Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 269

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_015722TTTTTC2123783890 %83.33 %0 %16.67 %339319318
2NC_015722TTAGAT21283884933.33 %50 %16.67 %0 %339319318
3NC_015722AGCATT2121577158833.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319319
4NC_015722CTTCTG212252825390 %50 %16.67 %33.33 %339319321
5NC_015722ATTAGC2122655266633.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319321
6NC_015722GCGTTT212274927600 %50 %33.33 %16.67 %339319321
7NC_015722TTAGGC2126016602716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %339319329
8NC_015722GCTAAA2126403641450 %16.67 %16.67 %16.67 %339319329
9NC_015722ATGCTA2127800781133.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319330
10NC_015722ATATTG2127910792133.33 %50 %16.67 %0 %339319330
11NC_015722GGGGAG2128700871116.67 %0 %83.33 %0 %339319332
12NC_015722TGTTTT212941794280 %83.33 %16.67 %0 %339319333
13NC_015722AATCAA212108981090966.67 %16.67 %0 %16.67 %339319334
14NC_015722GTTACA212194231943433.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319345
15NC_015722TTAGAA212197821979350 %33.33 %16.67 %0 %339319346
16NC_015722AAAATA212198321984383.33 %16.67 %0 %0 %339319346
17NC_015722AAGATT212201442015550 %33.33 %16.67 %0 %339319346
18NC_015722ATCTAT212236582366933.33 %50 %0 %16.67 %339319355
19NC_015722TAAAGG212237422375350 %16.67 %33.33 %0 %339319355
20NC_015722GGTAAA212243272433850 %16.67 %33.33 %0 %339319357
21NC_015722GCTATT212281972820816.67 %50 %16.67 %16.67 %342837483
22NC_015722GAATCA212326983270950 %16.67 %16.67 %16.67 %339319367
23NC_015722TATAGA212343933440450 %33.33 %16.67 %0 %339319370
24NC_015722ATGGAG212526285263933.33 %16.67 %50 %0 %339319393
25NC_015722TTTGGT21258013580240 %66.67 %33.33 %0 %339319398
26NC_015722AGTAAT212588315884250 %33.33 %16.67 %0 %339319400
27NC_015722ATTCCA212590335904433.33 %33.33 %0 %33.33 %339319400
28NC_015722AAAGCC212641746418550 %0 %16.67 %33.33 %339319405
29NC_015722TTCAAC212827738278433.33 %33.33 %0 %33.33 %339319421
30NC_015722CTATTT212852318524216.67 %66.67 %0 %16.67 %339319423
31NC_015722CATTGC212874668747716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %339319425
32NC_015722ATCGGA212910459105633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339319428
33NC_015722TCATTT212924889249916.67 %66.67 %0 %16.67 %339319429
34NC_015722TTGATG212932539326416.67 %50 %33.33 %0 %339319429
35NC_015722TTTTGC21295792958030 %66.67 %16.67 %16.67 %339319434
36NC_015722AGGAAT212991439915450 %16.67 %33.33 %0 %339319439
37NC_015722AAGACC21210085910087050 %0 %16.67 %33.33 %339319442
38NC_015722TCAGAT21210807210808333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319451
39NC_015722TAAAAG21210823610824766.67 %16.67 %16.67 %0 %339319451
40NC_015722AAATAG21211143611144766.67 %16.67 %16.67 %0 %339319455
41NC_015722AAATAT21211339111340266.67 %33.33 %0 %0 %339319456
42NC_015722CAAAAA21211800711801883.33 %0 %0 %16.67 %339319461
43NC_015722ATGGGA21213184613185733.33 %16.67 %50 %0 %339319474
44NC_015722ACAAAG21213774913776066.67 %0 %16.67 %16.67 %339319480
