MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015724	GGT	2	6	50	55	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015724	TGG	2	6	102	107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323775
3	NC_015724	GAA	2	6	169	174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323775
4	NC_015724	CAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323775
5	NC_015724	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323775
6	NC_015724	GGT	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323775
7	NC_015724	TGC	2	6	543	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323775
8	NC_015724	GAT	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323775
9	NC_015724	GAC	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
10	NC_015724	TGA	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323775
11	NC_015724	GCA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
12	NC_015724	CGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
13	NC_015724	GGA	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323775
14	NC_015724	GAT	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323776
15	NC_015724	GGC	2	6	1414	1419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323776
16	NC_015724	AGC	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
17	NC_015724	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
18	NC_015724	TAC	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323776
19	NC_015724	CGT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323776
20	NC_015724	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323776
21	NC_015724	AAG	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323776
22	NC_015724	GCT	2	6	2068	2073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323776
23	NC_015724	ACT	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323776
24	NC_015724	CCG	2	6	2089	2094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323776
25	NC_015724	GCA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
26	NC_015724	CGT	3	9	2286	2294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015724	ACA	2	6	2474	2479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015724	TCA	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015724	ATA	2	6	2574	2579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015724	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015724	CCT	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015724	CGT	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015724	CCT	2	6	2906	2911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323777
34	NC_015724	TGC	2	6	2930	2935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323777
35	NC_015724	CAT	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323777
36	NC_015724	CAG	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323777
37	NC_015724	CGG	2	6	3070	3075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323777
38	NC_015724	CCT	2	6	3338	3343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015724	CCG	2	6	3405	3410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015724	TTC	2	6	3432	3437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015724	GAT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015724	AGC	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015724	GAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015724	CCG	2	6	3644	3649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015724	ACA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015724	GCC	2	6	3789	3794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015724	ACC	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015724	GGT	2	6	4357	4362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015724	CGG	2	6	4444	4449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015724	GCC	2	6	4641	4646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015724	GGC	2	6	4697	4702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015724	GAA	2	6	4880	4885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015724	GAG	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015724	GCA	2	6	4914	4919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015724	CGC	2	6	4949	4954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015724	CGG	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
57	NC_015724	GTT	2	6	5136	5141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323778
58	NC_015724	GCA	2	6	5248	5253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
59	NC_015724	TCG	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
60	NC_015724	CAC	3	9	5420	5428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323778
61	NC_015724	AGC	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
62	NC_015724	GCG	2	6	5454	5459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
63	NC_015724	GGC	2	6	5517	5522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
64	NC_015724	CCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323778
65	NC_015724	CGG	2	6	5646	5651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
66	NC_015724	CAG	3	9	5666	5674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
67	NC_015724	CAC	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323778
68	NC_015724	AGG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323778
69	NC_015724	GCC	2	6	5805	5810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
70	NC_015724	GCC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
71	NC_015724	GCC	2	6	5897	5902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
72	NC_015724	GCA	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
73	NC_015724	TCG	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
74	NC_015724	AGG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323778
75	NC_015724	GTC	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
76	NC_015724	TCG	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
77	NC_015724	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
78	NC_015724	CGG	2	6	6610	6615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
79	NC_015724	CGG	2	6	6660	6665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
80	NC_015724	GCT	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
81	NC_015724	CGG	2	6	6775	6780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
82	NC_015724	ATA	2	6	6953	6958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015724	ACC	2	6	6989	6994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015724	GCC	2	6	7056	7061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015724	AGC	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015724	CGC	2	6	7124	7129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015724	CCT	2	6	7139	7144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015724	CCG	2	6	7164	7169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015724	TGT	2	6	7330	7335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015724	GCT	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015724	AGG	2	6	7459	7464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015724	CGC	2	6	7488	7493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015724	TTA	2	6	7569	7574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015724	GCG	2	6	7579	7584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015724	GCC	2	6	7653	7658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015724	TTA	2	6	7756	7761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015724	CGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
98	NC_015724	CCG	2	6	7836	7841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
99	NC_015724	CGA	2	6	7880	7885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
100	NC_015724	CGC	3	9	7906	7914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
101	NC_015724	GCC	2	6	7916	7921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
102	NC_015724	CGC	2	6	7942	7947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
103	NC_015724	CTG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
104	NC_015724	TGC	3	9	8008	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
105	NC_015724	GTT	2	6	8027	8032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323779
106	NC_015724	GAT	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323779
107	NC_015724	CTG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
108	NC_015724	CGA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
109	NC_015724	CTG	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
110	NC_015724	GAG	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323779
111	NC_015724	CGG	2	6	8330	8335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323779
112	NC_015724	GCC	2	6	8363	8368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
113	NC_015724	GAC	2	6	8421	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
114	NC_015724	CGC	2	6	8440	8445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
115	NC_015724	TCA	2	6	8446	8451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323779
116	NC_015724	GCC	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
117	NC_015724	TGG	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323779
118	NC_015724	TCC	2	6	8557	8562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323779
119	NC_015724	TGT	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323779
120	NC_015724	CTG	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
121	NC_015724	CAA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323779
122	NC_015724	GCG	2	6	8770	8775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323779
123	NC_015724	TGC	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
124	NC_015724	CGC	2	6	8834	8839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
125	NC_015724	GCA	3	9	8846	8854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
126	NC_015724	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323779
127	NC_015724	CCG	2	6	9034	9039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015724	CGG	2	6	9104	9109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015724	AGC	2	6	9113	9118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015724	TGC	2	6	9147	9152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015724	CTT	2	6	9178	9183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015724	GGT	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015724	CTT	2	6	9259	9264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323780
134	NC_015724	GAG	2	6	9283	9288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
135	NC_015724	CGT	2	6	9366	9371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
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139	NC_015724	TGA	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323780
140	NC_015724	GGA	2	6	9717	9722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
141	NC_015724	TGC	2	6	9758	9763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
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143	NC_015724	GAG	2	6	9905	9910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
144	NC_015724	ATC	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323780
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254	NC_015724	TGT	3	9	17109	17117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015724	GTG	2	6	17124	17129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015724	ATT	2	6	17140	17145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015724	TGC	2	6	17192	17197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_015724	CAG	2	6	17207	17212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323786
259	NC_015724	TCT	2	6	17224	17229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323786
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