MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 1369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015717	GATG	2	8	3319	3326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015717	TCGC	2	8	9499	9506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015717	TCGC	2	8	13683	13690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015717	GCAA	2	8	13696	13703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015717	TGCT	2	8	15636	15643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015717	GCCG	2	8	29419	29426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015717	GCCG	2	8	31666	31673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015717	GGCC	2	8	31678	31685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015717	GCCG	2	8	33157	33164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015717	CCGC	2	8	36465	36472	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015717	GATT	2	8	36839	36846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015717	CGGG	2	8	36858	36865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015717	AGCT	2	8	45113	45120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015717	GCAA	2	8	57377	57384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015717	ATGA	2	8	60793	60800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015717	GCCT	2	8	63859	63866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015717	GCCG	2	8	68716	68723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015717	AGGT	2	8	70066	70073	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015717	TGAT	2	8	70090	70097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015717	AGCG	2	8	70488	70495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015717	TTGG	2	8	74884	74891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015717	CGGT	2	8	80275	80282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015717	GCGG	2	8	81305	81312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015717	GCGG	2	8	84430	84437	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015717	ACCG	2	8	93762	93769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015717	TGCG	2	8	97996	98003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015717	GCGG	2	8	110034	110041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015717	TCGA	2	8	111881	111888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015717	GCTA	2	8	112592	112599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015717	AGCG	2	8	113861	113868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015717	TCCC	2	8	113983	113990	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_015717	TGGG	2	8	114501	114508	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015717	GCAC	2	8	114523	114530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015717	CTGA	2	8	118866	118873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015717	CGCT	2	8	122533	122540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015717	GCTT	2	8	122764	122771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015717	CGGT	2	8	122817	122824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015717	CACC	2	8	123864	123871	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_015717	AAGA	2	8	124058	124065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015717	ATGC	2	8	124225	124232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015717	TGGC	3	12	125536	125547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015717	CGCA	2	8	134387	134394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015717	TCGG	2	8	143219	143226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015717	GCGA	2	8	146245	146252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015717	TGTT	2	8	151523	151530	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015717	GCAA	2	8	151548	151555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015717	TGGA	2	8	157023	157030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015717	TCGG	2	8	157090	157097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015717	GCTC	2	8	158198	158205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015717	CTTC	2	8	168118	168125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015717	TGGA	2	8	170960	170967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015717	GGCG	2	8	188564	188571	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015717	TCCG	2	8	191102	191109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015717	TCTT	2	8	191254	191261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015717	TCGA	2	8	191524	191531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015717	GCGG	2	8	196716	196723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015717	TGCG	2	8	196741	196748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015717	TAGT	2	8	204672	204679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015717	GGCG	2	8	211600	211607	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015717	CGGC	2	8	212330	212337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015717	CGGG	2	8	215179	215186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015717	GCCT	2	8	215323	215330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015717	TCGA	2	8	215966	215973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015717	AGGA	2	8	216042	216049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015717	ATGG	2	8	218906	218913	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015717	CGGT	2	8	219524	219531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015717	GCGT	2	8	221762	221769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015717	CGCT	2	8	221971	221978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015717	GGCT	2	8	225150	225157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015717	GATA	2	8	227071	227078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015717	TGCA	2	8	230036	230043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015717	TTAC	2	8	230100	230107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015717	GATT	2	8	238704	238711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015717	AGTC	2	8	240567	240574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015717	GGCG	2	8	245990	245997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015717	TACA	2	8	260853	260860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015717	GTTT	2	8	260869	260876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015717	TGGC	2	8	264116	264123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015717	TAAT	2	8	270134	270141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015717	GGCG	2	8	276129	276136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015717	CGTC	2	8	278311	278318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015717	CCTT	2	8	278471	278478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015717	CGGA	2	8	278760	278767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015717	GGCC	2	8	278804	278811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015717	AAGA	2	8	278911	278918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015717	CGCA	2	8	279083	279090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015717	AAGC	2	8	283138	283145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015717	TTCG	2	8	285937	285944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015717	GAAA	2	8	286031	286038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015717	GCTG	2	8	289645	289652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015717	AGTT	2	8	291411	291418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015717	CGTT	2	8	294683	294690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015717	GCCG	2	8	306586	306593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015717	CATG	2	8	308375	308382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015717	GCCG	2	8	312188	312195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015717	GCCG	2	8	312440	312447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015717	CGGC	2	8	316663	316670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015717	AAGT	2	8	316696	316703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015717	CGAA	2	8	353183	353190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015717	TGGG	2	8	363854	363861	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015717	GGAT	2	8	365355	365362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015717	CGTT	2	8	365541	365548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015717	CAAA	2	8	366190	366197	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015717	CCGT	2	8	366670	366677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015717	CCGA	2	8	366702	366709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015717	GTGC	2	8	376196	376203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015717	CCCT	2	8	394456	394463	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_015717	GGTT	2	8	394525	394532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015717	CGGG	2	8	394597	394604	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015717	CGGT	2	8	396661	396668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015717	ACGT	2	8	396870	396877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015717	GTCC	2	8	404994	405001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015717	ACCA	2	8	409263	409270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015717	AGTG	2	8	414307	414314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015717	GATG	2	8	415748	415755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015717	ACGC	2	8	422285	422292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015717	ATTC	2	8	426739	426746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015717	AATT	2	8	429468	429475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015717	GCAG	2	8	429728	429735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015717	GGTG	2	8	431726	431733	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015717	TGGC	2	8	443383	443390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015717	AAAT	2	8	443436	443443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015717	ACTT	2	8	443539	443546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015717	TCGA	2	8	447411	447418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015717	AGTT	2	8	474319	474326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015717	CGGT	2	8	474944	474951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015717	AGCG	2	8	492272	492279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015717	TGCA	2	8	501169	501176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015717	TGGC	2	8	503094	503101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015717	ATGA	2	8	503121	503128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015717	CTCC	2	8	503256	503263	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_015717	GCAG	2	8	505453	505460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015717	GGCC	2	8	513425	513432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015717	GCCG	2	8	514476	514483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015717	TGCG	2	8	518560	518567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015717	CGAC	2	8	534917	534924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015717	CAAA	2	8	543014	543021	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015717	ATAA	2	8	556951	556958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015717	TGCG	2	8	571285	571292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015717	GGAA	2	8	572454	572461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015717	GAGC	2	8	575520	575527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015717	AGTC	2	8	577958	577965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015717	TCGA	2	8	594981	594988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015717	GCCG	2	8	596048	596055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015717	TTTC	2	8	597826	597833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015717	TTCT	2	8	599376	599383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015717	TTTC	2	8	624411	624418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015717	AGGG	2	8	625426	625433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015717	GGAA	2	8	625511	625518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015717	CATC	2	8	627925	627932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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462	NC_015717	TCGA	2	8	1651574	1651581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_015717	GGGT	2	8	1718532	1718539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
483	NC_015717	CGTT	2	8	1719386	1719393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_015717	GACG	2	8	1722266	1722273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_015717	GTAT	2	8	1722330	1722337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
486	NC_015717	CTCG	2	8	1722381	1722388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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490	NC_015717	TTTG	2	8	1735167	1735174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_015717	GGAG	2	8	1735193	1735200	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_015717	TCAC	2	8	1736686	1736693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
494	NC_015717	AGAC	2	8	1738489	1738496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_015717	TTGC	2	8	1738924	1738931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_015717	CGGA	2	8	1745626	1745633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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