45NC_015722TAAATT21214076214077350 %50 %0 %0 %339319484
46NC_015722TATGGT21214080614081716.67 %50 %33.33 %0 %339319484
47NC_015722GAATTT21214129414130533.33 %50 %16.67 %0 %339319484
48NC_015722TACCTA21214357714358833.33 %33.33 %0 %33.33 %339319486
49NC_015722ATTTCG21214446314447416.67 %50 %16.67 %16.67 %339319487
50NC_015722GATATT21214499614500733.33 %50 %16.67 %0 %339319487
51NC_015722GTTTTA21214603414604516.67 %66.67 %16.67 %0 %339319488
52NC_015722ATCATT21215138715139833.33 %50 %0 %16.67 %339319494
53NC_015722GCTCCT2121544671544780 %33.33 %16.67 %50 %339319496
54NC_015722TATAAC21216304116305250 %33.33 %0 %16.67 %339319505
55NC_015722ATTTCT21217944917946016.67 %66.67 %0 %16.67 %339319521
56NC_015722CAGCAA21217975517976650 %0 %16.67 %33.33 %339319522
57NC_015722TAGATT21218310718311833.33 %50 %16.67 %0 %339319525
58NC_015722TTAATT21219347619348733.33 %66.67 %0 %0 %339319535
59NC_015722TGTTTA21219375419376516.67 %66.67 %16.67 %0 %339319535
60NC_015722TCAGTT21220088220089316.67 %50 %16.67 %16.67 %339319539
61NC_015722TTCCTT2122029512029620 %66.67 %0 %33.33 %339319542
62NC_015722AAATCT21220410120411250 %33.33 %0 %16.67 %339319542
63NC_015722ATCCAT21220754820755933.33 %33.33 %0 %33.33 %339319545
64NC_015722ATCTAA21220899820900950 %33.33 %0 %16.67 %339319546
65NC_015722AATGTT21221182921184033.33 %50 %16.67 %0 %339319548
66NC_015722AAAGAA21221920521921683.33 %0 %16.67 %0 %339319556
67NC_015722TAGAAA21222071522072666.67 %16.67 %16.67 %0 %339319557
68NC_015722ATTTGG21222437722438816.67 %50 %33.33 %0 %339319560
69NC_015722GATATA21222640922642050 %33.33 %16.67 %0 %339319562
70NC_015722TAGATA21223344423345550 %33.33 %16.67 %0 %339319568
71NC_015722TTATCA21223589623590733.33 %50 %0 %16.67 %339319571
72NC_015722TAAGTG21223921623922733.33 %33.33 %33.33 %0 %339319574
73NC_015722AGATTG21224126824127933.33 %33.33 %33.33 %0 %339319578
74NC_015722ACAAAA21224469524470683.33 %0 %0 %16.67 %339319580
75NC_015722GATTAT21224995224996333.33 %50 %16.67 %0 %339319585
76NC_015722CTTTCT2122566132566240 %66.67 %0 %33.33 %339319591
77NC_015722GCTTTT2122662622662730 %66.67 %16.67 %16.67 %339319597
78NC_015722TTTGTC2122667022667130 %66.67 %16.67 %16.67 %339319597
79NC_015722AGGTAA21226709826710950 %16.67 %33.33 %0 %339319597
80NC_015722AAAATA21226833326834483.33 %16.67 %0 %0 %339319597
81NC_015722CAAAGG21226941226942350 %0 %33.33 %16.67 %339319598
82NC_015722GATATC21227375127376233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319602
83NC_015722AGATAA21227560327561466.67 %16.67 %16.67 %0 %339319604
84NC_015722TGATAA21228020228021350 %33.33 %16.67 %0 %339319609
85NC_015722ATTAGA21228214828215950 %33.33 %16.67 %0 %339319611
86NC_015722CAACTA21228632528633650 %16.67 %0 %33.33 %339319616
87NC_015722GATTTA21228924128925233.33 %50 %16.67 %0 %339319618
88NC_015722GAAAAA21229287829288983.33 %0 %16.67 %0 %339319621
89NC_015722AGTTTT21229414329415416.67 %66.67 %16.67 %0 %339319622
90NC_015722TAATAT21230015730016850 %50 %0 %0 %339319628
91NC_015722AGCCAA21230953430954550 %0 %16.67 %33.33 %339319636
