MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 10821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015726	ACGC	2	8	209	216	25 %	0 %	25 %	50 %	339324159
2	NC_015726	CGGC	2	8	579	586	0 %	0 %	50 %	50 %	339324159
3	NC_015726	CGCA	2	8	1172	1179	25 %	0 %	25 %	50 %	339324159
4	NC_015726	TACC	2	8	1246	1253	25 %	25 %	0 %	50 %	339324159
5	NC_015726	CGTG	2	8	1435	1442	0 %	25 %	50 %	25 %	339324159
6	NC_015726	GCCG	2	8	2076	2083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015726	TCCT	2	8	2341	2348	0 %	50 %	0 %	50 %	339324160
8	NC_015726	CGAC	2	8	2351	2358	25 %	0 %	25 %	50 %	339324160
9	NC_015726	ACCT	2	8	3190	3197	25 %	25 %	0 %	50 %	339324160
10	NC_015726	CAAG	2	8	4936	4943	50 %	0 %	25 %	25 %	339324161
11	NC_015726	CCAG	2	8	5028	5035	25 %	0 %	25 %	50 %	339324161
12	NC_015726	CTGA	2	8	5375	5382	25 %	25 %	25 %	25 %	339324161
13	NC_015726	CTGA	2	8	5402	5409	25 %	25 %	25 %	25 %	339324161
14	NC_015726	ATGC	2	8	5546	5553	25 %	25 %	25 %	25 %	339324161
15	NC_015726	TGCC	2	8	6316	6323	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015726	TCGT	2	8	6532	6539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015726	CCTC	2	8	6545	6552	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015726	CCGA	2	8	6573	6580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015726	GTAC	2	8	6673	6680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015726	GCCA	2	8	6887	6894	25 %	0 %	25 %	50 %	339324162
21	NC_015726	AGCC	2	8	6976	6983	25 %	0 %	25 %	50 %	339324162
22	NC_015726	ATGA	2	8	7097	7104	50 %	25 %	25 %	0 %	339324162
23	NC_015726	GCCT	2	8	7116	7123	0 %	25 %	25 %	50 %	339324162
24	NC_015726	GCGG	2	8	7206	7213	0 %	0 %	75 %	25 %	339324162
25	NC_015726	GTCG	2	8	7311	7318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015726	CTCA	2	8	7507	7514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015726	TGCC	2	8	8562	8569	0 %	25 %	25 %	50 %	339324164
28	NC_015726	GCGT	2	8	9061	9068	0 %	25 %	50 %	25 %	339324164
29	NC_015726	TCGC	2	8	9627	9634	0 %	25 %	25 %	50 %	339324165
30	NC_015726	CTGC	2	8	9646	9653	0 %	25 %	25 %	50 %	339324165
31	NC_015726	CGCC	2	8	9772	9779	0 %	0 %	25 %	75 %	339324165
32	NC_015726	ACCA	2	8	10496	10503	50 %	0 %	0 %	50 %	339324165
33	NC_015726	AGGC	2	8	10725	10732	25 %	0 %	50 %	25 %	339324165
34	NC_015726	CTGC	2	8	11677	11684	0 %	25 %	25 %	50 %	339324166
35	NC_015726	CCTG	2	8	11846	11853	0 %	25 %	25 %	50 %	339324166
36	NC_015726	CCGG	2	8	11998	12005	0 %	0 %	50 %	50 %	339324166
37	NC_015726	ACCT	2	8	12638	12645	25 %	25 %	0 %	50 %	339324167
38	NC_015726	GAGC	2	8	13352	13359	25 %	0 %	50 %	25 %	339324168
39	NC_015726	GGGT	2	8	13755	13762	0 %	25 %	75 %	0 %	339324168
40	NC_015726	TCAC	2	8	14722	14729	25 %	25 %	0 %	50 %	339324169
41	NC_015726	TCGG	2	8	14944	14951	0 %	25 %	50 %	25 %	339324169
42	NC_015726	GCCG	2	8	15922	15929	0 %	0 %	50 %	50 %	339324170
43	NC_015726	CTCG	2	8	16067	16074	0 %	25 %	25 %	50 %	339324170
44	NC_015726	GCTG	2	8	16626	16633	0 %	25 %	50 %	25 %	339324171
45	NC_015726	CCGG	2	8	16831	16838	0 %	0 %	50 %	50 %	339324171
46	NC_015726	GCCC	2	8	16869	16876	0 %	0 %	25 %	75 %	339324171
47	NC_015726	GTCG	2	8	17038	17045	0 %	25 %	50 %	25 %	339324171
48	NC_015726	AGAT	2	8	17174	17181	50 %	25 %	25 %	0 %	339324171
