MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 2985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	338705983
2	NC_015714	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	338705983
3	NC_015714	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
4	NC_015714	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	338705983
5	NC_015714	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	338705983
6	NC_015714	AACT	2	8	1634	1641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015714	CAAA	2	8	1940	1947	75 %	0 %	0 %	25 %	338705984
8	NC_015714	CTAT	2	8	2613	2620	25 %	50 %	0 %	25 %	338705984
9	NC_015714	GGTT	2	8	3588	3595	0 %	50 %	50 %	0 %	338705985
10	NC_015714	AAAG	2	8	4040	4047	75 %	0 %	25 %	0 %	338705986
11	NC_015714	GTAC	2	8	4105	4112	25 %	25 %	25 %	25 %	338705986
12	NC_015714	GCCC	2	8	4383	4390	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015714	AGAA	2	8	4444	4451	75 %	0 %	25 %	0 %	338705987
14	NC_015714	CGTC	2	8	4651	4658	0 %	25 %	25 %	50 %	338705987
15	NC_015714	TCAT	2	8	4708	4715	25 %	50 %	0 %	25 %	338705987
16	NC_015714	GTGC	2	8	5541	5548	0 %	25 %	50 %	25 %	338705987
17	NC_015714	TTAC	2	8	5772	5779	25 %	50 %	0 %	25 %	338705987
18	NC_015714	AAGA	2	8	5808	5815	75 %	0 %	25 %	0 %	338705987
19	NC_015714	GGGC	2	8	6093	6100	0 %	0 %	75 %	25 %	338705987
20	NC_015714	GACG	2	8	6182	6189	25 %	0 %	50 %	25 %	338705987
21	NC_015714	GAGG	2	8	6428	6435	25 %	0 %	75 %	0 %	338705987
22	NC_015714	GCGT	2	8	6766	6773	0 %	25 %	50 %	25 %	338705987
23	NC_015714	AGTT	2	8	7083	7090	25 %	50 %	25 %	0 %	338705989
24	NC_015714	TTAC	2	8	7268	7275	25 %	50 %	0 %	25 %	338705989
25	NC_015714	TTGC	2	8	7318	7325	0 %	50 %	25 %	25 %	338705989
26	NC_015714	GTCA	2	8	7489	7496	25 %	25 %	25 %	25 %	338705989
27	NC_015714	GGTT	2	8	8563	8570	0 %	50 %	50 %	0 %	338705990
28	NC_015714	CCGT	2	8	9127	9134	0 %	25 %	25 %	50 %	338705990
29	NC_015714	GGTA	2	8	9208	9215	25 %	25 %	50 %	0 %	338705990
30	NC_015714	GCAT	2	8	10135	10142	25 %	25 %	25 %	25 %	338705990
31	NC_015714	ATGT	2	8	10258	10265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015714	GTGG	2	8	10285	10292	0 %	25 %	75 %	0 %	338705991
33	NC_015714	GCTT	2	8	10667	10674	0 %	50 %	25 %	25 %	338705992
34	NC_015714	TGGA	2	8	11664	11671	25 %	25 %	50 %	0 %	338705992
35	NC_015714	AAGT	2	8	11888	11895	50 %	25 %	25 %	0 %	338705992
36	NC_015714	GAGC	2	8	12389	12396	25 %	0 %	50 %	25 %	338705992
37	NC_015714	GCGT	2	8	13265	13272	0 %	25 %	50 %	25 %	338705993
38	NC_015714	GTTT	2	8	13642	13649	0 %	75 %	25 %	0 %	338705993
39	NC_015714	GAAG	2	8	13700	13707	50 %	0 %	50 %	0 %	338705993
40	NC_015714	ACAT	2	8	13735	13742	50 %	25 %	0 %	25 %	338705993
41	NC_015714	AGGG	2	8	14153	14160	25 %	0 %	75 %	0 %	338705994
42	NC_015714	TTTC	2	8	14368	14375	0 %	75 %	0 %	25 %	338705994
43	NC_015714	AGAT	2	8	15026	15033	50 %	25 %	25 %	0 %	338705994
44	NC_015714	GCTC	2	8	15828	15835	0 %	25 %	25 %	50 %	338705994
45	NC_015714	GCTG	2	8	16258	16265	0 %	25 %	50 %	25 %	338705995
46	NC_015714	GTAC	2	8	16356	16363	25 %	25 %	25 %	25 %	338705995
47	NC_015714	TGCG	2	8	16740	16747	0 %	25 %	50 %	25 %	338705995
48	NC_015714	TTGG	2	8	17192	17199	0 %	50 %	50 %	0 %	338705995
