MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma bovis Hubei-1 chromosome

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015725	ATTTAT	2	12	56492	56503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015725	TAAATA	2	12	69623	69634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015725	TAAATT	2	12	109346	109357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015725	TAATAT	2	12	109453	109464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015725	AAGCAA	2	12	162593	162604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015725	GTTTGC	2	12	162606	162617	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015725	TAAAAT	2	12	173639	173650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015725	ATATAA	2	12	173653	173664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015725	AAATTG	2	12	206073	206084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015725	AGAAAA	2	12	206315	206326	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015725	AATTTA	2	12	279409	279420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015725	TTTTAG	2	12	298708	298719	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015725	ATTAAA	2	12	301871	301882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015725	TAAAAA	2	12	318688	318699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015725	ATTCTT	2	12	324601	324612	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015725	TTTAAT	2	12	361190	361201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015725	ATTAAT	2	12	372818	372829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015725	ATTCTT	2	12	376511	376522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015725	GTTGCA	2	12	384023	384034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015725	TTGCAA	2	12	385316	385327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015725	GTTGCA	2	12	397807	397818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015725	TATGAA	2	12	400460	400471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015725	AAACAT	2	12	402746	402757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015725	AGCAAG	2	12	431168	431179	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015725	ATGAGA	2	12	437112	437123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015725	AATGAA	2	12	439973	439984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015725	CTAAAA	2	12	457338	457349	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015725	AACACA	2	12	504988	504999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015725	ATAAAA	2	12	580978	580989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015725	AAAAGT	2	12	590688	590699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015725	ACTAAT	2	12	646630	646641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015725	TAATAT	2	12	655801	655812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015725	TGTTTA	2	12	677719	677730	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015725	CTCCAG	2	12	681651	681662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015725	TAAAAA	2	12	689786	689797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015725	AGCAAA	2	12	741187	741198	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015725	TTAATA	2	12	744753	744764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015725	TTATAA	2	12	746052	746063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015725	TAAAAA	2	12	747315	747326	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015725	TTTTTG	2	12	769986	769997	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015725	ATTTTT	2	12	790932	790943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015725	AAAGTT	2	12	808286	808297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015725	GATATT	2	12	826748	826759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015725	TATGCA	2	12	857131	857142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015725	ATATTA	2	12	860497	860508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015725	ATGAAA	2	12	890917	890928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015725	ATTACT	2	12	893322	893333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015725	ATTTTT	2	12	922146	922157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.