MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 43420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015723	CCA	2	6	123	128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321331
2	NC_015723	CAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321331
3	NC_015723	AAC	2	6	194	199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321331
4	NC_015723	CGA	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321331
5	NC_015723	GCG	2	6	273	278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321331
6	NC_015723	TGA	2	6	381	386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321331
7	NC_015723	GCA	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321331
8	NC_015723	GCC	2	6	425	430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321331
9	NC_015723	GCC	2	6	435	440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321331
10	NC_015723	GAA	2	6	532	537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321331
11	NC_015723	GCG	2	6	543	548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321331
12	NC_015723	CGG	2	6	637	642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321331
13	NC_015723	CAG	2	6	671	676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321331
14	NC_015723	CCA	2	6	696	701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321331
15	NC_015723	CTG	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321331
16	NC_015723	TGG	2	6	809	814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321331
17	NC_015723	GTG	2	6	857	862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321331
18	NC_015723	TTC	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321331
19	NC_015723	CTT	2	6	982	987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321331
20	NC_015723	TGG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321331
21	NC_015723	CAC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321332
22	NC_015723	CGT	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321332
23	NC_015723	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321333
24	NC_015723	GCG	2	6	2046	2051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321333
25	NC_015723	GCG	2	6	2102	2107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321333
26	NC_015723	CGA	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321333
27	NC_015723	GCG	2	6	2163	2168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321333
28	NC_015723	TCG	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321333
29	NC_015723	CGG	2	6	2232	2237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321333
30	NC_015723	GGT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321333
31	NC_015723	CGC	2	6	2304	2309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321333
32	NC_015723	GCG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321333
33	NC_015723	CGA	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321333
34	NC_015723	GTT	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339321333
35	NC_015723	GAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321333
36	NC_015723	AGG	2	6	2565	2570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321333
37	NC_015723	ATG	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321333
38	NC_015723	CGA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321333
39	NC_015723	GGC	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321334
40	NC_015723	TGC	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321334
41	NC_015723	GCC	2	6	2803	2808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321334
42	NC_015723	GTG	2	6	2890	2895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321334
43	NC_015723	AGA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321334
44	NC_015723	CCG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321334
45	NC_015723	GAC	2	6	3055	3060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321334
46	NC_015723	GCT	2	6	3153	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321334
47	NC_015723	GCT	2	6	3240	3245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321334
48	NC_015723	CGC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321334
49	NC_015723	GGC	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321334
50	NC_015723	ATC	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321334
51	NC_015723	AGG	2	6	3431	3436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321334
52	NC_015723	GCT	2	6	3621	3626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321334
53	NC_015723	CAG	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321335
54	NC_015723	CAG	2	6	3760	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321335
55	NC_015723	GCC	2	6	3806	3811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321335
56	NC_015723	CGG	2	6	3835	3840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
57	NC_015723	CGG	2	6	3843	3848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
58	NC_015723	GGC	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
59	NC_015723	CGC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321335
60	NC_015723	CAG	2	6	4078	4083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321335
61	NC_015723	GCC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321335
62	NC_015723	GGC	2	6	4297	4302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
63	NC_015723	CGG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
64	NC_015723	AGC	2	6	4499	4504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321335
65	NC_015723	CCT	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339321335
66	NC_015723	TGC	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321335
67	NC_015723	CGG	2	6	4554	4559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
68	NC_015723	CAG	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321335
69	NC_015723	GGC	2	6	4756	4761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
70	NC_015723	CCA	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321335
71	NC_015723	GCC	2	6	4837	4842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321335
72	NC_015723	GCG	2	6	4950	4955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
73	NC_015723	CCG	2	6	4956	4961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321335
74	NC_015723	CGG	2	6	4997	5002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321335
75	NC_015723	CAG	3	9	5035	5043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321335
76	NC_015723	TCG	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321335
77	NC_015723	TCG	2	6	5153	5158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321335
78	NC_015723	CAC	2	6	5173	5178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321335
79	NC_015723	GCC	2	6	5183	5188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321335
80	NC_015723	CCG	2	6	5214	5219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321335
