MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015722	AAAAAT	2	12	2806	2817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015722	TAACAA	2	12	8011	8022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015722	AGAAGT	2	12	20990	21001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015722	CTTTTT	2	12	42858	42869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015722	TAGGAG	2	12	49894	49905	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015722	GATTTA	2	12	52055	52066	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015722	TATTTT	2	12	52448	52459	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015722	TAACAA	2	12	62733	62744	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015722	ATGTAT	2	12	66737	66748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015722	TACTCT	2	12	78900	78911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015722	TCTTTT	2	12	134787	134798	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015722	TTAAAA	2	12	170783	170794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015722	TATTTT	2	12	195145	195156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015722	TTTTAC	2	12	198876	198887	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015722	CAATTA	2	12	223591	223602	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015722	TTAAAA	2	12	235390	235401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015722	CCGTAA	2	12	250883	250894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015722	ATGGAG	2	12	260088	260099	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015722	ATTAAA	2	12	298283	298294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015722	ATGTAG	2	12	339579	339590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015722	GGCTAA	2	12	387078	387089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015722	AGGTAA	2	12	392972	392983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015722	TTAAAT	2	12	397190	397201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015722	TTTAAA	2	12	492380	492391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015722	CAAAAA	2	12	493287	493298	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015722	AAATTT	2	12	496112	496123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015722	ACTATA	2	12	501246	501257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015722	TTAAAG	2	12	501401	501412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015722	CCTTCG	2	12	504701	504712	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015722	AATGTT	2	12	512098	512109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015722	AATCTA	2	12	525905	525916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015722	CTTTTA	2	12	526344	526355	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015722	TTCCAT	2	12	531203	531214	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015722	TATTTT	2	12	573150	573161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015722	AGCTGC	2	12	616846	616857	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015722	AGAAAA	2	12	622821	622832	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015722	TACCAT	2	12	631059	631070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015722	AATATA	2	12	660462	660473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015722	ATAAAA	2	12	661999	662010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015722	ATCATT	2	12	669401	669412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015722	TATTTT	2	12	670654	670665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015722	ATTCAA	2	12	670795	670806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015722	ACTCCT	2	12	729061	729072	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015722	AGTATT	2	12	744739	744750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015722	CTTTTT	2	12	778304	778315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015722	TTGTGT	2	12	790709	790720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015722	AAGAAA	2	12	798840	798851	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015722	GCAATT	2	12	801194	801205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015722	ATTCCC	2	12	818255	818266	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015722	TTCTAA	2	12	827308	827319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015722	AAGAGG	2	12	830234	830245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015722	ACATAC	2	12	832274	832285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015722	ATTAAA	2	12	832311	832322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015722	ACCGTT	2	12	851475	851486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015722	TTTGCA	2	12	852413	852424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015722	TTTGCA	2	12	855296	855307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015722	CCGTAA	2	12	857469	857480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015722	TTACTT	2	12	857509	857520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015722	GCTAAA	2	12	857568	857579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015722	CTTCCC	2	12	862128	862139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015722	TTTAAT	2	12	866168	866179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015722	TAACAC	2	12	869206	869217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015722	AAAGCC	2	12	872514	872525	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015722	TTAATT	2	12	873006	873017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015722	GCTTTT	2	12	893916	893927	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015722	ATGAAG	2	12	906288	906299	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015722	GTATAT	2	12	916996	917007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015722	TAGCAA	2	12	919831	919842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015722	TTTATC	2	12	923030	923041	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015722	AGAAAC	2	12	926395	926406	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015722	TATAAA	2	12	930382	930393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015722	CAATAA	2	12	935817	935828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015722	CAAATT	2	12	960040	960051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015722	CTATCA	2	12	988286	988297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015722	ATTGTA	2	12	990175	990186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015722	TAATGT	2	12	1081006	1081017	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015722	AATACA	2	12	1081089	1081100	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015722	CACACC	2	12	1087522	1087533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015722	CAAAAA	2	12	1120299	1120310	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015722	GTTGAG	2	12	1132890	1132901	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015722	TCTGAT	2	12	1147453	1147464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015722	CTCTGC	2	12	1148148	1148159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015722	CTAGAT	2	12	1150493	1150504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015722	ATAATT	2	12	1170721	1170732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015722	GATTTT	2	12	1175533	1175544	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.