MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 3461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015722	TGTT	2	8	62	69	0 %	75 %	25 %	0 %	339319318
2	NC_015722	TAAG	2	8	581	588	50 %	25 %	25 %	0 %	339319318
3	NC_015722	TAAA	2	8	1031	1038	75 %	25 %	0 %	0 %	339319318
4	NC_015722	ATTT	2	8	1604	1611	25 %	75 %	0 %	0 %	339319319
5	NC_015722	TCAT	2	8	2871	2878	25 %	50 %	0 %	25 %	339319322
6	NC_015722	AATT	2	8	3065	3072	50 %	50 %	0 %	0 %	339319322
7	NC_015722	ACAA	2	8	3215	3222	75 %	0 %	0 %	25 %	339319322
8	NC_015722	GCAC	2	8	3363	3370	25 %	0 %	25 %	50 %	339319322
9	NC_015722	GTAA	2	8	3778	3785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015722	TTAA	2	8	4005	4012	50 %	50 %	0 %	0 %	339319324
11	NC_015722	AAGA	2	8	4254	4261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015722	TGAT	2	8	4268	4275	25 %	50 %	25 %	0 %	339319325
13	NC_015722	CCTG	2	8	5657	5664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015722	GTTT	2	8	5758	5765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015722	TGCT	2	8	6176	6183	0 %	50 %	25 %	25 %	339319329
16	NC_015722	ATTT	2	8	6296	6303	25 %	75 %	0 %	0 %	339319329
17	NC_015722	AACA	2	8	6980	6987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015722	ATAG	2	8	9251	9258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015722	AAAC	2	8	9486	9493	75 %	0 %	0 %	25 %	339319333
20	NC_015722	CTTT	2	8	9631	9638	0 %	75 %	0 %	25 %	339319333
21	NC_015722	TCAG	2	8	9654	9661	25 %	25 %	25 %	25 %	339319333
22	NC_015722	AGAA	2	8	9798	9805	75 %	0 %	25 %	0 %	339319333
23	NC_015722	TTTA	2	8	10366	10373	25 %	75 %	0 %	0 %	339319334
24	NC_015722	AAAT	2	8	11515	11522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015722	AGTT	2	8	11865	11872	25 %	50 %	25 %	0 %	339319335
26	NC_015722	AAAT	2	8	11974	11981	75 %	25 %	0 %	0 %	339319335
27	NC_015722	TAAA	2	8	12129	12136	75 %	25 %	0 %	0 %	339319335
28	NC_015722	ATTG	2	8	12220	12227	25 %	50 %	25 %	0 %	339319335
29	NC_015722	AAGT	2	8	12348	12355	50 %	25 %	25 %	0 %	339319335
30	NC_015722	ATAA	2	8	12794	12801	75 %	25 %	0 %	0 %	339319335
31	NC_015722	TACT	2	8	12870	12877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015722	GCTG	2	8	12927	12934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015722	TAAG	2	8	13348	13355	50 %	25 %	25 %	0 %	339319337
34	NC_015722	TAAT	2	8	13375	13382	50 %	50 %	0 %	0 %	339319337
35	NC_015722	AGCA	2	8	13884	13891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015722	TGAA	2	8	14162	14169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015722	TTTA	2	8	14174	14181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015722	AAAT	2	8	14238	14245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015722	TCAA	2	8	14421	14428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015722	TGTT	2	8	14771	14778	0 %	75 %	25 %	0 %	339319338
41	NC_015722	CAAA	2	8	15059	15066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015722	TTAT	2	8	15094	15101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015722	ACCT	2	8	15168	15175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015722	TATG	2	8	15470	15477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015722	CTAT	2	8	15653	15660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015722	TTGA	2	8	16832	16839	25 %	50 %	25 %	0 %	339319340
47	NC_015722	CTGC	2	8	17216	17223	0 %	25 %	25 %	50 %	339319340
48	NC_015722	GTTA	2	8	18272	18279	25 %	50 %	25 %	0 %	339319343
49	NC_015722	AAGA	2	8	18380	18387	75 %	0 %	25 %	0 %	339319343
