_015726	CGGCG	2	10	94944	94953	0 %	0 %	60 %	40 %	339324251
74	NC_015726	CGGCG	2	10	96818	96827	0 %	0 %	60 %	40 %	339324252
75	NC_015726	GCTGC	2	10	97215	97224	0 %	20 %	40 %	40 %	339324253
76	NC_015726	GGCCG	2	10	97956	97965	0 %	0 %	60 %	40 %	339324255
77	NC_015726	GCCCG	2	10	98421	98430	0 %	0 %	40 %	60 %	339324255
78	NC_015726	CCAGC	2	10	100602	100611	20 %	0 %	20 %	60 %	339324257
79	NC_015726	CGGCG	2	10	100676	100685	0 %	0 %	60 %	40 %	339324257
80	NC_015726	CGCGG	2	10	101398	101407	0 %	0 %	60 %	40 %	339324258
81	NC_015726	GCACG	2	10	101905	101914	20 %	0 %	40 %	40 %	339324259
82	NC_015726	GCGCG	2	10	102384	102393	0 %	0 %	60 %	40 %	339324259
83	NC_015726	CGTGC	2	10	104610	104619	0 %	20 %	40 %	40 %	339324261
84	NC_015726	GCGCC	2	10	104637	104646	0 %	0 %	40 %	60 %	339324261
85	NC_015726	TCGGC	2	10	104936	104945	0 %	20 %	40 %	40 %	339324261
86	NC_015726	GCCGG	2	10	109480	109489	0 %	0 %	60 %	40 %	339324265
87	NC_015726	GCCGC	2	10	113194	113203	0 %	0 %	40 %	60 %	339324268
88	NC_015726	AAGCA	2	10	114809	114818	60 %	0 %	20 %	20 %	339324270
89	NC_015726	GACCC	2	10	114947	114956	20 %	0 %	20 %	60 %	339324271
90	NC_015726	GCCGC	2	10	116940	116949	0 %	0 %	40 %	60 %	339324273
91	NC_015726	GGCGC	2	10	117445	117454	0 %	0 %	60 %	40 %	339324273
92	NC_015726	AGCGC	2	10	117459	117468	20 %	0 %	40 %	40 %	339324273
93	NC_015726	GCGCC	2	10	119677	119686	0 %	0 %	40 %	60 %	339324276
94	NC_015726	GCTGG	2	10	119926	119935	0 %	20 %	60 %	20 %	339324276
95	NC_015726	CGGCG	2	10	120526	120535	0 %	0 %	60 %	40 %	339324277
96	NC_015726	CCAGC	2	10	120931	120940	20 %	0 %	20 %	60 %	339324277
97	NC_015726	TGGCG	2	10	121104	121113	0 %	20 %	60 %	20 %	339324278
98	NC_015726	CCCAG	2	10	121173	121182	20 %	0 %	20 %	60 %	339324278
99	NC_015726	AAGCA	2	10	122192	122201	60 %	0 %	20 %	20 %	339324278
100	NC_015726	TCGAC	2	10	123758	123767	20 %	20 %	20 %	40 %	339324280
101	NC_015726	CGGGT	2	10	124554	124563	0 %	20 %	60 %	20 %	339324281
102	NC_015726	GGCGT	2	10	124803	124812	0 %	20 %	60 %	20 %	339324281
103	NC_015726	GCATC	2	10	125217	125226	20 %	20 %	20 %	40 %	339324282
104	NC_015726	GGCGC	2	10	126817	126826	0 %	0 %	60 %	40 %	339324283
105	NC_015726	GCGCC	2	10	128211	128220	0 %	0 %	40 %	60 %	339324285
106	NC_015726	GGCCT	2	10	129273	129282	0 %	20 %	40 %	40 %	339324286
107	NC_015726	ATTTT	2	10	129389	129398	20 %	80 %	0 %	0 %	339324286
108	NC_015726	GCCCA	2	10	131667	131676	20 %	0 %	20 %	60 %	339324288
109	NC_015726	TGCCG	2	10	131887	131896	0 %	20 %	40 %	40 %	339324288
110	NC_015726	GCGCC	2	10	135375	135384	0 %	0 %	40 %	60 %	339324292
111	NC_015726	GGCGA	2	10	135467	135476	20 %	0 %	60 %	20 %	339324292
112	NC_015726	GGGCG	2	10	135936	135945	0 %	0 %	80 %	20 %	339324292
113	NC_015726	AGCCG	2	10	137242	137251	20 %	0 %	40 %	40 %	339324294
114	NC_015726	GCTGG	2	10	137947	137956	0 %	20 %	60 %	20 %	339324294
115	NC_015726	GCCAC	2	10	138095	138104	20 %	0 %	20 %	60 %	339324295
116	NC_015726	CATGG	2	10	138533	138542	20 %	20 %	40 %	20 %	339324295
117	NC_015726	GCCGC	2	10	140130	140139	0 %	0 %	40 %	60 %	339324298
118	NC_015726	CCTGG	2	10	142141	142150	0 %	20 %	40 %	40 %	339324299
119	NC_015726	CTGAC	2	10	145552	145561	20 %	20 %	20 %	40 %	339324301
120	NC_015726	CAGGC	2	10	146348	146357	20 %	0 %	40 %	40 %	339324303
121	NC_015726	ACCAC	2	10	150168	150177	40 %	0 %	0 %	60 %	339324307
122	NC_015726	TCCGC	2	10	150959	150968	0 %	20 %	20 %	60 %	339324307
123	NC_015726	GCGCC	2	10	161205	161214	0 %	0 %	40 %	60 %	339324318
124	NC_015726	CTGGA	2	10	161560	161569	20 %	20 %	40 %	20 %	339324318
125	NC_015726	AGCAC	2	10	162353	162362	40 %	0 %	20 %	40 %	339324319
126	NC_015726	CATCC	2	10	163963	163972	20 %	20 %	0 %	60 %	339324321
127	NC_015726	CGATT	2	10	164538	164547	20 %	40 %	20 %	20 %	339324322
128	NC_015726	GCGCG	2	10	164714	164723	0 %	0 %	60 %	40 %	339324322
129	NC_015726	GTGCC	2	10	165233	165242	0 %	20 %	40 %	40 %	339324323
130	NC_015726	GCCGG	2	10	168251	168260	0 %	0 %	60 %	40 %	339324326
131	NC_015726	CGCTG	2	10	170659	170668	0 %	20 %	40 %	40 %	339324328
132	NC_015726	GCCGC	2	10	171024	171033	0 %	0 %	40 %	60 %	339324328
133	NC_015726	GCCGC	2	10	172221	172230	0 %	0 %	40 %	60 %	339324329
134	NC_015726	ACCGC	2	10	172710	172719	20 %	0 %	20 %	60 %	339324330
135	NC_015726	CGGCT	2	10	173069	173078	0 %	20 %	40 %	40 %	339324330
136	NC_015726	GCCTG	2	10	176207	176216	0 %	20 %	40 %	40 %	339324332
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