MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 7853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015723	TCCG	2	8	205	212	0 %	25 %	25 %	50 %	339321331
2	NC_015723	TCGA	2	8	764	771	25 %	25 %	25 %	25 %	339321331
3	NC_015723	AGCG	2	8	1055	1062	25 %	0 %	50 %	25 %	339321331
4	NC_015723	CGCC	2	8	1220	1227	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015723	GCCC	2	8	1273	1280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_015723	CGGG	2	8	1352	1359	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015723	CTTG	2	8	1415	1422	0 %	50 %	25 %	25 %	339321332
8	NC_015723	GCCA	2	8	1957	1964	25 %	0 %	25 %	50 %	339321333
9	NC_015723	GAAT	2	8	2365	2372	50 %	25 %	25 %	0 %	339321333
10	NC_015723	TTGA	2	8	2600	2607	25 %	50 %	25 %	0 %	339321333
11	NC_015723	GCGG	2	8	2901	2908	0 %	0 %	75 %	25 %	339321334
12	NC_015723	CATC	2	8	2909	2916	25 %	25 %	0 %	50 %	339321334
13	NC_015723	CACG	2	8	2919	2926	25 %	0 %	25 %	50 %	339321334
14	NC_015723	GAAG	2	8	3177	3184	50 %	0 %	50 %	0 %	339321334
15	NC_015723	CGGC	2	8	3212	3219	0 %	0 %	50 %	50 %	339321334
16	NC_015723	GGCG	2	8	3339	3346	0 %	0 %	75 %	25 %	339321334
17	NC_015723	GTGC	2	8	3924	3931	0 %	25 %	50 %	25 %	339321335
18	NC_015723	GGCT	2	8	4164	4171	0 %	25 %	50 %	25 %	339321335
19	NC_015723	GCAT	2	8	4277	4284	25 %	25 %	25 %	25 %	339321335
20	NC_015723	AGCG	2	8	5315	5322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015723	GGAC	2	8	5612	5619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015723	CAAG	2	8	5708	5715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015723	CTGC	2	8	5927	5934	0 %	25 %	25 %	50 %	339321336
24	NC_015723	GGCA	2	8	6202	6209	25 %	0 %	50 %	25 %	339321336
25	NC_015723	CGGC	2	8	6336	6343	0 %	0 %	50 %	50 %	339321336
26	NC_015723	CGCC	2	8	6564	6571	0 %	0 %	25 %	75 %	339321336
27	NC_015723	GCCG	2	8	6689	6696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015723	ACCT	2	8	6912	6919	25 %	25 %	0 %	50 %	339321337
29	NC_015723	GCTG	2	8	7162	7169	0 %	25 %	50 %	25 %	339321337
30	NC_015723	CCTC	2	8	7351	7358	0 %	25 %	0 %	75 %	339321337
31	NC_015723	GAGC	2	8	7363	7370	25 %	0 %	50 %	25 %	339321337
32	NC_015723	AGCC	2	8	7439	7446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015723	GCAG	2	8	7453	7460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015723	GGCT	2	8	7573	7580	0 %	25 %	50 %	25 %	339321338
35	NC_015723	GCCC	2	8	8126	8133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_015723	CTGC	2	8	8224	8231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015723	CCGT	2	8	8401	8408	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015723	ACTC	2	8	8702	8709	25 %	25 %	0 %	50 %	339321339
39	NC_015723	CATG	2	8	8967	8974	25 %	25 %	25 %	25 %	339321339
40	NC_015723	GCTG	2	8	9218	9225	0 %	25 %	50 %	25 %	339321339
41	NC_015723	TGCC	2	8	9604	9611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015723	GATG	2	8	9750	9757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015723	CAGC	2	8	9855	9862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015723	ATCG	2	8	9953	9960	25 %	25 %	25 %	25 %	339321340
45	NC_015723	CTGA	2	8	10060	10067	25 %	25 %	25 %	25 %	339321340
46	NC_015723	CCCG	2	8	10264	10271	0 %	0 %	25 %	75 %	339321340
47	NC_015723	GCTG	2	8	10406	10413	0 %	25 %	50 %	25 %	339321340
48	NC_015723	GGTC	2	8	11031	11038	0 %	25 %	50 %	25 %	339321341
49	NC_015723	TGCG	2	8	11081	11088	0 %	25 %	50 %	25 %	339321341
50	NC_015723	CGGC	2	8	11618	11625	0 %	0 %	50 %	50 %	339321341
51	NC_015723	CGGT	2	8	12080	12087	0 %	25 %	50 %	25 %	339321341
52	NC_015723	TCGC	2	8	12472	12479	0 %	25 %	25 %	50 %	339321341
53	NC_015723	GCGG	2	8	12501	12508	0 %	0 %	75 %	25 %	339321341