49	NC_015714	GCAG	2	8	17547	17554	25 %	0 %	50 %	25 %	338705995
50	NC_015714	AAGG	2	8	17726	17733	50 %	0 %	50 %	0 %	338705995
51	NC_015714	GTGC	2	8	18200	18207	0 %	25 %	50 %	25 %	338705995
52	NC_015714	TTTA	2	8	18371	18378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015714	CGAT	2	8	18498	18505	25 %	25 %	25 %	25 %	338705996
54	NC_015714	CGTT	2	8	18721	18728	0 %	50 %	25 %	25 %	338705996
55	NC_015714	TATG	2	8	18767	18774	25 %	50 %	25 %	0 %	338705996
56	NC_015714	GTTA	2	8	19872	19879	25 %	50 %	25 %	0 %	338705997
57	NC_015714	GAAA	2	8	20724	20731	75 %	0 %	25 %	0 %	338705997
58	NC_015714	TGCG	2	8	20936	20943	0 %	25 %	50 %	25 %	338705997
59	NC_015714	GCTT	2	8	21256	21263	0 %	50 %	25 %	25 %	338705997
60	NC_015714	ACAA	2	8	22802	22809	75 %	0 %	0 %	25 %	338705998
61	NC_015714	GCAC	2	8	22941	22948	25 %	0 %	25 %	50 %	338705998
62	NC_015714	ATGT	2	8	23162	23169	25 %	50 %	25 %	0 %	338705998
63	NC_015714	CTTC	2	8	24373	24380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015714	CTCC	2	8	25036	25043	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_015714	AAAG	2	8	25344	25351	75 %	0 %	25 %	0 %	338705999
66	NC_015714	TTAT	2	8	25397	25404	25 %	75 %	0 %	0 %	338705999
67	NC_015714	GATT	2	8	25944	25951	25 %	50 %	25 %	0 %	338705999
68	NC_015714	AGCG	2	8	26082	26089	25 %	0 %	50 %	25 %	338705999
69	NC_015714	CCTT	2	8	26918	26925	0 %	50 %	0 %	50 %	338705999
70	NC_015714	GCAC	2	8	27024	27031	25 %	0 %	25 %	50 %	338705999
71	NC_015714	CAGT	2	8	27428	27435	25 %	25 %	25 %	25 %	338705999
72	NC_015714	TGCG	2	8	27876	27883	0 %	25 %	50 %	25 %	338706000
73	NC_015714	AGTG	2	8	28138	28145	25 %	25 %	50 %	0 %	338706000
74	NC_015714	TTTG	2	8	28522	28529	0 %	75 %	25 %	0 %	338706000
75	NC_015714	AAAG	2	8	31022	31029	75 %	0 %	25 %	0 %	338706002
76	NC_015714	GCGG	2	8	31198	31205	0 %	0 %	75 %	25 %	338706002
77	NC_015714	TCGT	2	8	31364	31371	0 %	50 %	25 %	25 %	338706002
78	NC_015714	TGTC	2	8	31504	31511	0 %	50 %	25 %	25 %	338706002
79	NC_015714	ATCC	2	8	32194	32201	25 %	25 %	0 %	50 %	338706002
80	NC_015714	CTCG	2	8	32203	32210	0 %	25 %	25 %	50 %	338706002
81	NC_015714	GTAC	2	8	32227	32234	25 %	25 %	25 %	25 %	338706002
82	NC_015714	TTCA	2	8	32539	32546	25 %	50 %	0 %	25 %	338706002
83	NC_015714	GTTG	2	8	32568	32575	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
84	NC_015714	CAAA	2	8	32877	32884	75 %	0 %	0 %	25 %	338706002
85	NC_015714	TGCG	2	8	33324	33331	0 %	25 %	50 %	25 %	338706003
86	NC_015714	CCGC	2	8	33727	33734	0 %	0 %	25 %	75 %	338706003
87	NC_015714	GCCG	2	8	34596	34603	0 %	0 %	50 %	50 %	338706004
88	NC_015714	ATTG	2	8	34882	34889	25 %	50 %	25 %	0 %	338706004
89	NC_015714	GACG	2	8	35033	35040	25 %	0 %	50 %	25 %	338706004
90	NC_015714	CGTG	2	8	35827	35834	0 %	25 %	50 %	25 %	338706005
91	NC_015714	GGGT	2	8	36370	36377	0 %	25 %	75 %	0 %	338706005
92	NC_015714	GACA	2	8	36512	36519	50 %	0 %	25 %	25 %	338706005
93	NC_015714	TAAG	2	8	36895	36902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015714	GTGC	2	8	37272	37279	0 %	25 %	50 %	25 %	338706006
95	NC_015714	GCGA	2	8	37554	37561	25 %	0 %	50 %	25 %	338706006