92NC_015722TACGGC21231633531634616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %339319642
93NC_015722AGCATT21231792231793333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319643
94NC_015722TAGATT21231832331833433.33 %50 %16.67 %0 %339319644
95NC_015722ATATTA21231969331970450 %50 %0 %0 %339319646
96NC_015722AATTAA21232351732352866.67 %33.33 %0 %0 %339319651
97NC_015722AGAAAA21232753932755083.33 %0 %16.67 %0 %339319656
98NC_015722TTTGAA21233217533218633.33 %50 %16.67 %0 %339319658
99NC_015722TACCTG21233557433558516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %339319661
100NC_015722TTTTTC2123363963364070 %83.33 %0 %16.67 %339319661
101NC_015722AAATAA21234133634134783.33 %16.67 %0 %0 %339319666
102NC_015722GAAATA21234452034453166.67 %16.67 %16.67 %0 %339319669
103NC_015722TAATAG21236247336248450 %33.33 %16.67 %0 %339319690
104NC_015722TTCTGC2123655653655760 %50 %16.67 %33.33 %339319693
105NC_015722GAAAAA21238358738359883.33 %0 %16.67 %0 %339319709
106NC_015722CTTCAT21239162339163416.67 %50 %0 %33.33 %339319718
107NC_015722TGACAC21240472740473833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %339319733
108NC_015722TTTTTC2124060284060390 %83.33 %0 %16.67 %339319734
109NC_015722AAGAGA21242361942363066.67 %0 %33.33 %0 %339319752
110NC_015722CTTCTC2124315314315420 %50 %0 %50 %339319759
111NC_015722TTCTTT2124414034414140 %83.33 %0 %16.67 %339319770
112NC_015722TCAAGA21244383644384750 %16.67 %16.67 %16.67 %339319771
113NC_015722TAAAAA21244969344970483.33 %16.67 %0 %0 %339319778
114NC_015722AGTAGC21245019545020633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339319778
115NC_015722AAAATT21245320245321366.67 %33.33 %0 %0 %339319780
116NC_015722TAAAGA21245628845629966.67 %16.67 %16.67 %0 %339319784
117NC_015722TCGAAA21247558047559150 %16.67 %16.67 %16.67 %339319803
118NC_015722CTTGAA21247579247580333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319803
119NC_015722CTATAT21247646647647733.33 %50 %0 %16.67 %339319803
120NC_015722AAGCAT21247889247890350 %16.67 %16.67 %16.67 %339319804
121NC_015722AAACTA21249441049442166.67 %16.67 %0 %16.67 %339319817
122NC_015722AGATGG21249556449557533.33 %16.67 %50 %0 %339319818
123NC_015722TACTTT21249811949813016.67 %66.67 %0 %16.67 %339319822
124NC_015722TCAATA21249984549985650 %33.33 %0 %16.67 %339319824
125NC_015722CTAAAT21250365850366950 %33.33 %0 %16.67 %339319830
126NC_015722TTTTTG2125038035038140 %83.33 %16.67 %0 %339319830
127NC_015722TCAAGG21250947750948833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339319836
128NC_015722CATTAA21251129951131050 %33.33 %0 %16.67 %339319838
129NC_015722GGAGGC21251232851233916.67 %0 %66.67 %16.67 %339319839
130NC_015722TTTTCT2125173895174000 %83.33 %0 %16.67 %339319845
131NC_015722CAAAAA21252738452739583.33 %0 %0 %16.67 %339319855
132NC_015722GTAATT21253458253459333.33 %50 %16.67 %0 %339319861
133NC_015722ACTGCA21254396454397533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %339319874
134NC_015722ACTTCA21254431554432633.33 %33.33 %0 %33.33 %339319874
135NC_015722TTCTAT21254602354603416.67 %66.67 %0 %16.67 %339319876
