MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 11822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015722	ATC	2	6	11	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319318
2	NC_015722	TTG	2	6	79	84	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319318
3	NC_015722	AGA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319318
4	NC_015722	ATT	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
5	NC_015722	ATT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
6	NC_015722	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
7	NC_015722	TAA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
8	NC_015722	ATG	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319318
9	NC_015722	AGC	2	6	745	750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319318
10	NC_015722	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
11	NC_015722	GCT	2	6	898	903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319318
12	NC_015722	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
13	NC_015722	AGC	2	6	1270	1275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319318
14	NC_015722	ATT	2	6	1321	1326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
15	NC_015722	TAT	2	6	1327	1332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319318
16	NC_015722	AAG	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319318
17	NC_015722	ATA	2	6	1388	1393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319318
18	NC_015722	CAG	2	6	1558	1563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319319
19	NC_015722	ATT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319319
20	NC_015722	CTA	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319319
21	NC_015722	GAC	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319319
22	NC_015722	GCG	2	6	1964	1969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319320
23	NC_015722	CTT	2	6	1992	1997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319320
24	NC_015722	TTA	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319320
25	NC_015722	CAG	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319320
26	NC_015722	TCC	2	6	2105	2110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339319320
27	NC_015722	TAA	2	6	2128	2133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319320
28	NC_015722	TCG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319320
29	NC_015722	TCT	2	6	2195	2200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319320
30	NC_015722	CTA	2	6	2244	2249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319320
31	NC_015722	GCG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319320
32	NC_015722	TTA	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319321
33	NC_015722	AAT	2	6	2642	2647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319321
34	NC_015722	GCT	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319321
35	NC_015722	ATA	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319321
36	NC_015722	CTA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319322
37	NC_015722	TAA	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319322
38	NC_015722	ATT	2	6	2990	2995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319322
39	NC_015722	AGC	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319322
40	NC_015722	TAT	2	6	3011	3016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319322
41	NC_015722	ATC	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319322
42	NC_015722	CTT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319322
43	NC_015722	CTT	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319322
44	NC_015722	ATC	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319322
45	NC_015722	CTG	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319322
46	NC_015722	TAA	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319322
47	NC_015722	TGT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319322
48	NC_015722	CAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319322
49	NC_015722	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319322
50	NC_015722	ACC	2	6	3661	3666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339319323
51	NC_015722	TAT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319324
52	NC_015722	AAG	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319324
53	NC_015722	ATG	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319324
54	NC_015722	ATT	2	6	4279	4284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319325
55	NC_015722	AGG	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339319325
56	NC_015722	TTG	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319325
57	NC_015722	TTA	2	6	4551	4556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319326
58	NC_015722	AGT	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319326
59	NC_015722	AAG	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319326
60	NC_015722	AGC	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319326
61	NC_015722	AGC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319326
62	NC_015722	TAA	2	6	4757	4762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319326
63	NC_015722	GTT	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319326
64	NC_015722	TCA	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319326
65	NC_015722	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319326
66	NC_015722	TTC	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319326
67	NC_015722	AAG	2	6	4987	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319326
68	NC_015722	GAA	2	6	5043	5048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319326
69	NC_015722	GTT	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319327
70	NC_015722	GGC	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339319327
71	NC_015722	CTC	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339319327
72	NC_015722	AAG	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319327
73	NC_015722	ATT	2	6	5275	5280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319327
74	NC_015722	TTA	2	6	5302	5307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319327
75	NC_015722	TGA	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319327
76	NC_015722	CAA	2	6	5359	5364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319327
77	NC_015722	TTC	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319327
78	NC_015722	ATG	3	9	5411	5419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319327
79	NC_015722	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319327
80	NC_015722	TCT	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319328
81	NC_015722	CTT	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319328
82	NC_015722	TAG	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319328
83	NC_015722	ATC	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319329
84	NC_015722	TAC	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319329
85	NC_015722	CAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339319329
86	NC_015722	ACT	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319329
87	NC_015722	GTG	2	6	6091	6096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319329
88	NC_015722	TCC	2	6	6192	6197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339319329
89	NC_015722	ACG	2	6	6202	6207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319329
90	NC_015722	TAA	2	6	6329	6334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319329
91	NC_015722	GGT	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319329
92	NC_015722	TTC	2	6	6534	6539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319329
93	NC_015722	CTT	2	6	6611	6616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319329
94	NC_015722	AGC	2	6	6669	6674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319329
95	NC_015722	ATA	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319329
96	NC_015722	TCA	2	6	6727	6732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339319329
97	NC_015722	GCT	2	6	7168	7173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319330
98	NC_015722	GCA	3	9	7319	7327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339319330
99	NC_015722	GAT	2	6	7333	7338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319330
100	NC_015722	ATG	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319330
101	NC_015722	GAT	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319330
102	NC_015722	AGA	2	6	7394	7399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319330
103	NC_015722	GAT	2	6	7616	7621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319330
104	NC_015722	GAT	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319330
105	NC_015722	GAA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319330
106	NC_015722	AGA	2	6	7855	7860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319330
107	NC_015722	GCT	2	6	7871	7876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319330
108	NC_015722	AAT	2	6	7956	7961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319330
109	NC_015722	GTG	2	6	8427	8432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339319331
110	NC_015722	GAA	2	6	8451	8456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319331
111	NC_015722	TGA	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319331
112	NC_015722	TAA	3	9	8512	8520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319331
113	NC_015722	TAG	2	6	8550	8555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319331
114	NC_015722	GTT	2	6	8797	8802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339319332
115	NC_015722	GCT	2	6	8818	8823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339319332
116	NC_015722	GTA	2	6	8837	8842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319332
117	NC_015722	AGT	2	6	8849	8854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319332
118	NC_015722	GAA	2	6	9472	9477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319333
119	NC_015722	AGA	2	6	9507	9512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319333
120	NC_015722	AGT	2	6	9568	9573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319333
121	NC_015722	TGA	2	6	9579	9584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319333
122	NC_015722	GAT	2	6	9613	9618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319333
123	NC_015722	TGA	2	6	9702	9707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319333
124	NC_015722	TCT	2	6	9848	9853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319333
125	NC_015722	ATT	2	6	9946	9951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319333
126	NC_015722	TTC	2	6	9996	10001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339319333
127	NC_015722	ATG	2	6	10045	10050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319333
128	NC_015722	TAT	2	6	10053	10058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339319333
129	NC_015722	AAT	2	6	10091	10096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339319334
130	NC_015722	TAG	2	6	10315	10320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339319334
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255	NC_015722	GAA	2	6	21901	21906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339319351
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