MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 2186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015723	TGCGC	2	10	3816	3825	0 %	20 %	40 %	40 %	339321335
2	NC_015723	GCCGC	2	10	4194	4203	0 %	0 %	40 %	60 %	339321335
3	NC_015723	GCAGG	2	10	6212	6221	20 %	0 %	60 %	20 %	339321336
4	NC_015723	GGGCC	2	10	6549	6558	0 %	0 %	60 %	40 %	339321336
5	NC_015723	AATGA	2	10	6930	6939	60 %	20 %	20 %	0 %	339321337
6	NC_015723	CAGCC	2	10	11725	11734	20 %	0 %	20 %	60 %	339321341
7	NC_015723	GCGCG	2	10	12454	12463	0 %	0 %	60 %	40 %	339321341
8	NC_015723	CGCGG	2	10	12787	12796	0 %	0 %	60 %	40 %	339321341
9	NC_015723	CCCGG	2	10	13780	13789	0 %	0 %	40 %	60 %	339321342
10	NC_015723	GGGTA	2	10	13974	13983	20 %	20 %	60 %	0 %	339321342
11	NC_015723	ACGTC	2	10	17696	17705	20 %	20 %	20 %	40 %	339321344
12	NC_015723	ACAGG	2	10	21300	21309	40 %	0 %	40 %	20 %	339321347
13	NC_015723	GCCGC	2	10	21441	21450	0 %	0 %	40 %	60 %	339321347
14	NC_015723	GGCGA	2	10	21881	21890	20 %	0 %	60 %	20 %	339321347
15	NC_015723	CCGGT	2	10	23761	23770	0 %	20 %	40 %	40 %	339321349
16	NC_015723	GCCAG	2	10	24736	24745	20 %	0 %	40 %	40 %	339321349
17	NC_015723	GCGCG	2	10	25024	25033	0 %	0 %	60 %	40 %	339321350
18	NC_015723	CGACC	2	10	27579	27588	20 %	0 %	20 %	60 %	339321351
19	NC_015723	TGCAC	2	10	27839	27848	20 %	20 %	20 %	40 %	339321351
20	NC_015723	AGCCC	2	10	28801	28810	20 %	0 %	20 %	60 %	339321352
21	NC_015723	CCACG	2	10	29002	29011	20 %	0 %	20 %	60 %	339321352
22	NC_015723	GCGCG	2	10	29020	29029	0 %	0 %	60 %	40 %	339321352
23	NC_015723	GCGGG	2	10	29913	29922	0 %	0 %	80 %	20 %	339321353
24	NC_015723	GGTCC	2	10	31038	31047	0 %	20 %	40 %	40 %	339321353
25	NC_015723	AGCCC	2	10	33544	33553	20 %	0 %	20 %	60 %	339321355
26	NC_015723	CATGC	2	10	33737	33746	20 %	20 %	20 %	40 %	339321356
27	NC_015723	GCCGC	2	10	34747	34756	0 %	0 %	40 %	60 %	339321356
28	NC_015723	GCGCC	2	10	34918	34927	0 %	0 %	40 %	60 %	339321357
29	NC_015723	GCCGC	2	10	35008	35017	0 %	0 %	40 %	60 %	339321357
30	NC_015723	TGCGC	2	10	35308	35317	0 %	20 %	40 %	40 %	339321357
31	NC_015723	CGGTC	2	10	36369	36378	0 %	20 %	40 %	40 %	339321358
32	NC_015723	GAACG	2	10	37088	37097	40 %	0 %	40 %	20 %	339321359
33	NC_015723	CGGGC	2	10	37133	37142	0 %	0 %	60 %	40 %	339321359
34	NC_015723	ATGGC	2	10	38399	38408	20 %	20 %	40 %	20 %	339321360
35	NC_015723	TGGGG	2	10	38422	38431	0 %	20 %	80 %	0 %	339321360
