MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015724	C	6	6	1371	1376	0 %	0 %	0 %	100 %	339323776
2	NC_015724	T	7	7	2326	2332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015724	C	6	6	2650	2655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_015724	C	6	6	3348	3353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_015724	A	6	6	5930	5935	100 %	0 %	0 %	0 %	339323778
6	NC_015724	A	8	8	7390	7397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015724	G	6	6	23170	23175	0 %	0 %	100 %	0 %	339323792
8	NC_015724	C	6	6	24913	24918	0 %	0 %	0 %	100 %	339323794
9	NC_015724	G	6	6	26867	26872	0 %	0 %	100 %	0 %	339323795
10	NC_015724	C	6	6	31981	31986	0 %	0 %	0 %	100 %	339323799
11	NC_015724	A	6	6	32242	32247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015724	G	6	6	36538	36543	0 %	0 %	100 %	0 %	339323805
13	NC_015724	G	6	6	43277	43282	0 %	0 %	100 %	0 %	339323809
14	NC_015724	A	7	7	50253	50259	100 %	0 %	0 %	0 %	339323815
15	NC_015724	A	7	7	50946	50952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015724	G	7	7	52489	52495	0 %	0 %	100 %	0 %	339323818
17	NC_015724	C	6	6	57485	57490	0 %	0 %	0 %	100 %	339323823
18	NC_015724	T	7	7	64584	64590	0 %	100 %	0 %	0 %	339323831
19	NC_015724	A	6	6	68472	68477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015724	C	6	6	70887	70892	0 %	0 %	0 %	100 %	339323839
21	NC_015724	C	6	6	78815	78820	0 %	0 %	0 %	100 %	339323846
22	NC_015724	A	6	6	78924	78929	100 %	0 %	0 %	0 %	339323846
23	NC_015724	T	7	7	81606	81612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015724	G	6	6	82645	82650	0 %	0 %	100 %	0 %	339323851
25	NC_015724	A	6	6	84394	84399	100 %	0 %	0 %	0 %	339323853
26	NC_015724	A	6	6	85095	85100	100 %	0 %	0 %	0 %	339323854
27	NC_015724	G	6	6	88316	88321	0 %	0 %	100 %	0 %	339323858
28	NC_015724	T	6	6	90902	90907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015724	G	6	6	94729	94734	0 %	0 %	100 %	0 %	339323864
30	NC_015724	G	7	7	110732	110738	0 %	0 %	100 %	0 %	339323877
31	NC_015724	G	6	6	113104	113109	0 %	0 %	100 %	0 %	339323879
32	NC_015724	G	6	6	113675	113680	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015724	G	6	6	116781	116786	0 %	0 %	100 %	0 %	339323882
34	NC_015724	G	6	6	118771	118776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015724	G	6	6	119587	119592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015724	C	6	6	121158	121163	0 %	0 %	0 %	100 %	339323888
37	NC_015724	A	7	7	133265	133271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015724	T	6	6	134407	134412	0 %	100 %	0 %	0 %	339323906
39	NC_015724	T	6	6	140913	140918	0 %	100 %	0 %	0 %	339323912
40	NC_015724	C	6	6	144984	144989	0 %	0 %	0 %	100 %	339323917
41	NC_015724	A	7	7	157404	157410	100 %	0 %	0 %	0 %	339323927
42	NC_015724	G	6	6	159140	159145	0 %	0 %	100 %	0 %	339323928
43	NC_015724	T	6	6	164382	164387	0 %	100 %	0 %	0 %	339323931
44	NC_015724	A	6	6	168201	168206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015724	T	6	6	168256	168261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015724	A	6	6	170393	170398	100 %	0 %	0 %	0 %	339323935
47	NC_015724	T	7	7	174862	174868	0 %	100 %	0 %	0 %	339323938
48	NC_015724	C	6	6	176273	176278	0 %	0 %	0 %	100 %	339323939
49	NC_015724	C	7	7	182161	182167	0 %	0 %	0 %	100 %	339323946
50	NC_015724	A	7	7	183420	183426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015724	C	7	7	183987	183993	0 %	0 %	0 %	100 %	339323948
52	NC_015724	G	6	6	184195	184200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015724	A	6	6	184861	184866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015724	A	6	6	187617	187622	100 %	0 %	0 %	0 %	339323952
55	NC_015724	G	6	6	193377	193382	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015724	G	7	7	193386	193392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015724	A	6	6	193425	193430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015724	C	7	7	204213	204219	0 %	0 %	0 %	100 %	339323964
59	NC_015724	T	6	6	205738	205743	0 %	100 %	0 %	0 %	339323965