49	NC_015726	GCGG	2	8	17210	17217	0 %	0 %	75 %	25 %	339324171
50	NC_015726	CCAT	2	8	17748	17755	25 %	25 %	0 %	50 %	339324172
51	NC_015726	CAGC	2	8	18037	18044	25 %	0 %	25 %	50 %	339324172
52	NC_015726	CCAG	2	8	18553	18560	25 %	0 %	25 %	50 %	339324173
53	NC_015726	GCCA	2	8	18714	18721	25 %	0 %	25 %	50 %	339324173
54	NC_015726	CAGC	2	8	19076	19083	25 %	0 %	25 %	50 %	339324174
55	NC_015726	CCGG	2	8	19939	19946	0 %	0 %	50 %	50 %	339324175
56	NC_015726	GCCG	2	8	20317	20324	0 %	0 %	50 %	50 %	339324175
57	NC_015726	CGGC	2	8	21140	21147	0 %	0 %	50 %	50 %	339324176
58	NC_015726	ACGA	2	8	22105	22112	50 %	0 %	25 %	25 %	339324177
59	NC_015726	CGGG	2	8	22297	22304	0 %	0 %	75 %	25 %	339324177
60	NC_015726	GGCG	2	8	23333	23340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015726	CAGC	2	8	23678	23685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015726	TGCG	2	8	23918	23925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015726	TCGA	2	8	24029	24036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015726	GGCA	2	8	24265	24272	25 %	0 %	50 %	25 %	339324178
65	NC_015726	GCTG	2	8	24378	24385	0 %	25 %	50 %	25 %	339324178
66	NC_015726	CGCA	2	8	24410	24417	25 %	0 %	25 %	50 %	339324178
67	NC_015726	GTTT	2	8	25085	25092	0 %	75 %	25 %	0 %	339324178
68	NC_015726	GCAA	2	8	25388	25395	50 %	0 %	25 %	25 %	339324178
69	NC_015726	GTTC	2	8	25632	25639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015726	GGGC	2	8	25849	25856	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015726	AAGC	2	8	26024	26031	50 %	0 %	25 %	25 %	339324179
72	NC_015726	TCCT	2	8	26183	26190	0 %	50 %	0 %	50 %	339324179
73	NC_015726	AGCG	2	8	26619	26626	25 %	0 %	50 %	25 %	339324180
74	NC_015726	GCCG	2	8	26726	26733	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
75	NC_015726	AGGT	2	8	27786	27793	25 %	25 %	50 %	0 %	339324180
76	NC_015726	TGCC	2	8	27913	27920	0 %	25 %	25 %	50 %	339324180
77	NC_015726	AGCC	2	8	28064	28071	25 %	0 %	25 %	50 %	339324180
78	NC_015726	CCGA	2	8	28209	28216	25 %	0 %	25 %	50 %	339324180
79	NC_015726	CGCC	2	8	28602	28609	0 %	0 %	25 %	75 %	339324180
80	NC_015726	CGCT	2	8	28917	28924	0 %	25 %	25 %	50 %	339324180
81	NC_015726	TGCC	2	8	29473	29480	0 %	25 %	25 %	50 %	339324181
82	NC_015726	GCAG	2	8	29567	29574	25 %	0 %	50 %	25 %	339324181
83	NC_015726	GAGC	2	8	29771	29778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015726	CCGC	2	8	30017	30024	0 %	0 %	25 %	75 %	339324182
85	NC_015726	CAAG	2	8	30086	30093	50 %	0 %	25 %	25 %	339324182
86	NC_015726	GCCA	2	8	30427	30434	25 %	0 %	25 %	50 %	339324182
87	NC_015726	TGGC	2	8	30481	30488	0 %	25 %	50 %	25 %	339324182
88	NC_015726	ATGC	2	8	30945	30952	25 %	25 %	25 %	25 %	339324183
89	NC_015726	CCGG	2	8	31064	31071	0 %	0 %	50 %	50 %	339324183
90	NC_015726	TCAA	2	8	31276	31283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015726	GTGG	2	8	31357	31364	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015726	GGCA	2	8	31413	31420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015726	CTGC	2	8	31527	31534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015726	CGAC	2	8	33106	33113	25 %	0 %	25 %	50 %	339324184
95	NC_015726	TCGA	2	8	33200	33207	25 %	25 %	25 %	25 %	339324184
96	NC_015726	CTAT	2	8	34073	34080	25 %	50 %	0 %	25 %	339324185