36	NC_015723	TGCGC	2	10	38961	38970	0 %	20 %	40 %	40 %	339321361
37	NC_015723	GCTTC	2	10	41063	41072	0 %	40 %	20 %	40 %	339321363
38	NC_015723	TGGCC	2	10	41165	41174	0 %	20 %	40 %	40 %	339321363
39	NC_015723	GCGCC	2	10	44110	44119	0 %	0 %	40 %	60 %	339321364
40	NC_015723	AAGCG	2	10	45240	45249	40 %	0 %	40 %	20 %	339321365
41	NC_015723	GCCAC	2	10	48443	48452	20 %	0 %	20 %	60 %	339321370
42	NC_015723	CCTCG	2	10	49820	49829	0 %	20 %	20 %	60 %	339321372
43	NC_015723	CGCGC	2	10	49883	49892	0 %	0 %	40 %	60 %	339321372
44	NC_015723	GCGCG	2	10	51474	51483	0 %	0 %	60 %	40 %	339321374
45	NC_015723	CGCGG	2	10	53600	53609	0 %	0 %	60 %	40 %	339321376
46	NC_015723	CTCGA	2	10	53958	53967	20 %	20 %	20 %	40 %	339321377
47	NC_015723	GCGCC	2	10	53992	54001	0 %	0 %	40 %	60 %	339321377
48	NC_015723	CGCGG	2	10	54707	54716	0 %	0 %	60 %	40 %	339321377
49	NC_015723	TGGCA	2	10	54767	54776	20 %	20 %	40 %	20 %	339321377
50	NC_015723	GGCTG	2	10	57008	57017	0 %	20 %	60 %	20 %	339321379
51	NC_015723	CTGGC	2	10	58054	58063	0 %	20 %	40 %	40 %	339321380
52	NC_015723	GGCAT	2	10	59197	59206	20 %	20 %	40 %	20 %	339321382
53	NC_015723	CAACG	2	10	59928	59937	40 %	0 %	20 %	40 %	339321382
54	NC_015723	CCGGT	2	10	62627	62636	0 %	20 %	40 %	40 %	339321385
55	NC_015723	GCGCC	2	10	63231	63240	0 %	0 %	40 %	60 %	339321385
56	NC_015723	GCGCC	2	10	63471	63480	0 %	0 %	40 %	60 %	339321385
57	NC_015723	TCGTC	2	10	63608	63617	0 %	40 %	20 %	40 %	339321385
58	NC_015723	ACGGC	2	10	64705	64714	20 %	0 %	40 %	40 %	339321387
59	NC_015723	CGCGC	2	10	65355	65364	0 %	0 %	40 %	60 %	339321387
60	NC_015723	GGCGC	2	10	65698	65707	0 %	0 %	60 %	40 %	339321388
61	NC_015723	CGCGC	2	10	65872	65881	0 %	0 %	40 %	60 %	339321388
62	NC_015723	CGGCC	2	10	66793	66802	0 %	0 %	40 %	60 %	339321388
63	NC_015723	GGCCA	2	10	67463	67472	20 %	0 %	40 %	40 %	339321390
64	NC_015723	ATGAG	2	10	68043	68052	40 %	20 %	40 %	0 %	339321390
65	NC_015723	GCGCG	2	10	70103	70112	0 %	0 %	60 %	40 %	339321392
66	NC_015723	CGCGC	2	10	70475	70484	0 %	0 %	40 %	60 %	339321393
67	NC_015723	CGGCA	2	10	71578	71587	20 %	0 %	40 %	40 %	339321394
68	NC_015723	CGCTG	2	10	73816	73825	0 %	20 %	40 %	40 %	339321396
69	NC_015723	AGTCC	2	10	74326	74335	20 %	20 %	20 %	40 %	339321396
70	NC_015723	GGCAT	2	10	74730	74739	20 %	20 %	40 %	20 %	339321396
71	NC_015723	CCGGT	2	10	77025	77034	0 %	20 %	40 %	40 %	339321397
72	NC_015723	ACGGT	2	10	77163	77172	20 %	20 %	40 %	20 %	339321397
