MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015724	ACCA	2	8	3781	3788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015724	GCCA	2	8	7474	7481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015724	AGTG	2	8	10076	10083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015724	GTCG	2	8	10090	10097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015724	TGCC	2	8	14674	14681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015724	AGCG	2	8	26391	26398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015724	GGTG	2	8	27135	27142	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015724	GCCG	2	8	29766	29773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015724	GGCA	2	8	32973	32980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015724	CGTT	2	8	33065	33072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015724	TCGG	2	8	38407	38414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015724	CCCA	2	8	39550	39557	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015724	CCCG	2	8	39578	39585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015724	CGTG	2	8	39697	39704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015724	GCCG	2	8	44359	44366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015724	TCGC	2	8	44397	44404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015724	CGGG	2	8	44474	44481	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015724	GCAG	2	8	45206	45213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015724	GCCG	2	8	60537	60544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015724	ATGG	2	8	60572	60579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015724	GGCG	2	8	62767	62774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015724	CTAC	2	8	63319	63326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015724	CATC	2	8	63365	63372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015724	CGCC	2	8	66565	66572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015724	GCCA	2	8	70395	70402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015724	GCCA	2	8	72134	72141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015724	GCAG	2	8	74003	74010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015724	GTCA	2	8	80415	80422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015724	ATTG	2	8	80449	80456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015724	CGCC	2	8	81755	81762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015724	GCTG	2	8	83126	83133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015724	GTGG	2	8	84290	84297	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015724	CGGC	2	8	84914	84921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015724	CCTG	2	8	87380	87387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015724	CCGA	2	8	90839	90846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015724	AACC	2	8	90931	90938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015724	TGCG	2	8	104076	104083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015724	ACAT	2	8	104175	104182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015724	CAAT	2	8	106240	106247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015724	GCTG	2	8	106249	106256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015724	CCCA	2	8	107889	107896	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_015724	CGTA	2	8	107906	107913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015724	GCCA	2	8	108071	108078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015724	GGAG	2	8	108516	108523	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015724	AAGG	2	8	112558	112565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015724	CGGC	2	8	113647	113654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015724	GGAA	2	8	113665	113672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015724	GCCC	2	8	118860	118867	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_015724	TCCA	2	8	118874	118881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015724	GGTT	2	8	119694	119701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015724	CGGG	2	8	134676	134683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015724	TCGA	2	8	141129	141136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015724	ATCA	2	8	143102	143109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015724	ACCA	2	8	145882	145889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015724	TTCA	2	8	154908	154915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015724	CCAG	2	8	170783	170790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015724	CGGC	2	8	170933	170940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015724	AGGC	2	8	171024	171031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015724	ACGA	2	8	171034	171041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015724	TGCA	2	8	175160	175167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015724	AGCG	2	8	175352	175359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015724	GGTA	2	8	176628	176635	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015724	CCTT	2	8	179829	179836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015724	GGCG	2	8	180439	180446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015724	GCCG	2	8	183621	183628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015724	AAGG	2	8	184951	184958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015724	CCCA	2	8	185069	185076	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_015724	GCAC	2	8	185743	185750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015724	CGGG	2	8	185876	185883	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015724	CTTG	2	8	185920	185927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015724	GATG	2	8	186009	186016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015724	GTCG	2	8	186132	186139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015724	GCCG	2	8	201751	201758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015724	TGAA	2	8	206078	206085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015724	GCCT	2	8	206146	206153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015724	AAAT	2	8	206872	206879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015724	GATC	2	8	210917	210924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015724	AGCG	2	8	216416	216423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015724	CCGG	2	8	227280	227287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015724	GGGT	2	8	228716	228723	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015724	GTCT	2	8	229018	229025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015724	CGCC	2	8	229056	229063	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_015724	CGAT	2	8	229547	229554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015724	GCGT	2	8	229662	229669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015724	CCAC	2	8	229707	229714	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_015724	TCCG	2	8	229791	229798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015724	GTGG	2	8	233005	233012	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015724	CGTG	2	8	233485	233492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015724	TGGC	2	8	233610	233617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015724	GACA	2	8	236199	236206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015724	GCGG	2	8	236351	236358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015724	TGGC	2	8	236860	236867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015724	GAGT	2	8	236936	236943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015724	GTAG	2	8	236999	237006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015724	GTTC	2	8	241749	241756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015724	ATGA	2	8	243383	243390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015724	GCCC	2	8	255520	255527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_015724	AGCC	2	8	255644	255651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015724	