96	NC_015714	GAGC	2	8	37817	37824	25 %	0 %	50 %	25 %	338706006
97	NC_015714	TGCG	2	8	38131	38138	0 %	25 %	50 %	25 %	338706006
98	NC_015714	CTTG	2	8	38505	38512	0 %	50 %	25 %	25 %	338706007
99	NC_015714	ACGA	2	8	38632	38639	50 %	0 %	25 %	25 %	338706007
100	NC_015714	GACT	2	8	39689	39696	25 %	25 %	25 %	25 %	338706007
101	NC_015714	GGTT	2	8	39708	39715	0 %	50 %	50 %	0 %	338706007
102	NC_015714	GTAT	2	8	40019	40026	25 %	50 %	25 %	0 %	338706007
103	NC_015714	TTTC	2	8	40179	40186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015714	TCGG	2	8	40252	40259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015714	TCCA	2	8	40556	40563	25 %	25 %	0 %	50 %	338706008
106	NC_015714	GAAA	2	8	41109	41116	75 %	0 %	25 %	0 %	338706008
107	NC_015714	AGAA	2	8	41300	41307	75 %	0 %	25 %	0 %	338706009
108	NC_015714	GAAA	2	8	41708	41715	75 %	0 %	25 %	0 %	338706009
109	NC_015714	CATC	2	8	43911	43918	25 %	25 %	0 %	50 %	338706013
110	NC_015714	GCTC	2	8	44327	44334	0 %	25 %	25 %	50 %	338706013
111	NC_015714	GGGT	2	8	44369	44376	0 %	25 %	75 %	0 %	338706013
112	NC_015714	ACCC	2	8	44578	44585	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_015714	GCAC	2	8	45448	45455	25 %	0 %	25 %	50 %	338706014
114	NC_015714	AGGA	2	8	45830	45837	50 %	0 %	50 %	0 %	338706015
115	NC_015714	TTAC	2	8	47247	47254	25 %	50 %	0 %	25 %	338706017
116	NC_015714	TCCC	2	8	47291	47298	0 %	25 %	0 %	75 %	338706017
117	NC_015714	TGGG	2	8	47915	47922	0 %	25 %	75 %	0 %	338706017
118	NC_015714	GTCG	2	8	48808	48815	0 %	25 %	50 %	25 %	338706017
119	NC_015714	GGAC	2	8	48858	48865	25 %	0 %	50 %	25 %	338706017
120	NC_015714	AGCG	2	8	49514	49521	25 %	0 %	50 %	25 %	338706018
121	NC_015714	CGGG	2	8	49582	49589	0 %	0 %	75 %	25 %	338706018
122	NC_015714	GTCG	2	8	49763	49770	0 %	25 %	50 %	25 %	338706019
123	NC_015714	TTCC	2	8	50003	50010	0 %	50 %	0 %	50 %	338706019
124	NC_015714	GAGG	2	8	50019	50026	25 %	0 %	75 %	0 %	338706019
125	NC_015714	TTCT	2	8	51549	51556	0 %	75 %	0 %	25 %	338706020
126	NC_015714	GGGC	2	8	52253	52260	0 %	0 %	75 %	25 %	338706020
127	NC_015714	ATGC	2	8	52910	52917	25 %	25 %	25 %	25 %	338706021
128	NC_015714	AATC	2	8	53412	53419	50 %	25 %	0 %	25 %	338706021
129	NC_015714	ATTA	2	8	53440	53447	50 %	50 %	0 %	0 %	338706021
130	NC_015714	CAAA	2	8	53782	53789	75 %	0 %	0 %	25 %	338706021
131	NC_015714	GGAA	2	8	54405	54412	50 %	0 %	50 %	0 %	338706021
132	NC_015714	GTAC	2	8	54622	54629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015714	CATC	2	8	54766	54773	25 %	25 %	0 %	50 %	338706022
134	NC_015714	TTTC	2	8	54855	54862	0 %	75 %	0 %	25 %	338706022
135	NC_015714	CTTT	2	8	54985	54992	0 %	75 %	0 %	25 %	338706022
136	NC_015714	TCGT	2	8	55451	55458	0 %	50 %	25 %	25 %	338706022
137	NC_015714	CTAA	2	8	56131	56138	50 %	25 %	0 %	25 %	338706023
138	NC_015714	TCCT	2	8	56505	56512	0 %	50 %	0 %	50 %	338706023
139	NC_015714	ACGA	2	8	58636	58643	50 %	0 %	25 %	25 %	338706026
140	NC_015714	GAGC	2	8	58855	58862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015714	CGTG	2	8	60330	60337	0 %	25 %	50 %	25 %	338706028
142	NC_015714	CTAC	2	8	60412	60419	25 %	25 %	0 %	50 %	338706028
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