MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 65111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015726	GGC	2	6	118	123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324159
2	NC_015726	AGC	2	6	124	129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
3	NC_015726	CGC	2	6	150	155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324159
4	NC_015726	GAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324159
5	NC_015726	CGC	2	6	343	348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324159
6	NC_015726	GCA	2	6	404	409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
7	NC_015726	GGC	2	6	452	457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324159
8	NC_015726	GGC	2	6	611	616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324159
9	NC_015726	GCA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
10	NC_015726	CCG	2	6	687	692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324159
11	NC_015726	GCA	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
12	NC_015726	CAG	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
13	NC_015726	CAG	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
14	NC_015726	GCG	2	6	774	779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324159
15	NC_015726	CCA	2	6	796	801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324159
16	NC_015726	CAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324159
17	NC_015726	GGC	2	6	953	958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324159
18	NC_015726	TGC	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324159
19	NC_015726	CGA	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
20	NC_015726	CTA	2	6	1111	1116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324159
21	NC_015726	CTG	3	9	1130	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324159
22	NC_015726	CGA	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
23	NC_015726	TTC	2	6	1154	1159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324159
24	NC_015726	TTC	2	6	1187	1192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324159
25	NC_015726	ATC	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324159
26	NC_015726	CGA	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
27	NC_015726	GCC	2	6	1324	1329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324159
28	NC_015726	TGA	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324159
29	NC_015726	GCC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324159
30	NC_015726	CTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324159
31	NC_015726	CTG	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324159
32	NC_015726	AGA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324159
33	NC_015726	ACA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324159
34	NC_015726	AGA	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324159
35	NC_015726	GGC	2	6	1727	1732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324159
36	NC_015726	TGC	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324159
37	NC_015726	CGA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
38	NC_015726	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324159
39	NC_015726	CTG	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324160
40	NC_015726	GCC	2	6	2282	2287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324160
41	NC_015726	CTG	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324160
42	NC_015726	CAC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324160
43	NC_015726	GCG	2	6	2390	2395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324160
44	NC_015726	CCA	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324160
45	NC_015726	GCT	2	6	2436	2441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324160
46	NC_015726	AGA	2	6	2609	2614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324160
47	NC_015726	CTG	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324160
48	NC_015726	GCA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324160
49	NC_015726	CTA	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324160
50	NC_015726	TGC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324160
51	NC_015726	TGG	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324160
52	NC_015726	AAG	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324160
53	NC_015726	GCG	2	6	2753	2758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324160
54	NC_015726	TCA	2	6	2804	2809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324160
55	NC_015726	CTG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324160
56	NC_015726	ACG	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324160
57	NC_015726	GCC	2	6	2881	2886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324160
58	NC_015726	GCA	2	6	3015	3020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324160
59	NC_015726	GAC	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324160
60	NC_015726	CCA	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324160
61	NC_015726	GAC	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324160
62	NC_015726	CGT	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324160
63	NC_015726	TGA	2	6	3325	3330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324160
64	NC_015726	CAG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
65	NC_015726	GCA	2	6	3577	3582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
66	NC_015726	CAC	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324161
67	NC_015726	CGA	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
68	NC_015726	TCG	2	6	3792	3797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
69	NC_015726	CGA	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
70	NC_015726	CGG	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324161
71	NC_015726	TCG	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
72	NC_015726	ATC	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324161
73	NC_015726	CGA	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
74	NC_015726	AAC	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324161
75	NC_015726	AGG	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324161
76	NC_015726	CGG	2	6	4297	4302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324161
77	NC_015726	TGC	2	6	4344	4349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
78	NC_015726	TCT	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324161
79	NC_015726	ACG	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
80	NC_015726	CAA	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324161
81	NC_015726	GGC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324161
82	NC_015726	TCA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324161
83	NC_015726	ACC	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324161
84	NC_015726	CGA	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
85	NC_015726	GAA	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324161
86	NC_015726	TCG	2	6	4695	4700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