97	NC_015726	GGAT	2	8	34116	34123	25 %	25 %	50 %	0 %	339324185
98	NC_015726	GCCA	2	8	34368	34375	25 %	0 %	25 %	50 %	339324185
99	NC_015726	GTTG	2	8	34568	34575	0 %	50 %	50 %	0 %	339324185
100	NC_015726	GGAA	2	8	34792	34799	50 %	0 %	50 %	0 %	339324185
101	NC_015726	GCAG	2	8	35024	35031	25 %	0 %	50 %	25 %	339324185
102	NC_015726	CGAC	2	8	35062	35069	25 %	0 %	25 %	50 %	339324185
103	NC_015726	GCCG	2	8	35109	35116	0 %	0 %	50 %	50 %	339324185
104	NC_015726	GCCG	2	8	35317	35324	0 %	0 %	50 %	50 %	339324186
105	NC_015726	ATGC	2	8	35714	35721	25 %	25 %	25 %	25 %	339324186
106	NC_015726	GCCG	2	8	36230	36237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015726	TGCC	2	8	36239	36246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015726	CAGC	2	8	36266	36273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015726	CCGC	2	8	36486	36493	0 %	0 %	25 %	75 %	339324187
110	NC_015726	GCCA	2	8	36849	36856	25 %	0 %	25 %	50 %	339324187
111	NC_015726	CCAT	2	8	37086	37093	25 %	25 %	0 %	50 %	339324187
112	NC_015726	CCGC	2	8	37165	37172	0 %	0 %	25 %	75 %	339324187
113	NC_015726	GCGG	2	8	37564	37571	0 %	0 %	75 %	25 %	339324187
114	NC_015726	TGCC	2	8	37756	37763	0 %	25 %	25 %	50 %	339324188
115	NC_015726	CGGC	2	8	37968	37975	0 %	0 %	50 %	50 %	339324188
116	NC_015726	CGTC	2	8	38502	38509	0 %	25 %	25 %	50 %	339324188
117	NC_015726	CTTC	2	8	39336	39343	0 %	50 %	0 %	50 %	339324189
118	NC_015726	GCCA	2	8	39406	39413	25 %	0 %	25 %	50 %	339324189
119	NC_015726	TCCG	2	8	39475	39482	0 %	25 %	25 %	50 %	339324189
120	NC_015726	GCGA	2	8	39512	39519	25 %	0 %	50 %	25 %	339324189
121	NC_015726	TGCC	2	8	39563	39570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015726	GGGC	2	8	40505	40512	0 %	0 %	75 %	25 %	339324191
123	NC_015726	CGCT	2	8	41107	41114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015726	CATC	2	8	41385	41392	25 %	25 %	0 %	50 %	339324193
125	NC_015726	GGCC	2	8	41790	41797	0 %	0 %	50 %	50 %	339324194
126	NC_015726	TGGC	2	8	41946	41953	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
127	NC_015726	GTGC	2	8	42705	42712	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
128	NC_015726	GGTC	2	8	42887	42894	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
129	NC_015726	GCTG	2	8	42987	42994	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
130	NC_015726	GATG	2	8	43044	43051	25 %	25 %	50 %	0 %	339324194
131	NC_015726	GCTG	2	8	43319	43326	0 %	25 %	50 %	25 %	339324195
132	NC_015726	GTGA	2	8	43851	43858	25 %	25 %	50 %	0 %	339324195
133	NC_015726	GCTG	2	8	43955	43962	0 %	25 %	50 %	25 %	339324195
134	NC_015726	CTTG	2	8	44531	44538	0 %	50 %	25 %	25 %	339324195
135	NC_015726	GCTG	2	8	44681	44688	0 %	25 %	50 %	25 %	339324196
136	NC_015726	GGCC	2	8	44791	44798	0 %	0 %	50 %	50 %	339324196
137	NC_015726	GTTC	2	8	45470	45477	0 %	50 %	25 %	25 %	339324197
138	NC_015726	CCAT	2	8	46773	46780	25 %	25 %	0 %	50 %	339324199
139	NC_015726	GACC	2	8	47101	47108	25 %	0 %	25 %	50 %	339324199
140	NC_015726	GCGG	2	8	47728	47735	0 %	0 %	75 %	25 %	339324200
141	NC_015726	GCCG	2	8	47967	47974	0 %	0 %	50 %	50 %	339324200
142	NC_015726	CGGC	2	8	48312	48319	0 %	0 %	50 %	50 %	339324201
143	NC_015726	GGCC	2	8	48840	48847	0 %	0 %	50 %	50 %	339324201
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