MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015722	AAATT	2	10	2343	2352	60 %	40 %	0 %	0 %	339319320
2	NC_015722	ATTTT	2	10	3864	3873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015722	TTTGA	2	10	5624	5633	20 %	60 %	20 %	0 %	339319328
4	NC_015722	TTTTA	2	10	6621	6630	20 %	80 %	0 %	0 %	339319329
5	NC_015722	TTAAA	2	10	7088	7097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015722	AGATG	2	10	7705	7714	40 %	20 %	40 %	0 %	339319330
7	NC_015722	TAAAA	2	10	7837	7846	80 %	20 %	0 %	0 %	339319330
8	NC_015722	GAAGG	2	10	8202	8211	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015722	CGATA	2	10	9591	9600	40 %	20 %	20 %	20 %	339319333
10	NC_015722	ATTTA	2	10	10073	10082	40 %	60 %	0 %	0 %	339319333
11	NC_015722	AACAA	2	10	10869	10878	80 %	0 %	0 %	20 %	339319334
12	NC_015722	GAGAG	2	10	13494	13503	40 %	0 %	60 %	0 %	339319337
13	NC_015722	AAAGA	2	10	13571	13580	80 %	0 %	20 %	0 %	339319337
14	NC_015722	GTTTT	2	10	14471	14480	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015722	TACTA	2	10	16639	16648	40 %	40 %	0 %	20 %	339319340
16	NC_015722	TAAAT	2	10	16732	16741	60 %	40 %	0 %	0 %	339319340
17	NC_015722	GATAA	2	10	18516	18525	60 %	20 %	20 %	0 %	339319343
18	NC_015722	AAAAG	2	10	19442	19451	80 %	0 %	20 %	0 %	339319345
19	NC_015722	ATGCG	2	10	20115	20124	20 %	20 %	40 %	20 %	339319346
20	NC_015722	AACTT	2	10	20433	20442	40 %	40 %	0 %	20 %	339319347
21	NC_015722	GTTGT	2	10	21503	21512	0 %	60 %	40 %	0 %	339319350
22	NC_015722	GAAAG	2	10	21692	21701	60 %	0 %	40 %	0 %	339319351
23	NC_015722	TAGTA	2	10	22548	22557	40 %	40 %	20 %	0 %	339319353
24	NC_015722	GAAAT	2	10	24462	24471	60 %	20 %	20 %	0 %	339319357
25	NC_015722	GGGAA	2	10	25514	25523	40 %	0 %	60 %	0 %	339319359
26	NC_015722	GATCA	2	10	26222	26231	40 %	20 %	20 %	20 %	339319360
27	NC_015722	ACAAT	2	10	28341	28350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015722	ATATT	2	10	28942	28951	40 %	60 %	0 %	0 %	339319363
29	NC_015722	GTTTT	2	10	30573	30582	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015722	GGTGA	2	10	32201	32210	20 %	20 %	60 %	0 %	339319367
31	NC_015722	AAAAG	2	10	32263	32272	80 %	0 %	20 %	0 %	339319367
32	NC_015722	AGGTT	2	10	33544	33553	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015722	TATAA	2	10	33583	33592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015722	GAAAG	2	10	33960	33969	60 %	0 %	40 %	0 %	339319370
35	NC_015722	AGAAA	2	10	34545	34554	80 %	0 %	20 %	0 %	339319370
36	NC_015722	TGCAA	2	10	34917	34926	40 %	20 %	20 %	20 %	339319371
37	NC_015722	CTTGC	2	10	35578	35587	0 %	40 %	20 %	40 %	339319371
38	NC_015722	GTTTT	2	10	36801	36810	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015722	TTTGT	2	10	37652	37661	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015722	AGGTT	2	10	38049	38058	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015722	AATAG	2	10	38300	38309	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015722	ATATA	2	10	39883	39892	60 %	40 %	0 %	0 %	339319376
43	NC_015722	AACTT	2	10	40412	40421	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015722	GTTTT	2	10	41713	41722	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015722	TCAAG	2	10	42788	42797	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015722	AAATA	2	10	44366	44375	80 %	20 %	0 %	0 %	339319382
47	NC_015722	AAAAC	2	10	45185	45194	80 %	0 %	0 %	20 %	339319384
48	NC_015722	ATGTT	2	10	48608	48617	20 %	60 %	20 %	0 %	339319387
49	NC_015722	TTTAG	2	10	49696	49705	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015722	AAAAC	2	10	51510	51519	80 %	0 %	0 %	20 %	339319392
