MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015722	AAATT	2	10	2343	2352	60 %	40 %	0 %	0 %	339319320
2	NC_015722	TTTGA	2	10	5624	5633	20 %	60 %	20 %	0 %	339319328
3	NC_015722	TTTTA	2	10	6621	6630	20 %	80 %	0 %	0 %	339319329
4	NC_015722	AGATG	2	10	7705	7714	40 %	20 %	40 %	0 %	339319330
5	NC_015722	TAAAA	2	10	7837	7846	80 %	20 %	0 %	0 %	339319330
6	NC_015722	CGATA	2	10	9591	9600	40 %	20 %	20 %	20 %	339319333
7	NC_015722	ATTTA	2	10	10073	10082	40 %	60 %	0 %	0 %	339319333
8	NC_015722	AACAA	2	10	10869	10878	80 %	0 %	0 %	20 %	339319334
9	NC_015722	GAGAG	2	10	13494	13503	40 %	0 %	60 %	0 %	339319337
10	NC_015722	AAAGA	2	10	13571	13580	80 %	0 %	20 %	0 %	339319337
11	NC_015722	TACTA	2	10	16639	16648	40 %	40 %	0 %	20 %	339319340
12	NC_015722	TAAAT	2	10	16732	16741	60 %	40 %	0 %	0 %	339319340
13	NC_015722	GATAA	2	10	18516	18525	60 %	20 %	20 %	0 %	339319343
14	NC_015722	AAAAG	2	10	19442	19451	80 %	0 %	20 %	0 %	339319345
15	NC_015722	ATGCG	2	10	20115	20124	20 %	20 %	40 %	20 %	339319346
16	NC_015722	AACTT	2	10	20433	20442	40 %	40 %	0 %	20 %	339319347
17	NC_015722	GTTGT	2	10	21503	21512	0 %	60 %	40 %	0 %	339319350
18	NC_015722	GAAAG	2	10	21692	21701	60 %	0 %	40 %	0 %	339319351
19	NC_015722	TAGTA	2	10	22548	22557	40 %	40 %	20 %	0 %	339319353
20	NC_015722	GAAAT	2	10	24462	24471	60 %	20 %	20 %	0 %	339319357
21	NC_015722	GGGAA	2	10	25514	25523	40 %	0 %	60 %	0 %	339319359
22	NC_015722	GATCA	2	10	26222	26231	40 %	20 %	20 %	20 %	339319360
23	NC_015722	ATATT	2	10	28942	28951	40 %	60 %	0 %	0 %	339319363
24	NC_015722	GGTGA	2	10	32201	32210	20 %	20 %	60 %	0 %	339319367
25	NC_015722	AAAAG	2	10	32263	32272	80 %	0 %	20 %	0 %	339319367
26	NC_015722	GAAAG	2	10	33960	33969	60 %	0 %	40 %	0 %	339319370
27	NC_015722	AGAAA	2	10	34545	34554	80 %	0 %	20 %	0 %	339319370
28	NC_015722	TGCAA	2	10	34917	34926	40 %	20 %	20 %	20 %	339319371
29	NC_015722	CTTGC	2	10	35578	35587	0 %	40 %	20 %	40 %	339319371
30	NC_015722	ATATA	2	10	39883	39892	60 %	40 %	0 %	0 %	339319376
31	NC_015722	AAATA	2	10	44366	44375	80 %	20 %	0 %	0 %	339319382
32	NC_015722	AAAAC	2	10	45185	45194	80 %	0 %	0 %	20 %	339319384
33	NC_015722	ATGTT	2	10	48608	48617	20 %	60 %	20 %	0 %	339319387
34	NC_015722	AAAAC	2	10	51510	51519	80 %	0 %	0 %	20 %	339319392
35	NC_015722	AATGC	2	10	64098	64107	40 %	20 %	20 %	20 %	339319405
36	NC_015722	TTTAT	2	10	64214	64223	20 %	80 %	0 %	0 %	339319405
37	NC_015722	TTCCT	2	10	65218	65227	0 %	60 %	0 %	40 %	339319406
38	NC_015722	AGGAG	2	10	68537	68546	40 %	0 %	60 %	0 %	339319407
39	NC_015722	TTTTA	2	10	69129	69138	20 %	80 %	0 %	0 %	339319407
40	NC_015722	GAAGA	2	10	70453	70462	60 %	0 %	40 %	0 %	339319408
41	NC_015722	GGTGA	2	10	73356	73365	20 %	20 %	60 %	0 %	339319411
42	NC_015722	CTCAC	2	10	75808	75817	20 %	20 %	0 %	60 %	339319414
43	NC_015722	AGCTA	2	10	80372	80381	40 %	20 %	20 %	20 %	339319418
44	NC_015722	AAAAC	2	10	81827	81836	80 %	0 %	0 %	20 %	339319419
45	NC_015722	AATTA	2	10	82902	82911	60 %	40 %	0 %	0 %	339319421
46	NC_015722	TTTTG	2	10	83125	83134	0 %	80 %	20 %	0 %	339319421