136NC_015722AGAAAT21254714754715866.67 %16.67 %16.67 %0 %339319876
137NC_015722CCTCCA21254751254752316.67 %16.67 %0 %66.67 %339319876
138NC_015722CAGAAG21254900154901250 %0 %33.33 %16.67 %339319877
139NC_015722TATTCA21255055655056733.33 %50 %0 %16.67 %339319878
140NC_015722GTTCAA21256393356394433.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319890
141NC_015722AACTTC21256433356434433.33 %33.33 %0 %33.33 %339319890
142NC_015722GCAGAA21257032657033750 %0 %33.33 %16.67 %339319898
143NC_015722ATTTTC21257426057427116.67 %66.67 %0 %16.67 %339319901
144NC_015722TATTAG21257885157886233.33 %50 %16.67 %0 %339319905
145NC_015722ATGGCT21257932357933416.67 %33.33 %33.33 %16.67 %339319906
146NC_015722TGATAC21258764058765133.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319917
147NC_015722TATTTG21259720859721916.67 %66.67 %16.67 %0 %339319924
148NC_015722TCATAT21260384160385233.33 %50 %0 %16.67 %339319927
149NC_015722ATTTTT21260633960635016.67 %83.33 %0 %0 %339319929
150NC_015722ACCTTT21260681060682116.67 %50 %0 %33.33 %339319929
151NC_015722TTTCTC2126203536203640 %66.67 %0 %33.33 %339319945
152NC_015722GGCATA21262336462337533.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339319951
153NC_015722GCAGCG21262538762539816.67 %0 %50 %33.33 %339319952
154NC_015722CAGAAA21262789062790166.67 %0 %16.67 %16.67 %339319955
155NC_015722CAATTT21263801163802233.33 %50 %0 %16.67 %339319965
156NC_015722GACAAT21263847863848950 %16.67 %16.67 %16.67 %339319965
157NC_015722GATAAT21264468264469350 %33.33 %16.67 %0 %339319968
158NC_015722AAAAAT21264517864518983.33 %16.67 %0 %0 %339319969
159NC_015722GCCAAT21264611064612133.33 %16.67 %16.67 %33.33 %339319971
160NC_015722GATCAA21264775064776150 %16.67 %16.67 %16.67 %339319972
161NC_015722AACAAA21264778964780083.33 %0 %0 %16.67 %339319972
162NC_015722ACCCTC21265058965060016.67 %16.67 %0 %66.67 %339319976
163NC_015722CTATTT21265443465444516.67 %66.67 %0 %16.67 %339319979
164NC_015722AATATT21265764165765250 %50 %0 %0 %339319983
165NC_015722ATAAAA21265817365818483.33 %16.67 %0 %0 %339319983
166NC_015722ATTAGC21266560966562033.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339319988
167NC_015722TAACTA21266814966816050 %33.33 %0 %16.67 %339319989
168NC_015722GGCATT21266821666822716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %339319989
169NC_015722TTTCTT2126781386781490 %83.33 %0 %16.67 %339319993
170NC_015722TATTAA21269398469399550 %50 %0 %0 %339320012
171NC_015722GAAAGA21270032670033766.67 %0 %33.33 %0 %339320017
172NC_015722TGGTAT21270124570125616.67 %50 %33.33 %0 %339320018
173NC_015722TTTTCA21270353170354216.67 %66.67 %0 %16.67 %339320021
174NC_015722TTAAAA21270463270464366.67 %33.33 %0 %0 %339320023
175NC_015722TGCTGG2127149097149200 %33.33 %50 %16.67 %339320031
176NC_015722ATAAGC21272306372307450 %16.67 %16.67 %16.67 %339320037
177NC_015722ATTTTG21273137473138516.67 %66.67 %16.67 %0 %339320047
178NC_015722ATATTT21273167873168933.33 %66.67 %0 %0 %339320047
179NC_015722ACTGAG21274124274125333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339320060
180NC_015722TTGGGG2127471147471250 %33.33 %66.67 %0 %339320065
