MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP01

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015715	GTT	2	6	332	337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015715	GCC	2	6	407	412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015715	TCG	2	6	420	425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015715	TAA	2	6	430	435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015715	ATT	2	6	2394	2399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015715	TCA	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015715	ATT	2	6	9860	9865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015715	TGG	3	9	9877	9885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015715	ATA	2	6	9946	9951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015715	ATT	2	6	9981	9986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015715	TTA	2	6	10069	10074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015715	TTC	2	6	10283	10288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015715	CGG	2	6	10302	10307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015715	AGT	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015715	GTT	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015715	GAA	2	6	10387	10392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015715	CTG	3	9	10412	10420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015715	AGA	2	6	10469	10474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015715	GAA	2	6	10554	10559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015715	TTC	2	6	10566	10571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015715	ACG	2	6	10667	10672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015715	GAA	2	6	10711	10716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015715	ATC	2	6	11080	11085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015715	AGA	2	6	11213	11218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015715	TCA	2	6	11361	11366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015715	ATT	2	6	11389	11394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015715	TCT	2	6	11409	11414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015715	GAT	2	6	11434	11439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015715	CCT	2	6	11521	11526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015715	CTT	2	6	11595	11600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015715	GTT	2	6	11749	11754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015715	AGG	2	6	11774	11779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015715	AGG	2	6	11839	11844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015715	AGG	2	6	11906	11911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015715	CGA	3	9	11912	11920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015715	AGG	2	6	11972	11977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015715	AGG	2	6	12039	12044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015715	AGG	2	6	12104	12109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015715	AGG	2	6	12170	12175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015715	CTT	2	6	12194	12199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015715	AGG	2	6	12235	12240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015715	TTA	2	6	12265	12270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015715	AGG	2	6	12301	12306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015715	AGG	2	6	12367	12372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015715	AGG	2	6	12433	12438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015715	AGG	2	6	12499	12504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015715	AAT	2	6	12535	12540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015715	AGG	2	6	12566	12571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015715	AGG	2	6	12632	12637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015715	AGG	2	6	12698	12703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015715	ACA	2	6	12715	12720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015715	CAT	2	6	12731	12736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015715	AGG	2	6	12763	12768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015715	GGC	2	6	12793	12798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015715	ATC	2	6	12802	12807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015715	AGG	2	6	12830	12835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015715	ATA	2	6	12901	12906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015715	TTG	2	6	12945	12950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015715	GCA	2	6	12995	13000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015715	AGA	2	6	13040	13045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015715	AAT	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015715	TAT	2	6	18455	18460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015715	ATT	2	6	20769	20774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015715	AAT	2	6	20823	20828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015715	AAT	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015715	TCT	2	6	20918	20923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015715	TTC	2	6	21091	21096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015715	ATT	2	6	21100	21105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015715	ACG	2	6	21713	21718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015715	GTA	2	6	21725	21730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015715	CAC	2	6	21913	21918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015715	CCT	2	6	21945	21950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015715	ATC	2	6	22049	22054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015715	CAG	2	6	22075	22080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015715	CAG	3	9	22216	22224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015715	ACC	2	6	22262	22267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015715	GTA	2	6	22308	22313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015715	CCA	2	6	22314	22319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015715	TGA	2	6	22437	22442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015715	TGA	2	6	22470	22475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015715	TAA	3	9	22507	22515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015715	CTG	2	6	22676	22681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015715	CGC	2	6	22810	22815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015715	CAT	2	6	22822	22827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015715	ATA	2	6	22835	22840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015715	ATT	2	6	22844	22849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015715	ATC	2	6	22877	22882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015715	GTC	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015715	GGT	2	6	22924	22929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015715	ATG	2	6	23017	23022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015715	ACC	2	6	23051	23056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015715	TTG	3	9	23104	23112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015715	CTA	2	6	23156	23161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015715	ACC	2	6	23242	23247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015715	CCA	2	6	23351	23356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015715	AGT	2	6	23396	23401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015715	CAC	2	6	23538	23543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015715	TCA	2	6	23615	23620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015715	GCT	2	6	23721	23726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015715	GAT	2	6	23878	23883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015715	CTG	2	6	23885	23890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015715	AGG	2	6	23931	23936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015715	TAA	2	6	23958	23963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015715	ATC	2	6	24077	24082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015715	AGA	2	6	24107	24112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015715	AGG	2	6	25144	25149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015715	TCA	2	6	25591	25596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015715	TAT	2	6	25965	25970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015715	TTA	2	6	26035	26040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015715	TAC	2	6	26145	26150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015715	TTA	2	6	26836	26841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015715	TCT	2	6	26896	26901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015715	GCT	2	6	26954	26959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015715	CTG	2	6	29029	29034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015715	ATT	2	6	29532	29537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015715	CAT	2	6	29653	29658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015715	AAT	2	6	29662	29667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015715	CAG	2	6	31690	31695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015715	TAA	2	6	31741	31746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015715	AAT	2	6	32022	32027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015715	CTT	2	6	32059	32064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015715	AAC	2	6	32081	32086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015715	AGA	2	6	32231	32236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015715	CAT	2	6	33434	33439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015715	TAA	2	6	33522	33527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015715	ATT	2	6	33550	33555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015715	ATA	2	6	33866	33871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015715	CAT	2	6	34375	34380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015715	TAA	2	6	34864	34869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015715	ATA	3	9	36437	36445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.