51	NC_015722	GTTTT	2	10	55979	55988	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015722	TTTTA	2	10	57138	57147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015722	GAGAT	2	10	61461	61470	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015722	GTTTT	2	10	62465	62474	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015722	AATGC	2	10	64098	64107	40 %	20 %	20 %	20 %	339319405
56	NC_015722	TTTAT	2	10	64214	64223	20 %	80 %	0 %	0 %	339319405
57	NC_015722	TTCCT	2	10	65218	65227	0 %	60 %	0 %	40 %	339319406
58	NC_015722	AAAAT	2	10	65429	65438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015722	AATTA	2	10	65611	65620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015722	GTAAA	2	10	66010	66019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015722	TTGGT	2	10	66191	66200	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015722	TGAAT	2	10	66206	66215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015722	AAGGC	2	10	66224	66233	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015722	GTCCT	2	10	67915	67924	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015722	AGGAG	2	10	68537	68546	40 %	0 %	60 %	0 %	339319407
66	NC_015722	TTTTA	2	10	69129	69138	20 %	80 %	0 %	0 %	339319407
67	NC_015722	ATAAA	2	10	69615	69624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015722	GAAGA	2	10	70453	70462	60 %	0 %	40 %	0 %	339319408
69	NC_015722	GTTTT	2	10	72198	72207	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015722	GGTGA	2	10	73356	73365	20 %	20 %	60 %	0 %	339319411
71	NC_015722	TACAA	2	10	75419	75428	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015722	GTAGA	2	10	75429	75438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015722	CTCAC	2	10	75808	75817	20 %	20 %	0 %	60 %	339319414
74	NC_015722	TCTAC	2	10	78572	78581	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015722	ATTTT	2	10	79200	79209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015722	TAATA	2	10	79213	79222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015722	AGCTA	2	10	80372	80381	40 %	20 %	20 %	20 %	339319418
78	NC_015722	TCTAA	2	10	81094	81103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015722	AAAAC	2	10	81827	81836	80 %	0 %	0 %	20 %	339319419
80	NC_015722	AATTA	2	10	82902	82911	60 %	40 %	0 %	0 %	339319421
81	NC_015722	TTTTG	2	10	83125	83134	0 %	80 %	20 %	0 %	339319421
82	NC_015722	AAGGC	2	10	84183	84192	40 %	0 %	40 %	20 %	339319422
83	NC_015722	TAAAA	2	10	84893	84902	80 %	20 %	0 %	0 %	339319423
84	NC_015722	TTATA	2	10	85860	85869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015722	ACAAT	2	10	85974	85983	60 %	20 %	0 %	20 %	339319424
86	NC_015722	ATATT	2	10	87143	87152	40 %	60 %	0 %	0 %	339319424
87	NC_015722	TTTCA	2	10	89361	89370	20 %	60 %	0 %	20 %	339319426
88	NC_015722	AACAT	2	10	90712	90721	60 %	20 %	0 %	20 %	339319428
89	NC_015722	TTGCT	2	10	97093	97102	0 %	60 %	20 %	20 %	339319437
90	NC_015722	GGGCT	2	10	97445	97454	0 %	20 %	60 %	20 %	339319437
91	NC_015722	CATTG	2	10	98569	98578	20 %	40 %	20 %	20 %	339319438
92	NC_015722	GAGGT	2	10	98940	98949	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015722	CTTTA	2	10	99023	99032	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015722	CAAAA	2	10	99280	99289	80 %	0 %	0 %	20 %	339319439
95	NC_015722	GTGTA	2	10	99786	99795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015722	TGAAA	2	10	100016	100025	60 %	20 %	20 %	0 %	339319440
97	NC_015722	TGAGA	2	10	101992	102001	40 %	20 %	40 %	0 %	339319444