54	NC_015723	CCTG	2	8	12687	12694	0 %	25 %	25 %	50 %	339321341
55	NC_015723	TCCG	2	8	12807	12814	0 %	25 %	25 %	50 %	339321341
56	NC_015723	GCTG	2	8	12834	12841	0 %	25 %	50 %	25 %	339321341
57	NC_015723	TGCG	2	8	13208	13215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015723	CGTG	2	8	13545	13552	0 %	25 %	50 %	25 %	339321342
59	NC_015723	GGCA	2	8	13881	13888	25 %	0 %	50 %	25 %	339321342
60	NC_015723	CGGC	2	8	13926	13933	0 %	0 %	50 %	50 %	339321342
61	NC_015723	GAAG	2	8	14212	14219	50 %	0 %	50 %	0 %	339321342
62	NC_015723	CGAT	2	8	14510	14517	25 %	25 %	25 %	25 %	339321342
63	NC_015723	TTTC	2	8	14893	14900	0 %	75 %	0 %	25 %	339321342
64	NC_015723	GCTG	2	8	14939	14946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015723	CGGA	2	8	15008	15015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015723	GTTC	2	8	15255	15262	0 %	50 %	25 %	25 %	339321343
67	NC_015723	GCTC	2	8	15444	15451	0 %	25 %	25 %	50 %	339321343
68	NC_015723	GCCG	2	8	15609	15616	0 %	0 %	50 %	50 %	339321343
69	NC_015723	TGCC	2	8	16577	16584	0 %	25 %	25 %	50 %	339321343
70	NC_015723	GCGT	2	8	16669	16676	0 %	25 %	50 %	25 %	339321343
71	NC_015723	GCCG	2	8	16705	16712	0 %	0 %	50 %	50 %	339321343
72	NC_015723	GGTT	2	8	17307	17314	0 %	50 %	50 %	0 %	339321343
73	NC_015723	TCAC	2	8	17803	17810	25 %	25 %	0 %	50 %	339321345
74	NC_015723	GCTG	2	8	18400	18407	0 %	25 %	50 %	25 %	339321345
75	NC_015723	GCGG	2	8	18464	18471	0 %	0 %	75 %	25 %	339321345
76	NC_015723	GAGC	2	8	18512	18519	25 %	0 %	50 %	25 %	339321345
77	NC_015723	GGCA	2	8	18994	19001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015723	ACGG	2	8	19126	19133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015723	CTGG	2	8	19654	19661	0 %	25 %	50 %	25 %	339321346
80	NC_015723	GCCG	2	8	19843	19850	0 %	0 %	50 %	50 %	339321346
81	NC_015723	GGCA	2	8	20119	20126	25 %	0 %	50 %	25 %	339321346
82	NC_015723	CTGG	2	8	20692	20699	0 %	25 %	50 %	25 %	339321346
83	NC_015723	CTTG	2	8	20907	20914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015723	TCGC	2	8	21523	21530	0 %	25 %	25 %	50 %	339321347
85	NC_015723	CTGC	2	8	22020	22027	0 %	25 %	25 %	50 %	339321347
86	NC_015723	CTGC	2	8	22455	22462	0 %	25 %	25 %	50 %	339321348
87	NC_015723	CAGC	2	8	22698	22705	25 %	0 %	25 %	50 %	339321348
88	NC_015723	GACC	2	8	22963	22970	25 %	0 %	25 %	50 %	339321348
89	NC_015723	GCAG	2	8	23124	23131	25 %	0 %	50 %	25 %	339321348
90	NC_015723	GCCC	2	8	24163	24170	0 %	0 %	25 %	75 %	339321349
91	NC_015723	GGAA	2	8	24889	24896	50 %	0 %	50 %	0 %	339321350
92	NC_015723	GGCA	2	8	24958	24965	25 %	0 %	50 %	25 %	339321350
93	NC_015723	CGGG	2	8	25068	25075	0 %	0 %	75 %	25 %	339321350
94	NC_015723	CCAT	2	8	25397	25404	25 %	25 %	0 %	50 %	339321350
95	NC_015723	CTAC	2	8	26422	26429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015723	CTGT	2	8	26535	26542	0 %	50 %	25 %	25 %	339321351
97	NC_015723	AGCG	2	8	26694	26701	25 %	0 %	50 %	25 %	339321351
98	NC_015723	GGCG	2	8	26730	26737	0 %	0 %	75 %	25 %	339321351
99	NC_015723	ATGG	2	8	27180	27187	25 %	25 %	50 %	0 %	339321351
100	NC_015723	GGCG	2	8	27529	27536	0 %	0 %	75 %	25 %	339321351
101	NC_015723	CCGC	2	8	28016	28023	0 %	0 %	25 %	75 %	339321351
102	NC_015723	TCCG	2	8	28400	28407	0 %	25 %	25 %	50 %	339321352
103	NC_015723	GCCG	2	8	28652	28659	0 %	0 %	50 %	50 %	339321352
104	NC_015723	CCAG	2	8	28843	28850	25 %	0 %	25 %	50 %	339321352
105	NC_015723	GCAC	2	8	29214	29221	25 %	0 %	25 %	50 %	339321353
106	NC_015723	GATC	2	8	29322	29329	25 %	25 %	25 %	25 %	339321353
107	NC_015723	TGCC	2	8	30664	30671	0 %	25 %	25 %	50 %	339321353