60	NC_015724	C	6	6	227399	227404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_015724	G	6	6	228779	228784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015724	A	6	6	234474	234479	100 %	0 %	0 %	0 %	339323989
63	NC_015724	G	7	7	240271	240277	0 %	0 %	100 %	0 %	339323995
64	NC_015724	G	7	7	248136	248142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015724	C	6	6	252081	252086	0 %	0 %	0 %	100 %	339324008
66	NC_015724	A	8	8	255287	255294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015724	C	6	6	256505	256510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_015724	C	6	6	259649	259654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_015724	T	6	6	266326	266331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015724	A	7	7	271684	271690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015724	T	6	6	272690	272695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015724	T	6	6	273525	273530	0 %	100 %	0 %	0 %	339324026
73	NC_015724	A	7	7	285506	285512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015724	A	6	6	285578	285583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015724	G	7	7	289020	289026	0 %	0 %	100 %	0 %	339324037
76	NC_015724	G	6	6	295641	295646	0 %	0 %	100 %	0 %	339324041
77	NC_015724	T	6	6	297516	297521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015724	A	6	6	297705	297710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015724	T	6	6	297806	297811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015724	G	6	6	298662	298667	0 %	0 %	100 %	0 %	339324043
81	NC_015724	T	6	6	299098	299103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015724	C	6	6	301501	301506	0 %	0 %	0 %	100 %	339324046
83	NC_015724	A	6	6	302438	302443	100 %	0 %	0 %	0 %	339324047
84	NC_015724	C	6	6	303946	303951	0 %	0 %	0 %	100 %	339324048
85	NC_015724	A	7	7	311785	311791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015724	A	6	6	322608	322613	100 %	0 %	0 %	0 %	339324068
87	NC_015724	A	6	6	324298	324303	100 %	0 %	0 %	0 %	339324070
88	NC_015724	A	6	6	327676	327681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015724	A	8	8	330408	330415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015724	A	6	6	336539	336544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015724	G	6	6	342179	342184	0 %	0 %	100 %	0 %	339324089
92	NC_015724	A	6	6	346102	346107	100 %	0 %	0 %	0 %	339324092
93	NC_015724	A	6	6	346145	346150	100 %	0 %	0 %	0 %	339324092
94	NC_015724	A	6	6	350117	350122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015724	G	6	6	351785	351790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015724	A	7	7	364384	364390	100 %	0 %	0 %	0 %	339324107
97	NC_015724	T	7	7	364669	364675	0 %	100 %	0 %	0 %	339324107
98	NC_015724	A	6	6	366102	366107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015724	G	6	6	366204	366209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015724	G	6	6	369617	369622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015724	C	6	6	379050	379055	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_015724	A	7	7	379276	379282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015724	C	7	7	380949	380955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_015724	G	6	6	381600	381605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015724	A	9	9	381826	381834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015724	C	7	7	386050	386056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_015724	C	6	6	390324	390329	0 %	0 %	0 %	100 %	339324129
108	NC_015724	G	7	7	392404	392410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015724	G	6	6	396337	396342	0 %	0 %	100 %	0 %	339324134
110	NC_015724	T	6	6	397035	397040	0 %	100 %	0 %	0 %	339324134
111	NC_015724	C	6	6	405733	405738	0 %	0 %	0 %	100 %	339324143
112	NC_015724	A	6	6	419120	419125	100 %	0 %	0 %	0 %	339324155
113	NC_015724	A	7	7	419495	419501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015724	T	6	6	423287	423292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.