47	NC_015722	AAGGC	2	10	84183	84192	40 %	0 %	40 %	20 %	339319422
48	NC_015722	TAAAA	2	10	84893	84902	80 %	20 %	0 %	0 %	339319423
49	NC_015722	ACAAT	2	10	85974	85983	60 %	20 %	0 %	20 %	339319424
50	NC_015722	ATATT	2	10	87143	87152	40 %	60 %	0 %	0 %	339319424
51	NC_015722	TTTCA	2	10	89361	89370	20 %	60 %	0 %	20 %	339319426
52	NC_015722	AACAT	2	10	90712	90721	60 %	20 %	0 %	20 %	339319428
53	NC_015722	TTGCT	2	10	97093	97102	0 %	60 %	20 %	20 %	339319437
54	NC_015722	GGGCT	2	10	97445	97454	0 %	20 %	60 %	20 %	339319437
55	NC_015722	CATTG	2	10	98569	98578	20 %	40 %	20 %	20 %	339319438
56	NC_015722	CAAAA	2	10	99280	99289	80 %	0 %	0 %	20 %	339319439
57	NC_015722	TGAAA	2	10	100016	100025	60 %	20 %	20 %	0 %	339319440
58	NC_015722	TGAGA	2	10	101992	102001	40 %	20 %	40 %	0 %	339319444
59	NC_015722	ATATT	2	10	107135	107144	40 %	60 %	0 %	0 %	339319449
60	NC_015722	AGAAA	2	10	108285	108294	80 %	0 %	20 %	0 %	339319451
61	NC_015722	TGTCA	2	10	110141	110150	20 %	40 %	20 %	20 %	339319454
62	NC_015722	TAGTA	2	10	110600	110609	40 %	40 %	20 %	0 %	339319454
63	NC_015722	TGCGG	2	10	112250	112259	0 %	20 %	60 %	20 %	339319455
64	NC_015722	TAAAA	2	10	113009	113018	80 %	20 %	0 %	0 %	339319455
65	NC_015722	ATTTA	2	10	117700	117709	40 %	60 %	0 %	0 %	339319461
66	NC_015722	TCATG	2	10	120280	120289	20 %	40 %	20 %	20 %	339319461
67	NC_015722	TGGTG	2	10	120447	120456	0 %	40 %	60 %	0 %	339319462
68	NC_015722	TGTTA	2	10	121262	121271	20 %	60 %	20 %	0 %	339319463
69	NC_015722	TTTTA	2	10	122165	122174	20 %	80 %	0 %	0 %	339319464
70	NC_015722	ATTTT	2	10	128578	128587	20 %	80 %	0 %	0 %	339319470
71	NC_015722	CCTAT	2	10	128731	128740	20 %	40 %	0 %	40 %	339319470
72	NC_015722	AAAAG	2	10	133330	133339	80 %	0 %	20 %	0 %	339319477
73	NC_015722	GCAAA	2	10	141352	141361	60 %	0 %	20 %	20 %	339319484
74	NC_015722	CATTA	2	10	141542	141551	40 %	40 %	0 %	20 %	339319484
75	NC_015722	GTATT	2	10	141869	141878	20 %	60 %	20 %	0 %	339319485
76	NC_015722	TTGGC	2	10	142364	142373	0 %	40 %	40 %	20 %	339319485
77	NC_015722	AGGAT	2	10	143675	143684	40 %	20 %	40 %	0 %	339319486
78	NC_015722	CAATG	2	10	144450	144459	40 %	20 %	20 %	20 %	339319487
79	NC_015722	TCAGT	2	10	144946	144955	20 %	40 %	20 %	20 %	339319487
80	NC_015722	CTCTT	2	10	145418	145427	0 %	60 %	0 %	40 %	339319487
81	NC_015722	CATTA	2	10	145530	145539	40 %	40 %	0 %	20 %	339319487
82	NC_015722	AAAAT	2	10	145951	145960	80 %	20 %	0 %	0 %	339319488
83	NC_015722	TGCTT	2	10	146998	147007	0 %	60 %	20 %	20 %	339319490
84	NC_015722	ATTTA	2	10	147418	147427	40 %	60 %	0 %	0 %	339319490
85	NC_015722	TCTCT	2	10	148056	148065	0 %	60 %	0 %	40 %	339319490
86	NC_015722	TACCC	2	10	149010	149019	20 %	20 %	0 %	60 %	339319491
87	NC_015722	TAAAG	2	10	149627	149636	60 %	20 %	20 %	0 %	339319491
88	NC_015722	TTTCT	2	10	150234	150243	0 %	80 %	0 %	20 %	339319493
89	NC_015722	GGATT	2	10	150694	150703	20 %	40 %	40 %	0 %	339319494
90	NC_015722	ATAGT	2	10	151044	151053	40 %	40 %	20 %	0 %	339319494
91	NC_015722	AGTAT	2	10	151282	151291	40 %	40 %	20 %	0 %	339319494