73	NC_015723	GCGCG	2	10	77797	77806	0 %	0 %	60 %	40 %	339321398
74	NC_015723	GCCGC	2	10	79347	79356	0 %	0 %	40 %	60 %	339321399
75	NC_015723	CACCG	2	10	81646	81655	20 %	0 %	20 %	60 %	339321402
76	NC_015723	GCGCA	2	10	81881	81890	20 %	0 %	40 %	40 %	339321402
77	NC_015723	GCTGG	2	10	81976	81985	0 %	20 %	60 %	20 %	339321402
78	NC_015723	GCGCC	2	10	82759	82768	0 %	0 %	40 %	60 %	339321402
79	NC_015723	GGCGT	2	10	84645	84654	0 %	20 %	60 %	20 %	339321404
80	NC_015723	GGGCT	2	10	84798	84807	0 %	20 %	60 %	20 %	339321404
81	NC_015723	CGCGC	2	10	86549	86558	0 %	0 %	40 %	60 %	339321405
82	NC_015723	GCGCA	2	10	88290	88299	20 %	0 %	40 %	40 %	339321406
83	NC_015723	TGCGA	2	10	91114	91123	20 %	20 %	40 %	20 %	339321409
84	NC_015723	GGCGC	2	10	92116	92125	0 %	0 %	60 %	40 %	339321410
85	NC_015723	GTCGG	2	10	92277	92286	0 %	20 %	60 %	20 %	339321410
86	NC_015723	GCCGG	2	10	92958	92967	0 %	0 %	60 %	40 %	339321411
87	NC_015723	GGGCA	2	10	93367	93376	20 %	0 %	60 %	20 %	339321411
88	NC_015723	CGGCC	2	10	94451	94460	0 %	0 %	40 %	60 %	339321412
89	NC_015723	CGCGG	2	10	94604	94613	0 %	0 %	60 %	40 %	339321412
90	NC_015723	CTGGA	2	10	95732	95741	20 %	20 %	40 %	20 %	339321414
91	NC_015723	AGGCC	2	10	98124	98133	20 %	0 %	40 %	40 %	339321416
92	NC_015723	GCGCC	2	10	99883	99892	0 %	0 %	40 %	60 %	339321417
93	NC_015723	CTGCG	2	10	100012	100021	0 %	20 %	40 %	40 %	339321417
94	NC_015723	CCGGC	2	10	100129	100138	0 %	0 %	40 %	60 %	339321418
95	NC_015723	TGGTC	2	10	100483	100492	0 %	40 %	40 %	20 %	339321418
96	NC_015723	GCGCG	2	10	100789	100798	0 %	0 %	60 %	40 %	339321418
97	NC_015723	CTTGC	2	10	103428	103437	0 %	40 %	20 %	40 %	339321421
98	NC_015723	GCACC	2	10	103958	103967	20 %	0 %	20 %	60 %	339321421
99	NC_015723	GCCGC	2	10	108812	108821	0 %	0 %	40 %	60 %	339321425
100	NC_015723	CTGCG	2	10	111026	111035	0 %	20 %	40 %	40 %	339321425
101	NC_015723	GGCCT	2	10	112370	112379	0 %	20 %	40 %	40 %	339321427
102	NC_015723	GCCGC	2	10	114321	114330	0 %	0 %	40 %	60 %	339321428
103	NC_015723	CTGGG	2	10	114843	114852	0 %	20 %	60 %	20 %	339321428
104	NC_015723	GAAGG	2	10	115101	115110	40 %	0 %	60 %	0 %	339321428
105	NC_015723	CAGGC	2	10	115208	115217	20 %	0 %	40 %	40 %	339321429
106	NC_015723	ACCGG	2	10	116479	116488	20 %	0 %	40 %	40 %	339321430
107	NC_015723	CCGGC	2	10	117720	117729	0 %	0 %	40 %	60 %	339321432
