MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP01

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015715	GCCC	2	8	97	104	0 %	0 %	25 %	75 %	338708678
2	NC_015715	TTTA	2	8	699	706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015715	GCCT	2	8	788	795	0 %	25 %	25 %	50 %	338708679
4	NC_015715	GACT	2	8	1950	1957	25 %	25 %	25 %	25 %	338708681
5	NC_015715	ATCA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	0 %	25 %	338708681
6	NC_015715	GAAC	2	8	2946	2953	50 %	0 %	25 %	25 %	338708683
7	NC_015715	CTTC	2	8	3166	3173	0 %	50 %	0 %	50 %	338708683
8	NC_015715	AGGT	2	8	3251	3258	25 %	25 %	50 %	0 %	338708683
9	NC_015715	AGCG	2	8	3290	3297	25 %	0 %	50 %	25 %	338708683
10	NC_015715	TAGT	2	8	3597	3604	25 %	50 %	25 %	0 %	338708683
11	NC_015715	GATT	2	8	4407	4414	25 %	50 %	25 %	0 %	338708683
12	NC_015715	AATA	2	8	4616	4623	75 %	25 %	0 %	0 %	338708683
13	NC_015715	CTTT	2	8	4625	4632	0 %	75 %	0 %	25 %	338708683
14	NC_015715	CAAT	2	8	5016	5023	50 %	25 %	0 %	25 %	338708683
15	NC_015715	CATC	2	8	5068	5075	25 %	25 %	0 %	50 %	338708683
16	NC_015715	CTTG	2	8	5102	5109	0 %	50 %	25 %	25 %	338708683
17	NC_015715	ATCC	3	12	5537	5548	25 %	25 %	0 %	50 %	338708684
18	NC_015715	ATCA	2	8	6035	6042	50 %	25 %	0 %	25 %	338708684
19	NC_015715	TACC	2	8	6469	6476	25 %	25 %	0 %	50 %	338708684
20	NC_015715	TAAG	2	8	6520	6527	50 %	25 %	25 %	0 %	338708684
21	NC_015715	ACAT	2	8	6902	6909	50 %	25 %	0 %	25 %	338708685
22	NC_015715	TACT	2	8	7359	7366	25 %	50 %	0 %	25 %	338708685
23	NC_015715	ATCA	2	8	7634	7641	50 %	25 %	0 %	25 %	338708685
24	NC_015715	CCTG	2	8	8119	8126	0 %	25 %	25 %	50 %	338708686
25	NC_015715	CTAT	2	8	8164	8171	25 %	50 %	0 %	25 %	338708686
26	NC_015715	TAGC	2	8	8513	8520	25 %	25 %	25 %	25 %	338708686
27	NC_015715	GAAA	2	8	9261	9268	75 %	0 %	25 %	0 %	338708686
28	NC_015715	ATAA	2	8	9970	9977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015715	TCTG	2	8	10446	10453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015715	GGAT	2	8	10589	10596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015715	TCTG	2	8	10953	10960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015715	TTGT	2	8	10993	11000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015715	GCTA	2	8	11120	11127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015715	GATA	2	8	11275	11282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015715	AAGG	2	8	11668	11675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015715	GAAG	2	8	11702	11709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015715	GTGG	2	8	12141	12148	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015715	GTTT	2	8	12341	12348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015715	TTTA	2	8	12463	12470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015715	ATTA	2	8	13587	13594	50 %	50 %	0 %	0 %	338708688
41	NC_015715	TTTG	2	8	14616	14623	0 %	75 %	25 %	0 %	338708689
42	NC_015715	ATAG	2	8	14975	14982	50 %	25 %	25 %	0 %	338708689
43	NC_015715	GGAT	2	8	15168	15175	25 %	25 %	50 %	0 %	338708690
44	NC_015715	TCGA	2	8	15206	15213	25 %	25 %	25 %	25 %	338708690