181NC_015722CTTTTT2127670057670160 %83.33 %0 %16.67 %339320084
182NC_015722AGCAGG21278073578074633.33 %0 %50 %16.67 %339320105
183NC_015722AGTATT21279785879786933.33 %50 %16.67 %0 %339320119
184NC_015722CTATTA21279815679816733.33 %50 %0 %16.67 %339320119
185NC_015722TATAGA21280427380428450 %33.33 %16.67 %0 %339320129
186NC_015722TAAGAA21280576480577566.67 %16.67 %16.67 %0 %339320131
187NC_015722AGTTAA21281586881587950 %33.33 %16.67 %0 %339320143
188NC_015722AGTTGC21285322685323716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %339320183
189NC_015722TAACAA21285373285374366.67 %16.67 %0 %16.67 %339320184
190NC_015722TGCTCC2128636408636510 %33.33 %16.67 %50 %339320195
191NC_015722GAATTA21286725386726450 %33.33 %16.67 %0 %339320198
192NC_015722ATCTTT21287798287799316.67 %66.67 %0 %16.67 %339320210
193NC_015722TCCACA21288139988141033.33 %16.67 %0 %50 %339320212
194NC_015722ATATAA21288167888168966.67 %33.33 %0 %0 %339320212
195NC_015722ACACTG21288308788309833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %339320214
196NC_015722TACCAA21288421588422650 %16.67 %0 %33.33 %339320215
197NC_015722CCAAAA21288572088573166.67 %0 %0 %33.33 %339320216
198NC_015722GTTGGA21288686088687116.67 %33.33 %50 %0 %339320217
199NC_015722TAAAAA21288841888842983.33 %16.67 %0 %0 %339320218
200NC_015722TCACTT21289565189566216.67 %50 %0 %33.33 %339320225
201NC_015722TCCTAT21290453490454516.67 %50 %0 %33.33 %339320234
202NC_015722AATAGA21291027391028466.67 %16.67 %16.67 %0 %339320242
203NC_015722TTGCAA21291724791725833.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339320249
204NC_015722GTAACG21291888591889633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339320250
205NC_015722CCAACT21292962792963833.33 %16.67 %0 %50 %339320263
206NC_015722CCCTAT21293875593876616.67 %33.33 %0 %50 %339320269
207NC_015722TCCCAG21293879393880416.67 %16.67 %16.67 %50 %339320269
208NC_015722TCTTCA21294406994408016.67 %50 %0 %33.33 %339320274
209NC_015722GTAATT21294524394525433.33 %50 %16.67 %0 %339320276
210NC_015722TGAAAA21294576194577266.67 %16.67 %16.67 %0 %339320276
211NC_015722TTCAAT21295578295579333.33 %50 %0 %16.67 %339320282
212NC_015722AGAGGC21296814596815633.33 %0 %50 %16.67 %339320296
213NC_015722ATAAAA21296971096972183.33 %16.67 %0 %0 %339320297
214NC_015722TGAAGA21297051297052350 %16.67 %33.33 %0 %339320297
215NC_015722AATTAA21297396297397366.67 %33.33 %0 %0 %339320300
216NC_015722GAGAAG21298012698013750 %0 %50 %0 %339320304
217NC_015722AAAAGA21298121098122183.33 %0 %16.67 %0 %339320304
218NC_015722CCTCTT2129845029845130 %50 %0 %50 %339320308
219NC_015722TTCTGC2129913649913750 %50 %16.67 %33.33 %339320312
220NC_015722GATCAT21299335499336533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339320314
221NC_015722GAAAAA21299509999511083.33 %0 %16.67 %0 %339320316
222NC_015722TTAATG21299993399994433.33 %50 %16.67 %0 %339320325
223NC_015722AAGTGC2121000171100018233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339320325
224NC_015722TTAAAA2121002093100210466.67 %33.33 %0 %0 %339320328