87	NC_015726	CTG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
88	NC_015726	ATC	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324161
89	NC_015726	TCG	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
90	NC_015726	CGC	2	6	4771	4776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324161
91	NC_015726	GCC	2	6	4790	4795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324161
92	NC_015726	CGC	2	6	4817	4822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324161
93	NC_015726	TGG	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324161
94	NC_015726	GGC	2	6	4925	4930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324161
95	NC_015726	GAC	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
96	NC_015726	ACC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324161
97	NC_015726	CAT	4	12	5116	5127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324161
98	NC_015726	TTC	2	6	5177	5182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324161
99	NC_015726	CAT	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324161
100	NC_015726	GCC	2	6	5233	5238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324161
101	NC_015726	GAT	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324161
102	NC_015726	CTG	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
103	NC_015726	TTG	2	6	5436	5441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324161
104	NC_015726	GCT	3	9	5498	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
105	NC_015726	CTG	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
106	NC_015726	GGC	2	6	5569	5574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324161
107	NC_015726	ATG	3	9	5580	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324161
108	NC_015726	CTG	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
109	NC_015726	TGA	2	6	5614	5619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324161
110	NC_015726	TGA	2	6	5640	5645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324161
111	NC_015726	CGT	2	6	5651	5656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
112	NC_015726	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324161
113	NC_015726	TGC	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
114	NC_015726	GCT	2	6	5842	5847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
115	NC_015726	GTT	2	6	5914	5919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324161
116	NC_015726	GAC	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324161
117	NC_015726	CTG	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324161
118	NC_015726	GCG	2	6	5981	5986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324161
119	NC_015726	TGG	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324161
120	NC_015726	CCT	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324162
121	NC_015726	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324162
122	NC_015726	TGA	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324162
123	NC_015726	CGT	2	6	6937	6942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324162
124	NC_015726	GTA	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324162
125	NC_015726	CGT	2	6	7183	7188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324162
126	NC_015726	GGC	2	6	7599	7604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324163
127	NC_015726	GCT	2	6	7608	7613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324163
128	NC_015726	ACC	2	6	7717	7722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324163
129	NC_015726	CTT	2	6	7800	7805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324163
130	NC_015726	ACT	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324163
131	NC_015726	GCC	2	6	7993	7998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324163
132	NC_015726	CCG	2	6	8024	8029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324163
133	NC_015726	TAC	2	6	8167	8172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324163
134	NC_015726	CTT	2	6	8181	8186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324163
135	NC_015726	CAC	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324163
136	NC_015726	CTG	2	6	8299	8304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324163
137	NC_015726	CTG	3	9	8317	8325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324163
138	NC_015726	CCA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324163
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142	NC_015726	CGG	2	6	8617	8622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324164
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146	NC_015726	CAT	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324164
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159	NC_015726	CGC	2	6	9858	9863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324165
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162	NC_015726	CCG	2	6	10047	10052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324165
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251	NC_015726	GCA	2	6	14393	14398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324169
252	NC_015726	AGT	2	6	14441	14446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324169
253	NC_015726	CGA	2	6	14454	14459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324169
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377	NC_015726	ATC	2	6	24551	24556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324178
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380	NC_015726	CCG	2	6	24678	24683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324178
381	NC_015726	GGC	2	6	24758	24763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324178
382	NC_015726	TCG	2	6	24846	24851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324178
383	NC_015726	CGC	2	6	24877	24882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324178
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482	NC_015726	CGA	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324184
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484	NC_015726	CAA	2	6	33622	33627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324184
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492	NC_015726	GGC	2	6	34203	34208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324185
493	NC_015726	CCA	2	6	34292	34297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324185
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495	NC_015726	GCG	2	6	34342	34347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324185
496	NC_015726	TGG	2	6	34471	34476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324185
497	NC_015726	GGT	2	6	34484	34489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324185
498	NC_015726	AGC	2	6	34645	34650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324185
499	NC_015726	GAC	2	6	34659	34664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324185
500	NC_015726	CGC	2	6	34685	34690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324185

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