MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP01

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015715	CAT	2	6	177	182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708678
2	NC_015715	AAT	2	6	187	192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708678
3	NC_015715	TTG	2	6	811	816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708679
4	NC_015715	GCG	2	6	860	865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708679
5	NC_015715	AGC	2	6	995	1000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708679
6	NC_015715	TAT	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708680
7	NC_015715	ATG	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708680
8	NC_015715	CAG	2	6	1114	1119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708680
9	NC_015715	CAA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708680
10	NC_015715	TAA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708680
11	NC_015715	TCG	2	6	1388	1393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708680
12	NC_015715	GGT	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338708680
13	NC_015715	AAT	2	6	1436	1441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708680
14	NC_015715	GCT	2	6	1467	1472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708680
15	NC_015715	GTT	2	6	1548	1553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708680
16	NC_015715	ATG	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708680
17	NC_015715	TAA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708680
18	NC_015715	GAC	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708681
19	NC_015715	GTC	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708681
20	NC_015715	GAT	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708681
21	NC_015715	CGG	2	6	1910	1915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708681
22	NC_015715	CAT	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708681
23	NC_015715	GGA	2	6	2031	2036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338708681
24	NC_015715	CTG	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708681
25	NC_015715	GGC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708682
26	NC_015715	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708682
27	NC_015715	TCA	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708682
28	NC_015715	ACA	2	6	2210	2215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708682
29	NC_015715	ATT	2	6	2423	2428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708683
30	NC_015715	CAT	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708683
31	NC_015715	ATA	2	6	2575	2580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708683
32	NC_015715	GAC	2	6	2593	2598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708683
33	NC_015715	TAA	2	6	2649	2654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708683
34	NC_015715	TTC	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708683
35	NC_015715	CCA	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338708683
36	NC_015715	TGC	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708683
37	NC_015715	CAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708683
38	NC_015715	TAA	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708683
39	NC_015715	AGC	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708683
40	NC_015715	AGA	2	6	3095	3100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708683
41	NC_015715	CAG	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708683
42	NC_015715	ATG	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708683
43	NC_015715	ATC	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708683
44	NC_015715	GTT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708683
45	NC_015715	TCA	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708683
46	NC_015715	TAA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708683
47	NC_015715	TCA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708683
48	NC_015715	GTT	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708683
49	NC_015715	TGA	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708683
50	NC_015715	CTT	2	6	4099	4104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708683
51	NC_015715	ATT	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708683
52	NC_015715	TCT	2	6	4185	4190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708683
53	NC_015715	TTA	3	9	4207	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708683
54	NC_015715	TCT	2	6	4281	4286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708683
55	NC_015715	TCC	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338708683
56	NC_015715	TAG	2	6	4336	4341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708683
57	NC_015715	TTC	3	9	4364	4372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708683
58	NC_015715	TGT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708683
59	NC_015715	TAT	2	6	4471	4476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708683
60	NC_015715	TTC	2	6	4523	4528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708683
61	NC_015715	GAA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708683
62	NC_015715	ATC	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708683
63	NC_015715	ATT	2	6	4562	4567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708683
64	NC_015715	AAG	2	6	4639	4644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708683
65	NC_015715	TGA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708683
66	NC_015715	TTC	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708683
67	NC_015715	ATC	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708683
68	NC_015715	AAT	2	6	4847	4852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708683
69	NC_015715	ATT	2	6	5030	5035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708683
70	NC_015715	AAT	2	6	5114	5119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708683
71	NC_015715	GGT	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338708683
72	NC_015715	CAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708683
73	NC_015715	GAA	2	6	5425	5430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708683
74	NC_015715	ATT	2	6	5480	5485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708683
75	NC_015715	AAT	2	6	5491	5496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708683
76	NC_015715	ATT	2	6	5693	5698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708684
77	NC_015715	ATA	2	6	5709	5714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708684
78	NC_015715	CCA	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338708684
79	NC_015715	TTC	2	6	5966	5971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708684
80	NC_015715	ATA	2	6	6090	6095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708684
81	NC_015715	ATT	2	6	6134	6139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708684
82	NC_015715	TCG	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708684
83	NC_015715	GTA	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708684
84	NC_015715	ACT	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708684
85	NC_015715	ATT	2	6	6440	6445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708684
86	NC_015715	TAG	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708684
87	NC_015715	ATT	2	6	6537	6542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708684
88	NC_015715	GCA	2	6	6643	6648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708684
89	NC_015715	TCA	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708684
90	NC_015715	GAA	2	6	6845	6850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708685
91	NC_015715	ACG	2	6	6928	6933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708685
92	NC_015715	AGC	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708685
93	NC_015715	ATT	2	6	6961	6966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708685
94	NC_015715	TAA	2	6	7018	7023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708685
95	NC_015715	ATT	2	6	7054	7059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708685
96	NC_015715	GAT	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708685
97	NC_015715	TAA	2	6	7272	7277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708685
98	NC_015715	ATA	3	9	7424	7432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708685
99	NC_015715	ATG	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708685
100	NC_015715	CAA	2	6	7528	7533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708685
101	NC_015715	CTT	2	6	7596	7601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708685
102	NC_015715	TTC	2	6	7603	7608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708685
103	NC_015715	TGC	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708685
104	NC_015715	TTG	2	6	7647	7652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708686
105	NC_015715	CAA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708686
106	NC_015715	ACA	2	6	7729	7734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338708686
107	NC_015715	ATC	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708686
108	NC_015715	TGT	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708686
109	NC_015715	TAA	2	6	7967	7972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708686
110	NC_015715	AGC	2	6	8094	8099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338708686
111	NC_015715	ATA	2	6	8177	8182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708686
112	NC_015715	AAG	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708686
113	NC_015715	GCC	2	6	8368	8373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338708686
114	NC_015715	CTT	2	6	8393	8398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708686
115	NC_015715	TAG	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708686
116	NC_015715	TAT	2	6	8477	8482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338708686
117	NC_015715	CTT	2	6	8564	8569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708686
118	NC_015715	ATC	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338708686
119	NC_015715	TTG	2	6	8751	8756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708686
120	NC_015715	TTG	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708686
121	NC_015715	TAA	2	6	8813	8818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708686
122	NC_015715	TCT	2	6	8915	8920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708686
123	NC_015715	TTG	2	6	8934	8939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708686
124	NC_015715	GCT	2	6	8951	8956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708686
125	NC_015715	TGA	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708686
126	NC_015715	TGC	2	6	9180	9185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338708686
127	NC_015715	TGT	2	6	9303	9308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338708686
128	NC_015715	ATA	2	6	9374	9379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338708686
129	NC_015715	GGC	2	6	9433	9438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338708686
130	NC_015715	CTT	2	6	9440	9445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338708686
131	NC_015715	AAG	2	6	9452	9457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338708686
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133	NC_015715	GAT	2	6	9509	9514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708686
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136	NC_015715	GAT	2	6	13053	13058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338708687
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.