92	NC_015722	ATAAA	2	10	151582	151591	80 %	20 %	0 %	0 %	339319494
93	NC_015722	TGATT	2	10	154066	154075	20 %	60 %	20 %	0 %	339319496
94	NC_015722	TAGCA	2	10	154739	154748	40 %	20 %	20 %	20 %	339319496
95	NC_015722	CAGGG	2	10	155585	155594	20 %	0 %	60 %	20 %	339319497
96	NC_015722	TTTTA	2	10	156370	156379	20 %	80 %	0 %	0 %	339319498
97	NC_015722	TTGTT	2	10	159863	159872	0 %	80 %	20 %	0 %	339319501
98	NC_015722	TTTGG	2	10	163302	163311	0 %	60 %	40 %	0 %	339319506
99	NC_015722	ATGGC	2	10	165137	165146	20 %	20 %	40 %	20 %	339319507
100	NC_015722	AGCCA	2	10	165223	165232	40 %	0 %	20 %	40 %	339319507
101	NC_015722	AAAGA	2	10	166908	166917	80 %	0 %	20 %	0 %	339319509
102	NC_015722	TTTGT	2	10	171575	171584	0 %	80 %	20 %	0 %	339319512
103	NC_015722	TCTAT	2	10	173801	173810	20 %	60 %	0 %	20 %	339319515
104	NC_015722	ATTTT	2	10	173820	173829	20 %	80 %	0 %	0 %	339319515
105	NC_015722	ACATC	2	10	174981	174990	40 %	20 %	0 %	40 %	339319516
106	NC_015722	GGTTT	2	10	175832	175841	0 %	60 %	40 %	0 %	339319517
107	NC_015722	ATTAA	2	10	177151	177160	60 %	40 %	0 %	0 %	339319518
108	NC_015722	GATAA	2	10	178410	178419	60 %	20 %	20 %	0 %	339319520
109	NC_015722	ATTTT	2	10	178627	178636	20 %	80 %	0 %	0 %	339319520
110	NC_015722	AGGTA	2	10	179177	179186	40 %	20 %	40 %	0 %	339319520
111	NC_015722	AATTT	2	10	180197	180206	40 %	60 %	0 %	0 %	339319523
112	NC_015722	ATACT	2	10	180593	180602	40 %	40 %	0 %	20 %	339319523
113	NC_015722	AGAAA	2	10	182079	182088	80 %	0 %	20 %	0 %	339319524
114	NC_015722	GCATG	2	10	182413	182422	20 %	20 %	40 %	20 %	339319524
115	NC_015722	TGATT	2	10	182484	182493	20 %	60 %	20 %	0 %	339319524
116	NC_015722	CTTTT	2	10	183170	183179	0 %	80 %	0 %	20 %	339319525
117	NC_015722	TTCGT	2	10	183641	183650	0 %	60 %	20 %	20 %	339319526
118	NC_015722	ATCTA	2	10	184298	184307	40 %	40 %	0 %	20 %	339319526
119	NC_015722	ACATA	2	10	184946	184955	60 %	20 %	0 %	20 %	339319527
120	NC_015722	TCTCT	2	10	185228	185237	0 %	60 %	0 %	40 %	339319527
121	NC_015722	TTTCT	2	10	188458	188467	0 %	80 %	0 %	20 %	339319531
122	NC_015722	TACTA	2	10	190699	190708	40 %	40 %	0 %	20 %	339319533
123	NC_015722	AGAGC	2	10	191912	191921	40 %	0 %	40 %	20 %	339319534
124	NC_015722	TTTGG	2	10	192599	192608	0 %	60 %	40 %	0 %	339319535
125	NC_015722	CAGTA	2	10	193210	193219	40 %	20 %	20 %	20 %	339319535
126	NC_015722	ATATT	2	10	196814	196823	40 %	60 %	0 %	0 %	339319536
127	NC_015722	GCTCA	2	10	201322	201331	20 %	20 %	20 %	40 %	339319539
128	NC_015722	ATGTC	2	10	201817	201826	20 %	40 %	20 %	20 %	339319540
129	NC_015722	AACAT	2	10	204823	204832	60 %	20 %	0 %	20 %	339319542
130	NC_015722	CTGCC	2	10	206060	206069	0 %	20 %	20 %	60 %	339319543
131	NC_015722	ATAGA	2	10	217381	217390	60 %	20 %	20 %	0 %	339319555
132	NC_015722	TAAAG	2	10	218279	218288	60 %	20 %	20 %	0 %	339319555
133	NC_015722	AGGGT	2	10	218684	218693	20 %	20 %	60 %	0 %	339319556
134	NC_015722	TGGCA	2	10	220905	220914	20 %	20 %	40 %	20 %	339319557
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