108	NC_015723	CAGC	2	8	31210	31217	25 %	0 %	25 %	50 %	339321354
109	NC_015723	GGTG	2	8	31231	31238	0 %	25 %	75 %	0 %	339321354
110	NC_015723	CGTG	2	8	32289	32296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015723	GCGT	2	8	32315	32322	0 %	25 %	50 %	25 %	339321355
112	NC_015723	GCAG	2	8	32476	32483	25 %	0 %	50 %	25 %	339321355
113	NC_015723	GTTC	2	8	32917	32924	0 %	50 %	25 %	25 %	339321355
114	NC_015723	GTGC	2	8	33002	33009	0 %	25 %	50 %	25 %	339321355
115	NC_015723	CTCG	2	8	33047	33054	0 %	25 %	25 %	50 %	339321355
116	NC_015723	TCGC	2	8	33279	33286	0 %	25 %	25 %	50 %	339321355
117	NC_015723	TGCG	2	8	33469	33476	0 %	25 %	50 %	25 %	339321355
118	NC_015723	GCGG	2	8	33659	33666	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015723	GTGC	2	8	33799	33806	0 %	25 %	50 %	25 %	339321356
120	NC_015723	GTGA	2	8	33952	33959	25 %	25 %	50 %	0 %	339321356
121	NC_015723	GCAG	2	8	34134	34141	25 %	0 %	50 %	25 %	339321356
122	NC_015723	GTGC	2	8	34433	34440	0 %	25 %	50 %	25 %	339321356
123	NC_015723	GGAA	2	8	34647	34654	50 %	0 %	50 %	0 %	339321356
124	NC_015723	CCGC	2	8	35257	35264	0 %	0 %	25 %	75 %	339321357
125	NC_015723	ACGC	2	8	35276	35283	25 %	0 %	25 %	50 %	339321357
126	NC_015723	CGGT	2	8	35631	35638	0 %	25 %	50 %	25 %	339321357
127	NC_015723	GCAG	2	8	35986	35993	25 %	0 %	50 %	25 %	339321357
128	NC_015723	GGCT	2	8	36023	36030	0 %	25 %	50 %	25 %	339321357
129	NC_015723	CGGC	2	8	36156	36163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015723	GGGC	2	8	36213	36220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015723	GCAG	2	8	36968	36975	25 %	0 %	50 %	25 %	339321359
132	NC_015723	GAGG	2	8	37491	37498	25 %	0 %	75 %	0 %	339321359
133	NC_015723	CATG	2	8	37574	37581	25 %	25 %	25 %	25 %	339321359
134	NC_015723	GCAG	2	8	38391	38398	25 %	0 %	50 %	25 %	339321360
135	NC_015723	GCCG	2	8	39528	39535	0 %	0 %	50 %	50 %	339321361
136	NC_015723	GCGG	2	8	40010	40017	0 %	0 %	75 %	25 %	339321362
137	NC_015723	GATC	2	8	40301	40308	25 %	25 %	25 %	25 %	339321362
138	NC_015723	TCGA	2	8	40323	40330	25 %	25 %	25 %	25 %	339321362
139	NC_015723	ACGC	2	8	40663	40670	25 %	0 %	25 %	50 %	339321362
140	NC_015723	CGCA	2	8	40833	40840	25 %	0 %	25 %	50 %	339321362
141	NC_015723	ACGA	2	8	40966	40973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015723	CGAG	2	8	41222	41229	25 %	0 %	50 %	25 %	339321363
143	NC_015723	CGCC	2	8	41594	41601	0 %	0 %	25 %	75 %	339321363
144	NC_015723	GCCC	2	8	41675	41682	0 %	0 %	25 %	75 %	339321363
145	NC_015723	GTCG	2	8	41856	41863	0 %	25 %	50 %	25 %	339321363
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149	NC_015723	TCAT	2	8	42781	42788	25 %	50 %	0 %	25 %	339321363
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151	NC_015723	ATCG	2	8	43443	43450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015723	AGGT	2	8	44332	44339	25 %	25 %	50 %	0 %	339321364
153	NC_015723	GCAG	2	8	44990	44997	25 %	0 %	50 %	25 %	339321365
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157	NC_015723	TGGA	2	8	45699	45706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015723	ACAT	2	8	45847	45854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_015723	GCCT	2	8	46098	46105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_015723	GCCG	2	8	46250	46257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_015723	CCGC	2	8	46264	46271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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250	NC_015723	TGGT	2	8	75492	75499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015723	GCAG	2	8	89673	89680	25 %	0 %	50 %	25 %	339321408
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