98	NC_015722	AGCTA	2	10	103529	103538	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015722	ATATT	2	10	107135	107144	40 %	60 %	0 %	0 %	339319449
100	NC_015722	AGAAA	2	10	108285	108294	80 %	0 %	20 %	0 %	339319451
101	NC_015722	TGTCA	2	10	110141	110150	20 %	40 %	20 %	20 %	339319454
102	NC_015722	TAGTA	2	10	110600	110609	40 %	40 %	20 %	0 %	339319454
103	NC_015722	TGCGG	2	10	112250	112259	0 %	20 %	60 %	20 %	339319455
104	NC_015722	TAAAA	2	10	113009	113018	80 %	20 %	0 %	0 %	339319455
105	NC_015722	GTCAA	2	10	116773	116782	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015722	ATTTA	2	10	117700	117709	40 %	60 %	0 %	0 %	339319461
107	NC_015722	TCATG	2	10	120280	120289	20 %	40 %	20 %	20 %	339319461
108	NC_015722	TGGTG	2	10	120447	120456	0 %	40 %	60 %	0 %	339319462
109	NC_015722	AACCT	2	10	120557	120566	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015722	AGGGT	2	10	120763	120772	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015722	TGTTA	2	10	121262	121271	20 %	60 %	20 %	0 %	339319463
112	NC_015722	TTTTA	2	10	122165	122174	20 %	80 %	0 %	0 %	339319464
113	NC_015722	AAAAC	2	10	123624	123633	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015722	AATTC	2	10	124809	124818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015722	TTGTT	2	10	125309	125318	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015722	ATGGC	2	10	125570	125579	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015722	TTTTG	2	10	125751	125760	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015722	AATTA	2	10	126072	126081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015722	TTAAC	2	10	126460	126469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015722	ATTTT	2	10	128578	128587	20 %	80 %	0 %	0 %	339319470
121	NC_015722	CCTAT	2	10	128731	128740	20 %	40 %	0 %	40 %	339319470
122	NC_015722	TCTTG	2	10	130114	130123	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015722	GAAAT	2	10	132372	132381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015722	AAATA	2	10	132683	132692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015722	GTTTT	2	10	132922	132931	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015722	AGTAT	2	10	133225	133234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015722	AAAAG	2	10	133330	133339	80 %	0 %	20 %	0 %	339319477
128	NC_015722	TAATA	2	10	136078	136087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015722	AAGAT	2	10	136164	136173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015722	GTTTT	2	10	137892	137901	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015722	AAAAC	2	10	138655	138664	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015722	TGCAC	2	10	138930	138939	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015722	GCAAA	2	10	141352	141361	60 %	0 %	20 %	20 %	339319484
134	NC_015722	CATTA	2	10	141542	141551	40 %	40 %	0 %	20 %	339319484
135	NC_015722	TGTTT	2	10	141701	141710	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015722	GTATT	2	10	141869	141878	20 %	60 %	20 %	0 %	339319485
137	NC_015722	TTGGC	2	10	142364	142373	0 %	40 %	40 %	20 %	339319485
138	NC_015722	AGGAT	2	10	143675	143684	40 %	20 %	40 %	0 %	339319486
139	NC_015722	CAATG	2	10	144450	144459	40 %	20 %	20 %	20 %	339319487
140	NC_015722	TCAGT	2	10	144946	144955	20 %	40 %	20 %	20 %	339319487
141	NC_015722	CTCTT	2	10	145418	145427	0 %	60 %	0 %	40 %	339319487
142	NC_015722	CATTA	2	10	145530	145539	40 %	40 %	0 %	20 %	339319487
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