81	NC_015723	TCA	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321335
82	NC_015723	CCA	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321336
83	NC_015723	CCT	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339321336
84	NC_015723	CTG	2	6	5822	5827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321336
85	NC_015723	CTG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321336
86	NC_015723	CGG	2	6	5944	5949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321336
87	NC_015723	GGA	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321336
88	NC_015723	GGC	2	6	6016	6021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321336
89	NC_015723	GCG	2	6	6101	6106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321336
90	NC_015723	CGG	2	6	6124	6129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321336
91	NC_015723	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321336
92	NC_015723	GCT	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321336
93	NC_015723	CAA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321336
94	NC_015723	CGC	2	6	7003	7008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321337
95	NC_015723	TGC	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321337
96	NC_015723	GCT	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321337
97	NC_015723	CTG	2	6	7239	7244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321337
98	NC_015723	CGG	2	6	7292	7297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321337
99	NC_015723	GAC	2	6	7343	7348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321337
100	NC_015723	TCG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321338
101	NC_015723	TGC	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321338
102	NC_015723	GCT	2	6	7634	7639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321338
103	NC_015723	GCC	3	9	7683	7691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321338
104	NC_015723	GCC	3	9	7781	7789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321338
105	NC_015723	GCG	2	6	8495	8500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321339
106	NC_015723	CTG	2	6	8551	8556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321339
107	NC_015723	GCC	2	6	8571	8576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321339
108	NC_015723	TCG	2	6	8747	8752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321339
109	NC_015723	CAG	2	6	8766	8771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321339
110	NC_015723	GCC	2	6	8778	8783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321339
111	NC_015723	CTA	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321339
112	NC_015723	CGC	2	6	8913	8918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321339
113	NC_015723	CAT	2	6	8919	8924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321339
114	NC_015723	CCG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321339
115	NC_015723	GCT	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321339
116	NC_015723	TGC	2	6	9041	9046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321339
117	NC_015723	CAC	2	6	9151	9156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321339
118	NC_015723	TGC	2	6	9170	9175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321339
119	NC_015723	GCT	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321339
120	NC_015723	AGG	2	6	9239	9244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321339
121	NC_015723	GGC	2	6	9255	9260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321339
122	NC_015723	TCA	2	6	9323	9328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321339
123	NC_015723	GCA	2	6	10020	10025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321340
124	NC_015723	ACC	2	6	10102	10107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321340
125	NC_015723	GGT	2	6	10110	10115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321340
126	NC_015723	GCT	2	6	10119	10124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321340
127	NC_015723	GCT	2	6	10128	10133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321340
128	NC_015723	CGG	2	6	10203	10208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321340
129	NC_015723	CTG	2	6	10273	10278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321340
130	NC_015723	TGT	2	6	10322	10327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339321340
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251	NC_015723	CCG	2	6	16787	16792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321343
252	NC_015723	CAC	2	6	17011	17016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321343
253	NC_015723	GCA	2	6	17028	17033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321343
254	NC_015723	CCG	2	6	17043	17048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321343
255	NC_015723	GCC	2	6	17051	17056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321343
256	NC_015723	CCA	2	6	17163	17168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321343
257	NC_015723	GAC	2	6	17191	17196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321343
258	NC_015723	CGC	2	6	17208	17213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321343
259	NC_015723	CTT	2	6	17286	17291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321343
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261	NC_015723	ATC	2	6	17407	17412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321344
262	NC_015723	CTG	2	6	17433	17438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321344
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270	NC_015723	GCC	2	6	17949	17954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321345
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274	NC_015723	GCA	2	6	18187	18192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321345
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278	NC_015723	TCG	2	6	18348	18353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321345
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377	NC_015723	GCA	2	6	24400	24405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321349
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382	NC_015723	GGC	2	6	24637	24642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321349
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487	NC_015723	CGA	2	6	30247	30252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321353
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498	NC_015723	AGC	2	6	30812	30817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321353
499	NC_015723	GGT	2	6	30888	30893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321353
500	NC_015723	GGC	2	6	30924	30929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321353

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