MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 9292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015726	ACGC	2	8	209	216	25 %	0 %	25 %	50 %	339324159
2	NC_015726	CGGC	2	8	579	586	0 %	0 %	50 %	50 %	339324159
3	NC_015726	CGCA	2	8	1172	1179	25 %	0 %	25 %	50 %	339324159
4	NC_015726	TACC	2	8	1246	1253	25 %	25 %	0 %	50 %	339324159
5	NC_015726	CGTG	2	8	1435	1442	0 %	25 %	50 %	25 %	339324159
6	NC_015726	TCCT	2	8	2341	2348	0 %	50 %	0 %	50 %	339324160
7	NC_015726	CGAC	2	8	2351	2358	25 %	0 %	25 %	50 %	339324160
8	NC_015726	ACCT	2	8	3190	3197	25 %	25 %	0 %	50 %	339324160
9	NC_015726	CAAG	2	8	4936	4943	50 %	0 %	25 %	25 %	339324161
10	NC_015726	CCAG	2	8	5028	5035	25 %	0 %	25 %	50 %	339324161
11	NC_015726	CTGA	2	8	5375	5382	25 %	25 %	25 %	25 %	339324161
12	NC_015726	CTGA	2	8	5402	5409	25 %	25 %	25 %	25 %	339324161
13	NC_015726	ATGC	2	8	5546	5553	25 %	25 %	25 %	25 %	339324161
14	NC_015726	GCCA	2	8	6887	6894	25 %	0 %	25 %	50 %	339324162
15	NC_015726	AGCC	2	8	6976	6983	25 %	0 %	25 %	50 %	339324162
16	NC_015726	ATGA	2	8	7097	7104	50 %	25 %	25 %	0 %	339324162
17	NC_015726	GCCT	2	8	7116	7123	0 %	25 %	25 %	50 %	339324162
18	NC_015726	GCGG	2	8	7206	7213	0 %	0 %	75 %	25 %	339324162
19	NC_015726	TGCC	2	8	8562	8569	0 %	25 %	25 %	50 %	339324164
20	NC_015726	GCGT	2	8	9061	9068	0 %	25 %	50 %	25 %	339324164
21	NC_015726	TCGC	2	8	9627	9634	0 %	25 %	25 %	50 %	339324165
22	NC_015726	CTGC	2	8	9646	9653	0 %	25 %	25 %	50 %	339324165
23	NC_015726	CGCC	2	8	9772	9779	0 %	0 %	25 %	75 %	339324165
24	NC_015726	ACCA	2	8	10496	10503	50 %	0 %	0 %	50 %	339324165
25	NC_015726	AGGC	2	8	10725	10732	25 %	0 %	50 %	25 %	339324165
26	NC_015726	CTGC	2	8	11677	11684	0 %	25 %	25 %	50 %	339324166
27	NC_015726	CCTG	2	8	11846	11853	0 %	25 %	25 %	50 %	339324166
28	NC_015726	CCGG	2	8	11998	12005	0 %	0 %	50 %	50 %	339324166
29	NC_015726	ACCT	2	8	12638	12645	25 %	25 %	0 %	50 %	339324167
30	NC_015726	GAGC	2	8	13352	13359	25 %	0 %	50 %	25 %	339324168
31	NC_015726	GGGT	2	8	13755	13762	0 %	25 %	75 %	0 %	339324168
32	NC_015726	TCAC	2	8	14722	14729	25 %	25 %	0 %	50 %	339324169
33	NC_015726	TCGG	2	8	14944	14951	0 %	25 %	50 %	25 %	339324169
34	NC_015726	GCCG	2	8	15922	15929	0 %	0 %	50 %	50 %	339324170
35	NC_015726	CTCG	2	8	16067	16074	0 %	25 %	25 %	50 %	339324170
36	NC_015726	GCTG	2	8	16626	16633	0 %	25 %	50 %	25 %	339324171
37	NC_015726	CCGG	2	8	16831	16838	0 %	0 %	50 %	50 %	339324171
38	NC_015726	GCCC	2	8	16869	16876	0 %	0 %	25 %	75 %	339324171
39	NC_015726	GTCG	2	8	17038	17045	0 %	25 %	50 %	25 %	339324171
40	NC_015726	AGAT	2	8	17174	17181	50 %	25 %	25 %	0 %	339324171
41	NC_015726	GCGG	2	8	17210	17217	0 %	0 %	75 %	25 %	339324171
42	NC_015726	CCAT	2	8	17748	17755	25 %	25 %	0 %	50 %	339324172
43	NC_015726	CAGC	2	8	18037	18044	25 %	0 %	25 %	50 %	339324172
44	NC_015726	CCAG	2	8	18553	18560	25 %	0 %	25 %	50 %	339324173
45	NC_015726	GCCA	2	8	18714	18721	25 %	0 %	25 %	50 %	339324173
46	NC_015726	CAGC	2	8	19076	19083	25 %	0 %	25 %	50 %	339324174