GCCG	2	8	256009	256016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015724	GCTG	2	8	256195	256202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015724	TGGC	2	8	256215	256222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015724	CCGA	2	8	256556	256563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015724	ATCG	2	8	265159	265166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015724	GCGA	2	8	266989	266996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015724	CGCA	2	8	269053	269060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015724	ACCA	2	8	275985	275992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015724	TGCT	2	8	276435	276442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015724	CGAC	2	8	276550	276557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015724	CCGA	2	8	276615	276622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015724	CGGC	2	8	276802	276809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015724	TCGA	2	8	276874	276881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015724	GCTG	2	8	277437	277444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015724	GGTC	2	8	277566	277573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015724	ATCC	2	8	277824	277831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015724	GCAA	2	8	278038	278045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015724	TTGC	2	8	279617	279624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015724	GAAG	2	8	279648	279655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015724	TCAA	2	8	280111	280118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015724	ATCG	2	8	280778	280785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015724	CGAG	2	8	280892	280899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015724	GGTC	2	8	281477	281484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015724	GCAC	2	8	281737	281744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015724	CGTT	2	8	281795	281802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015724	CGAC	2	8	281999	282006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015724	CGAA	2	8	282632	282639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015724	CCAG	2	8	283257	283264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015724	TGAT	2	8	284327	284334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015724	GTTT	2	8	284486	284493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015724	GCCA	2	8	285753	285760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015724	CCAC	2	8	285874	285881	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_015724	CCAT	2	8	297340	297347	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015724	GCGT	2	8	299521	299528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015724	GCCT	2	8	299611	299618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015724	GACA	2	8	300782	300789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015724	GGCC	2	8	300825	300832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015724	CGAT	2	8	302186	302193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015724	CAGC	2	8	302204	302211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015724	AAAG	2	8	302804	302811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015724	GCGA	2	8	305193	305200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015724	CGGG	2	8	311604	311611	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015724	ACAA	2	8	311779	311786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015724	CGGC	2	8	313237	313244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015724	GCCG	2	8	313364	313371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015724	CCGT	2	8	313455	313462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015724	CCCG	2	8	317585	317592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_015724	GGTG	2	8	319890	319897	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015724	GGCC	2	8	320033	320040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015724	AGCA	2	8	321103	321110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015724	GACG	2	8	323647	323654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015724	AGGC	2	8	327710	327717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015724	GAGC	2	8	336081	336088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015724	AGCA	2	8	336488	336495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_015724	ATGC	2	8	336684	336691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_015724	GAGC	2	8	336808	336815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_015724	GAAG	2	8	339465	339472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015724	CGGG	2	8	344614	344621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
157	NC_015724	CCCG	2	8	344638	344645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
158	NC_015724	TGAG	2	8	349098	349105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015724	GCTC	2	8	349583	349590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_015724	TAGC	2	8	350066	350073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_015724	CGGC	2	8	350295	350302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_015724	GCTC	2	8	351589	351596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_015724	TATG	2	8	356590	356597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015724	CAGC	2	8	356691	356698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NC_015724	AGCG	2	8	356869	356876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
166	NC_015724	CTAT	2	8	360808	360815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_015724	GATC	2	8	364158	364165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_015724	GGCG	2	8	365473	365480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
169	NC_015724	CCGG	2	8	368990	368997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_015724	ATTC	2	8	371859	371866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_015724	CAGC	2	8	372850	372857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_015724	CGGC	2	8	372903	372910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_015724	GGGC	2	8	374579	374586	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
174	NC_015724	GAGC	2	8	374739	374746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
175	NC_015724	TGCC	2	8	374797	374804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_015724	GCCG	2	8	377128	377135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_015724	GAAA	2	8	379271	379278	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015724	ATCT	2	8	379498	379505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_015724	TTTG	2	8	381146	381153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
180	NC_015724	CGAG	2	8	381284	381291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
181	NC_015724	GGCC	2	8	381447	381454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_015724	GGGC	2	8	381462	381469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
183	NC_015724	CTCA	2	8	386355	386362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_015724	GGCT	2	8	389194	389201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
185	NC_015724	CGGC	2	8	389267	389274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
186	NC_015724	AGGA	2	8	390221	390228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015724	CCAG	2	8	391598	391605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
188	NC_015724	ATCA	2	8	413142	413149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_015724	GGCC	2	8	417323	417330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
190	NC_015724	CTGC	2	8	419302	419309	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
191	NC_015724	GGTC	2	8	421368	421375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NC_015724	ATTG	2	8	423536	423543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015724	TGTC	2	8	423636	423643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
194	NC_015724	CCAT	2	8	423972	423979	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.