MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 4469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015722	TTA	2	6	1451	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015722	CTA	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015722	TTA	2	6	5671	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015722	CTT	2	6	5701	5706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015722	ATT	2	6	5733	5738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015722	CTC	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015722	TAA	2	6	5773	5778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015722	GTC	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015722	TAG	3	9	5799	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015722	ATA	2	6	7054	7059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015722	TGT	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015722	CGC	2	6	8004	8009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015722	AAT	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015722	TGT	2	6	8033	8038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015722	ATG	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015722	GCG	2	6	8122	8127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015722	ATG	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015722	GAA	2	6	8163	8168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015722	ATA	2	6	8194	8199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015722	TCA	2	6	8240	8245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015722	AGA	2	6	8321	8326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015722	GGC	2	6	8346	8351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015722	ATG	2	6	8591	8596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015722	TTG	2	6	8686	8691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015722	GCT	2	6	8910	8915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015722	GCT	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015722	CAT	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015722	CTT	2	6	9183	9188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015722	ATT	2	6	9221	9226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015722	AAT	2	6	9259	9264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015722	ATA	2	6	12895	12900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015722	ATT	2	6	12960	12965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015722	AAT	2	6	12966	12971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015722	TAT	2	6	13007	13012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015722	ATA	2	6	13638	13643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015722	TCT	2	6	13652	13657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015722	AAG	2	6	13724	13729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015722	TAA	2	6	13776	13781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015722	GTA	2	6	13807	13812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015722	GTG	3	9	13958	13966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015722	CTT	2	6	14066	14071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015722	CTG	2	6	14115	14120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015722	GAA	2	6	14156	14161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015722	AAG	2	6	14182	14187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015722	AAG	2	6	14441	14446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015722	GTT	2	6	14449	14454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015722	TGA	2	6	14493	14498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015722	CAA	2	6	14837	14842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015722	CAT	2	6	14972	14977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015722	GTT	2	6	15034	15039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015722	ATC	2	6	15050	15055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015722	CTA	2	6	15073	15078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015722	GAA	2	6	15113	15118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015722	AGA	2	6	15203	15208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015722	CAA	2	6	15212	15217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015722	CTT	2	6	15293	15298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015722	CTT	2	6	15444	15449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015722	CTT	2	6	15509	15514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015722	ATT	2	6	15533	15538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015722	AAT	2	6	15571	15576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015722	ATT	2	6	15585	15590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015722	TAG	2	6	15613	15618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015722	TCA	2	6	15625	15630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015722	GTT	2	6	15721	15726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015722	GAA	2	6	15767	15772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015722	AGT	2	6	15784	15789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015722	GAT	2	6	15792	15797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015722	ATG	2	6	15821	15826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015722	AGC	2	6	15846	15851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015722	GAT	2	6	15856	15861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015722	GGA	2	6	15913	15918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015722	TAA	2	6	16065	16070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015722	GAA	2	6	16191	16196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015722	GTT	2	6	16212	16217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015722	ATT	2	6	16224	16229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015722	TTA	2	6	17271	17276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015722	GGT	2	6	17359	17364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015722	AAG	2	6	21958	21963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015722	TCG	2	6	23305	23310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015722	AGA	2	6	25159	25164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015722	TTA	2	6	25620	25625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015722	GTA	2	6	27690	27695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015722	ATT	2	6	28260	28265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015722	AGA	2	6	28290	28295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015722	ATA	2	6	28304	28309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015722	TGC	2	6	28441	28446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015722	TGC	2	6	28706	28711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015722	CTT	2	6	28720	28725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015722	TAG	2	6	30312	30317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015722	TAA	2	6	30333	30338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015722	GTG	2	6	30475	30480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015722	AAG	2	6	30543	30548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015722	GTT	2	6	30551	30556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015722	TAG	2	6	30754	30759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015722	AAT	2	6	31546	31551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015722	ATC	2	6	33193	33198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015722	TTC	2	6	33221	33226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015722	CTC	2	6	33537	33542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015722	ATC	2	6	33562	33567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015722	ATA	2	6	33593	33598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015722	TGG	2	6	35667	35672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015722	TTG	2	6	35766	35771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015722	GAT	2	6	36095	36100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015722	AAT	2	6	36207	36212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015722	TGT	2	6	36220	36225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015722	ATT	2	6	36231	36236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015722	TAA	2	6	36246	36251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015722	GTT	2	6	36356	36361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015722	AAG	2	6	36771	36776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015722	GTT	2	6	36779	36784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015722	TGA	2	6	36823	36828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015722	CAA	2	6	37167	37172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015722	CAT	2	6	37302	37307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015722	ATC	2	6	37380	37385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015722	CTA	2	6	37403	37408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015722	CTT	2	6	37465	37470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015722	TTA	2	6	37609	37614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015722	ATG	2	6	37638	37643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015722	ATC	2	6	37703	37708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015722	ATC	2	6	38025	38030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015722	TTC	2	6	38163	38168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015722	CTA	2	6	38226	38231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015722	TTG	2	6	38250	38255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015722	AAT	2	6	38377	38382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015722	ATT	2	6	38388	38393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015722	CCA	2	6	38432	38437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015722	TGA	2	6	39009	39014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015722	AAT	2	6	39063	39068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015722	CAA	2	6	39253	39258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015722	TTA	2	6	40396	40401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015722	CCT	2	6	40671	40676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015722	TCA	2	6	40716	40721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015722	AAG	2	6	41683	41688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015722	GTT	2	6	41691	41696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015722	TGA	2	6	41735	41740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015722	TTA	2	6	41952	41957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015722	TTG	2	6	41995	42000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015722	GCA	2	6	42028	42033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015722	CAG	2	6	42037	42042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015722	CAA	2	6	42079	42084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015722	CAT	2	6	42213	42218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015722	ATC	2	6	42291	42296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015722	CTA	2	6	42314	42319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015722	GAA	2	6	42354	42359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_015722	TAA	2	6	42542	42547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_015722	TAA	2	6	42629	42634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015722	CGC	2	6	42729	42734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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162	NC_015722	GTA	2	6	43824	43829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015722	GAG	2	6	43946	43951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015722	TGG	2	6	49651	49656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_015722	AAT	2	6	115319	115324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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