47	NC_015726	CCGG	2	8	19939	19946	0 %	0 %	50 %	50 %	339324175
48	NC_015726	GCCG	2	8	20317	20324	0 %	0 %	50 %	50 %	339324175
49	NC_015726	CGGC	2	8	21140	21147	0 %	0 %	50 %	50 %	339324176
50	NC_015726	ACGA	2	8	22105	22112	50 %	0 %	25 %	25 %	339324177
51	NC_015726	CGGG	2	8	22297	22304	0 %	0 %	75 %	25 %	339324177
52	NC_015726	GGCA	2	8	24265	24272	25 %	0 %	50 %	25 %	339324178
53	NC_015726	GCTG	2	8	24378	24385	0 %	25 %	50 %	25 %	339324178
54	NC_015726	CGCA	2	8	24410	24417	25 %	0 %	25 %	50 %	339324178
55	NC_015726	GTTT	2	8	25085	25092	0 %	75 %	25 %	0 %	339324178
56	NC_015726	GCAA	2	8	25388	25395	50 %	0 %	25 %	25 %	339324178
57	NC_015726	AAGC	2	8	26024	26031	50 %	0 %	25 %	25 %	339324179
58	NC_015726	TCCT	2	8	26183	26190	0 %	50 %	0 %	50 %	339324179
59	NC_015726	AGCG	2	8	26619	26626	25 %	0 %	50 %	25 %	339324180
60	NC_015726	GCCG	2	8	26726	26733	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
61	NC_015726	AGGT	2	8	27786	27793	25 %	25 %	50 %	0 %	339324180
62	NC_015726	TGCC	2	8	27913	27920	0 %	25 %	25 %	50 %	339324180
63	NC_015726	AGCC	2	8	28064	28071	25 %	0 %	25 %	50 %	339324180
64	NC_015726	CCGA	2	8	28209	28216	25 %	0 %	25 %	50 %	339324180
65	NC_015726	CGCC	2	8	28602	28609	0 %	0 %	25 %	75 %	339324180
66	NC_015726	CGCT	2	8	28917	28924	0 %	25 %	25 %	50 %	339324180
67	NC_015726	TGCC	2	8	29473	29480	0 %	25 %	25 %	50 %	339324181
68	NC_015726	GCAG	2	8	29567	29574	25 %	0 %	50 %	25 %	339324181
69	NC_015726	CCGC	2	8	30017	30024	0 %	0 %	25 %	75 %	339324182
70	NC_015726	CAAG	2	8	30086	30093	50 %	0 %	25 %	25 %	339324182
71	NC_015726	GCCA	2	8	30427	30434	25 %	0 %	25 %	50 %	339324182
72	NC_015726	TGGC	2	8	30481	30488	0 %	25 %	50 %	25 %	339324182
73	NC_015726	ATGC	2	8	30945	30952	25 %	25 %	25 %	25 %	339324183
74	NC_015726	CCGG	2	8	31064	31071	0 %	0 %	50 %	50 %	339324183
75	NC_015726	CGAC	2	8	33106	33113	25 %	0 %	25 %	50 %	339324184
76	NC_015726	TCGA	2	8	33200	33207	25 %	25 %	25 %	25 %	339324184
77	NC_015726	CTAT	2	8	34073	34080	25 %	50 %	0 %	25 %	339324185
78	NC_015726	GGAT	2	8	34116	34123	25 %	25 %	50 %	0 %	339324185
79	NC_015726	GCCA	2	8	34368	34375	25 %	0 %	25 %	50 %	339324185
80	NC_015726	GTTG	2	8	34568	34575	0 %	50 %	50 %	0 %	339324185
81	NC_015726	GGAA	2	8	34792	34799	50 %	0 %	50 %	0 %	339324185
82	NC_015726	GCAG	2	8	35024	35031	25 %	0 %	50 %	25 %	339324185
83	NC_015726	CGAC	2	8	35062	35069	25 %	0 %	25 %	50 %	339324185
84	NC_015726	GCCG	2	8	35109	35116	0 %	0 %	50 %	50 %	339324185
85	NC_015726	GCCG	2	8	35317	35324	0 %	0 %	50 %	50 %	339324186
86	NC_015726	ATGC	2	8	35714	35721	25 %	25 %	25 %	25 %	339324186
87	NC_015726	CCGC	2	8	36486	36493	0 %	0 %	25 %	75 %	339324187
88	NC_015726	GCCA	2	8	36849	36856	25 %	0 %	25 %	50 %	339324187
89	NC_015726	CCAT	2	8	37086	37093	25 %	25 %	0 %	50 %	339324187
90	NC_015726	CCGC	2	8	37165	37172	0 %	0 %	25 %	75 %	339324187
91	NC_015726	GCGG	2	8	37564	37571	0 %	0 %	75 %	25 %	339324187
92	NC_015726	TGCC	2	8	37756	37763	0 %	25 %	25 %	50 %	339324188
93	NC_015726	CGGC	2	8	37968	37975	0 %	0 %	50 %	50 %	339324188