225NC_015722TATGCA2121006933100694433.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339320332
226NC_015722AGGATC2121018786101879733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %339320345
227NC_015722ATATTA2121019881101989250 %50 %0 %0 %339320346
228NC_015722ACTGCA2121023379102339033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %339320349
229NC_015722AAGAGC2121025270102528150 %0 %33.33 %16.67 %339320350
230NC_015722GTTTTT212103081510308260 %83.33 %16.67 %0 %339320359
231NC_015722GACACC2121031380103139133.33 %0 %16.67 %50 %339320359
232NC_015722GATTTA2121034930103494133.33 %50 %16.67 %0 %339320364
233NC_015722ATGGTG2121035594103560516.67 %33.33 %50 %0 %339320364
234NC_015722TTCCTT212104109510411060 %66.67 %0 %33.33 %339320369
235NC_015722CTTTTA2121044831104484216.67 %66.67 %0 %16.67 %339320373
236NC_015722CCTTTG212104628210462930 %50 %16.67 %33.33 %339320374
237NC_015722TCTACC2121048394104840516.67 %33.33 %0 %50 %339320375
238NC_015722CTGGAG2121052706105271716.67 %16.67 %50 %16.67 %339320379
239NC_015722TGATAT2121053502105351333.33 %50 %16.67 %0 %339320380
240NC_015722CTTCAC2121057309105732016.67 %33.33 %0 %50 %339320385
241NC_015722CTCAAA2121057727105773850 %16.67 %0 %33.33 %339320386
242NC_015722CTAAAT2121058650105866150 %33.33 %0 %16.67 %339320387
243NC_015722CCAGCT2121068761106877216.67 %16.67 %16.67 %50 %339320394
244NC_015722TAATAT2121081524108153550 %50 %0 %0 %339320413
245NC_015722TTCAAT2121084350108436133.33 %50 %0 %16.67 %339320418
246NC_015722AATATT2121085030108504150 %50 %0 %0 %339320418
247NC_015722AATTTC2121093075109308633.33 %50 %0 %16.67 %339320429
248NC_015722GCTTGC212109650010965110 %33.33 %33.33 %33.33 %339320433
249NC_015722CAGTAT2121100308110031933.33 %33.33 %16.67 %16.67 %339320437
250NC_015722TTCTAT2121100501110051216.67 %66.67 %0 %16.67 %339320437
251NC_015722CCTTTT212110795511079660 %66.67 %0 %33.33 %339320446
252NC_015722GATTTC2121108029110804016.67 %50 %16.67 %16.67 %339320446
253NC_015722AGCACA2121115259111527050 %0 %16.67 %33.33 %339320452
254NC_015722CACAAC2121121455112146650 %0 %0 %50 %339320459
255NC_015722CTTAAA2121124567112457850 %33.33 %0 %16.67 %339320463
256NC_015722ATAAAA2121128765112877683.33 %16.67 %0 %0 %339320467
257NC_015722AATGAG2121130021113003250 %16.67 %33.33 %0 %339320468
258NC_015722TAAAAA2121133467113347883.33 %16.67 %0 %0 %339320472
259NC_015722ATCAGA2121138323113833450 %16.67 %16.67 %16.67 %339320475
260NC_015722GGCGCT212114170411417150 %16.67 %50 %33.33 %339320482
261NC_015722TGTAAA2121148626114863750 %33.33 %16.67 %0 %339320489
262NC_015722CTATAC2121153043115305433.33 %33.33 %0 %33.33 %339320492
263NC_015722TATTGA2121156923115693433.33 %50 %16.67 %0 %339320496
264NC_015722ATTTTA2121163153116316433.33 %66.67 %0 %0 %339320504
265NC_015722TGCTGG212116320311632140 %33.33 %50 %16.67 %339320504
266NC_015722GCCAGA2121172456117246733.33 %0 %33.33 %33.33 %339320511
267NC_015722TTTTTC212117271611727270 %83.33 %0 %16.67 %339320512
268NC_015722AACTCA2121173224117323550 %16.67 %0 %33.33 %339320513
269NC_015722ATGGAG2121173403117341433.33 %16.67 %50 %0 %339320514