50	NC_015722	TTAA	2	8	18453	18460	50 %	50 %	0 %	0 %	339319343
51	NC_015722	GTTG	2	8	18665	18672	0 %	50 %	50 %	0 %	339319343
52	NC_015722	CCAA	2	8	18930	18937	50 %	0 %	0 %	50 %	339319343
53	NC_015722	AATT	2	8	18980	18987	50 %	50 %	0 %	0 %	339319343
54	NC_015722	TAAT	2	8	19002	19009	50 %	50 %	0 %	0 %	339319343
55	NC_015722	GAAG	2	8	20204	20211	50 %	0 %	50 %	0 %	339319346
56	NC_015722	ATTG	2	8	20814	20821	25 %	50 %	25 %	0 %	339319348
57	NC_015722	AATT	2	8	20825	20832	50 %	50 %	0 %	0 %	339319348
58	NC_015722	TAAA	2	8	21513	21520	75 %	25 %	0 %	0 %	339319350
59	NC_015722	ACCA	2	8	21866	21873	50 %	0 %	0 %	50 %	339319351
60	NC_015722	GAAA	2	8	22252	22259	75 %	0 %	25 %	0 %	339319352
61	NC_015722	GGTT	2	8	23544	23551	0 %	50 %	50 %	0 %	339319355
62	NC_015722	ATTG	2	8	24057	24064	25 %	50 %	25 %	0 %	339319356
63	NC_015722	TAAT	2	8	25389	25396	50 %	50 %	0 %	0 %	339319359
64	NC_015722	TAGC	2	8	25848	25855	25 %	25 %	25 %	25 %	339319360
65	NC_015722	AAAG	2	8	26008	26015	75 %	0 %	25 %	0 %	339319360
66	NC_015722	TGTT	2	8	26202	26209	0 %	75 %	25 %	0 %	339319360
67	NC_015722	GGAC	2	8	26324	26331	25 %	0 %	50 %	25 %	339319360
68	NC_015722	TTGT	2	8	26844	26851	0 %	75 %	25 %	0 %	339319360
69	NC_015722	TGAT	2	8	27563	27570	25 %	50 %	25 %	0 %	339319361
70	NC_015722	GATT	2	8	27618	27625	25 %	50 %	25 %	0 %	339319361
71	NC_015722	ATTT	2	8	27711	27718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015722	TTAG	2	8	27794	27801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015722	GGCA	2	8	27961	27968	25 %	0 %	50 %	25 %	342837483
74	NC_015722	AACT	2	8	27997	28004	50 %	25 %	0 %	25 %	342837483
75	NC_015722	AAAG	2	8	28423	28430	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015722	AAAG	2	8	28471	28478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015722	TGTC	2	8	29479	29486	0 %	50 %	25 %	25 %	339319363
78	NC_015722	TCTT	2	8	29930	29937	0 %	75 %	0 %	25 %	339319364
79	NC_015722	GCGA	2	8	30463	30470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015722	TCAA	2	8	30523	30530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015722	ATAA	2	8	30731	30738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015722	TGAT	2	8	30772	30779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015722	AAAC	2	8	31054	31061	75 %	0 %	0 %	25 %	339319365
84	NC_015722	CTAG	2	8	31275	31282	25 %	25 %	25 %	25 %	339319365
85	NC_015722	TCTA	2	8	31379	31386	25 %	50 %	0 %	25 %	339319365
86	NC_015722	GCTT	2	8	31607	31614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015722	GATA	2	8	31841	31848	50 %	25 %	25 %	0 %	339319367
88	NC_015722	CATA	2	8	32310	32317	50 %	25 %	0 %	25 %	339319367
89	NC_015722	CAAG	2	8	32354	32361	50 %	0 %	25 %	25 %	339319367
90	NC_015722	GTCA	2	8	32529	32536	25 %	25 %	25 %	25 %	339319367
91	NC_015722	GATA	2	8	32981	32988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015722	CAGT	2	8	33506	33513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015722	CTGC	2	8	33621	33628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015722	AAAG	2	8	33675	33682	75 %	0 %	25 %	0 %	339319370
95	NC_015722	GCAA	2	8	34286	34293	50 %	0 %	25 %	25 %	339319370
96	NC_015722	TAAA	2	8	36056	36063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015722	AGGC	2	8	36109	36116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015722	CTGT	2	8	36287	36294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015722	GCGA	2	8	36693	36700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015722	TCAA	2	8	36751	36758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015722	TGTT	2	8	37101	37108	0 %	75 %	25 %	0 %	339319373