108	NC_015723	CGCGG	2	10	120691	120700	0 %	0 %	60 %	40 %	339321436
109	NC_015723	CGCGC	2	10	121007	121016	0 %	0 %	40 %	60 %	339321437
110	NC_015723	CACGC	2	10	121577	121586	20 %	0 %	20 %	60 %	339321437
111	NC_015723	GCCGC	2	10	121901	121910	0 %	0 %	40 %	60 %	339321437
112	NC_015723	CGCGC	2	10	124869	124878	0 %	0 %	40 %	60 %	339321439
113	NC_015723	TGCGG	2	10	127019	127028	0 %	20 %	60 %	20 %	339321441
114	NC_015723	GCCGC	2	10	128358	128367	0 %	0 %	40 %	60 %	339321442
115	NC_015723	CGCAG	2	10	129134	129143	20 %	0 %	40 %	40 %	339321443
116	NC_015723	CGATG	2	10	129474	129483	20 %	20 %	40 %	20 %	339321443
117	NC_015723	CTTGC	2	10	130756	130765	0 %	40 %	20 %	40 %	339321444
118	NC_015723	GTGCC	2	10	131064	131073	0 %	20 %	40 %	40 %	339321444
119	NC_015723	TGGCG	2	10	133739	133748	0 %	20 %	60 %	20 %	339321446
120	NC_015723	GCGCT	2	10	134171	134180	0 %	20 %	40 %	40 %	339321447
121	NC_015723	CGCGG	2	10	135699	135708	0 %	0 %	60 %	40 %	339321448
122	NC_015723	GCGCC	2	10	135926	135935	0 %	0 %	40 %	60 %	339321448
123	NC_015723	GCCTT	2	10	136578	136587	0 %	40 %	20 %	40 %	339321449
124	NC_015723	GAACG	2	10	137120	137129	40 %	0 %	40 %	20 %	339321449
125	NC_015723	CGCGG	2	10	137299	137308	0 %	0 %	60 %	40 %	339321450
126	NC_015723	GCACC	2	10	137973	137982	20 %	0 %	20 %	60 %	339321450
127	NC_015723	GGCCG	2	10	139058	139067	0 %	0 %	60 %	40 %	339321451
128	NC_015723	GCTGG	2	10	140874	140883	0 %	20 %	60 %	20 %	339321452
129	NC_015723	CGCGG	2	10	141629	141638	0 %	0 %	60 %	40 %	339321453
130	NC_015723	CCGGC	2	10	142587	142596	0 %	0 %	40 %	60 %	339321453
131	NC_015723	CGCGG	2	10	143370	143379	0 %	0 %	60 %	40 %	339321453
132	NC_015723	CAGGA	2	10	144384	144393	40 %	0 %	40 %	20 %	339321454
133	NC_015723	GGCCA	2	10	144965	144974	20 %	0 %	40 %	40 %	339321455
134	NC_015723	CGCTG	2	10	147101	147110	0 %	20 %	40 %	40 %	339321456
135	NC_015723	CAGCG	2	10	149285	149294	20 %	0 %	40 %	40 %	339321457
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254	NC_015723	GCGAG	2	10	304914	304923	20 %	0 %	60 %	20 %	339321604
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259	NC_015723	GCGAG	2	10	309107	309116	20 %	0 %	60 %	20 %	339321604
260	NC_015723	CAATG	2	10	314514	314523	40 %	20 %	20 %	20 %	339321608
261	NC_015723	GCGGA	2	10	315757	315766	20 %	0 %	60 %	20 %	339321610
262	NC_015723	TACGA	2	10	318036	318045	40 %	20 %	20 %	20 %	339321612
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