94	NC_015726	CGTC	2	8	38502	38509	0 %	25 %	25 %	50 %	339324188
95	NC_015726	CTTC	2	8	39336	39343	0 %	50 %	0 %	50 %	339324189
96	NC_015726	GCCA	2	8	39406	39413	25 %	0 %	25 %	50 %	339324189
97	NC_015726	TCCG	2	8	39475	39482	0 %	25 %	25 %	50 %	339324189
98	NC_015726	GCGA	2	8	39512	39519	25 %	0 %	50 %	25 %	339324189
99	NC_015726	GGGC	2	8	40505	40512	0 %	0 %	75 %	25 %	339324191
100	NC_015726	CATC	2	8	41385	41392	25 %	25 %	0 %	50 %	339324193
101	NC_015726	GGCC	2	8	41790	41797	0 %	0 %	50 %	50 %	339324194
102	NC_015726	TGGC	2	8	41946	41953	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
103	NC_015726	GTGC	2	8	42705	42712	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
104	NC_015726	GGTC	2	8	42887	42894	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
105	NC_015726	GCTG	2	8	42987	42994	0 %	25 %	50 %	25 %	339324194
106	NC_015726	GATG	2	8	43044	43051	25 %	25 %	50 %	0 %	339324194
107	NC_015726	GCTG	2	8	43319	43326	0 %	25 %	50 %	25 %	339324195
108	NC_015726	GTGA	2	8	43851	43858	25 %	25 %	50 %	0 %	339324195
109	NC_015726	GCTG	2	8	43955	43962	0 %	25 %	50 %	25 %	339324195
110	NC_015726	CTTG	2	8	44531	44538	0 %	50 %	25 %	25 %	339324195
111	NC_015726	GCTG	2	8	44681	44688	0 %	25 %	50 %	25 %	339324196
112	NC_015726	GGCC	2	8	44791	44798	0 %	0 %	50 %	50 %	339324196
113	NC_015726	GTTC	2	8	45470	45477	0 %	50 %	25 %	25 %	339324197
114	NC_015726	CCAT	2	8	46773	46780	25 %	25 %	0 %	50 %	339324199
115	NC_015726	GACC	2	8	47101	47108	25 %	0 %	25 %	50 %	339324199
116	NC_015726	GCGG	2	8	47728	47735	0 %	0 %	75 %	25 %	339324200
117	NC_015726	GCCG	2	8	47967	47974	0 %	0 %	50 %	50 %	339324200
118	NC_015726	CGGC	2	8	48312	48319	0 %	0 %	50 %	50 %	339324201
119	NC_015726	GGCC	2	8	48840	48847	0 %	0 %	50 %	50 %	339324201
120	NC_015726	CCGC	2	8	49669	49676	0 %	0 %	25 %	75 %	339324202
121	NC_015726	CGGT	2	8	50268	50275	0 %	25 %	50 %	25 %	339324203
122	NC_015726	CGGA	2	8	51274	51281	25 %	0 %	50 %	25 %	339324205
123	NC_015726	GCTT	2	8	51455	51462	0 %	50 %	25 %	25 %	339324205
124	NC_015726	ACTG	2	8	51737	51744	25 %	25 %	25 %	25 %	339324205
125	NC_015726	CAGG	2	8	51745	51752	25 %	0 %	50 %	25 %	339324205
126	NC_015726	CAGC	2	8	51834	51841	25 %	0 %	25 %	50 %	339324205
127	NC_015726	AGCA	2	8	52675	52682	50 %	0 %	25 %	25 %	339324207
128	NC_015726	GGCA	2	8	53609	53616	25 %	0 %	50 %	25 %	339324208
129	NC_015726	CGGC	2	8	53673	53680	0 %	0 %	50 %	50 %	339324208
130	NC_015726	GCGG	2	8	53949	53956	0 %	0 %	75 %	25 %	339324208
131	NC_015726	GTGA	2	8	54284	54291	25 %	25 %	50 %	0 %	339324209
132	NC_015726	CTGC	2	8	55327	55334	0 %	25 %	25 %	50 %	339324210
133	NC_015726	GACC	2	8	55509	55516	25 %	0 %	25 %	50 %	339324210
134	NC_015726	CGGC	2	8	55748	55755	0 %	0 %	50 %	50 %	339324210
135	NC_015726	GACG	2	8	56172	56179	25 %	0 %	50 %	25 %	339324210
136	NC_015726	ATCG	2	8	56715	56722	25 %	25 %	25 %	25 %	339324211
137	NC_015726	TGAC	2	8	57258	57265	25 %	25 %	25 %	25 %	339324211
138	NC_015726	CCGG	2	8	58041	58048	0 %	0 %	50 %	50 %	339324212
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