102	NC_015722	CAAA	2	8	37389	37396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015722	TTAT	2	8	37424	37431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015722	CAAT	2	8	37823	37830	50 %	25 %	0 %	25 %	339319374
105	NC_015722	CAGT	2	8	38011	38018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015722	TCAT	2	8	38068	38075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015722	CAAT	2	8	38606	38613	50 %	25 %	0 %	25 %	339319375
108	NC_015722	CTCC	2	8	38860	38867	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_015722	ATAG	2	8	39020	39027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015722	AATT	2	8	39550	39557	50 %	50 %	0 %	0 %	339319376
111	NC_015722	TAAA	2	8	40175	40182	75 %	25 %	0 %	0 %	339319376
112	NC_015722	GAAA	2	8	40291	40298	75 %	0 %	25 %	0 %	339319377
113	NC_015722	AAGA	2	8	40333	40340	75 %	0 %	25 %	0 %	339319377
114	NC_015722	AAAG	2	8	40766	40773	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015722	AGAA	2	8	40846	40853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015722	ATTC	2	8	40931	40938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015722	TCAA	2	8	41663	41670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015722	TGTT	2	8	42013	42020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015722	CAAA	2	8	42300	42307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015722	TTAT	2	8	42335	42342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015722	CTTT	2	8	42655	42662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015722	CCAA	2	8	42982	42989	50 %	0 %	0 %	50 %	339319381
123	NC_015722	CTTA	2	8	43256	43263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015722	ATTG	2	8	43299	43306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015722	CCTT	2	8	43418	43425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015722	AGAT	2	8	43765	43772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015722	AAAT	2	8	44103	44110	75 %	25 %	0 %	0 %	339319382
128	NC_015722	AGAT	2	8	44123	44130	50 %	25 %	25 %	0 %	339319382
129	NC_015722	AAAG	2	8	44143	44150	75 %	0 %	25 %	0 %	339319382
130	NC_015722	AAAT	2	8	44226	44233	75 %	25 %	0 %	0 %	339319382
131	NC_015722	ATAC	2	8	44392	44399	50 %	25 %	0 %	25 %	339319382
132	NC_015722	TGGG	2	8	45254	45261	0 %	25 %	75 %	0 %	339319384
133	NC_015722	TAAT	2	8	45423	45430	50 %	50 %	0 %	0 %	339319384
134	NC_015722	ATAA	2	8	45645	45652	75 %	25 %	0 %	0 %	339319384
135	NC_015722	AGAT	2	8	45855	45862	50 %	25 %	25 %	0 %	339319384
136	NC_015722	TAGC	2	8	46149	46156	25 %	25 %	25 %	25 %	339319384
137	NC_015722	TAAC	2	8	46163	46170	50 %	25 %	0 %	25 %	339319384
138	NC_015722	ATGA	2	8	46390	46397	50 %	25 %	25 %	0 %	339319385
139	NC_015722	AGAC	2	8	47123	47130	50 %	0 %	25 %	25 %	339319386
140	NC_015722	AATA	2	8	47211	47218	75 %	25 %	0 %	0 %	339319386
141	NC_015722	TTAA	2	8	48388	48395	50 %	50 %	0 %	0 %	339319387
142	NC_015722	TAAA	2	8	48954	48961	75 %	25 %	0 %	0 %	339319387
143	NC_015722	CAGG	2	8	49229	49236	25 %	0 %	50 %	25 %	339319388
144	NC_015722	CTGT	2	8	49567	49574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015722	GAGC	2	8	49621	49628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015722	GCGA	2	8	49965	49972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015722	GGTG	2	8	50053	50060	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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