45	NC_015715	TCCT	2	8	16415	16422	0 %	50 %	0 %	50 %	338708691
46	NC_015715	AAAT	2	8	17288	17295	75 %	25 %	0 %	0 %	338708691
47	NC_015715	AAGA	2	8	17395	17402	75 %	0 %	25 %	0 %	338708691
48	NC_015715	AACA	2	8	17584	17591	75 %	0 %	0 %	25 %	338708691
49	NC_015715	TTGT	2	8	18055	18062	0 %	75 %	25 %	0 %	338708692
50	NC_015715	AGCA	2	8	18383	18390	50 %	0 %	25 %	25 %	338708692
51	NC_015715	ATTT	2	8	18474	18481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015715	CAGC	2	8	18897	18904	25 %	0 %	25 %	50 %	338708693
53	NC_015715	AATC	2	8	19183	19190	50 %	25 %	0 %	25 %	338708693
54	NC_015715	GCCC	2	8	20277	20284	0 %	0 %	25 %	75 %	338708693
55	NC_015715	TTCT	2	8	21558	21565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015715	CTAC	2	8	21586	21593	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015715	AACC	2	8	22142	22149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015715	CTTG	2	8	22951	22958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015715	TTGG	2	8	23318	23325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015715	AATT	2	8	23968	23975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015715	TAAT	2	8	23983	23990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015715	GCAA	2	8	24122	24129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015715	GAAA	2	8	24956	24963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015715	TTCT	2	8	25640	25647	0 %	75 %	0 %	25 %	338708696
65	NC_015715	TGTT	2	8	26181	26188	0 %	75 %	25 %	0 %	338708697
66	NC_015715	CATC	2	8	26477	26484	25 %	25 %	0 %	50 %	338708697
67	NC_015715	GCTT	2	8	26599	26606	0 %	50 %	25 %	25 %	338708698
68	NC_015715	TCGA	2	8	26712	26719	25 %	25 %	25 %	25 %	338708698
69	NC_015715	ATCC	2	8	26722	26729	25 %	25 %	0 %	50 %	338708698
70	NC_015715	TCTG	2	8	26981	26988	0 %	50 %	25 %	25 %	338708699
71	NC_015715	ATAA	2	8	27245	27252	75 %	25 %	0 %	0 %	338708699
72	NC_015715	TCTT	2	8	27460	27467	0 %	75 %	0 %	25 %	338708699
73	NC_015715	AGGC	2	8	27665	27672	25 %	0 %	50 %	25 %	338708699
74	NC_015715	ACGG	2	8	27900	27907	25 %	0 %	50 %	25 %	338708699
75	NC_015715	TCAG	2	8	28925	28932	25 %	25 %	25 %	25 %	338708700
76	NC_015715	TCTT	2	8	30088	30095	0 %	75 %	0 %	25 %	338708702
77	NC_015715	CAAT	2	8	30104	30111	50 %	25 %	0 %	25 %	338708702
78	NC_015715	TAAT	2	8	30375	30382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015715	ATTT	2	8	31253	31260	25 %	75 %	0 %	0 %	338708704
80	NC_015715	TAGA	2	8	31411	31418	50 %	25 %	25 %	0 %	338708705
81	NC_015715	CCCA	2	8	33711	33718	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_015715	CAGT	2	8	33845	33852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015715	CTTT	2	8	34307	34314	0 %	75 %	0 %	25 %	338708707
84	NC_015715	ATTT	2	8	35792	35799	25 %	75 %	0 %	0 %	338708709
85	NC_015715	AATG	2	8	35946	35953	50 %	25 %	25 %	0 %	338708709
86	NC_015715	TTAT	2	8	36068	36075	25 %	75 %	0 %	0 %	338708709
87	NC_015715	TCTT	2	8	36303	36310	0 %	75 %	0 %	25 %	338708709
88	NC_015715	GTCG	2	8	37213	37220	0 %	25 %	50 %	25 %	338708710

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.